环状RNA在胃癌中的研究现状与策略

环状RNA (circRNA)是一种共价闭合的非编码RNA,可以调节真核生物中的基因表达.最近应用高通量RNA测序和生物信息学方法揭示人类细胞中存在大量circRNA.许多circRNA具有一定的组织和时序特异性,且与生理发育和各种肿瘤等疾病密切相关. circRNA被证明在细胞质中富集和稳定,表明其具有作为肿瘤生物标志物的潜力.胃癌(gastric carcinoma,GC)是一种常见的恶性肿瘤,在全球癌症相关死亡原因中排第3位.尽管该疾病在诊断和治疗方面取得了许多进展,但GC患者的预后仍然很差,大多数国家的5年总生存率低于30%.因此,寻找能调节GC发生发展和评估预后的新分子机制和治疗靶标至关重要.近年来circRNA在胃癌中的研究不断增多,其在胃癌的发生发展、诊断、治疗及预后过程中扮演重要角色.本文就circRNA产生机制及一般特征、生物学功能、在胃癌中的研究进展及研究中存在的问题作一综述.     

环状RNA在胃癌与结直肠癌中的功能和作为临床标志物的潜力

环状RNA（circRNA）是一种广泛存在于生物体内的新型内源性RNA。CircRNA由RNA前体可变剪接产生,比线性RNA有更好的稳定性,是最近几年RNA领域的明星分子。CircRNA来源于内含子或外显子,可充当miRNA海绵或者结合蛋白质来参与基因表达调控,甚至已发现有circRNA能编码蛋白质。越来越多的研究表明,circRNA在肿瘤（如：食管癌、肝癌、胃癌、结直肠癌和膀胱癌等）的发生发展中发挥了重要作用。近年来,circRNA在胃癌、结直肠癌的研究逐渐增加,circRNA可能成为新的生物学标志物发挥诊断和预后的作用。本文将主要介绍circRNA 在胃癌及结直肠癌的功能和作为临床标志物的研究进展。     

环状RNA在肿瘤中的表达与功能

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类闭合环状的内源RNA分子,广泛存在于不同物种及多种人体细胞中,具有丰富性、稳定性和组织特异性等特点。人体细胞中的circRNA主要可分为外显子circRNA、环状内含子RNA和外显子-内含子circRNA等。与正常组织相比,circRNA在多种肿瘤组织中异常表达,并具有作为微小RNA(microRNA,miRNA)海绵调控miRNA、结合蛋白质、参与翻译等功能。虽然circRNA在肿瘤中异常表达的具体机制尚不明确,但其在食管鳞状细胞癌、胃癌、结直肠癌、肝细胞癌、神经胶质瘤等多种肿瘤发生、发展的分子通路中具有重要作用,并有望成为全新的肿瘤标志物和治疗靶点。circRNA领域的发展日新月异,本文根据最新研究报道,就circRNA的基本特征、异常表达机制、调控肿瘤的机制及其在多种肿瘤中发挥的作用作一综述。     

环状RNA：胃癌诊治的新星

环状RNA (circular RNA,circRNA)是一类闭合环状结构的RNA分子，广泛分布于各种组织中，它比线性RNA更稳定。circRNA分为外显子circRNA、外显子-内含子circRNA和内含子circRNA等3类。circRNA的主要功能为充当微RNA海绵、与RNA结合蛋白结合、翻译成蛋白质和调节转录等。近年来，大量研究表明，circRNA的异常表达在胃癌发生发展过程中起着至关重要的作用。circPTPN22、hsa＿circ＿0001772、circCYFIP2、hsa＿circ＿0017639和circPIP5K1A等的上调以及hsa＿circ＿002059、hsa＿circ＿0000190和circMTO1等的下调与胃癌的增殖和转移密切相关；而hsa＿circ＿0001313等影响胃癌细胞的顺铂耐药性。组织、血浆及外泌体中circPTPN22、hsa＿circ＿102958、hsa＿circ＿0141633、hsa＿circ＿0065149和hsa＿circ＿0026344等是胃癌新型诊断标志物；而hsa＿circ＿0005529、circ-RanGAP1、cir...     

