左手螺旋Z-DNA的研究 Ⅴ 环境因子对Oligo-d(G-C)_6构象的影响

脱氧寡聚核苷酸ｄ（Ｇ－Ｃ）６是迄今所报道的同类脱氧多聚核苷酸中能形成左手螺旋ＤＮＡ（Ｚ－ＤＮＡ）的最短序列。环境因子如ＰＨ,温度和离子的类别与浓度对ｄ（Ｇ－Ｃ）６在溶液中的Ｚ－构象的形成和Ｂ－、Ｚ－构象的相对稳定性有着明显的影响。在合适的条件下,ｄ（Ｇ－Ｃ）６在溶液中可呈现Ｂ－构象区,Ｚ－构象相对稳定区和Ｂ－、Ｚ－构象跃迁过渡区。     

寡聚脱氧核苷酸d（CCGTACGG）质子共振谱线归属和溶液物象表征

寡聚脱氧核苷酸ｄ（ＣＣＧＴＡＣＧＧ）质子共振谱线归属和溶液物象表征王萍,石根斌,宋国强,陈凯先,嵇汝运（中国科学院上海药物研究所,２０００３１）关键词寡聚脱氧核苷酸;２ＤＮＭＲ;溶液构象石蒜内铵是一种新型ＤＮＡ嵌合剂,它可以显著改变ＤＮＡ螺旋的构象。...     

利用RT—PCR,DNA序列分析及原核基因表达对我国大豆花叶病毒进行分 …

大豆花叶病毒（ＳＭＶ）在大豆（Ｇｋｌｙｃｉｎｅ ｍａｘ Ｌ．）上引起严重病害。利用ＲＴ－ＰＣＲ扩增并克隆了ＳＭＶ－ＺＫ（一个中国ＳＭＶ分离株）基因组中全部蛋白质编码区的ｄＤＮＡ,通过对ＨＣ－ＰＲＯ,ＮＩｂ和ＣＰ编码区进行序列测定与分析,发现ＳＭＶ－ＺＫ与ＭＳＶ－Ｇ２高度同源,从而在分子水平上证明在我国大豆作物中存在ＳＭＶ－Ｇ２类似株系。     

乙肝病毒核衣壳启动子内三链DNA的形成

用电泳迁移分析方法研究了２１ｎｔ脱氧寡核苷酸Ｇ３ＴＧ２ＴＧＴ２Ｇ５ＴＧ２ＴＧＴ（ＣＰ１）与１２９ｂｐ的乙肝病毒（ＨＢＶ）核衣壳启动子（Ｃｐ）片段内一位点结合形成的三链ＤＮＡ的特异性及稳定性．在克隆有ＨＢＶ基因组的质粒ｐＣＰ１０的酶切产物中,ＣＰ１仅与含Ｃｐ的１２９ｂｐ片段结合．在２０ｍｍｏｌ／ＬＭｇ２＋溶液中其解离常数（Ｋｄ）为１．４×１０－７ｍｏｌ／Ｌ．不同离子稳定三链ＤＮＡ的效果依次为ｓｐ４＋（精胺）＞Ｍｇ２＋＞Ｚｎ２＋＞Ｎａ＋＞Ｋ＋,离子之间存在相互竞争作用．比ＣＰ１多一误配碱基的脱氧寡核苷酸Ｇ２ＴＧ２ＴＧＴＧ３ＴＧ２ＴＧ２ＴＧ２Ｔ（ＣＰ２）在２０ｍｍｏｌ／ＬＭｇ２＋溶液中与Ｃｐ结合的Ｋｄ值约为ＣＰ１的１／７,而在６０ｍｍｏｌ／ＬＫ＋或５ｍｍｏｌ／ＬＺｎ２＋溶液中检测不到它与Ｃｐ的结合,这进一步显示了三链ＤＮＡ形成的特异性．细胞的生理离子浓度被认为是：Ｓｐ４＋１ｍｍｏｌ／Ｌ,Ｍｇ２＋１０ｍｍｏｌ／Ｌ,Ｋ＋１４０ｍｍｏｌ／Ｌ,因此,ＣＰ１在细胞内将能特异地与Ｃｐ结合并具有较好的稳定性．     

大熊猫基因指纹探针F2ZGP96060801的研制及比较实验分析

利用ＡＢＩ－３９４型ＤＮＡ合成仪合成的寡核苷酸５－「Ａ（Ｘ）ｎ－ｘＴＣＣＡＣ」ｎ－３,经高效液相色谱仪纯化后,制备成了命名为为Ｆ２ＺＧＰ９６０６０８０１的大熊猫基因指纹探针,用同位素标记法标记Ｆ２ＺＧＰ９６０６０８０１,ＬＺＦ－Ｉ、朋５、３３．６和（ＣＡＣ）６／ＧＴＧ）５等５种基因指纹探针,比较检测了大熊猫随机个体的被毛、大熊猫３雄配Ｉ雌所产１个双胞胎计６只个体的福尔马林固定的肝组织和粪便中的胃肠     

