电喷雾串联质谱图的叠合与多肽序列分析

利用离子阱电喷雾串联质谱仪,在选择性改变某些食品参数的条件下对模式分子Met-脑啡肽和自行固相化学合成的7肽及其修饰产物、10肽和20肽进行碎裂处理,从而获得一系列具有一定差异的串联质谱图。选择具有适当互补性的图谱进行叠合处理,得到具有连贯性“三联套”（triplet）及“二联套”（doublet）碎片离子峰的叠合串联质谱图,据此可以方便准确地角析出多肽的氨基酸序列。实验结果表明,这种方法在多肽的质谱法测定中具有一定的实用性。     

碎片结构分析在MALDI—TOF—MS法测定多肽序列中的 …

采用基质辅助的激光解吸电离习行时间质谱法碎片结构分析（ｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ＴＯＦＭＳ,ＦＡＳＴ）技术,对多肽样品血管紧张肽Ⅱ（ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎⅡ）和促肾上腺皮质激素（ａｄｒｎｏｃｏｒｔｉｃｏｔｒｏｐｉｃ ｈｏｒｍｏｎｅ,ＡＣＴＨ）１８￣３９肽段进行了测序研究。根据ＦＡＳＴ谱图中典型碎片离子峰的质谱数据,分析得到了多分子的主要氨基酸组成以     

用于串联质谱鉴定多肽的计量方法

目前已有多种对串联质谱与数据库中多肽的理论质谱的一致性进行评估的高通量计量算法用于鸟枪法蛋白质组学 (shotgunproteomics)研究。然而这些方法操作时存在大量错误的多肽鉴定。这里提出一种新的串联质谱识别多肽序列的计量算法。该算法综合考虑了串联质谱中不同离子出现的概率、多肽的酶切位点数、理论离子与实验离子的匹配程度和匹配模式。对大容量的串联质谱数据集的测试表明 ,根据算法开发的软件PepSearch比目前最常用的软件SEQUEST有更好的鉴定准确性。PepSearch可从http : compbio.sibsnet.org projects pepsearch下载。     

质谱图聚类网络法在鉴定多肽翻译后修饰中的应用及研究进展

蛋白质组学多肽鉴定方法一直以基于质谱分析和数据库搜索的方法为主,随着质谱仪技术的发展,海量的质谱数据被获取,这为大规模蛋白质的鉴定提供了一个强大的数据仓库,使得以质谱数据为基础的蛋白质组学研究成为主流。传统的串联质谱图搜库方法鉴定多肽翻译后修饰时具有诸多局限,质谱网络方法可以在一定程度上弥补局限。文中系统综述了基于质谱聚类的质谱网络和质谱图库搜索方法的发展历程、理论研究和应用研究,讨论了质谱网络库方法在鉴定多肽翻译后修饰的优势,并进行了分析和展望。     

串联质谱在多肽测序中的应用

采用纳升喷雾(Nano)技术和碰撞诱导解离(CID collision inducd dissociation)方法,在电喷雾-四极杆-飞行时间质谱(ESI-Q-TOF electrspectrometry ionization-quadrupole-time of flight)上,对两种序列部分未知的天然多肽进行从头测序(de novo sequence),结果证明质谱的de novo sequence可以方便有效的解决传统的Edman降解法测序中常见的实际问题,如末位残基的丢失,赖氨酸和亮氨酸难鉴定等,此方法的建立是对Edman降解测序法很好的补充．     

一种优化的MALDI-TOF质谱分析多肽C端序列方法

利用基质辅助激光解吸飞行时间 (MALDI TOF)质谱技术 ,测定羧肽酶Y消化蛋白质和多肽 .所产生的缩短肽片段的质量 ,在一张谱图上得到各个不同酶解时间所形成的肽质量梯度 .根据谱图中相邻两肽峰的质量差得到切去氨基酸的信息 ,从而读出C端氨基酸序列 .在pmol水平下对人促肾上腺皮质激素片段 (ACTH 1 3 9) ,人血管紧张肽片段 (angiotensin Ⅰ ,angiotensin Ⅱ )的C端序列进行了测定 .讨论了在不同浓度 ,不同时间 ,不同温度下酶解所得到的序列测定结果 .在优化条件下 ,人ACTH片段得到了C端 2 0个氨基酸残基顺序 ,为目前C端序列分析所得到的最长序列     

