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相似文献
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1.
提出一种新颖的方案使蛋白质结构信息可视化。在滑动窗口方法基础上,每一个天然氨基酸采用从氨基酸索引数据库中挑选的48种特性参数描述,在某一特定窗口下的所有氨基酸残基的参数就组成一个矩阵,通过矩阵变换得到一个方矩阵,再经过窗口的滑动就得到基于整个蛋白质的所有这些窗口矩阵的本征值矩阵。对本征值矩阵元素作图得到一系列的本征值曲线,这种曲线的轮廓不随窗口的变化而变化,这些曲线被称为蛋白质的特征曲线。为选择合适的窗口宽度、对同一类型蛋白质不同窗口宽度及不同类型蛋白质相同窗口宽度下的本征值矩阵进行了比较研究,对其潜在的用途进行了讨论。  相似文献   

2.
Mueller矩阵是公认的能很好地表述介质偏振特性的一种方法,由于散射光偏振在生物组织无创伤诊断技术等诸多领域中的重要应用价值,对组织散射特性的Mueller矩阵的研究成为国际上组织光学的热点之一。研究设计了一种新的测量Mueller矩阵的实验装置:斜入射正接收装置,并推导出一组后续数据处理的算法。由此所获得的Mueller矩阵空间分布图的清晰度不亚于其它所报道的,并且测量方法具有结构简单、方便、准确等优点。实验结果表明:入射角影响Mueller矩阵空间分布图;随着介质浓度的增大,随机介质后向散射Mueller矩阵各元素的空间分布图样减小;同时列举了真实生物组织样品(肌肉组织)的后向散射Mueller矩阵的实测结果,由此证明各向异性生物组织的后向散射Mueller矩阵各元素的空间分布图样与纤维的走向有关。  相似文献   

3.
混浊介质后向散射特性的Mueller矩阵实验测量   总被引:3,自引:0,他引:3  
Mueller矩阵是一种公认的能很好地表述介质偏振特性的方法.由于散射光偏振在生物组织无创伤诊断技术等诸多领域中的重要应用价值,对组织散射特性的Mueller矩阵的研究成为国际上组织光学的热点之一.与现有测量Mueller矩阵的实验方法相比,斜入射正接收装置用来测量Mueuer矩阵是一个更加行之有效的方法,再结合一种新的算法来处理后续数据,由此所获得的Mueller矩阵空间分布图的清晰度不亚于其它文献的报道.这种测量方法结构更简单,具有测量更方便、准确等优点.结果表明:入射角影响Mueller矩阵的空间分布图.随着介质浓度的增大,随机介质后向散射Mueller矩阵各元素的空间分布图样减小.  相似文献   

4.
构建基于折叠核心的全α类蛋白取代矩阵   总被引:1,自引:0,他引:1  
氨基酸残基取代矩阵是影响多序列比对效果的重要因素,现有的取代矩阵对低相似序列的比对性能较低.在已有的 BLOSUM 取代矩阵算法基础上,定义了基于蛋白质折叠核心结构的序列 结构数据块;提出一种新的基于全α类蛋白质折叠核心结构的氨基酸残基取代矩阵——TOPSSUM25,用于提高低相似度序列的比对效果.将矩阵TOPSSUM25导入多序列比对程序,对相似性小于25%的一组四螺旋束序列 结构数据块的测试结果表明,基于 TOPSSUM25的多序列比对效果明显优于BLOSUM30矩阵;基于一个BAliBASE子集的比对检验也进一步表明, TOPSSUM25在全α类蛋白质的两两序列比对上优于BLOSUM30矩阵.研究结果可为进一步的阐明低同源蛋白质序列 结构 功能关系提供帮助.  相似文献   

5.
在Vandermeer的昆虫矩阵模型的基础上,提出了具有吸收状态的昆虫种群矩阵模型。并且导出了k步吸收状态与转移状态的矩阵表达式,将有助于昆虫种群动态的研究.  相似文献   

6.
在坡上讨论研究矩阵积和式的三类问题:首先,证明当Per(A)=1时,矩阵A的行与列的元素是互补的,同时给出矩阵A可逆的条件;其次,讨论积和式Per(A)与Per(AB)及Per(A+B)间的不等关系,给出若干不等式;最后,研究给出矩阵积和式Per(A)的若干分解.这些结果推广了分配格和交换坡上的相应的结论.  相似文献   

7.
烟青虫种群动态模型的研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
谢立群  张孝羲 《生态学报》1999,19(4):458-463
在对烟青虫Helicoverpaassulta实验种群研究的基础上,应用变维矩阵综合差分方程,建立了烟青虫种群动态模拟模型,模型采用分块矩阵的方式,以实际日龄为步长,通过适当增加矩阵维数,对虫期(态)向量实行按矩阵维数的变化而伸缩的形式,使模型不但适合于变温条件,而且能够表示烟青虫个体发育的差异,该理论模型有待于地方化。  相似文献   