重组RA—538及反义c—myc腺病毒对人胃癌,食管癌和bcl—2高表达细胞系的作用

本课题研究ＲＡ５３８、反义c-ymc重组腺病毒对人胃癌（ＳＧＣ７９０１）、食管癌（Ｅ Ｃ１０９、ＥＣ８７１２）、正常人胚肺２ＢＳ（２ＢＳ）及ｂｃｌ－２高表达细胞第的体仙外生物学作用及其分子机制。结果显示Ａｄ－ＲＡ５３８及Ａｄ－ＡＳｃ－ｍｙｃ对ＳＧＣ７９０１细胞体内外均具有明显的生长抑制及凋亡诱导作用,并能抑制其ｃ－ｍｙｃ、ｂｃｌ－２、ｃｙｃｌｉｎＤ１基因的表达及刺激ｂａｘ基因的表达。对ＥＣ１０９、ＥＣ８     

6—DMAP对小鼠卵母细胞减数分裂启动及孤雌发育作用

小鼠卵泡卵母细胞体外培养过程中加入２ｍｍｏｌ／Ｌ６－ＤＭＡＰ可抑制卵母细胞自发的染色持浓缩和生发泡破裂（ＧＶＢＤ）。源自超排的ＭⅡ期卵母细胞则能为６－ＤＭＡＰ所激活。ｈＣＧ注射后１８－１９ｈ的卵母细胞置于２ｍｍｏｌ／Ｌ６－ＤＭＡＰ的ＣＺＢ溶液中培养０．５ｈ、１ｈ、２ｈ、３ｈ,卵母细胞的激活率分别为２６．１％、７５．２％、７５．８％、７７．３％、卵裂率分别为８８．２％、７３．２％、６７．０％、５８．     

传染性法氏囊病病毒CJ－801bkf毒株VP2 cDNA基因结构的分析

以传染性法氏囊病病毒（ＩＢＤＮ）中国毒株ＣＪ－８０１ｂｋｆ的基因组Ａ片段ｄｓＲＭＡ为模板,经反向转录和ＰＣＲ扩增,克隆了保护性抗原ＶＰ２ｃＤＮＡ基因。经Ｓａｎｇｅｒ法测序,确定了ＶＰ２ｃＤＮＡ基因有１４８４个核苷酸,推测了ＶＰ２氨基酸的顺序,与已报导的６株ＩＢＤＶ毒株ＣｕＩ、ＰＢＧ９８、５２／７０、００２－７３、ＳＴＣ和ＶａｒｉａｎｔＥ的ＶＰ２区做了比较,证明：克隆的ＣＪ－８０１ｂｋｆＶＰ２ｃＤＮＡ基因是全长的,含有正确的起始密码子ＡＴＧ;ＣＪ－８０１ｂｋｆ与毒株Ｃｕｌ和ｐＢＧ９８同源性最高;ＣＪ－８０１ｂｋｆＶＰ２高可变区内两个亲水区的氨基酸顺序与ＣｕＩ、ＰＢＧ９８、５２／７０、００２－７３和ＳＴＣ完全相同;７肽区内第三个丝氨酸残基则变异为精氨酸。这些结果提示,中国ＣＪ－８０１ｂｋｆ毒株应属标准血清Ｉ型ＩＢＤＶ弱毒株。     

人GM—CSF cDNA的克隆和在大肠杆菌中的表达

从诱导的人胚肺细胞ＨＦＬ株中提取总ＲＮＡ．经ＲＴ－ＰＣＲ反应获取了人ＧＭ－ＣＳＦｃＤＮＡ,ＤＮＡ序列测定表明其顺序与文献报道完全一致。为了获得高效表达,应用ＰＣＲ改造了人ＧＭ－ＣＳＦ的ｃＤＮＡ５’端核苷酸序列,并将改造的人ＧＭ－ＣＳＦ基因插入含Ｔ７启动子的质粒ｐＥＴ－１１ｄ构建成表达质粒ｐＥＴＣ－５,将此质粒转化大肠杆菌株ＢＬ２１（ＤＥ３）得到表达菌株ＢＬＥＣ４。表达菌株用０．５ｍｏｌ／ＬＩＰＴＧ诱导２小时后,产生大量重组蛋白并形成包涵体。ＳＤＳ—ＰＡＧＥ电泳图谱扫描结果表明,ｒｈＧＭ－ＣＳＦ产量占菌体总蛋白量的１６％。ＥＬＩＳＡ和ＴＦ－１细胞培养测定表明,初步纯化和复性的ｒｈＧＭ－ＣＳＦ具有天然的ｈＧＭ－ＣＳＦ生物活性。     

