EcoRI限制性内切酶底物专一性的研究——具有核糖修饰的EcoRI底物类似物的合成

本文报道用化学和酶促相结合的方法合成了d-GGArATTCC和d-GGArATTC。酶促反应结果说明,当受体3′末端为核糖核苷时大大促进RNA连接酶的作用。产物的结构均经蛇毒磷酸二酯酶部分酶解后的电泳-同系层析双向图谱鉴定得到证明。这两种类似物都能被EcoRI限制性内切酶识别并在专一位置上水解,结果说明EcoRI的识别顺序中第四位上d-A变为r-A并不显著影响酶的识别,而且证明了EcoRI的最小底物是含有识别顺序的七聚脱氧核苷酸。     

多核苷酸合成的研究 ⅩⅣ.EcoRI接头片段脱氧八核苷七磷酸的合成

本文采用化学方法和化学与酶促相结合的方法分别合成了自身互补的EcoRI接头片段脱氧八核苷酸d-GpGpApApTpTpCpC。化学方法使用二酯法(4 4)的路线,各中间片段和最终产物用DEAE-葡聚糖凝胶A-25柱层析纯化。酶促合成是用化学合成的两个片段d-GGAA和d-TTCC,借RNA连接酶连接成脱氧八核苷酸。两种方法合成的八核苷酸都能被限制性内切酶EcoRI识别并水解得到预期的产物,同时双向指纹图谱分析证明合成的产物具有正确的核苷酸排列顺序。     

多核苷酸合成的研究——ⅩⅣ.EcoRI 接头片段脱氧八核苷七磷酸的合成

本文采用化学方法和化学与酶促相结合的方法分别合成了自身互补的EcoRI 接头片段脱氧八核苷酸d-GpGpApApTpTpCpC。化学方法使用二酯法(4 4)的路线,各中间片段和最终产物用DEAE-葡聚糖凝胶A-25柱层析纯化。酶促合成是用化学合成的两个片段d-GGAA和d-TTCC,借RNA 连接酶连接成脱氧八核苷酸。两种方法合成的八核苷酸都能被限制性内切酶EcoRI 识别并水解得到预期的产物,同时双向指纹图谱分析证明合成的产物具有正确的核苷酸排列顺序。     

DNA-蛋白质相互作用的研究——EcoRI内切酶切割P_2-DNA

限制性核酸内切酶不仅是分析和操纵DNA序列的工具,而且也为研究DNA-蛋白质之间相互作用提供了一条可行的途径。核酸内切酶如何识别、结合、切割DNA,不少文章已有报道。至今没有解决的一个问题是:同一DNA分子上具有相同核苷酸顺序的不同限制位,为什么能以不同的速度为同一种内切酶切割。为了研究这个问题,我们选择P_2噬菌体DNA和EcoRI内切酶作为试验系统,用酶促反应的动力学和热力学方法研究其切割机制,所得资料表明,不同限制位点的切割速度     

限制内切酶EcoRI的纯化及其活性鉴定

本文叙述了一个较简便的EcoRI限制内切酶的提纯方法。从大肠杆菌HB101(PMB_4)中制备出高活性的EcoRI酶,并鉴定其生物活性。     

限制内切酶EcoRI的纯化及其活性鉴定

本文叙述了一个较简便的EcoRI限制内切酶的提纯方法。从大肠杆菌HB101(PMB_4)中制备出高活性的EcoRI酶,并鉴定其生物活性。     

限制性内切酶EcoRI诱发CHO细胞染色体畸变的细胞动力学研究

一些限制性内切酶能够诱发CHO细胞染色体畸变已经不同实验所证实［11,4.5.77。有作者提出 限制性内切酶的致染色体畸变作用类似于电离辐射,即这种作用是非S期依赖性的闻。最近,又 有作者详细研究了Alul对处于细胞周期各个时相的染色体的作用〔17o Alul识别序列为4个碱基 对,产生平切末端,而对另一大类识别序列为6个碱基对,产生粘性末端的限制酶则尚无研究。为 此,我们以CHO细胞为材料,观察了EcoRI对处于细胞周期不同时相染色体的效应。现将结果报 告如下。     

用于DNA无性繁殖的EcoRI接头的化学合成

利用二酯法化学合成了一个脱氧八核苷酸(d-G-G-A-A-T-T-C-C)。此八核苷酸片段自身互补形成双链DNA片段,能被限制性内切酶EcoRI酶解。利用双向同系层析测定了它的核苷酸序列,证明这一片段的序列符合实验设计要求。     

双底物酶促反应动力学机制判别的优化方法

研究双底物酶促反应动力学机制的常用方法是二次作图法.本文针对二次作图法存在的问题提出了一种基于最小二乘拟合的优化算法.该算法利用最小二乘原理对顺序机制和乒乓机制下的双倒数速度方程的常系数进行拟合求解,通过比较两种拟合方程下得到的残差平方和判别酶促反应的动力学机制.通过实例计算证明该优化算法具有可靠性强、计算过程简单的特点,在双底物酶促反应动力学机制判别的准确性方面更具优势.     

