牛分支杆菌与肺结核分支杆菌基因组的比较

通过比较基因组学的方法研究发现,牛分支杆菌与肺结核杆菌基因组的同源性为99．95％,但在牛分枝杆菌基因组中有11个缺失区,大小从1kb到12．7kb,遗传信息的缺失引起牛分枝杆菌的基因组减小;牛分枝杆菌与肺结核分枝杆菌H37Rv间存在着2437个单核苷酸多态性（SNPs）,与肺结核分枝杆菌CDC1551间存在着2423个单核苷酸多态性（SNPs）,牛分支杆菌与肺结核分枝杆菌在编码细胞壁和分泌蛋白上变异程度也是巨大的。研究结果揭示了牛分支杆菌与肺结核分枝杆菌的遗传关系,为研究分支杆菌疫苗和诊断试剂提供理论依据,对牛肺结核病的防治有着非常重要的意义。     

结核分支杆菌耐链霉素分子机制的研究进展

链霉素（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｉｎ,ＳＭ）是一线抗结核药物,本文概要地介绍了结核分支杆菌耐链霉素的分子机制。最近的研究认为大多数结核分支杆菌分离株耐ＳＭ是由于核糖体蛋白Ｓ１２编码基因（ｒｐｓＬ）和（或）１６ＳｒＲＮＡ编码基因（ｒｒｓ）突变所致,少数菌株的耐药机制尚需进一步研究     

链霉素耐药结核分支杆菌rpsL基因分析

结核分支杆菌（Mycobacterium tuberculosis.TB)的rpsL基因突变往往与链霉素（Streptomycin.SM)耐药变异有关。选择了77例TB临床分离株,应用BACTEC460快速培养系统进行常规药敏实验,同时针对rpsL基因进行聚合酶链反应（PCR）,对PCR产物进行单链构型多态性（SSCP）分析,MboⅡ酶切后的限制性片段长度分析（RFLP）和序列测定分析。常规药敏实验显示：有20株为SM敏感,57株为耐药。SSCP显示：34株的rpsL基因为野生型,43株为突变型。与常规药敏相比SSCP的特异性与阳性预期值分别为95％和98％。RFLP显示：81.4%的突变类型使其失去MboⅡ酶切位点。序列测定显示：失去MboⅡ酶切位点的突变为rpsL基因43位密码子存有单碱基突变（AAG→AGG）。实验结果表明,TB对SM耐药变异与rpsL基因突变相关,其中第43位密码子的突变是最常见的原因。     

母牛分支杆菌菌苗治疗糖尿病合并初治肺结核的临床分析

目的 探讨母牛分支杆菌菌苗（简称微卡）治疗糖尿病合并肺结核的疗效。方法 同期选取40例糖尿病合并肺结核初治患者,随机分为A、B组。A组以常规抗痨治疗（2HRZE／4HR）,B组在常规抗痨治疗的基础上加用微卡治疗2月。结果 B组结核病灶消散吸收、空洞完全或部分闭合、痰结核菌阴转速度均明显快于A组（P〈0．05）,且不良反应少见。结论 微卡可用作糖尿病合并肺结核的免疫治疗。     

细胞壁缺陷结核分支杆菌致细胞病变作用的观察

目的：探讨细胞壁缺陷结核分支杆菌的致细胞病变作用。方法：用利福平诱导结核分支杆菌形成稳定L型后感染Vero细胞,直接在显微镜下和抗酸染色观察细胞病变情况以及结核分支杆菌同宿主细胞的关系。结果：Vero细胞受结核分支杆菌L型感染72h后形成空泡、变圆、脱落和裂解,结核分支杆菌稳定L型细胞粘附或侵入细胞内。结论：细胞壁缺陷结核分支杆菌仍然能够引起Vero细胞发生病变但致细胞病变的作用较其亲代细菌型明显减弱,L型能够粘附于宿主细胞表面或进入宿主细胞内生长繁殖,引起缓慢的细胞病变。     

脓肿分支枝杆菌embB基因耐乙胺丁醇的分析

目的 分析脓肿分支枝杆菌的embB基因,以探讨其耐乙胺丁醇的分子机制.方法 用16S rRNA基因序列分析法鉴定5株脓肿分枝杆菌临床株,测定乙胺丁醇对临床株及标准株( ATCC 19977)的最低抑菌浓度(MIC).PCR扩增embB基因的全序列,将所测序列进行生物信息学分析.结果 乙胺丁醇对5株脓肿分支杆菌标准株和临床株的MIC均为128μg/mL.,属高度耐药.从脓肿分支枝杆菌的标准株和临床株均扩增出约3200 bp片段,与GenBank中脓肿分支枝杆菌标准株的embB基因大小一致.5株临床株与标准株比较,其核苷酸序列存在9个点突变,在突变位点所编码的氨基酸序列中,仅第18位、87位、770位密码子编码与标准株不同的氨基酸.6株脓肿分支枝杆菌的embB基因与对EMB敏感的结核分支杆菌标准株(H37RV)的相应基因序列比较,第303-305位密码子的核苷酸序列存在差异,但仅第303、304位核苷酸编码的氨基酸序列不同,第306位密码子的核苷酸序列无差异.结论 脓肿分支杆菌对乙胺丁醇的耐药并非embB基因的突变所致,为embB基因天然存在结构的不同,属于天然耐药.结构的差异与第306位密码子无关,可能与第303、304密码子有关.     

