时空监测海水浴场粪大肠菌群和人类腺病毒方法的探讨（英文稿）

[目的]人类腺病毒(40/41)与人类急性胃肠炎显著相关,被用作娱乐水体中人类病毒污染的指示生物.粪大肠菌群(FC)作为传统的细菌指示生物,用来估计水环境中病原微生物的潜在风险.了解水传播的病原微生物的时空分布对公众健康和疾病的预防具有十分重要的意义.[方法]于2008年5月到10月,在中国10个典型海水浴场共采集30个表层海水样品,分别用定量PCR和细胞培养的方法分析人类腺病毒和FC.[结果]腺病毒的含量为1.7×106-1.1×108基因拷贝/L,其阳性检出率为30％,而普通PCR的阳性检出率为26.7％.其中7个海水浴场的FC超出了景观娱乐水质标准(2 000 CFU/L).时间分布趋势表明,人类腺病毒从8月份到10月份的污染较其他月份严重(P＜0.05).在该实验条件下,不论是在同一浴场的不同站位还是在不同浴场,腺病毒的空间分布差异都不明显(P＞0.05).同样,FC在不同浴场的时空分布也无明显差异(P＞0.05),但是其分布与离岸距离的远近显著相关(P＜0.05).此外,在我们所研究的浴场,细菌和病毒这两种指示生物之间并没有相关性.[结论]为避免在游泳季节胃肠道疾病的大规模爆发,必须加强卫生设施建设和肠道细菌、病毒两种指示生物的监测.     

荧光定量PCR技术在临床微生物检测中的应用

荧光定量PCR技术是近些年来发展起来的一种核酸检测技术,它以灵敏度高、特异性强、重复性好、快速准确定量等特点被广泛应用于各个领域。现主要介绍荧光定量PCR技术在病毒、细菌、真菌和寄生虫4个临床微生物检测方面的应用进展。     

外来入侵物种的风险评估定量模型及应用

预防生物入侵的一个重要手段是对外来物种进行风险评估,应用模型则是定量评估的必备方法。本文简述了常用的适生性风险评估模型,概述了诸如遗传算法、模糊包络模型、自组织特征映射网络等较新的理论方法,它们使用环境变量和物种实际分布数据,利用不同的机理模型预测物种潜在分布区。本文还综述了适用于研究物种扩散性的模型,积分差分方程模型可以模拟物种扩散行为,元胞自动机模型可以揭示种间竞争关系,景观中性模型大多用于种群动态等生态过程的研究。     

实时荧光定量PCR及其在微生物生态学中的应用

定量描述微生物群落的组成,在微生物生态学的许多研究领域都是非常重要的。然而由于可培养技术的局限性,定量描述微生物群落成为比较困难的事情。最近包括PCR技术在内的分子生物学技术为人们提供了有力的工具,使对微生物群落的分布、丰度等有了进一步的了解。实时荧光定量PCR技术作为核酸定量检测技术,自从发明以来在微生物生态学研究中逐渐得到了广泛的应用。从微生物生态学角度,综述了实时荧光定量PCR技术的原理、发展、优缺点及其在微生物生态学研究中的应用与研究进展,并探讨了实时荧光定量PCR技术的发展和应用前景。     

实时荧光定量PCR技术在检测复发性口腔溃疡患者口腔微生物菌群改变中的应用

目的 研究实时荧光定量PCR法在检测复发性口腔溃疡患者口腔微生物菌群改变中的应用。方法 取一般口腔溃疡患者和复发性口腔溃疡患者的唾液样本,分别使用涂片、革兰染色鉴定和实时荧光定量PCR法进行检测,比较检测方法是否存在差异。结果 复发性口腔溃疡患者口腔中革兰阴性球菌的数量要低于一般口腔溃疡患者（t=0.9841,P=0.0251）,其他类型的细菌则没有明显改变。细菌计数发现复发性口腔溃疡患者口腔链球菌、韦荣球菌、奈瑟菌明显低于一般口腔溃疡患者（t=0.997 4,P=0.004 0;t=0.976 7,P=0.036 6;t=0.998 4,P=0.002 6）。实时荧光定量PCR则进一步证实这个结果。结论 实时荧光定量PCR可应用于检测复发性口腔溃疡患者口腔中的菌群变化,为临床治疗和合理用药提供依据。     

实时定量RT—PCR在微生物分子特性研究中的应用

实时定量RT—PCR是一种高效检测低丰度mRNA的方法,该方法具有易操作、高通量、敏感度高和特异性强的特点。本文对实时定量RT—PCR在真核生物中的原生动物和真菌、细菌以及非细胞类病毒三大微生物类群中的研究进展加以简要综述,同时对实时定量IKT—PCtK在微生物分子特性研究中的应用作了展望。