MALDI-TOF质谱技术研究多肽一级结构特性

海兔酸性多肽(Aplysiaacidicpeptide,AAP)和海兔胰岛素Cβ(AplysiaInsulinCβ,AICβ)的一级结构分别由27和15个氨基酸残基组成,其中前者含有6个亮氨酸残基(L),并组成3对LL键,后者仅有2个亮氨酸残基,组成1对LL键。选用基质辅助激光解吸离子化飞行时间(matrixassistedlaserdesorptionionizationtimeoffight,MALDITOF)质谱技术研究AAP,AICβ和它们分解产物的一级结构稳定性过程中,发现在弱酸性介质条件下,AAP和AICβ的LL酰氨键键能比LR键能(R表示除了L以外的氨基酸残基)更强,不易被分解。AICβ和猪血管紧张肽I(angiotensinI,AnI)样品中均含有单电荷的多聚肽。随着多肽聚合数递增,多肽质谱峰的相对强度剧减。AICβ在形成多聚肽过程中,发生释放H+的现象 。     

胞内随机序列多肽库的构建

根据达尔文的进化论思想发展起来的分子进化工程(Molecular Evolution Engineering),不仅有助于生命科学基础研究的发展,还有可能成为药物筛选的新手段.多肽进化是分子进化的一个重要组成部分,利用合成的随机序列寡核苷酸片段表达形成的多肽库(Random Peptide Library)包含一定长度多肽的所有可能的氨基酸排列顺序,通过一定模式的筛选,可定向筛选出有生物活性的肽段,用作药物或酶抑制剂.     

ITS序列分析与MALDI-TOF MS质谱技术在丝状真菌鉴定中的应用

丝状真菌常用的鉴定方法为形态方法和基因鉴定方法,前者限于检验人员的知识和技能,后者操作繁琐,费用略昂贵,不适合常规开展。因此,寻找丝状真菌快速鉴定方法势在必行。本文采用VITEK MALDI-TOF MS（基质辅助激光解析电离时间飞行质谱）IVD数据库（3.0版本）对临床分离的254株丝状真菌进行鉴定,并以ITS（internal transcribed spacer 内转录间隔区）序列分析为标准,验证MALDI-TOF MS质谱技术鉴定丝状真菌的准确性。结果表明MALDI-TOF MS质谱技术可以对大部分丝状真菌实现快速、准确的鉴定,其中对毛癣菌属（100%）、毛孢子菌属（100%）、毛霉菌属（100%）、曲霉菌属（96.5%）准确率很高,对犬小孢子菌（75%）、镰刀菌属（50%）、新月弯孢霉（46.2%）准确率较低,对丝状真菌鉴定的总体准确率为86.36%,与ITS测序分析符合率为83.97%。     

提高蛋白质和多肽类药物代谢稳定性的研究进展

蛋白质和多肽类药物在体内存留时间的长短极大地影响到药物的使用剂量和治疗效果。本文综合现有的资料,对包括蛋白酶的作用、物理和化学变化、给药方式等影响该类药物代谢稳定性的因素以及相应的解决方案作一综述。     

聚乙二醇化修饰对蛋白多肽药物药代动力学的影响

聚乙二醇（PEG）化修饰在生物制药领域被认为是改变蛋白多肽类药物生物、理化性质的最佳方法之一。众多研究表明,PEG化后的蛋白多肽在生物体内的药代动力学行为有了很大改变,主要表现在：吸收相半衰期及消除相半衰期延长．血药峰浓度提高,达峰时间滞后,表观分布容积变小,免疫反应性减弱,血浆清除减慢。这些变化极大地改善了蛋白多肽药物在机体内清除快、免疫原性高、有效血药浓度持续时间短、需频繁给药等缺点。聚乙二醇化修饰为生物制药领域开辟了新的天地。     

The Mass Spectra of Thiohydantoins Derived from Some Amino Acids

One of the bound forms of vitamin B₆ occurring in rice bran was isolated in a faintly yellowish syrup by repeating ion-exchange and paper-partition chromatographic techniques. The behaviors of the isolate on thin-layer and Aminex A–5 column chromatograms were coincident with those of synthetic pyridoxine-β-d-glucoside which was obtained by Königs-Knorr condensation of α⁴,3-O-isopropylidene pyridoxine and 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-α-d-glucopyranosyl bromide. On acid hydrolysis, the isolate gave pyridoxine and glucose. Glucose was proved to bind to the 5-hydroxymethyl group of pyridoxine, because the isolate did not react with 2,6-dichloroquinone chlorimide in the presence of boric acid. An equimolar amount of pyridoxine and d-glucose was produced with an equivalent consumption of the isolate by the action of β-glucosidase. No essential difference between the isolated and synthetic preparations could be detected in UV- and NMR-spectral features. Thus, the chemical structure of the isolate was identified as 5′-O-(β-d-glucopyranosyl) pyridoxine.     