一种随机引物联合多特异性DNA片段检测结核分支杆菌的新方法

目的:针对目前结核性疾病实验室诊断的局限性,探索一种更为敏感和特异的结核分枝杆菌DNA检测新方法。方法:选取10株江苏地区流行的结核分支杆菌(MTB)菌株,选取临床其他常见菌株及分枝杆菌菌株作为对照组,分别提取DNA作为随机引物的模板。参考国内、外文献设计12条随机引物,并分别对MTB及对照菌株进行单个引物随机扩增,2%的琼脂糖凝胶电泳对扩增产物进行分离并切胶纯化,通过TA克隆将纯化片段连接到质粒pEASYTM-T5 Zero并进行测序,通过BLAST-nr比对验证是否为MTB DNA片段。按照所确定的MTB片段序列,在其内部设计、合成一对特异性引物。用此特异性引物扩增对应的随机引物扩增产物,获得MTB特异性条带图谱。并将该方法检测的敏感性和特异性与临床上常用的real-time PCR进行比较。结果:经BLAST-nr比对,随机引物IS986F,S535及IS986R扩增的条带与MTB DNA有高度同源性(均为99%)。随机引物IS986F、S535和IS986R分别联合其特异性引物可以检测稀释105倍、105倍和103倍的MTB DNA,其特异性分别为100%、90%和80%。常规real-time PCR可检测出稀释104倍的MTB DNA。结论:随机引物IS986F联合其特异性引物检测结核分枝杆菌的灵敏度和特异性优于S535、IS986R两组,特异性为100%,且灵敏度优于常规real-time PCR法。     

异烟肼影响重组耻垢分支杆菌Rv1776c基因表达的实验研究

目的 研究经典抗结核药物异烟肼对重组耻垢分支杆菌生长增殖及其Rv1776c基因表达的影响。方法 将重组菌MS-Rv1776c接种于LB培养基培养作为对照组,实验组给予异烟肼药物处理,不同时间点取菌液测量A600值,根据所测A值绘制增殖曲线;提取菌液DNA以RT-PCR方法检测异烟肼对Rv1776c基因表达的影响;免疫印迹法SDS-PAGE及Western blot检测异烟肼对Rv1776c蛋白表达的影响。结果 异烟肼对两组重组耻垢分枝杆菌增殖无显著影响（P>0.05）;异烟肼可抑制Rv1776c基因的表达（P<0.05）;SDS-PAGE及Western blot检测发现异烟肼可显著降低ERv1776c蛋白的表达（P<0.05）。结论 异烟肼对重组耻垢分支杆菌的增殖无影响,但可抑制结核分枝杆菌Rv1776c基因及其表达的蛋白。该结果对研究结核菌从休眠菌到复苏初期及活跃期的药物预防提供了实验依据。     

不同来源的谷氨酸棒杆菌氨基脱氧分支酸合成酶的活性分析

分别以高产L-丝氨酸的谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)SYPS-062与模式菌株谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum) ATCC 13032的基因组DNA为模板,运用PCR技术扩增出氨基脱氧分支酸合成酶(ADC synthase)的编码基因pabAB。实验结果表明：来源于SYPS-062和ATCC 13032的pabAB片段全长均为1863bp,编码620个氨基酸。两片段存在16个碱基的差异,引起了7个氨基酸的突变。将pabAB连接表达载体pET-28a(+),构建表达质粒pET-28a-pabAB,并转化E.coli BL21(DE3),在IPTG诱导下,E.coli BL21(DE3)(pET-28a-pabAB)高效表达分子量约为67kDa的可溶性蛋白。表达产物带有His-tag标记,选用Ni柱对表达产物进行纯化,纯化后酶活测定结果表明,来源于SYPS-062氨基脱氧分支酸合成酶的比酶活低于ATCC 13032达46.6%。     

苏云金芽孢杆菌基因组研究概况

迄今为止,全球已有2个Bt株菌株完成了全基因组测序,1个Bt菌株正在拼接中,15个Bt菌株正在进行测序中.已有22个Bt质粒完成了全序列测定.Bt是作为生物农药使用最广泛的微生物菌株,也是最为成功地将其杀虫晶体蛋白基因应用于植物转基因的微生物.在基因组进化、新基因发现、基因表达调控等方面一直是科学家研究的热点,并取得了相当多的成果.本文概述了苏云金芽孢杆菌基因组测序现状、基因组特征及比较基因学等方面的研究进展.     