环状RNA的功能特性与胃癌的发生及诊断

环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类具备环状闭合结构的内源性非编码RNA(nocoding RNA,ncRNA),主要由外显子和(或)内含子转录而成,具有组织和细胞表型特异性及稳定性,在生命活动中行使着重要的生物学功能,如circRNA可充当微小RNA(microRNA, miRNA)海绵以调控基因表达、与蛋白质相互作用、直接参与翻译过程、参与免疫反应、调控细胞功能、参与缺氧诱导肿瘤发生发展等功能。特别是参与肿瘤的发生发展使circRNA能成为肿瘤诊断及治疗的潜在靶点。本文将从circRNA的功能、参与胃癌的发生发展以及作为临床诊断标志物等展开综述。     

联合TCGA和GEO数据库构建和分析胃癌中circRNA相关的ceRNA网络

环状RNA (circular RNA, circRNA)是一类呈闭环状结构的竞争性内源RNA (competing endogenous RNA, ceRNA),其通过竞争性地吸附微RNA (microRNA, mi RNA)来调节基因表达。circRNA失调与癌细胞的增殖、分化和侵袭等密切相关。本研究基于生物信息学分析和多数据库的联合应用,以ceRNA为切入点探析胃癌中circRNA潜在的致病机制,以期为胃癌提供潜在的临床诊疗靶点,并为胃癌的科学研究提供新思路。首先,通过挖掘胃癌差异表达的circRNA、mi RNA和m RNA构建circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络;随后,利用网络拓扑属性分析确定核心的节点,并根据这些核心的节点从原始的ceRNA网络中提取子网;最后,对子网进行功能学分析和生存分析,分析网络行使的生物学功能并挖掘预后相关的基因。结果显示:共挖掘了6个核心节点(hsa_circ_0008468、hsa_circ_0005822、hsa_circ_0025842、hsa-miR-940、hsa-miR-944及hsa-miR-515-5p);从原始的ceRNA网络中提取了包含8对circRNA-miRNA和539个mi RNA-m RNA关系对的子网络。功能富集结果表明子网涉及癌症相关的多个生物学过程,包括代谢途径、cAMP信号通路、pathways in cancer信号通路等,生存分析发现子网中ACO2、E2F8、GHR、ITIH5等14基因与预后显著相关,这表明3个核心circRNA介导的ceRNA网络与胃癌的发生发展及预后密切相关。     

环状RNA翻译功能与消化系统肿瘤

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类新型单链RNA,可通过多种机制影响各类疾病的发生发展。由于没有5′帽端和3′尾端,过去认为circRNA不具备翻译功能。随着测序技术和蛋白组学的发展,大量研究表明,circRNA能够通过“非帽依赖式翻译”合成蛋白,且其产物可参与多系统肿瘤的演变。本文简述了circRNA的主要翻译机制,包括IRES介导、m6A介导及滚环扩增,介绍了常用的circRNA翻译功能预测工具,阐述了circRNA编码产物与胃癌、结直肠癌、肝癌等多种消化道肿瘤的关系,旨在为消化系统肿瘤的研究提供新思路。     

环状RNA与病毒感染之间相互关系的研究进展

非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA)是指一类不具有编码蛋白质功能的RNA,包括转运RNA (transfer RNA,tRNA)、核糖体RNA (ribosomal RNA,rRNA)、微小RNA (micro RNA,miRNA)、长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)以及环状RNA(circular RNA,circRNA)等.近年来circRNA在癌症,肿瘤以及心脑血管疾病等多种疾病中被证实发挥重要作用,此外研究还发现宿主circRNA与病毒来源的cicrRNA均会参与到病毒感染进程,但其中circRNA发挥的功能还有待进一步研究,因此,该文综述了circRNA的发现、分类、主要功能以及宿主circRNA和病毒来源的circRNA与病毒感染之间相互关系的研究进展,将有助于理解circRNA与病毒感染之间的互作机制.     

环状RNA作为生物标志物的研究进展

环状RNA(circRNA)是一种共价闭合环状结构的非编码RNA,与线性RNA有显著差别。circRNA通过外显子或内含子的反向剪接进而环化形成完整的环形结构。近年研究已证实circRNA在基因的表达调控和肿瘤等疾病的发生和发展中发挥着重要作用,提示circRNA可能具有巨大的临床诊疗价值。就circRNA的形成、特征、功能,特别是其作为肿瘤生物标志物的研究进展做简要综述。     