8.
〔1〕提出了一个描述生物种群动态的矩阵模型——广义Leslie矩阵模型。这个模型是Leslie矩阵模型的一个推广,它考虑了昆虫发育过程中个体在虫态发育历期上的差异。因此与普通Leslie矩阵模型相比,该模型更适于描述昆虫种群的动态。〔2〕对广义Leslie矩阵模型的渐近性质做了分析,给出了相应的稳定年龄结构的表达式,同时从马氏链的观点出发,给出了种群年龄结构渐近稳定或周期变化的充要条件。本文是〔2〕的继续,将给  相似文献   

9.
本文基于Legendre多项式构造了一类新的正交函数,即分数阶Legendre函数,利用分数阶微分和积分的定义推导微分算子矩阵和乘积算子矩阵。  相似文献   

10.
在坡上引入对合反自同构和矩阵的M-P逆的概念,获得矩阵M-P逆的一些条件和性质.其结果推广了已有分配格和交换坡上的结论.  相似文献   

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It has now been over twenty years since a novel herpesviral genome was identified in Kaposi's sarcoma biopsies. Since then, the cumulative research effort by molecular biologists, virologists, clinicians, and epidemiologists alike has led to the extensive characterization of this tumor virus, Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus(KSHV; also known as human herpesvirus 8(HHV-8)), and its associated diseases. Here we review the current knowledge of KSHV biology and pathogenesis, with a particular emphasis on new and exciting advances in the field of epigenetics. We also discuss the development and practicality of various cell culture and animal model systems to study KSHV replication and pathogenesis.  相似文献   

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Comprises species occurring mostly in subtidal habitats in tropical, subtropical and warm-temperate areas of the world. An analysis of the type species, V. spiralis (Sonder) Lamouroux ex J. Agardh, a species from Australia, establishes basic characters for distinguishing species in the genus. These characters are (1) branching patterns of thalli, (2) flat blades that may be spiralled on their axis, (3) width of the blade, (4) primary or secondary derivation of sterile and fertile branchlets and (5) position of sterile and fertile branchlets on the thalli. Application of the latter two characters provides an important basic method for separation of species into three major groups. Osmundaria , a genus known only in southern Australia, was studied in relation to Vidalia , and its separation from the Vidalia assemblage is not accepted. Species of Vidalia therefore are transferred to the older genus name, Osmundaria. Two new species, Osmundaria papenfussii and Osmundaria oliveae are described from Natal. Confusion in the usage of the epithet, Vidalia fimbriala Brown ex Turner has been clarified, and Vidalia gregaria Falkenberg, described as an epiphyte on Osmundaria pro/ifera Lamouroux, is revealed to be young branches of the host, Osmundaria prolifera.  相似文献   

18.
Fifteen chromosome counts of six Artemisia taxa and one species of each of the genera Brachanthemum, Hippolytia, Kaschgaria, Lepidolopsis and Turaniphytum are reported from Kazakhstan. Three of them are new reports, two are not consistent with previous counts and the remainder are confirmations of very scarce (one to four) earlier records. All the populations studied have the same basic chromosome number, x = 9, with ploidy levels ranging from 2x to 6x. Some correlations between ploidy level, morphological characters and distribution are noted.  相似文献   

19.
肝癌中HBV和HCV基因和抗原的分布及意义   总被引:1,自引:0,他引:1  
采用原位分子杂交方法检测HCV RNA及HBV X基因;采用免疫组织化学方法研究HCV核心抗原,非结构区C33c抗原及HBxAg在肝细胞肝癌中的定位及分布.结果表明(1)HCV RNA、HBV X基因在肝细胞肝癌组织检出率分别为40%(55/136)和82%(112/136).HCV RNA定位于癌细胞的胞浆内,阳性细胞呈散在、灶状及弥漫分布三种形式;HBV X基因在肝癌细胞中的分布呈胞浆型、核型及核浆型,阳性细胞也呈上述三种分布形式;(2)HCV C33c抗原、核心抗原在肝细胞肝癌中的阳性率为81%(133/164)及86%(141/164).C33c抗原定位于癌细胞及肝细胞的胞浆内;核心抗原既定位于癌细胞核中,又可定位于胞浆中.C33c抗原阳性细胞以灶状分布为主;而核心抗原阳性细  相似文献   

20.
For a plant selection model with frequency-independent viabilities, fertilities and selfing rates, it is shown that apart from global fixation, for certain parameter combinations a protected polymorphism and facultative fixation (either allele may become fixed according to initial frequencies) may both occur. Facultative fixation requires different selling rates for the dominant and recessive type. Protection of the polymorphism requires resource allocation for male and female function. In this connection the problem of purely genetically caused population extinction is discussed.
For general frequency dependence and regular segregation, the chances for establishment of a completely recessive gene are compared to those of a completely dominant gene. It is proven that the process of establishment of the recessive gene, despite a fitness advantage, may be considerably endangered by drift effects if random mating prevails. The recessive gene may reach the same effectivity in establishment as a dominant gene, only if the recessive homozygote mates exclusively with its own type during the period of establishment.  相似文献   

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