肠道病毒B组山东地方株的基因型分布

为明确源自急性弛缓性麻痹(AFP)病例的HEV-B组病毒山东地方株的基因型分布,探讨其优势基因型的变迁与疾病暴发之间的关系,本研究对山东省1994年~2008年AFP监测系统分离到的HEV-B组病毒进行了VP1区核酸扩增和序列测定。序列测定结果显示HEV-B山东地方株共包括29种基因型,其中CVA 1种(CVA9),CVB 5种(CVB1~5),ECHO 20种以及新型肠道病毒EV73、75、97。其中ECHO11、CVB3、ECHO6、ECHO14、ECHO25是AFP监测系统中最常分离到的B组病毒。同源性比较显示,相同血清型HEV-B山东地方株型内核苷酸同源性最小75.4%,最大99.6%,与原型株核苷酸同源性最小73.8%,最大85.2%,但氨基酸变异不大。研究表明,不同基因型病毒具有不同的时间循环模式,相同基因型毒株内部根据其遗传距离的远近又可划分为不同的基因亚型,从而帮助确定HEV的传播途径和传播范围。     

云南省2006～2010年非脊灰肠道病毒分子流行病学特征分析

为了解云南省非脊髓灰质炎(脊灰)肠道病毒(NPEV)的基因型分布及分子进化特征,对2006～2010年间从急性迟缓性麻痹(AFP)病例中分离到的105株NPEVs进行VP1区部分核苷酸扩增和序列测定。所获得的云南地方株基因序列与各基因型原型株进行核苷酸与氨基酸同源性比较,并与GenBank中选取的代表株构建基因进化关系树。结果分析显示:105株NPEVs分别属于HEV-A、HEV-B、HEV-C,其中HEV-A 18株(7个血清型)所占比例为17.1%;HEV-B 77株(22个血清型)所占比例为73.3%,表明云南省AFP病例中流行的NPEV还是以HEV-B为主;HEV-C 10株(4个血清型)所占比例为9.5%;没有分离到HEV-D组肠道病毒;基因进化树中各种血清型病毒与对应原型株及代表株聚集一起,除CA2、EV90和EV76外,云南地方株与原型株位于不同分支。相同型别的毒株在5年的流行过程中变异程度亦不同,亲缘关系远近不一,表明这些病毒在云南省存在不同的传播链。     

人类肠道病毒B组73、75和97型山东地方株的鉴定及其基因特征分析

本研究对3例急性弛缓性麻痹患者标本的阳性病毒分离物进行了分子生物学定型。按照文献报道的方法,用扩增人类肠道病毒(Human Enterovirus,HEV)VP1完整编码区通用引物008-013、011-012进行逆转录-聚合酶链反应,反应产物纯化后进行序列测定。所得序列通过BLAST程序进行基因定型,显示3株病毒分别为HEV B组中新型病毒HEV73、HEV75和HEV97。将获得的序列与GenBank数据库中已有的各型病毒株VP1基因序列进行同源性分析并构建系统发生树,结果显示与各自的原型株相比有较大的变异,提示本次发现的HEV B组73、75、97型山东地方株与各型原型株相比具有不同的基因特征,这是在国内首次发现HEV97。     

菏泽地区2009年肠道病毒71型与其他肠道病毒所致手足口病临床差异研究

目的:探讨EV71引起小儿手足口病与其他肠道病毒所致手足口病的临床特点的差异.方法:回顾性分析2009年3月-9月菏泽地区各定点医院收治的病原学检测为阳性的320例小儿手足口病的临床资料,筛出EV71感染的手足口病患儿进行分析,其他肠道病毒所致手足口痛患儿作为对照组.结果:菏泽地区2009年抽取的病原学检测为阳性的320例患儿,肠道病毒71型引起手足口病占106例,其余为其他肠道病毒所致手足口病.(1)男女发病基本相同,发病年龄1～3岁居多,农村患儿占绝大多数.(2)EV71感染的患儿临床主要表现高热、神经系统症状、无皮疹,大多数外周血象高、血糖高,可合并心肌损害,心电图异常、部分发现胸片、脑电图及核磁异常,部分符合重症手足口病标准.(3)其他肠道病毒感染的惠儿临床症状以皮疹、低热、上感症状为主,少数患儿有精神差,基本不出现神经系统症状,少数发现外周血象高、血糖高、合并心肌损害,一般胸片不会发现异常.(4)56例出现神经系统症状的患儿收集脑脊液进行两次RT-PCR扩增,发现50例EV71阳性.结论:EV71导致的手足口病,病情凶险,易致神经损害及肺水肿,早期识别重症病例,及时救治,普及病原体的检测对提高诊治能力,加强疾病的认识,对减少致残率及死亡率很有帮助.     

