核酸靶序列的体外选择和扩增技术

核酸靶序列的体外选择和扩增技术王成济（第四军医大学生化教研室,西安７１００３２）关键词寡聚核苷酸,体外选择,ＰＣＲ基因表达的转录水平调控很大程度上依赖于基因的顺式调控元件（ｃｉｓ－ａｃｔｉｎｇｅｌｅｍｅｎｔｓ）与反式调节因子（ｔｒａｎｓ－ａｃｔｉｎｇ...     

植物基因表达调控的机制：核因子作用

植物基因表达调控的机制：核因子作用邵宏波（四平师范学院生物工程研究所四平１３６０００）１引言真核生物的转录启始是由顺式作用的ＤＮＡ基序（ｅｔｓ－ａｃｔｉｎｇＤＮＡｍｏｔｉｆ）与反式作用的蛋白质因子（ｔｒａｎｓ－ａｃｔｉｎｚｎｒｏｔｅｉｎｆａｃｔｏｒ）...     

羟基脲促进HEL细胞分化机制的研究

以往研究表明, 用羟基脲诱导人红白血病细胞（ＨＥＬｃｅｌｌ）后, 能促进成年型β珠蛋白基因表达, 使ＨＥＬ细胞趋向终末分化。本文试图进一步揭示羟基脲诱导ＨＥＬ细胞分化的分子机制。ＧＭＳＡ 与Ｗｅｓｔｅｒｎ 印迹分析结果显示, 随着羟基脲诱导ＨＥＬ 细胞时间延长, 细胞核内的ＧＡＴＡ１ 转录因子的含量增加, 它与β珠蛋白基因５＇旁侧ＤＮＡ 序列内一个正调控序列（ＰＣＲ：－ ２２３～－ １９４ ｂｐ） 以及人工合成的ＧＡＴＡＤＮＡ 序列结合能力增加; 与此相反,细胞核内的ＧＡＴＡ２ 转录因子的含量下降, 它与ＧＡＴＡＤＮＡ 序列结合能力也下降。此外, 还检测到在羟基脲诱导ＨＥＬ细胞后, 核内与ＹＹ１ 类似的一个转录因子含量也迅速下降。实验结果表明ＧＡＴＡ２ 可能在红系细胞早期分化中起重要作用, 而ＧＡＴＡ１ 则在红系细胞终末分化过程中起调控作用。推测类似ＹＹ１ 的一个转录因子可能具有抑制ＨＥＬ细胞趋向终末分化的功能     

酵母RNA聚合酶Ⅱ转录活性的调控研究进展

真核生物基因转录活性的调控过程十分复杂,许多蛋白质在这一过程中发挥作用。酵母中对ＲＮＡ聚合酶Ⅱ转录活性的调控可分为以下４种类型：（１）阻遏物的直接抑制作用;（２）阻遏物的间接抑制作用;（３）激活物的直接活化作用;（４）激活物的亚细胞定位调节作用。本文拟就近来酵母中ＲＮＡ聚合酶Ⅱ转录活性的上述４种调控机制的研究进展作一综述。１　阻遏蛋白的直接抑制作用１．１半乳糖代谢作用的调控　目前对于酿酒酵母（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）利用半乳糖（包括摄取、转运、代谢等）的过程以及相关酶基…     

利用大肠杆菌克隆在原核生物中有活性的油菜基因启动子

利用本室构建的基因启动子探针型载体ｐＳＵＰＶ４直接在大肠杆菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａｃｏｌｉ（Ｍｉｇｕｌａ）ＣａｓｔｅｌａｎｉｅｔＣｈａｌｍｅｒｓ）中分离油菜（ＢｒａｓｉｃａｎａｐｕｓＬ．）基因启动子片段,获得卡那霉素抗性重组子３３个。对重组子ｐＲＰ１０做了进一步鉴定：Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交表明ＲＰ１０片段来自油菜基因组,并与基因组中的另一些序列具有同源性;ＲＰ１０片段５′端区域的缺失可使卡那霉素抗性水平从１００ｍｇ／Ｌ降至２５ｍｇ／Ｌ,说明缺失的序列可能影响基因转录效率;序列分析发现ＲＰ１０片段内存在几个真核基因启动子的保守序列;用根癌农杆菌（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍｔｕｍｅｆａｃｉｅｎｓ（ＳｍｉｔｈｅｔＴｏｗｎｓｅｎｄ）Ｃｏｎｎ）转化法将ＲＰ１０ＧＵＳ基因转入油菜,组织化学分析显示ＲＰ１０在愈伤组织中可以启动融合的ＧＵＳ基因表达     