基因组基因定位(基因DNA酶解图谱技术)的计算机方法研究

本文提出基于酶解图谱技术的基因组基因定位的计算机方法,用于连接定位从克隆分析得到的数据．我们选择了若干例子作为研究对象,尝试了该方法的有效性．结果表明,计算机方法性能良好,可望成为大基因组基因定位的有用工具．     

微菌落观察法快速检测和鉴别结核杆菌培养物的研究

将取自肺结核患者的219例痰标本接种匡氏琼脂平板,共分离到112例结核菌生长物。其中培养法104例(92.8％)阳性,微菌落观察法108例(96.4％)阳性,微菌落法阳性率稍高。培养法和微菌落法阳性标本首次检出时间分别为18.6d和11d,微菌落检出时间更短(P<0.01)。常规菌型鉴别方法与微菌落法对结核杆菌菌型鉴别的符合率为99％。     

DEVELOPMENTAL CORRELATES OF GENOME SIZE IN PLETHODONTID SALAMANDERS AND THEIR IMPLICATIONS FOR GENOME EVOLUTION

We present an analysis of the evolutionary relationship between genome size (C-value, mass of DNA per haploid nucleus) and developmental rate using observations of limb regeneration in salamanders of the family Plethodontidae. Rates of growth and differentiation of regenerating limbs are reported for 27 plethodontid species whose C-values range from 14 to 76 picograms. A phylogenetic analysis employing Felsenstein's method of independent contrasts indicates that rate of differentiation is inversely proportional to genome size, although we have not identified any statistically significant association between genome size and the growth rate of regenerating tissue. Our results are consistent with an interpretation that genome size may place a limit on the maximum rate of regeneration attainable in plethodontid salamanders. The implications of our findings for the “junk DNA,” “nucleotypic DNA,” “selfish DNA,” and “skeletal DNA” hypotheses of genome evolution are discussed.     

拟南芥基因组研究进展

拟南芥基因组全序列在2000年底已完全测定并公开发表,这是第一个经完全测序的开花植物.序列的获得为进行大规模高等植物基因的鉴定、基因结构与功能的分析、基因表达与调控的研究奠定了坚实物质基础,并将改进和发展一系列进行功能基因组研究的方法与技术.     

环状病毒M14 dSRNA基因组的进一步研究

M14病毒是1981年从北京郊区捕获的三带喙库蚊中分离获得。其生物学、形态学和理化特性均符合呼肠孤病毒科环状病毒的特点。聚丙烯酰胺凝胶电泳将其dsRNA基因组分离成11条区带。但最近的进一步研究发现,它是由12个片段的RNA组成。又用猴轮状病毒SA11株作为标准,测定了每个片段的分子量。 白纹伊蚊细胞C6/36纯系,由日本长畸大学热带医学研究A.Igarashi教授惠赠,并照他的方法培养传代。     

肠原发性非何杰金淋巴瘤与结核杆菌感染

目的 探讨肠原发性非何杰金淋巴瘤（PINHL）与结核杆菌感染的关系。方法 采用聚合酶链反应（PCR）技术对20例手术切除的PINHL的瘤组织的瘤旁粘膜组织进行结核杆菌DNA（TB－DNA）检测,同时回顾临床资料,结果 20％的PINHL瘤组织和30％的瘤旁粘膜组织中检出了TB－DNA,且发现TB－DNA阳性病例多是B细胞性PINHL,发病部位多靠近回盲部。结论 结核杆菌感染与PINHL之间可能存在特殊相关性。     

COMPLICATIONS OF GOLD THERAPY AND THEIR MANAGEMENT

Early recognition of manifestations of gold intoxication is important to the treatment of such complications. Proper dosage schedules should be followed and blood and urine frequently examined.Most toxic manifestations subside, but those which become worse or which do not subside on withdrawal of the gold should be treated with BAL (2, 3-Dimercaptopropanol).BAL has a toxicity of its own and is painful on injection. Since BAL combines with gold, the therapeutic effect of the metal may be lost after such treatment.The beneficial effects of methionine and methionine plus BAL in treatment of experimentally induced gold intoxication of animals suggests such combined therapy in the treatment of clinical complications of gold poisoning. A schedule of combined antidotes is outlined.     

GENOME RELATIONS OF AGROPYRON SERICEUM,HORDEUM JUBATUM AND THEIR HYBRIDS

Cytogenetic investigation of microsporogenesis in Agropyron sericeum, Hordeum jubatum, their spontaneous hybrid, Agrohordeum pilosilemma, its amphiploid, and the backcross of the amphiploid to A. sericeum, B₁, elucidated the genome relationships of A. sericeum and H. jubatum. The tetraploid parental species share a partially homologous genome which affects the pairing relationships evidenced in their hybrids. The genome formulae assigned to these plants are: A. sericeum, A“A”BB; H. jubatum, AAA'A‘; Agrohordeum pilosilemma, AA'A“B; the amphiploid, AAA'A‘A”A“BB; and B₁, AA'A”A“BB. Observed pairing configurations were compatible with the expected maximum pairing configurations predicted under the assumption of genetic control of pairing with dosage effects. This is interpreted as further support for the hypothesis that pairing in the hybrids of H. jubatum is controlled by the A genome, one dose of A allowing homeologous pairing and two doses of A promoting homeologous association.