青、草、鲢、鳙四大家鱼的血红蛋白和红细胞乳酸脱氢酶同工酶分析

过去对物种的分类一般沿用形态特征的比较分类法。随着生物学中各种新技术的应用及各学科间的相互渗透,用生物化学等方法来鉴别物种的特异性和它们在进化上的亲缘关系已日益多见。特别是对某些基因的特定产物——一些特异性蛋白和酶有了可靠的鉴别方法,所以它们已被用于鉴别生物遗传特征或器官特异性的标记。     

淡水浮游植物功能类群划分方法及其生态学应用研究进展(综述)

浮游植物功能类群分类方法是一种以浮游植物个体生态学特征为依据的生态分类法,弥补了传统分类方法在生态学应用上存在的不足,是开展淡水生态研究的重要工具。文中概述浮游植物功能类群的理论基础、分类依据及其生态学研究中的优势,并介绍功能类群分类法在国内外淡水浮游植物生态学研究中的应用进展和现状,最后探讨浮游植物功能类群研究中存在的问题及未来发展方向。     

淡水浮游植物功能类群分类法的提出、发展及应用

浮游植物分类方法是揭示浮游植物群落演替规律、开展淡水生态研究的工作基础和重要工具.林氏分类法和分子鉴定法在生态学应用上存在的不足促进了浮游植物功能类群分类法的发展.功能类群分类法是一种以浮游植物个体生态学为依据的生态分类法.本文概述了浮游植物功能类群(functional group,FG)、生态功能类群(morpho-functional group,MFG)和形态功能类群(morphology-based functional group,MBFG)等浮游植物分类方法的理论基础和分类依据,分析比较了这3种分类方法的优势与不足,认为FG是目前应用于水生生态学研究和水环境生物评价中相对适用的浮游植物分类方法.介绍了功能类群分类法在国内外淡水浮游植物生态学研究中的应用现状,简述了以FG为基础提出的Q指数法和Q-R指数法两种水质评价法的评价标准及存在的不足.
     

群落排表分类的两种数学方法

本文描述两种执行群落排表分类的数学方法:X²分类法和信息熵分类法,并以德国西北部草地数据为例进行了应用和分析。结果表明这两个方法都是有效的群落排表分类方法,它们所排的群落表可直接地反映群落类型和种类组成之间的关系,体现了Braun-Blanquet传统排表法的特点。     

病原体致病性和毒力的现代概念

微生物致病性和毒力的传统概念不能反映病原体与宿主相互作用的复杂关系。本文介绍一种损伤－应答分类法,将致病性的现代概念。     

草原植物群落分类方法的比较研究——以呼伦贝尔草原为例

选择植被分类中常用的优势种分类法、TWINSPAN和UPGMA等3种方法对呼伦贝尔草原40个样点进行了群落分类比较。优势种分类法将这40个样点分为16个组,TWINSPAN将其分为10个组,UPGMA将其分为11个组。优势种分类法和UPGMA的结合系数为0.94,TWINSPAN和UPGMA的结合系数为0.91,优势种分类法和TWINSPAN的结合系数为0.87,最高的结合系数表明优势种分类法和UPGMA的分类结果高度一致。通过计算3种方法各分组内的物种丰富度、地面总生物量和平均相似系数的方差,优势种分类法的3项累计方差为1131,TWINSPAN为976.8,UPGMA为952.8。这一结果表明,优势种分类法各分组内部有较大的差异性,其结果需要适当调整,而UPGMA各分组的差异性最小。从累计方差来看,相较于广泛采用的优势种分类法,UPGMA更适于呼伦贝尔草原的植物群落分类研究。本研究结果对于开展我国草原植被分类研究工作具有一定的参考价值。     

细菌的数值分类方法

细菌的数值分类方法郭秀花,李爱国,冯丹,张德舜,朴相浩（解放军北京医学高等专科学校,北京１０００７１）数值分类已广泛应用于微生物学、动物学、植物学、古生物学等领域［１］。本文就细菌数值分类进行讨论。１数值分类的概念及发展概况细菌分类方法有：传统分类法...     