肠道病毒71型安徽、河南株的分离与VP1序列进化分析

旨在研究手足口病患者中肠道病毒71型分离株的病毒基因型特征。采集手足口病患者的粪便标本,进行病毒分离和逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)特异性扩增进行鉴定,同时选取其中9株EV71分离株,对其抗原决定簇部位VP1区进行核酸序列测定,并参考EV71 A、B、C各基因型的参考株和以往中国EV71的分离株进行同源分析和构建系统发生树。结果显示,所分析的9株病毒株均为C4亚型,3株安徽株H7、H8和H9的VP1序列相似度很高(≥98.8%,其中H7、H9的相似度为100.0%),4株河南株H3、H4、H5和H6相似度较高(≥98.4%,H3、H4和H5≥99.6%,其中H3、H4的相似度为100.0%),它们同河南株H1、H5的相似度也较高(≥97.2%),河南株H2虽然与其他河南株具有较高的序列相似度,但进化分析表明,其与安徽株同源性较高。结果表明,安徽株H7、H8和H9株变异速率明显加快,这可能导致了手足口病在安徽省的率先爆发与大流行,河南株H2最初可能由安徽传入河南。     

2013～2018年泰安地区手足口病病原学构成及流行病学分析

近年来手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)对我国儿童的健康造成了严重的危害。为了解山东省泰安地区HFMD的感染状况,本研究对2013～2018年度3 043份HFMD标本,应用实时荧光定量PCR进行肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)、柯萨奇病毒A组16型(Coxsachievirus A16,CV-A16)和其他肠道病毒(其他EV)的病原体检测和分析。结果显示,肠道病毒检出阳性率为86.82%,确诊病例中其他EV所占比例最高,为42.92%,EV-A71和CV-A16分别占30.62%和26.46%。EV-A71是引起重症HFMD的主要病原,占73.09%。2013～2016年EV-A71和CV-A16为优势病原,占比例达50%以上,在2014年和2016年出现两个增长高峰。其他肠道病毒与EV-A71、CV-A16出现交替流行状况,2017年所占比例达到54.27%,2018年继续上升至77.78%。本地区HFMD夏季高发,集中在5～8月份,1～4岁幼儿易感,占确诊病例总人数的82.95%,特别是1～2岁年龄段发病...     

National Epidemiology and Evolutionary History of Four Hand,Foot and Mouth Disease-Related Enteroviruses in China from 2008 to 2016

Hand, foot and mouth disease(HFMD) is a major public health concern in China. The most predominant enteroviruses that cause HFMD have traditionally been attributed to enterovirus A71(EVA71) and coxsackievirus A16(CVA16). Since its first large outbreak in 2008, the dominant HFMD pathogens are constantly changing. In 2013 and 2015, CVA6 exceeded both EVA71 and CVA16 to become the leading cause of HFMD in some provinces. However, there still lacks a comprehensive overview on the molecular epidemiology and evolution of HFMD-related enteroviruses at the national level. In this study, we performed systematic epidemiological analyses of HFMD-related enteroviruses using the data of 64 published papers that met the inclusion criteria, and conducted phylogenetic analyses based on 12,080 partial VP1 sequences identified in China before 31 st June 2018. We found that EVA71 prevalence has decreased sharply but other enteroviruses have increased rapidly from 2008 to 2016 and that one subtype of each enterovirus is represented during the epidemic. In addition, four genotypes EVA71_C4, CVA16_B1, CVA6_D and CVA10_C are the most predominant enterovirus strains and collectively they cause over 90% of all HFMD cases in China according to the phylogenetic trees using representative partial VP1 sequences. These four major enterovirus genotypes have different geographical distributions, and they may cocirculate with other genotypes and serotypes. These results suggest that more molecular epidemiological studies should be performed on several enteroviruses simultaneously, and such information should have implications for virological surveillance, disease management, vaccine development and policy-making on the prevention and control of HFMD.     