An Interpretation of the Mass Spectra of Salinomycin and Its Derivatives

Salinomycin is a new polyether antibiotic elaborated by Streptomyces albus. An interpretation of the mass spectra of salinomycin and its derivatives has been achieved with the aid of high resolution mass spectrometry along with measurement of the metastable ions. Interesting aspects of the mass spectral data of these compounds are that the characteristic cleavage occurred at the ring C of the tricyclic spiroketal system, and that the sodium salts of salinomycin itself and some derivatives thereof are volatile enough to give distinct spectra which showed fragmentations comparable with those of the free acid and the methyl ester.

An interpretation of the principal fragment ions and their formation mechanism for salinomycin and its derivatives is discussed.     

pH值及金属离子对樟树果实红色素吸收光谱的影响

以樟树果实为材料,运用800～400 nm光谱扫描分析了pH值、金属离子、加热时间及温度、光照等稳定性因子对樟树果实红色素吸收光谱的影响。结果表明:最大吸收波长是517 nm,酸性条件对色素吸收光谱无明显影响,当pH为8.6的强碱性环境,红色素结构变化,最大吸收峰漂移至402 nm;100℃内,色素性质稳定,当加热时间延长至120 min,最大吸收峰在512.5 nm;红色素耐光性较好,但避光更利于保存;金属离子对红色素吸收光谱的影响强弱为:Fe3+>Al3+>Mg2+>Ca2+>Na+>K+,Fe3+短时内引起色素变色、发生沉淀,最大吸收峰漂移,浓度越高影响越大,Na+、K+对红色素吸收光谱无明显影响。     

The Mass Spectra of the Lankacidin Antibiotics

Bundlins A and B, antibiotics elaborated by Streptomyces sp. 6642 GC₁, have the unique structures which possess a seventeen-membered carbon skeleton fused with an unusual β-keto-δ-Mactonic system and a pyruvamide side chain. In the course of the structural studies of the antibiotics, we found that these compounds showed the interesting fragmentations in their mass spectra and in consequence, the investigation about the interpretation of the principal peaks together with their formation mechanism was undertaken by the aid of high resolution mass spectrometry and the measurement of meta stable ions. In addition to the two antibiotics, the mass spectra of related compounds designated T–2636 D and T-2636 F were also investigated.     

Geographical Variation in the Characteristics of Absorption Spectra and Fluorescence Spectra of Pinus armandi

By measuring the derivative absorption spectra of chloroplasts of different populations of Pinus armandi Franch., it was found that southern populations maintained higher absorption at 680 nm than at 670 nm, but some of the northern populations deviated the maximum absorption from 680 nm to 670 nm, which indicated that the activity of PS Ⅱ in some of the northern populations declined. Clear geographical differences also have been found in the positions of emission peaks of PS Ⅰ and PS Ⅱ in the fluorescence emission spectra at 77 K. Analysis of the fluorescence excitation spectra at 77 K revealed geographical changes in the absorption.status of Chl a. Besides, the experimental results indicated that the intact needles of Pinus armandi are not ideal materials to be used in detecting the geographical variation in photochemical reaction process because the presence of thicker coat, resin etc. can conceal the spectral differences in different populations.     

自适应蚁群算法在DNA中的应用

主要讨论了自适应蚁群算法在DNA序列比对中的应用,主要的过程是：首先,我们设一个计分函数和一个得分策略,在任意给出一对DNA序列,建立一个序列比对矩阵．现由4只蚂蚁从左上角向右下角移动,并且最终到达右下角,那么这4只蚂蚁随意走出4条路径,根据4条路径得出4对等长的比对,再依照计分函数分别计算出4条路径的比对得分,再由1．3式进一步验证4条路径的平均得分值,取其中得分最高（即最优路径）路径;进行第二次信息素增量的调整,方法是根据蚂蚁所走过的方向和该方向上得分比例计算出来的,信息素的变化量利用矩阵来存储,那么下一次蚂蚁所选的路径就要根据以前在各条路径上的信息素浓度总和的大小选择移动方向,最终经过有限次迭代,蚂蚁就会找到一条最优路径,也就是一条与原来DNA最相似的DNA链．     

成像质谱在微生物代谢产物研究中的应用

微生物代谢产物的结构和功能多样,对相邻微生物和环境会产生重要影响。传统的天然产物分离方法不能系统全面地监测单一或混合微生物样品中代谢物的合成和释放模式。成像质谱能够同时可视化观察从单一微生物菌落到复杂微生物群落的多个代谢产物的时空分布,可以用于发现重要的生物活性分子,观察微生物菌落的代谢交流,以及跟踪微生物之间相互竞争过程中代谢物的修饰等方面的研究。本文综述了成像质谱在微生物代谢产物研究中的最新进展,展望了该技术的应用前景。