棉花法呢基焦磷酸合酶cDNA克隆、序列分析及其在种子发育过程中的表达特征

根据法呢基焦磷酸合酶（ＦＰＳ）保守域设计简并引物,应用ＮｅｓｔＰＣＲ和ＰＣＲ９６孔板筛库技术分离到亚洲棉（ＧｏｓｙｐｉｕｍａｒｂｏｒｅｕｍＬ．）法呢基焦磷酸合成酶的ｃＤＮＡ。序列分析表明,该ｃＤＮＡ全长１２８０ｂｐ,开放阅读框共编码３４２个氨基酸残基,推断蛋白质分子量约为３９ｋＤ,推测的氨基酸顺序与拟南芥和青蒿的ＦＰＰ合酶序列同源性为７８９％和８０７％。应用ＲＴＰＣＲ定量分析ｆｐｓ１基因在“苏棉６号”（Ｇ．ｈｉｒｓｕｔｕｍＬ．ｃｖ．“Ｓｕｍｉａｎ６”）种子发育过程中的表达特征,发现从胚珠开始形成种子（开花后２０ｄ）至种子成熟（开花后４０ｄ）,ｆｐｓ１ｍＲＮＡ转录水平发生明显变化。在种子发育早期,开花后２０ｄ至２７ｄｆｐｓ１基因保持相对稳定的表达水平;但从开花后２７ｄ到种子成熟,ｆｐｓ１ｍＲＮＡ的转录水平迅速增高,此期倍半萜棉毒素在种子中的积累亦呈明显的增长趋势,完全风干成熟的种子中倍半萜棉毒素的含量可达１３ｍｇ／ｇ。推测ｆｐｓ１基因在转录水平参与种子中倍半萜类物质合成的调控。     

架棚中酚类化合物的研究

从架棚（ＣｅｒａｔｏｓｔｉｇｍａｍｉｎｕｓＳｔａｐｆｅｘＰｒａｉｎ）的乙酸乙酯部分分离得到１４个酚类化合物。经波谱技术,特别是２ＤＮＭＲ技术鉴定,其中化合物ｐｌｕｍｂｏｃａｔｅｃｈｉｎｓＡ（１）和Ｂ（２）为新化合物。其他１２个化合物被分别鉴定为ｐｌｕｍｂｏｌａｃｔｏｎｅＡ（３）、ｐｌｕｍｂａｂｉｃａｃｉｄ（４）、ｉｓｏｓｈｉｎａｎｏｌｏｎｅ（５）、ｅｐｉｓｏｓｈｉｎａｎｏｌｏｎｅ（６）、Ｎｔｒａｎｓｃａｆｅｏｙｌｔｙｒａｍｉｎｅ、Ｎｔｒａｎｓｆｅｒｕｌｏｙｌｔｙｒａｍｉｎｅ、ａｐｏｃｙｎｉｎ、ｖａｎｉｌｉｃａｃｉｄ、ｓｙｒｉｎｇｉｃａｃｉｄ、ｇａｌｏｃａｔｅｃｈｉｎ、（＋）ｃａｔｅｃｈｉｎ和１,２,６ｔｒｉＯｇａｌｏｙｌｇｌｕｃｏｓｅ。     

新书介绍

《转录因子》(ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎＦａｃｔｏｒｓ)Ｊ .Ｌｏｃｋｅｒ编著 ,2 0 0 1年ＢＩＯＳＳｃｉｅｎｔｉｆｉｃＰｕｂｌｉｓｈｅｒｓＬｉｍｉｔｅｄ出版 ,336页。本书着重于基本机制和在真核细胞中调控转录的因子。检查了调节基因表达的调控系统 ,以及整个哺乳动物生物体局部调节基因表达的更多的特殊系统。内容有 :ＲＮＡ聚合酶ＩＩ转录机制 ;转录的染色质结构和调节 ;转录因子的ＤＮＡ结合 ;细胞周期转录调节 ;胞外信号转录调节 ;早期淋巴细胞发育的转录调节 ;核受体激素和代谢的转录整合 ;神经转录因子等等。《钙信号》(Ｃａ…     