植物学分类新方法

植物分类学是一门历史悠久的学科。随着科学技术的迅猛发展,植物分类学研究方法不断发展和创新。已由最初经典的形态分类发展到后来的染色体分类法、化学分类法、超微结构分类法及目前比较热门的分子分类法。     

关于我国古代动物分类学的讨论

我国古代动物分类法有好几种,而都不外乎唯物与唯心两个观点、两种方法的斗争。《尔雅》动物五篇所体现的虫鱼鸟兽分类法,是古代劳动人民接触大自然总结经验而成,是一种朴素唯物的动物分类法。《礼记·月令》所包含的鳞羽倮毛介五虫分类法,是五行家言,欲夺《尔雅》分类的地位,逐渐转变而成为与其他事物一同纳入五行的唯心的动物分类     

酶的命名规范化及有关问题

在微生物、植物和动物体内,迄今已发现的酶有数千种之多。为了避免混乱,国际酶学委员会在1961年曾提出一个关于酶的分类命名的报告。1972年出版的《酶分类法》中,收录了当时所知的所有酶的分类命名资料。国际酶学委员会关于酶的分类命名原则已被各国酶学工作者广泛接受。鉴于这一原则有充分的科学依据,又便于国际交流,我国的各种出版物中也应     

酵母菌分类学方法研究进展

阐述了经典分类法、化学分类法、分子分类法在酵母菌分类中的应用,并对它们的优缺点作了简要的评价。     

有的科学家提出以DNA作为生物分类基础

有的科学家提出以ＤＮＡ作为生物分类基础据英国《每日电讯报》报道,澳大利亚科学院最近收到由澳大利亚科学家参加的一个国际科研小组的报告,指出利用ＤＮＡ作为生物分类的基础比传统生物分类法要科学,因为后者过多依赖于生物的外在因素,是在人类无法了解生物遗传本质...     

醋酸菌多相分类研究进展

醋酸菌是一大群革兰氏染色阴性、绝对好氧的细菌的总称, 能将乙醇或糖类不完全氧化为有机酸。醋酸菌的分类在近30年经历了很大变化, 早期的分类系统主要以表型和生化特征为基础。如今, 大多采用结合表型、化学分类法和基因型数据的多相分类法对醋酸菌进行分类。本文综述了醋酸菌的多相分类研究进展, 主要介绍了醋酸菌的现行分类情况及表型分类、化学分类和基因分型等方法在醋酸菌分类中的应用。     

基于可见光植被指数的面向对象湿地水生植被提取方法

利用ESP分割工具确定最佳分割尺度,通过多尺度分割算法创建最优分割影像,基于微型无人机影像数据生成可见光植被指数,从一系列可见光植被指数中选取一组最优植被指数,建立决策树规则,利用隶属度函数对研究区自动分类,生成水生植被分布图.结果表明: 监督分类法的总体精度为53.7%,面向对象分类法总体精度为91.7%,与基于像元的监督分类法相比,面向对象分类法显著改善了影像分类结果,并大大提高了水生植被提取精度,监督分类法的Kappa系数为0.4,而面向对象分类法的Kappa系数为0.9.这表明利用微型无人机数据生成的可见光植被指数结合面向对象分类方法提取水生植被在该研究区是可行的,并能够应用到其他类似区域.     