环状RNA的研究进展

环状RNA(Circular RNA,circRNA)是一类具有闭合环状结构的内源性非编码RNA(noncodingRNA,ncRNA),主要由前体RNA(pre-mRNA)通过可变剪切加工产生,circRNA广泛存在于所有真核生物中,并且非常稳定。目前,circRNA的研究已经成为了RNA研究领域的新热点,研究发现circRNA在转录本中占有相当大的比例,有的表达丰度甚至显著高于其他转录本。同时,circRNA对基因的表达有重要调控作用,在生物的发育进程中发挥了重要的生物学功能,如充当miRNA海绵、作为内源性RNA以及生物标记物,在疾病的诊断与治疗中也发挥重要作用。研究发现circRNA在一些疾病的发生中扮演了重要角色,包括动脉硬化、神经系统紊乱、糖尿病和癌症的发生。综述了circRNA的研究进展,阐述了circRNA的研究历史、circRNA的特点、形成过程、表达情况、circRNA与疾病间的关系以及circRNA的功能,并讨论了circRNA的研究意义及存在的问题。     

CircRNA在动物脂质代谢中的调控作用

脂质代谢具有复杂的生理过程，受激素、转录因子、酶和非编码RNA等多种因素影响，其中遗传是主要因素之一。环状RNA (circular RNA, circRNA)是存在于真核生物中的共价闭合的环形非编码RNA，具有组织特异性、保守性和稳定性。近年来，circRNA在脂肪生成和发育中的分子调控机制被广泛研究。本文概述了脂肪的分类、功能及其生成的调控机制，并重点综述circRNA对脂质代谢的调控，尤其是circOgdh和circHIPK3等标志性circRNA在动物脂肪沉积调控中的作用，以期为后续研究提供参考。     

环状RNA的生物学功能及其在疾病发生中的作用

环状RNA(circular RNA,circRNA)主要包括由外显子转录本构成的、经非线性反向剪接形成的内源性RNA分子和内含子来源的环状RNA分子等两类。研究发现,circRNA在人体细胞中广泛表达,在转录后水平具有调控基因表达的重要功能。有些circRNA具有天然微小RNA(microRNA,miRNA)海绵作用,可通过与miRNA结合而抑制其活性,从而调控miRNA靶标发挥作用。circRNA在动脉粥样硬化、神经系统紊乱、糖尿病和肿瘤等疾病发生过程中起着较为重要的作用,深入研究circRNA的结构和功能可使我们更好地了解疾病的发生机制,提高相关疾病的预防和诊断水平。文章就circRNA的形成、功能及其在疾病发生中的作用等做一综述。     

环状RNA翻译蛋白在癌症中的研究进展北大核心CSCD

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种单链环状闭合RNA分子,由线性RNA通过反向剪接形成,具有稳定、高度保守、组织特异性等特点。circRNA能够通过形成竞争性内源性RNA、结合蛋白等多种方式参与机体的生理、病理过程。最近发现,circRNA分子可以通过翻译形成多肽或蛋白参与癌症的发生和发展。circRNA是人类癌症中有前途的诊断和预后标志物,也是癌症治疗的潜在药物靶点。本文重点介绍了circRNAs编码的多肽和蛋白质在多种癌症中的相关研究进展。这些多肽和蛋白质分别依赖内部核糖体进入位点和m6A两种不同的机制进行翻译。我们还总结了circRNA编码的多肽和蛋白质在各种癌症的诊断、治疗、预后和机制研究中的潜在用途。     

环状RNA研究进展

环状RNA(circRNA)是一类内源性非编码RNA(Non-coding RNA;ncRNA),与传统线性RNA不同,它是由反向剪接形成的、没有5'端帽子和3'端多聚腺苷酸尾巴的环状闭合结构。起初人们认为circRNA是错误剪接或者低丰度mRNA转录过程中的副产物,但随着高通量测序技术和生物信息学的发展,越来越多的circRNA已被发现和鉴定。circRNA在哺乳动物细胞中具有内生、丰富、保守、稳定、组织特异性、时空特异性等特点,且亚细胞定位存在差异。大量研究发现它可以通过多种机制参与动物生长发育调控,疾病等的发生和发展。综述了circRNA的发现与形成、特征、作用机制、研究方法及与疾病相关的研究进展,以期为circRNA的进一步研究提供参考。     

环状RNA及其作为疾病标志物的潜能

环状RNA（circular RNA, circRNA）是一种共价闭合环状结构的内源性非编码RNA分子,不具有5′端帽子和3′端poly(A)尾巴结构,具有广泛性、保守性、组织特异性以及稳定性等特性;根据序列来源的不同可分为3种类型：外显子circRNA、内含子circRNA、外显子-内含子circRNA;随着生物信息学的快速发展和高通量测序技术的不断革新,目前已经在真核细胞中发现大量内源性circRNA,主要分布于细胞质中,其独特的序列结构,使它具有microRNA海绵、调节选择性剪接或转录、与RNA结合蛋白结合、滚动翻译和衍生假基因等功能;它参与癌症、糖尿病、神经系统疾病和动脉粥样硬化等疾病发生、发展过程。众多研究显示circRNA会成为新型的疾病临床诊断标志物或人类疾病治疗的潜在靶点,该评述较为详细地从circRNA的形成、特性、生物学功能、研究方法、研究数据库以及和疾病的关系等方面来阐述circRNA的最新研究进展,方便研究人员进行circRNA研究。     

