DNA载体的数据分类及查询系统的开发和应用

DNA载体是基因工程中一个重要的工具,从1977年组建了第一个载体到现在,裁体的数量已经达到上百种.为了更好、更充分地利用这些载体为科研人员服务,设计了DNA载体的数据分类及查询系统软件.DNA载体的数据分类及查询系统包括3个模块:数据输入模块、数据查询模块和数据计算模块.首先将载体按照功能的不同进行分类和编号,建立一个较完整的载体数据库.然后利用查询和计算功能,令用户快速地查找到其需要的载体.     

放射治疗网络系统的设计和应用

目的:研发放射治疗计划和放射治疗信息管理系统。方法:放疗网络采用客户机服务器模式,Oracle 9i为数据库服务器;使用PowerBuilder9i为编程语言进行开发。结果:该系统包括医生模块(放射治疗计划模块)、技术员模块、物理师模块、放射治疗电子病历查询和统计模块、系统管理模块五个部分。结论:该系统运行稳定,数据安全可靠,操作简单,可作为科室信息化建设的重要组成部分。     

结合基因表达数据和ChIP-chip数据的酵母转录调控模块的识别

活细胞依赖其众多的转录调控模块来实现复杂的生物功能,识别转录调控模块对深入理解细胞的功能及其转录机制有着重要的意义。本文结合酵母基因表达数据和ChIP-chip数据,提出了一种转录调控模块识别算法。该算法通过采用不同的P值阈值分别得到了核心集和粗糙集,然后对核心集和粗糙集进行判别,最后对基因进行扩展之后得到基因转录调控模块。将该算法运用到两个酵母基因表达数据中,得到了一些具有显著生物学意义的基因转录调控模块。与其它算法相比,该算法不仅可以识别含有较多基因的转录调控模块,而且可以识别一些其它算法不能识别的基因转录调控模块。识别得到的基因转录调控模块有着不同的生物学功能,并且有助于进一步理解酵母的转录调控机制。     

基于ComGIS的区域景观格局监测信息系统

从区域景观生态数据科学管理和景观格局动态分析的需要入手,以陕北纸坊沟流域作为设计和应用实例,采用地理信息系统组件MapX与可视化编程语言Delphi相结合的方式研制和开发了区域景观格局监测信息系统;文中首先对系统设计路线和建立方法进行简要说明,然后详细介绍了系统的基本结构和功能:该系统主要由数据管理模块、查询管理模块、景观指标分析和景观预测模块组成,实现了景观属性和景观图形数据的有机集成和高效管理,提供景观空间信息的显示、定位和交互查询,在此基础上计算景观类型和整个景观层次上的各种景观指数来实现景观格局综合分析,并且能够对景观发展趋势进行模拟预测,同时可以动态生成统计图表,形象直观地反映出不同时期内景观格局的发展变化规律.     

视网膜脱离病史管理系统的裂孔分析

材料与方法 视网膜脱离病史管理系统由两大模块构成:数据库文件管理模块和医学统计模块,具有输入、查询、修改和统计等多项功能。 住院的视网膜脱离病人双眼均放大瞳孔,用检眼镜与三面镜压陷法检查。将检查的眼底情况记录于表格及眼底绘图中,并一一填入电脑登记表,输入IBM-PC储存。 视网膜脱离裂孔分为马蹄形裂孔、圆形裂孔、锯齿缘裂孔、黄斑裂孔与巨大裂孔。     

基于属性分离存储的种质数据组织方法

传统的作物种质数据组织方法,针对不同作物种类建立不同数据表,这种方法已不能有效适应种质数据综合分析的需要.本文提出了一种基于属性分离存储的种质数据组织方法,根据种质的每个属性分别建立数据表,各属性间没有从属关系.该方法可统一数据查询操作,优化查询过程,提高分析效率,具有灵活、可扩展的特点,可以方便地集成与种质分析相关的数据,适用于种质资源分布式数据库和相关信息系统的建立.     