红球菌属的分类及应用研究进展*

从Zopf于1891年建立红球菌属至今,红球菌属各种菌的分类地位一直处于不断的变化之中。近年来,随着一些种的重新分类以及新种的发现,红球菌属的分类发生了很大变化。这主要是由于分类手段已由传统的形态学分类方法向现代的多相分类法过渡。此外,由于红球菌能降解一些环境污染物,合成或转化形成一些有用的化合物,同时它的一些种对人、动物或植物都有影响。因此,红球菌也越来越为人们所关注。     

机器学习在MALDI-TOF MS鉴定微生物中的应用

基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)是一种新兴的高通量技术,已广泛应用于临床微生物、食品微生物和水产微生物的快速鉴定。如何进一步提高MALDI-TOF MS在微生物鉴定中的分辨率是该技术当前面临的一大挑战。为了高效处理大量高维微生物MALDI-TOF MS数据,各种机器学习算法得到了应用。本文综述了机器学习在微生物MALDI-TOFMS鉴定中的应用。首先,本文在介绍机器学习在微生物MALDI-TOF MS分类中的工作流程后,进一步对MALDI-TOF MS的数据特征、MALDI-TOF MS数据库、数据的预处理和模型的性能评估进行了描述。然后讨论了典型的机器学习分类算法和集成学习算法的应用。简单的机器学习算法很难满足微生物MALDI-TOF MS分类的高分辨率的需求,而组合不同机器学习算法和集成学习算法可以获得更好的微生物分类性能。在MALDI-TOF MS数据的预处理方面,小波算法和遗传算法的应用最广,它们...     

青、草、鲢、镰四大家鱼的血红蛋白和红细胞乳酸脱氢酶同工酶分析

过去对物种的分类一般沿用形态特征的比 较分类法。随着生物学中各种新技术的应用及 各学科间的相互渗透,用生物化学等方法来鉴 别物种的特异性和它们在进化上的亲缘关系已 日益多见［[1,73。特别是对某些基因的特定产物 — 一些特异性蛋白和酶有了可靠的鉴别方 法,所以它们已被用于鉴别生物遗传特征或器 官特异性的标记［s10     

简议我国古代植物分类和命名

在参阅大量古籍文献的基础上,对我国古代植物的分类和命名进行了探讨。我国很早就用功能属性分类法和自然属性分类法对植物进行分类,有些类群的划分与国际上科学分类法的观点非常相似;运用植物的取象名素创立的“类部“和”种部”的植物命名方法类似于国际上植物命名的双名法。对我国古代植物分类学与国外分类学的异同,以及我国古代植物分类学发展不足的原因也作了分析。     

基于16S rRNA和rpoB基因的分子系统发育分析在铜绿假单胞菌鉴定中的应用

为对比16S rRNA和rpo B基因分子系统发育分析与传统表型分类法对铜绿假单胞菌的鉴定,评估16S rRNA和rpo B基因序列分析在铜绿假单胞菌鉴定中的应用,用表型分类方法对临床自动微生物鉴定系统鉴定为铜绿假单胞菌的23株分离株进行再鉴定,PCR扩增23株分离株16S rRNA和rpo B基因片段,并测序进行系统发育分析。结果表明,表型再鉴定结果与自动微生物鉴定系统鉴定结果一致。基于两个基因的系统发育分析均显示分离株p22与不动杆菌属序列聚为一枝,其余22株分离株与铜绿假单胞菌序列聚为一枝。因此p22应鉴定为不动杆菌,16S rRNA和rpo B基因序列分析均能准确鉴定铜绿假单胞菌并能较好建立假单胞菌属内种间关系。     

民间生物分类的研究进展

民间生物分类是一种基于当地文化的方言命名系统,是指在科学分类以外、存在于民间的对生物进行分门别类的方法和过程。许多研究证明,民间分类与科学分类法十分相似,在生物多样性调查与编目、生物文化多样性保护和资源的可持续利用等方面有着非常重要的作用。随着文化同质性和生物多样性丧失的日益加剧,许多珍贵的民间分类传统知识在没有被记录或被发现之前就已经消失,亟待抢救。本文对民间生物分类的概念、主要研究内容和进展进行全面回顾,并对目前民间生物分类存在的问题进行展望,以期为人们全面了解民间生物分类提供参考,并为今后民间生物分类的相关研究提供资料。