江西二叠-三叠系界线层的牙形刺及Hindeodus-Isarcicela的演化谱系

对江西修水清水岩乡东岭剖面和乐平沿沟剖面的再研究表明,ＨｉｎｄｅｏｄｕｓｐａｒｖｕｓＭｏｒｐｈｏｔｙｐｅ１在东岭剖面首现于大冶组的最低层位,生物地层界线与岩石地层界线一致,仅比事件地层界线高５－６ｃｍ。沿沟剖面Ｈｉｎｄｅｏｄｕｓｐａｒｖｕｓ带厚仅３６ｃｍ,其首现与岩石地层界线也一致。张克信等提出的Ｈ．ｌａｔｉｄｅｎｔａｔｕｓ→Ｈ．ｐａｒｖｕｓ→Ｈ．ｔｕｒｇｉｄｕｓ→Ｉ．ｉｓａｒｃｉｃａ的演化谱系需作进一步修正。依据华南的资料,本文第一作者提出新的演化谱系：Ｈ．ｌａｔｉｄｅｎｔａｔｕｓ→Ｈ．ｐａｒｖｕｓ→Ｉ．ｓｔａｅｓｃｈｅｉ→Ｉ．ｉｓａｒｃｉｃａ。Ｈ．ｔｕｒｇｉｄｕｓ并不在此演化系列中,它属Ｈｉｎｄｅｏｄｕｓ的另一分枝。二叠三叠系界线层的牙形刺应区分出浮游相与浅水相。在浮游相,牙形刺序列为：（１）ＣｌａｒｋｉｎａｃｈａｎｇｘｉｎｇｅｎｓｉｓＣ．ｄｅｆｌｅｃｔａ带,（２）Ｃ．ｃａｒｉｎａｔａ带,（３）Ｃ．ｐｌａｎａｔａ带。在浅水相,牙形刺序列为：（１）Ｈ．ｌａｔｉｄｅｎｔａｔｕｓ带,（２）Ｈ．ｐａｒｖｕｓ带,（３）Ｉ．ｓｔａｅｓｃｈｅｉ带,（４）Ｉ．ｉｓａｒｃｉｃａ带,（５）Ｈ．ｐｏｓｔｐａｒｖｕｓ带     

抗σ因子

Ｔ4噬菌体的ＡｓｉＡ可以抑制大肠杆菌的σ70 因子 ,因而称为抗σ70 因子 ,调节Ｔ4噬菌体早期基因的转录。细菌中的ＦｌｇＭ ,是抗σ2 8因子在细菌鞭毛形成过程中起调控作用。ＦｌｇＭ比较特殊 ,天然形式是未折叠的。枯草杆菌(Ｂａｃｉｌｌｕｓｓｕｂｔｉｌｉｓ)的ＳｐｏＩＩＡＢ可抑制芽孢形成过程的专一性σ因子σＦ 和σＧ。该菌中的另一个抗σ因子是ＲｓｂＷ可以抑制应急反应中基因转录所需的σＢ 因子。此外 ,在真细菌类中 ,发现一类新的具内膜接合特性的抗σ因子 ,调控着具有胞外功能蛋白的基因表达 ,因而被分作抗σ因子的细胞外因子 …     

青蒿转杜松烯合成酶基因发根系的培养

将已克隆的棉花杜松烯合成酶的ｃＤＮＡ（ｃａｄＣ１４）插入到植物表达载体ｐＢＩ１２１中,构建含ＣａＭＶ３５Ｓ启动子驱动下的杜松烯合成酶基因的植物表达载体ｐＢＩＣ１４。用含ｐＢＩＣ１４质粒的发根农杆菌（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍｒｈｉｚｏｇｅｎｅｓ）１５８３４感染青蒿（ＡｒｔｅｍｉｓｉａａｎｎｕａＬ．）叶片并诱导发根,共建立１２１个生长迅速的发根系。经浓度为２０ｍｇ／Ｌ的Ｋａｎ筛选,获得１２个抗Ｋａｎ阳性根系。ＰＣＲ和Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔｉｎｇ分析表明,外源杜松烯合成酶基因已整合到青蒿基因组中,其转基因频率为３％。ＲＴＰＣＲ分析表明,外源杜松烯合成酶基因在Ｃ３７根系中,在转录水平上已有表达。     