环状RNA在巨噬细胞中的作用

环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类特殊的非编码RNA类型,在真核生物细胞和人体转录本中大量存在。circRNA是由前体信使RNA(pre-mRNA)反向剪接形成的共价闭合环状RNA分子,通过充当微核糖核酸(microRNA, miRNA)"海绵"、与蛋白质结合、参与基因转录调控和蛋白质翻译等发挥其生物学作用。随着对circRNA研究的日益增多,已有研究人员报道了circRNA在免疫细胞中的作用。现对circRNA的形成、分类、生物学特性、功能及其在巨噬细胞中的作用作一概述。     

环状RNA的特征及其在畜禽中的研究进展

环状RNA(circRNA)是一类新发现的内源性非编码RNA,为共价键形成的闭合环形结构RNA分子。circRNA在真核生物体内广泛存在,主要来源于外显子或内含子,具有种类丰富、保守性强、细胞组织表达特异性、稳定性高等特点。目前研究表明,circRNA的形成方式包括剪接体套索驱动环化和内含子配对驱动环化,期间会有多种顺式原件和反式原件调控circRNA的形成。circRNA可通过多种方式发挥其生物学功能,circRNA与RNA结合蛋白结合调控基因表达及蛋白质翻译,circRNA与miRNA结合发挥miRNA海绵功能,circRNA可编码功能性蛋白,circRNA还可参与细胞通讯和信号转导。畜禽的经济性状及疾病防控是畜牧学关注的重点,目前研究发现,circRNA广泛地参与了家畜的疾病发生及防控、繁殖繁育、肌肉发育、脂肪沉积、神经发育等生理过程,在家畜的疾病发生防控和肉奶产量品质等经济性状中具有重要的研究价值。对circRNA的特征、形成机制、主要生物学功能及其在畜禽中的研究进展进行综述,旨在为circRNA在畜禽的研究提供一定的依据及参考,为开发新的分子遗传标记提供新的思路,为丰富畜禽品系选育提供新的技术和方法。     

CircRNA肿瘤相关生物学功能的研究进展

环状RNA(circRNA)是一类具有环状结构的非编码RNA(noncoding RNAs, ncRNA),广泛存在于多种生物细胞中,具有结构稳定、序列保守及细胞或组织特异性表达等特征。已被证实circRNA在许多癌症中存在表达异常,参与了恶性肿瘤的发生发展。CircRNA在细胞中的分布与其功能发挥密切相关。研究表明,胞核分布的circRNA可以参与调节mRNA转录和表观遗传调控,胞质分布的circRNA具有充当"miRNA海绵"、与RNA结合蛋白结合、影响蛋白质翻译、编码蛋白质等功能。本文对circ RNA在肿瘤中发挥的相关生物学功能进行综述,以期为后续研究提供一定的理论依据。     

环状RNA研究进展

环状RNA (circular RNA, circRNA)是一类不具有3’端poly(A)和5’端帽子结构的、以共价键首尾相连的单链内源闭合环状RNA。CircRNA具有广泛性、多样性、稳定性和保守性等特点,其具有转录调控和蛋白质翻译等功能。本文从circRNA的生物合成机制、分类、表达、生物学功能、与疾病的关系,以及鉴定与分析方法等方面对近年来的研究进展作一综述,并展望了circRNA的应用前景和研究方向。     

环状RNA在恶性肿瘤中的研究进展

环状RNA(circRNA)最早发现于20世纪70年,与传统的线性RNA不同,它的结构是一个闭合的共价环状分子,无5'的帽子结构和3'的poly A尾,不易被核酸外切酶降解,具有高度保守性、稳定性。circRNA的来源主要有三类:内含子序列形成的环状RNA(ciRNA),外显子序列形成的环状RNA(ecircRNA)以及内含子和外显子序列共同形成的环状RNA(EIciRNA)。目前cricRNA在核糖核酸的领域已经成为一个新的研究热点。大量研究发现,circRNA具有调节细胞增殖、分化、凋亡等作用,与肿瘤发生、发展密切相关。本文就circRNA的起源、功能及其与肿瘤关系的研究进展做一综述。