四氢小檗碱的中枢抑制作用与GABA受体无关

应用蚯蚓背肌收缩反应,证实四氢小檗碱（ＴＨＢ,１０－７－１０－４ｍｏｌ／Ｌ）不能影响ＧＡＢＡ和ＡＣｈ两种受体的功能,多巴胺受体阻滞剂氟哌啶醇（ＨＡＬ）亦不能影响它们。由于异烟肼（ＩＮＨ）和氨基硫脲（ＴＳＣ）抑制ＧＡＢＡ的生物合成,印防己毒素（ＰＴ）和毕枯枯灵（Ｂｉｃ）作用于ＧＡＢＡ－ＢＺ受体复合体,它们都使小鼠产生惊厥,该作用能被氨基氧乙酸（ＡＯＡＡ）和安定（ＢＺ）所拮抗,但ＴＨＢ和ＨＡＬ却不能。由此表明前述ＴＨＢ的中枢抑制作用与ＧＡＢＡ抑制无关。     

γ射线诱导质粒pGEM-3Zf(-)DNA lacZ基因突变的序列分析

利用质粒ｐＧＥＭ－３Ｚｆ（－）ＤＮＡ上带有的ｌａｃＺ基因,通过Ｘ－ｇａｌ显色平板筛选经＾６０Ｃｏγ辐射诱导形成的突变体。对４个突变体的ｌａｃＺ基因进行序列分析发现,所有突变体无一例外地检测到碱基变化。在被测序的４８９ｂｐ范围内,一个突变体发生的碱基变异达２－７个位点。碱基变异的类型包括颠换（５７％）、转换（１９％）、缺失（１９％）及插入（５％）。在碱基置换中,以Ｃ／Ｇ→Ａ／Ｔ颠换最多（占５０％）。     

犬腺病毒基因组缺失VA RNA编码区的发现

将两株１型犬腺病毒（Ｃａｎｉｎｅ ａｄｅｎｏｖｉｒｕｓ ｔｙｐｅ １,ＣＡｄｌ）ＤＮＡ片段（２９￣４０ｍ．ｕ．）和两株２型犬腺病毒（ＣＡｄ２）ＤＮＡ片段（２８￣４４ｍ．ｕ．）,分别克隆到质粒ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＳＫ中。经核苷酸序列测定和计算机分析表明,在上述克隆片段内,两株ＣＡｄｌ（ＣＬＬ和Ｇｌａｘｏ）的序列相同,两株ＣＡｄ２（Ｔｏｒｏｎｔｏ和Ｃｈｉｎａ）的序列也相同;ＣＡｄ１与ＣＡｄ２具有９     

黑子南瓜甘油-3-磷酸酰基转移酶基因的克隆及序列分析

依据国外报道的南瓜甘油－３－磷酸转酰酶（ＧＰＡＴ）基因的ｃＤＮＡ序列合成相应引物,用ＲＴ－ＰＣＲ技术,成功地分离了黑子南瓜（Ｃｕｃｕｒｂｉｔａｆｉｃｉｆｏｌｉａ）ＧＰＡＴ基因的ｃＤＮＡ片段,并亚克隆到了ｐＧＥＭ－Ｔ载体系统的多克隆位点上,序列分析表明黑子南瓜ＧＰＡＴ基因的ｃＤＮＡ序列及递推的氨基酸序列与南瓜（Ｃｕｃｕｒｂｉｔａｍｏｓｃｈａｔａ）相比分别具有９８％和９６５％的同源性。在１１８８ｂｐ中有２２个核苷酸发生变化,导致１３个氨基酸的改变     

人粒细胞集落刺激因子（hG—CSF）cDNA3‘—UTR对其表达的影响

利用人粒细胞集落刺激因子（ｈＧ－ＣＳＦ（）ｃＤＮＡ３＇端非翻译区（３＇ＵＴＲ）中存在的ＤｒａＩ酶切位点,通过部分酶切与完全酶切,删除３＇－ＵＴＲ不同长度构建了四种ｈＧ－ＣＳＦ ｃＤＮＡ瞬时重组表达质粒,转染ＣＯＳ－７细胞手,生物活性测定结果提示,ｈＧ－ＣＳＦｃＤＮＡ３＇－ＵＴＲ对其表达起负调控作用,其关键性序列位于紧接终止密码子ＴＧＡ下游的６５ｂｐ范围内,３＇－ＵＴＲ对ｈＧ－ＣＳＦ ｃＤＮＡ表达的     