茶树病虫害多媒体数据库的开发研究

本介绍了应用Ｖｉｓｕａｌ ｆｏｘｐｒｏ６．０语言、结合我我媒体技术开发茶树病虫害数据库的结果。该数据库包括：４２种茶树害虫和２１种茶树病害的鉴别、咨询知识库,主要病虫的测报、防治决策专家系统,常用农药知识库及系统维护等模块,是一种查询简便、计算的茶树病虫计算机决策系统。     

灾难及突发事件住院信息管理系统的开发与实现

本文从系统设计目标、功能设计、结构设计等几个方面论述了灾难及突发事件住院信息管理系统的开发与实现。该系统由六大模块构成,实现了从预约管理、住院信息管理、床位管理、伤情评分、感染监测、查询统计到打印输出的灾害及突发时间住院伤病员信息全过程管理。应用本系统可规范灾害及突发事件医疗救援保障流程,大大提高了住院伤病员信息管理水平和工作效率。     

灾难及突发事件住院信息管理系统的开发与实现

本文从系统设计目标、功能设计、结构设计等几个方面论述了灾难及突发事件住院信息管理系统的开发与实现。该系统由六大模块构成,实现了从预约管理、住院信息管理、床位管理、伤情评分、感染监测、查询统计到打印输出的灾害及突发时间住院伤病员信息全过程管理。应用本系统可规范灾害及突发事件医疗救援保障流程,大大提高了住院伤病员信息管理水平和工作效率。     

基于Web的水稻芯片数据注释和分析平台

国际水稻基因组测序计划(IEGSP)顺利完成, 水稻基因的研究也进入了后基因组研究阶段. 水稻基因芯片数据注释分析是一项重要的功能基因组学研究内容, 它为理解水稻基因的生物学意义提供了帮助. 本研究开发了一个基于Web的水稻基因芯片数据注释和分析平台(RiceChip), 它比同类的注释数据库更加全面快捷. 本平台共由5个功能模块组成: BioChip模块为水稻基因表达数据提供快速检索和高级检索, 可依次按照Probe Set ID, Locus ID, Analysis Name等字段进行检索; BioAnno模块整合多个生物学数据库, 为水稻基因提供基因功能、蛋白质结构、生物代谢途径以及转录调控等方面的注释信息; BioSeq模块则收集水稻基因组的序列信息, 支持对水稻基因与芯片探针的序列查询; BioView模块是系统图形可视化的核心模块, 提供友好的访问界面与结果输出, 方便研究人员使用; BioAnaly模块结合R/Bioconductor统计分析工具提供高通量芯片数据的在线分析. 本系统从不同的方面依次提供了数据检索、基因注释、序列分析、数据可视化和数据分析等功能, 其数据收集的全面性与功能分析的强大性在同类水稻基因芯片数据注释和分析平台中都较突出.     

封面说明

<正>以前人的研究数据以及综述总结为基础,封面图为SAGA复合物(Spt-AdaGcn5 Acetyltransferase complex)的结构模式图,包括了19个亚基体内的基本分布情况。圆圈的大小模拟代表蛋白的相对大小。虚线代表前人已经有实验验证两者之间存在遗传或生化的相互作用。颜色代表不同的模块,绿色代表乙酰化功能模块,橙色代表去泛素化功能模块,蓝色代表TATA结合蛋白相关模块,黄     

影响因子(IF)即输即现快速查询的实现

影响因子不仅是期刊影响力和有用性的重要指标,而且往往是科研工作者选择拟投稿期刊时所关注的重要因素之一。随着目前国际期刊数量的迅猛增长,影响因子的快速查询便成为一项重要工作。本文在传统的查询检索服务的基础上,构建了一个人性化的期刊影响因子查询的Web应用IFSearch,提供了一种快捷高效的查询服务,通过实现即输即现搜索的用户体验,提高了查询的便利性与效率,对于作者投稿选择合适的期刊具有一定参考价值(http://biocompute.bmi.ac.cn/IF-SearchEngine)。     

脑Willis环循环分析专用软件研制Ⅱ．临床应用

前一篇文章中描述了此软件的流程和各模块的功能,在这篇中将叙述此软件在临床上的实际应用,从而不仅说明了软件具有着实用价值,还说明了软件中所采用的算法模型是符合生理实际的,在临床应用上也是切实可行的。     

国家野外试验站现状分析及网络化体系构建

为了推动筹建国家级重点野外科学观测试验站网络化管理的工作,充分发挥野外试验站所观测数据的作用.我们选取了25个野外试验站作为试点站,并于2002年8月至10月主要采用调查表、网上查询和电子邮件交流的方式进行调查,调研的主要内容涉及各野外台站的基本情况、软硬什和网络以及数据集现状,以及国外野外台站的运行状况和发展趋势.通过调查结果的分析,表明目前我国野外台站在数据监测、管理以及数据标准化与共享方面存在较多的不足之处.据此提出建立网络台站管理体系的框架,为实现我国国家级野外试验站数据标准化与信息共事的目标奠定基础.     