Hin P_1I底物片段d-ATGCGCAT的固相磷酸三酯法合成

本文报道用固相磷酸三酯法化学合成了限制性内切酶HinP_1Ⅰ的底物片段d-ATGCGCAT。固相载体采用β-丙氨酰基聚苯乙烯树脂(2%交联度)。合成的产物经顺序分析得到证明,同时能被限制性内切酶HinP_1Ⅰ识别并在专一位置上水解。     

线粒体基因组的研究 Ⅰ.猪肝线粒体基因组的限制性内切酶图谱

猪肝线粒体DNA经限制性内切酶BamHI、BglI、EcoRI和PstI水解分别切成5、3、3和4个片段,对这些片段的分子量进行了测定。EcoRI片段的顺序是以复制位移环(D-环)为基准通过部分水解产物的电泳和电镜分析确定的。BamHI、BglI和PstI的切割位点则根据双酶水解产物的分析,参照EcoRI位点进行定位,从而得到了由15个片段组成的物理图谱。猪肝线粒体DNA的分子量为10.40×10~6道尔顿,有15.76千碱基对。     

线粒体基因组的研究——Ⅰ.猪肝线粒体基因组的限制性内切酶图谱

猪肝线粒体DNA 经限制性内切酶BamHI、BglI、EcoRI 和PstI 水解分别切成5、3、3和4个片段,对这些片段的分子量进行了测定.EcoRI 片段的顺序是以复制位移环(D-环)为基准通过部分水解产物的电泳和电镜分析确定的。BamHI、BglI 和PstI 的切割位点则根据双酶水解产物的分析,参照EcoRI 位点进行定位,从而得到了由15个片段组成的物理图谱。猪肝线粒体DNA 的分子量为10.40×10~6道尔顿,有15.76千碱基对。     

懒猴高重复顺序DNA的核苷酸顺序分析及其与类α-DNA顺序的比较

为确知懒猴高重复顺序与灵长类类α顺序间的相互关系,我们将懒猴DNA经EcoRI酶切所得到的高重复顺序DNA的最小片段重组到质粒pUC~(12)上,经转化、筛选、鉴定得到含有懒猴高重复顺序片段的克隆,命名为pLS(EcoR Ⅰ)-1,测定其全部核苷酸顺序为641bp,发现该顺序有与类α顺序的相似性,但变异性较大,我们对此进行了讨论。     

C型产气荚膜梭菌α毒素基因的克隆与表达

利用PCR技术,从C型产气荚膜梭菌染色体基因组中扩增了1．2kb的α毒素基因,将纯化的PCR产物与载体pGEM-T连接,转化至受体菌JM109中,经NcoI／EcoRI和BamHI／EcoRI酶切鉴定及核苷酸序列测定证实,重组质粒pXCPAl中含有α毒素全基因。随后用NcoI／EcoRI酶切质粒pXCPAl,回收α毒素基因片段,插入到事先经同样酶切处理的载体pET-28c中相应酶切位点,构建了表达质粒pETXAl,经NcoI／EcoRI和BamHI／EcoRI酶切鉴定及核苷酸序列测定证实,表达质粒含有α毒素基因且基因序列和阅读框架正确。重组菌株BL21(DE3)(pETXAl)表达产物经ELISA检测和SDS-PAGE分析,重组菌株表达的α毒素蛋白能够被α毒素单抗识别,其表达量占菌体总蛋白相对含量的16．28％。     