香蕉束顶病毒基因克隆和序列分析

对香蕉束顶病毒（ＢＢＴＶ）中国分离株ＤＮＡ组份Ｉ（ＤＮＡ－１）、外壳蛋白（ＣＰ）和运转蛋白（ＭＰ）基因进行了克隆和序列分析。ＢＢＴＶＤＮＡ－１含有１１０３个核苷酸,与南太平洋和亚洲分离株分别有８７％－８８％ ９６．９－９８％的核苷酸序列同源性。由ＤＮＡ－１编码的复制酶含有１８６个在酸残基。与南太平洋和亚洲分离株分别有８４．４％－９５．８％和９７．６％、９８．０％的氨基酸序列同源性。外壳蛋白基因由５     

BALB／c等小鼠线粒体DNAD环区PCR—SSCP分析

用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法分析ＢＡＬＢ／ｃ等７个近交系小鼠线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）的多态性,探讨其遗传起源及亲缘关系,结果发现,这些小鼠ｍｔＤＮＡ的高变异性区,Ｄ－ｌｏｏｐ ５’及３’端的ＳＳＣＰ电泳带型完全相同,未发现多态性。表明ＴＡ２、６１５、Ｔ７３９、ＢＡＬＢ／ｃ、Ｃ３Ｈ、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊ、ＤＢＡ／２等近交系小鼠的ｍｔＤＮＡ具有高度的同源性。     

粒细胞—巨噬细胞集落刺激因子／白细胞介素—3融合蛋白的表达研究

利用ＰＣＲ扩增得到粒细胞－巨噬细胞集落刺激因子（ＧＭ－ＣＳＦ）、白细胞介素－３（ＩＬ－３）完整基因片段,将其分别克隆ｐＧＥＭ－Ｔ构建成ＧＭ－ＣＳＦ／ＩＬ－３融合蛋白基因,ＤＮＡ序列与设计预期一致。将得到的融合蛋白基因克隆对７２ＲＮＡ聚合酶表达载体ｐＴ７ｚｚ,得到表达质粒ｐＦｕ,经转化至表达宿主Ｅ．ｃｏｌｉ ＢＬ２１（ＤＥ３）,在ＩＰＴＧ诱导下获得融合蛋白目的产物的直接表达。经ＳＤＳ－ＰＡＧＥ电泳鉴     

重组人骨形成蛋白-3羧基端肽在大肠杆菌中表达及其诱骨活性

以双顺反子表达载体,在大肠杆菌中经ＩＰＴＧ诱导表达了人骨形成蛋白－３羧基端肽段（ｈＢＭＰ－３Ｃ）,表达量占菌体总蛋白量的１８．５％．目的蛋白为２５ｋＤ、含ｈＢＭＰ－３Ｃ端２１５个氨基酸残基组成的肽段,包括ｈＢＭＰ－３成熟肽和一部分前肽．表达产物以包涵体的形式存在,用含ＴｒｉｔｏｎＸ－１００的洗涤液和５ｍｏｌ／Ｌ以下脲溶液连续洗涤,可获得较高纯度的重组人骨形成蛋白－３Ｃ端肽．经复性处理成可溶性蛋白,植入小鼠肌肉内,第１４ｄ组织切片显示有软骨细胞和软骨基质形成,第２１ｄ可见成骨细胞和骨基质形成．将ｒｈＢＭＰ－３Ｃ与脱矿去免疫原性异种骨粒复合后作小鼠肌肉植入试验,２１ｄ组织切片上可见硬质骨形成．结果表明：大肠杆菌表达的ｈＢＭＰ－３Ｃ经复性后具有诱骨活性,糖基化并非ＢＭＰ－３活性所必需．     

MALDL—TOF—MS对寡核苷酸的序列分析

通过对几种基质测定含不同碱基的寡核苷酸的灵敏度及精确度的比较,发现用混合基质α－氰基－４－羟基肉桂酸（α－Ｃｙａｎｏ）／３－羟基吡啶羧酸（３ＨＰＡ）用于基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱中测定脱氧寡核苷酸,不仅能得到较好的分子离子峰,而且一些金属离子的加合物峰能得到的有效的抑制,提高了测定的灵敏度,用３′和５′－外切酶对脱氧寡核苷酸１２－ｍｅｒ（５′－ＡＴＧ ＣＡＴ ＡＴＧ ＣＡＴ－３′）进行部分     

d（GGTATACC）2水溶液中构象柔性研究

富含ＡＴ脱氧核糖核酸片断是一些抗肿瘤药物的作用位点，茜些药物还在共小沟部位以氢键与之结合，本文进行了低聚核苷糖ｄ（ＧＧＴＡＴＡＣＣ）２三维结构的溶液修正，构象分析研究表明核苷酸片断在水溶液中保持双螺旋，属Ｂ类结构，各碱基相对于糖环呈反式构象，糖环本身则均以Ｃ２’＝ｅｎｄｏ构象为主。