构建基于EBI数据库的本地SRS服务系统

为了建立基于EBI数据库的本地SRS服务系统,进而为生物医学研究人员提供方便、快速搜索EBI常用生物数据库的web服务,同时提供一套技术机制为其他生物医学研究机构建设自己的SRS服务系统提供参考。在Linux系统和Tomcat环境下安装调试EBI提供的SRS8.1学术版软件,并利用perl和shell程序设计语言开发EBI数据库的自动下载和定期更新模块。完成了本地SRS系统的安装和测试,实现了EBI数据库的自动下载和更新机制,目前系统已经正常运行。     

血红蛋白结构及其携氧功能的软件平台开发

血红蛋白及其携氧功能的软件平台（HBMS）是运用JavaEE的技术开发的关于血红蛋白空间结构和携氧功能的查询软件平台,通过该平台可快速查询血红蛋白的结构和功能的一些特性。HBMS提供了血红蛋白的各级空间结构的查询,同时可以计算出不同氧分压下血氧饱和度的变化并绘制血氧饱和度曲线,用以解析血红蛋白的输送氧气的能力。该系统并提供了血红蛋白结构及其携氧功能的免费查询网站（地址：http：／／192.168.1．25：8050／sybms／）。     

基于节点-模块置信度及局部模块度双重约束挖掘前列腺癌候选疾病模块

前列腺癌病因及发病机理研究有助于前列腺癌预防和治疗.目前,前列腺癌生化试验研究方法成本高、耗时,而基于网络计算方法容易受基因表达谱数据不完整、噪声高及实验样本数量少等约束.为此,本文提出一种基于节点-模块置信度及局部模块度的双重约束算法(命名为NMCOM),挖掘前列腺癌候选疾病模块.NMCOM算法不依赖基因表达谱数据,采用候选基因与致病表型之间一致性得分,候选基因与致病基因之间语义相似性得分融合排序策略,选取起始节点,并基于节点-模块置信度及局部模块度双重约束挖掘前列腺癌候选疾病模块.通过对挖掘出的模块进行富集分析,最终得到18个有显著意义的候选疾病基因模块.与单一打分排序方法及随机游走重开始方法相比,NMCOM融合排序策略的平均排名比小、AUC值大,且挖掘出结果明显优于其他模块挖掘算法,模块生物学意义显著.NMCOM算法不仅能准确有效地挖掘前列腺癌候选疾病模块,且可扩展挖掘其他疾病候选模块.     

传染病医院血清标本库系统建设

血清标本库是组织库的一种,血清样本是十分重要的临床病例原始资料,对病例回访追踪、科研教学都是重要的资源,尤其是对传染病医院来说,在确认疫情性质、追踪传染病的来源、明确潜在的传染源、为感染者寻找有效的治疗措施等方面发挥着重要的作用,很多新发突发传染病的血清标本本身就是极其重要的第一手临床资料,因此,建设、完善和管理专业的血清标本库对医院甚至对国家来说都是具有战略意义的.我们根据我院自身情况,基于网络数据技术在原有血清库的基础上自行开发研制了血清标本库系统,包括外部浏览使用和内部管理两大部分,在冰箱管理、数据同步、外部浏览方面较前做了很大改进,可以快捷地管理、查询、取用血清标本,本文就其设计、使用及特点等方面做简单介绍.     

《微生物学报》投稿方式

2012年3月修订从2006年起,本刊采用"稿件远程处理系统",全面实行网上投稿、网上审稿、网上查询等方式进行工作。欢迎广大作者通过登陆本刊网站进行投稿和查询。     

《中国种子植物》数据库印象

不久前 ,我单位购买了中国科学院昆明植物研究所吴征镒、丁托娅研制的《中国种子植物》数据库光盘 ,使用一段时间来 ,有如下几点印象和体会 ;在此与广大读者分享。1 关于系统 :该数据库居于当今流行的Ｗｉｎｄｏｗｓ平台 ,安装方便且易于移植 ,符合众多用户的需要 ;整个系统设计上 ,结构合理 ,逻辑关系清楚 ,各数据模块具有较强独立性且完整性强 ,能够充分体现和表达信息详细程度。界面美观大方颇具亲切感 ,且操作简单 ,易于掌握 ;查询过程采用了键盘和鼠标作为用户键入的两大方式 ,极大地方便了用户 ,使用户对信息的获取有随手拈来之感。2 …