痢疾福氏2a asd基因的克隆及其序列分析

本文根据大肠杆菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）Ｋ１２ａｓｄ基因两侧序列设计了一对引物,用全菌ＰＣＲ扩增了福氏２ａ Ｔ３２株的ａｓｄ基因及其两侧序列。对ＰＣＲ产物的初步结果表明,在ａｓｄ基因两端存在ＢａｍＨ Ｉ位点。为了防止由ＰＣＲ扩增带来的差错,我们又从福氏２ａ Ｔ３２株染色体中克隆了全长的ａｓｄ基因。序列分析了结果表明,福氏２ａＴ３２株ａｓｄ基因的序列与Ｅ．ｃｏｌｉ Ｋ１２的完全一致,全长１６８０ｂｐ,其两侧     

粘细菌转录因子FruA的表达、纯化及调控作用

ＦｒｕＡ是粘细菌（Ｍｙｘｏｃｏｃｃｕｓ ｘａｎｔｈｕｓ）发育所必需的转录因子,影响着一系列发育特异性基因的表达,在大肠杆菌中表达了带组氨酸标记的ＦｒｕＡ,并用镍离子层析进行快速分离纯化。凝胶阻滞试验提示ＦｒｕＡ对靶基因的调控可能需要其它因子的参与。     

cAMP反应序列结合蛋白及其家族与转录调节

ｃＡＭＰ反应序列结合蛋白（ｃＡＭＰ－ｒｅｓｐｏｎｓｉｖｅｅｌｅｍｅｎｔｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎ,ＣＲＥＢ）经磷酸化激活后,可参与ｃＡＭＰ诱导的多种靶基因的转录调控。新近研究表明,ＣＲＥＢ的转录调节作用可能是通过ＣＲＥＢ结合蛋白（ＣＲＥＢ－ｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎ,ＣＢＰ）实现的。在神经系统中,ＣＲＥＢ可能介导神经递质诱导的基因表达,并能通过放大神经营养因子的信号,参与神经细胞增殖、分化、存活等生物效应。     

环状芽孢杆菌C-2几丁酶基因的克隆

环状芽孢杆菌（Ｂａｃｉｌｕｓｃｉｒｃｕｌａｎｓ）Ｃ２总ＤＮＡ经ＰｓｔＩ部分酶切后分离２～１０ｋｂ的片段,插入质粒ｐＵＣ１９的ＰｓｔＩ位点,转化大肠杆菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａｃｏｌｉ）,利用几丁质平板从约８０００个重组子中筛选到一个几丁酶基因阳性克隆（命名为ｐＣＨＴ１）。用１２种限制酶对重组质粒进行的酶切分析表明,重组质粒中的插入片段长３０ｋｂ,其中各有一个ＫｐｎＩ,ＳａｃＩ和ＳｓｐＩ位点。把该克隆片段反向插入ｐＵＣ１９的ＰｓｔＩ位点所得到的重组子同样具有几丁酶基因表达活性,说明此片段含有一个完整的几丁酶基因,其自身的启动子能被大肠杆菌转录系统所识别。Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交证实了该片段来自于Ｂ．ｃｉｒｃｕｌａｎｓＣ２基因组,且以单拷贝形式存在,它不能与来自于其它７株几丁酶产生菌的总ＤＮＡ杂交。     

大鼠星形胶质细胞组织因子活性的表达及其调控

本实验观察了基础培养条件和凝血酶刺激条件下,大鼠星形胶质细胞组织因子活性的表达及其信号传递途径。结果显示,基础条件下,Ａ２３１８７（４ｂｒｏｍｏｃａｌｃｉｕｍｉｏｎｏｐｈｏｒｅ）和佛波醇脂（ｐｈｏｒｂｏｌ１２ｍｙｒｉｓｔａｔｅ１３ａｃｅｔａｔｅ,ＰＭＡ）能明显提高星形胶质细胞组织因子活性的表达,而三氟吡啦嗪（ｔｒｉｆｌｕｏｐｅｒａｚｉｎｅ,ＴＦＰ）和１（５异喹啉磺胺）３甲基哌嗪［１（５ｉｓｏｑｕｉｎｏｌｉｎｙｌｓｕｌｆｏｎｙｌ）３ｍｅｔｈｙｌｐｉｐｅｒａｚｉｎｅ,Ｈ７］则降低星形胶质细胞组织因子活性的表达。凝血酶能明显增加星形胶质细胞表达组织因子活性;当凝血酶与ＴＦＰ或Ｈ７联合应用时,凝血酶的刺激作用受到明显抑制。实验表明,星形胶质细胞在基础培养条件下能表达组织因子,凝血酶能刺激它表达组织因子活性。Ｃａ２＋／钙调素和ＰＫＣ途径参与了在基础条件以及凝血酶刺激条件下星形胶质细胞组织因子活性的表达。     

