三叶肽：从结构到功能

三叶结构域是一段由38－39个氨基酸组成的多肽序列,其中包含6个高度保守的半胱氨酸残基,这6个半胱氨酸残基以1－5,2－4,3－6的交联方式形成三对二硫,窝囊鑫肽链折叠成特征性的三叶结构。已发现的哺乳动物三叶肽有三种：pS1、SP及ITF。三叶肽通常位于消化道腔面的粘膜层,具有保护和修复功能,在维持粘膜的完整性中发挥着重要作用。     

三叶因子3的研究

三叶因子 3 (ｔｒｅｆｏｉｌｆａｃｔｏｒ 3 ,ＴＦＦ3 )是一种胃肠道粘膜修复因子 ,1 991年在大鼠ｃＤＮＡ文库中第一次被克隆 ,它由 60个氨基酸组成 ,分子中含有 7个Ｃｙｓ ,其中有 6个Ｃｙｓ以Ｃｙｓ1 Ｃｙｓ5 、Ｃｙｓ2 Ｃｙｓ4、Ｃｙｓ3 Ｃｙｓ6 的形式构成二硫键 ,形成一个状似叶片的紧凑结构 ,因而最初命名为小肠三叶因子 (ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｔｒｅｆｏｉｌｆａｃ ｔｏｒ,ＩＴＦ) [1] 。哺乳动物中有 3种三叶因子 ,分别为含有一个三叶结构域的乳腺癌相关肽(ＴＦＦ1或ｐＳ2 ) ,含有两个三叶结构域的解痉挛多肽 (ＴＦＦ2或ＳＰ)以及…     

三叶因子家族

三叶因子家族是一类具有特殊结构——P结构域的蛋白质家族, P结构域包含6个高度保守的半胱氨酸残基及精氨酸、甘氨酸、色氨酸和苯丙氨酸残基.半胱氨酸残基以Cys1-Cys5, Cys2-Cys4, Cys3-Cys6连接形成三个链内二硫桥.已发现多种含有P结构域的多肽,其中最引人注目的是TFF1/ pS2、TFF2/SP及TFF3/ITF,在正常组织中其主要表达位点分别为胃基底和胃体(TFF1/pS2)、胃窦深部的小凹（TFF2/SP）及小肠和大肠杯状细胞（TFF3/ITF）.TFF可能具有维持粘膜屏障和促进溃疡治愈的功能.TFF含有α折叠(α-helix),β片层(β-sheet).三叶因子家族多肽的作用机理仍处于猜测阶段,现有与粘蛋白共同作用和与受体作用两种假说.     

三叶木通促分裂原活化蛋白激酶基因mapk3的克隆及表达分析

植物MAPK信号途径在植物生长发育以及多种逆境胁迫响应和激素调控过程中发挥着至关重要的作用。本文利用RACE-PCR技术克隆三叶木通促分裂原活化蛋白激酶基因mapk3的全长c DNA序列,并对其进行生物信息学分析和时空表达分析。克隆所得的Aktmapk3基因的ORF全长序列为1 164 bp,编码387个氨基酸,其编码的蛋白具有ATP结合位点,MAPK激酶保守结构和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶激活位点,推测其可能通过被磷酸化而激活以及通过磷酸化下游蛋白而执行生理功能。实时荧光定量PCR结果显示,Aktmapk3基因在三叶木通各组织器官均有表达,在芽成熟叶片以及花中表达量比较高,在茎、幼叶和果肉中的表达量最低,暗示该基因可能参与了三叶木通芽的形成和花的发育。     

人三叶因子3在毕氏酵母中的表达及生物活性分析

利用PCR方法在人胎儿胎盘cDNA中扩增了人三叶因子3基因（hTFF3）,插入到含有AOX1启动子和α－因子信号肽序列的表达载体pPIC9K中,采用毕氏酵母表达系统对其进行了高效的分泌表达,并用G418筛选高拷贝整合转化子。2％甲醇诱导酵母表达48h后,上清经SDS－PAGE和Western印迹证明重组蛋白质以双体的形式分泌表达,占总蛋白质的45％,能被抗hTFF3抗体所识别。表达产物经S－Sepharose、Q-Sepharose离子交换及Sephacryl S-100纯化后纯度达到95％以上。体内生物学活性研究证实hTFF3可有效的防止盐酸诱导的大鼠胃溃疡。     

三叶木通花粉前纤维蛋白基因的克隆与表达

以三叶木通花蕾为材料,采用RT-PCR、3-′RACE方法克隆了三叶木通花粉前纤维蛋白基因,命名为Atf-Pro(GenBank登录号GQ478584)。结果表明:AtfPro的cDNA全长735 bp、阅读框393 bp、编码131个氨基酸,有1个342 bp的3′端非翻译区。预测分子量约为14.081 kD,等电点4.74。氨基酸和核苷酸序列的同源性分析发现,AtfPro基因属于植物花粉profilin基因家族的新成员。RT-PCR定性分析表明,AtfPro基因在三叶木通花蕾、花药、雌花花瓣和柱头组织中均有表达,但在幼叶、茎尖、根尖组织中低水平表达或不表达,生殖器官中的表达时期从花序分化发育开始到开花散粉结束。     