人类线粒体肌酸激酶uMtCK的底物结合位点分析

研究人类线粒体肌酸激酶u Mt CK的结合位点,将其与底物肌酸和ATP结合有关的关键氨基酸进行突变,并对突变体进行酶动力学和圆二色谱数据分析,探讨这些关键氨基酸在底物识别和催化过程中的作用。结果显示,与野生酶相比,突变体Q313A和R336A的K_m~(Cr)分别提高了2.6和2.9倍,k_(cat)下降了19%和55%;同样地,与ATP结合相关的突变体R125A和R287A分别使得K_m~(ATP)升高了3.2和4.2,k_(cat)下降了72%和38%。以上结果表明突变体R125A、R287A、Q313A和R336A影响对底物的结合,同时也降低了酶促反应的速度。利用圆二色谱比较野生酶与不同突变体的二级结构并无明显变化,但进一步的结构模拟表明底物结合位点氨基酸在与底物之间的氢键对底物的识别和酶催化过程中发挥着重要作用。     

几种限制性核酸内切酶的纯化

通常所说的限制性内切酶或限制酶实际上是指Ⅱ类脱氧核糖核酸内切酶。此类酶能够识别双链DNA分子上的特定核苷酸顺序,并在这特定的顺序处将DNA的双链切断。各种不同的限制酶都有它自己的识别顺序,所产生的片段的末端电不尽相同。自从Smith于1970     

北京鸭肝脏线粒体DNA 2.17kb的EcoRI/BamHI片段的分子克隆

本文以质粒pAT153为载体,以E.coli SK1592为受体菌,将北京鸭肝脏mtDNA的2.17kb的EcoRI/BamHI限制片段进行了克隆,并对重组质粒作了限制性内切酶分析、Southern吸印与杂交分析。此外,还对重组体的一些性质作了初步研究,并对鸭肝mtDNA的另一个EeoRI/BamHI片段(2.81kb)不能被克隆的原因进行了讨论。     

蚯蚓纤溶酶底物特异性

蚯蚓纤溶酶是具有较强溶栓作用的丝氨酸蛋白酶,为研究蚯蚓纤溶酶在溶栓的同时是否对其他血液蛋白有破坏作用,本实验以一些血液功能蛋白为底物,用蚯蚓纤溶酶在体外对其进行水解,采用SDS—PAGE检测水解前后底物成分的变化。结果显示,蚯蚓纤溶酶短时间内能完全水解纤维蛋白和纤维蛋白原,长时间作用下能部分水解牛血清白蛋白和人免疫球蛋白重链,不水解牛血红蛋白、牛血超氧化物歧化酶和牛凝血酶原。表明蚯蚓纤溶酶对血栓成分具有较强的识别和水解能力,而对其他血液蛋白作用微弱,说明蚯蚓纤溶酶作为药物使用时具有较强的溶栓和预防血栓形成的作用,且副作用较小。     

小麦丛矮病毒（WRSV）的近全长cDNA基因文库的构建

用大肠杆菌Poly（A）聚合酶,在纯化的小麦丛矮病毒的单链基因组RNA3＇末端加多聚腺苷酸,以此RNA作模板,12－18寡聚脱氧胸核着酸作引物,合成cNDA后,分别用限制性内切酶PstI和EcoRI对该cDNA酶切,同时再分别用PstI单酶和SmaI与EcoRI双酶对pUC载体酶切,经连接、转化感受态细胞、筛选和酶切鉴定后,共得到10种不同大小的非定向克隆,其大小之和约14kb,同时还得到定向克隆47个。已知N蛋白基因3＇端含有SacI酶切位点,故在用限制性内切酶SacI对10种插入片段进行分析后发现,仅有约6kb的插入片段含有SacI位点,再用合成的与WRSVNN蛋白mRNA3＇端顺序相同的引物对该克隆进行顺序分析证明,它含有WRSVN蛋白、G蛋白、M蛋白和部分L蛋白基因。对47个定向克隆进行顺序测定后,用DNA顺序分析软件将它与其它几种弹状病毒基因组的3＇前导（leader）和5＇拖尾（trailer）RNA进行比较后发现,有两个定向克隆分别含有它们的3＇前导或5＇拖尾的高保守区顺序,构建了一个近全长的小麦丛矮病毒（WRSV）cDNA文库。     

胆碱脱氢酶的底物保护作用

胆碱脱氢酶（ＣＤＨ）是线粒体电子传递酶系的一个重要组成,它位于线粒体内膜。膜固有的ＣＤＨ与用去垢剂从线粒体上增溶下来的酶在性质上有一定差异,本文研究了温度、ＳＤＳ对增溶ＣＤＨ的失活作用,发现底物胆碱的存在有明显的保护作用,说明底物诱导ＣＤＨ产主构象变化．