巨大芽孢杆菌α-淀粉酶基因核苷酸序列分析

巨大芽孢杆菌（Ｂａｃｉｌｕｓｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ）ＡＳ１．１２７的淀粉酶基因的全碱基序列已被测定。结构基因由１９８２ｂｐ的单一开读框架组成。由ＤＮＡ序列推测出的前体酶蛋白由６５９个氨基酸组成,Ｎ端３３个氨基酸为信号肽。成熟酶分子由６２６个氨基酸组成,分子量为６８６７６ｋＤ。该淀粉酶属糖化型α淀粉酶。并与枯草杆菌（Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ）１６８产生的糖化型α淀粉酶之间有８３３％的同源性。分析发现两种菌产生的酶分子的Ｎ端３／４的同源性为９０４％,而Ｃ端１／４的同源性只有７０％。序列排比结果说明在淀粉酶基因的趋异进化过程中,基因突变和遗传重组都曾起过作用。     

木质素过氧化物酶基因5'端上游调控序列的分析

黄孢原毛平革菌（Ｐｈａｎｅｒｏｃｈａｅｔｅｃｈｒｙｓｏｓｐｏｒｉｕｍ）能产生降解木质素的胞外木质素过氧化物酶（ＬＩＰ） 和锰过氧化物酶（ ＭｎＰ）同工酶。为研究ＬＩＰ基因的转录调控机理, 对ＬＩＰ基因（ ＧＬＧ３ 和ＧＬＧ６） 的５′端上游序列进行亚克隆, 获得６ 个亚克隆ＤＮＡ 片段, 然后应用凝胶迁移率变动分析技术筛选能与菌体蛋白质专一性结合的ＤＮＡ片段。结果表明： ＬＩＰ基因ＧＬＧ６ 的５′端上游有一个约６７０ ｂｐ 的ＤＮＡ 片段能与总蛋白质组分专一性结合, 其核苷酸序列分析表明该片段可能含有蛋白质结合的序列特征。研究结果初步显示, 黄孢原毛平革菌可能存在有与ＬＩＰ基因上游某些顺式调控元件相互作用的蛋白质, 调控着ＬＩＰ基因的转录表达。     

四川盆地第四纪哺乳动物群的演替

在新发现的北碚天台山、华蓥天池、合川三汇坝等哺乳动物化石群研究的基础上,综合四川盆地及盆周山地１５个化石群的资料,应用动物生存时代几率、断代动物、动物绝灭率的分析和年代学数据的比较等方法,判断了各动物群的时代,划分出四川盆地第四纪哺乳动物群的５个演化阶段（３个动物群含４个亚群）：早更新世的Ａｉｌｕｒｏｐｏｄａｍｉｃｒｏｔａ动物群;中晚更新世的ＲｈｉｎｏｃｅｒｏｓｓｉｎｅｎｓｉｓＭｅｇａｔａｐｉｒｕｓａｕｇｕｓｔｕｓ动物群,包括Ａ．ｍｄａｎｏｌｅｕｃａｆｏｖｅａｌｉｓＨｙａｅｎａｓｉｎｅｎｓｉｓ亚群（Ｑ２）和Ａ．ｍ．ｂａｃｏｎｉＣｒｏｃｕｔａｕｌｔｉｍａ亚群（Ｑ３）;全新世的Ａ．ｍ．ｍｅｌａｎｏｌｅｕｃａＤｏｍｅｓｔｉｃ动物群,包括Ｒ．ｓｏｎｄａｉｃｕｓＳｕｓｄｏｍｅｓｔｉｃａ亚群（Ｑ４中后期）和田野城镇（ＦｉｅｌｄＴｏｗｎ）亚群     

酵母PHO85结合蛋白PAP1基因的克隆和表达

酵母调探因了ＰＨＯ８５是一个依赖于细胞周期蛋白（ｃｙｃｌｉｎ）的蛋白酶（ＣＤＫ）,参与对细胞周期和酸性磷酸酯酶基因表达的调控。冯ＰＨＯ８５为靶分子,利用酵母的染色体基因文库中克隆到了一个新的与ＰＨＯ８５相结合的蛋白因子的基因,利用酵母双杂交（ｔｗｏ－ｈｙｂｒｉｄ）系统从酵母的染色体基因文加中克隆到了一个新的与ＰＨＯ８５相结合的蛋白因子的基因,将此蛋白质命名为ＰＡＰ１（ＰＨＯ８５ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