三叶木通转录组分析及三萜皂苷生物合成途径关键酶基因的发掘

为了解三叶木通(Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.)的三萜皂苷合成途径及其关键酶,本研究对其花、叶、根、茎进行转录组测序,组装获得了57.25 Gb数据,含140 859个unigenes,序列平均长度为1350 bp。KEGG代谢通路富集结果显示,517个unigenes参与三萜皂苷合成相关的3条代谢途径,其中415个unigenes编码三萜皂苷生物合成途径的19个关键酶。对三萜皂苷生物合成过程中的关键酶角鲨烯环氧酶(SE)进行序列分析和同源建模,发现其具有保守的底物结合结构域。将三叶木通茎与花、叶、根的基因表达水平进行比较,发现茎与根相比较其上调基因数目最多,其中295个差异表达基因(DEGs)与三萜皂苷生物合成途径相关。     

三叶木通光敏色素A基因的序列及表达分析

光敏色素( phytochrome,简称PHY)是植物体内最重要的光受体,参与调节植物种子萌发、幼苗生长、茎的伸长、子叶伸展直至开花控制等许多生理过程。该研究通过RT-PCR方法首次从三叶木通( Akebia trifoli-ata)中获得了编码光敏色素A的cDNA序列(命名为AktrPHYA1,GenBank登录号为KP864055)。结果表明：该序列由3496 bp组成,包含一个3426 bp的完整开放阅读框,编码1141个氨基酸。 AktrPHYA1编码的蛋白N端为光感受区域,包括一个GAF结构域、一个PHY结构域;C端为光调节区域,C端包括两个PAS结构域、一个组氨酸激酶A结构域和一个类似组氨酸激酶的ATP 激酶结构。同源蛋白比对显示,AktrPHYA1与耧斗菜、荷花的同源蛋白序列一致性分别为83％和82％。遗传进化树分析表明,单子叶植物和双子叶植物的光敏色素A基因分别聚为两支;在双子叶植物中,AktrPHYA1与耧斗菜、荷花PHYA聚在一起,说明三叶木通与耧斗菜、荷花遗传关系较近。 AktrPHYA1在三叶木通茎、叶片、雄花、雌花、种子中均有表达,且在种子中表达最强,在叶片中表达量最低。 AktrPHYA1的组织表达谱暗示了其在植物中可能的功能。该研究结果为三叶木通光敏色素A基因的功能研究奠定了基础。     

三叶因子:从实验室研究到临床医学

三叶因子（trefoil factor, TFF）家族是具有一个或多个三叶因子结构域的蛋白质多肽,在进化上具有高度的保守性,具有耐热、耐酶消化的理化特性。哺乳动物的TFF有三个成员(TFF1、TFF2和TFF3)。黏膜组织,如胃肠道和呼吸道黏膜等是TFF的主要合成场所。生理条件下,TFF的分布具有组织专一性,具有黏膜保护和创伤修复作用。TFF在肿瘤组织中广泛表达,在肿瘤的发生、发展、侵袭、转移过程中发挥着重要作用,可能是癌基因在对不同刺激做出反应时的共有递质。TFF生物学功能存在一个复杂的调控过程,单链TFF可通过膜受体而激活相关信号通路,TFF也可以通过与其它蛋白质的结合而协同发挥作用。TFF在临床医学领域主要运用在黏膜保护、黏膜损伤相关疾病的预防和治疗及肿瘤病理的诊断与干预等方面。TFF的作用机制和功能行使相关信号通路仍然是目前研究的重点,TFF与βγ-晶状体蛋白天然复合物的发现有助于对TFF的进一步认识和深入研究。     

胃肠内分泌学的新进展

本文对胃肠内分泌学的特点以及胃肠激素和肽类的化学、生理学的新进展作了简要的介绍。胃肠内分泌学近十余年来进展迅速,一些老激素的分离、提纯、阐明化学结构和人工合成,一些新激素和肽类的发现,使这一部分科学的面貌为之一新。胃肠激素和肽类是由个别地散处于胃肠道粘膜上皮细胞之间的内分泌细胞所分泌。由于胃肠道粘膜的面积特别大,胃肠内分泌细胞的总数超过机体所有其它内分泌细胞的总和,因而消化道粘膜被认为是机体内最大最复杂的内分泌器官。另一值得注意的现象是:有些存在于神经系统中的肽类,也在消化道内发现;而原先在消化道内发现的,现在也在神经系统中找到。此现象的生理意义,尚有待进一步明确。