2010–2015年华东地区猪圆环病毒2型的分子流行病学分析

【目的】猪圆环病毒2型(PCV2)是严重危害世界养猪业的重要传染病,即猪圆环病毒相关疾病(PCVAD)的重要病原,其致病机制及流行规律尚未阐明。本研究对2010–2015年间采集自中国华东地区的病料进行PCV2检测,以探讨中国华东地区PCV2的分子流行病学特征,分析PCV2的遗传演化规律。【方法】本研究利用PCR方法对384份断奶仔猪多系统衰竭综合征疑似发病猪样本进行检测,并对随机选取的42份阳性样品进行PCV2全基因组的测定和分析。【结果】华东地区普遍存在PCV2的感染,阳性率为41.15%。序列扩增获得42株PCV2全长基因组,同源性和系统进化树分析表明,基于PCV2 ORF2和全长核苷酸序列构建的系统进化树结构是基本一致的。从病料中测得的42株PCV2与11株参考毒株序列的ORF2基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为87.0%–100.0%和82.5%–100.0%。遗传进化分析显示,53株PCV2毒株可分为4个基因型,即PCV2a、PCV2b、PCV2c和PCV2d。本文获得的42株序列ORF2基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为89.6%–100.0%和86.8%–100%,...     

山东省十地市人轮状病毒分子流行病学研究

用核酸凝胶电泳法对1985—1986年山东省十地市的318份婴幼儿急性腹泻粪便标本中测出的170份HRV阳性标本作了RNA电泳型分析,发现3个地区为HRVI亚群流行,3个地区为HRVⅡ亚群流行,4个地区为两亚群共同流行,共检出差异电泳型34个,其中14个属长RNA电泳型,20个属短RNA电泳型。在一个地区虽有多个差异电泳型毒株流行,但仅有其中的1—2个占流行优势。在两亚群毒株共同流行区,检出的差异电泳型特别多。本文并对HRV RNA电泳型多形性的原因及意义进行了讨论。     

2008～2010年河南省人肠道病毒71型基因特征和重组分析

对河南省2008～2010年河南省人肠道病毒71型进行基因特征及重组特点研究。对河南省2008～2010年分离的5株肠道病毒EV71型构建VP1序列系统进化树并分析其全基因组序列的重组特点。VP1序列系统进化分析显示2008～2010年河南株均属于C4基因型的C4a亚群,Bootscan分析和5’NCR、P1、P2、P3区的进化树证实C4基因型在2A～2B处存在EV71的B基因型和C基因型的型内重组及在3B～3C处存在EV71的B基因型和CA16/G-10间的型间重组。2008～2010年河南EV71分离株为C4基因型的C4a亚群,与2004年以来的中国大陆优势株流行趋势完全一致,EV71C4基因型存在基因型内和型间双重组现象。     

Molecular typing of non-polio enteroviruses isolated from acute flaccid paralysis cases in Iran from 2010 to 2015

<正>Dear Editor,Acute flaccid paralysis(AFP)is a complex syndrome often caused by polioviruses.While most countries have eradicated wild polioviruses by vaccination,AFP still remains a health problem in these countries.Most studies have highlighted non-polio enteroviruses(NPEVs)as     

昆明地区人输血传播病毒分子流行病学研究

目的检测昆明市体检人群血清输血传播病毒,研究该地区第4和第5组群输血传播病毒分子流行病学特征。方法聚合酶链反应检测血清输血传播病毒,阳性样品测序后进行同源性和系统进化分析。结果检测了224份血清,通过序列测定和比对确定了151份阳性样品,病毒感染率为67.41%（151/224）,第4组群和第5组群分别检测到48份和79份,混合感染10份,两组群输血传播病毒流行率为21.43%（48/224）和35.27%（79/224）,混合感染率为4.46%（10/224）。结论获得了昆明地区第4和第5组群输血传播病毒流行病学数据,为昆明地区输血传播病毒的预防奠定基础。     

河南省2009—2013年流行性腮腺炎流行病学特征分析

了解河南省2009—2013年流行性腮腺炎的流行病学特征及规律,为制定流行性腮腺炎的预防控制措施提供参考依据。方法对河南省2009年1月1日至2013年12月31日通过"传染病报告信息管理系统"网络直报系统获得的流行性腮腺炎个案资料进行描述性流行病学分析。结果 2009—2013年河南省累计报告流行性腮腺炎病例91 822例,年均发病率为19.50/10万,男女发病比为1.95∶1(男性60 699例,女性31 123例),14岁以下年龄组发病率较高,年均发病率为88.99/10万,学生是主要的发病人群;流行性腮腺炎冬春季节多发,疾病流行呈现双峰分布;每年均有暴发疫情报告,多为学校内暴发。结论 2013年河南省年流行性腮腺炎发病率呈现下降趋势。暴发疫情起数和病例数波动较大,学校及托幼机构是流行性腮腺炎暴发流行的主要场所,应加强冬春季节学校及托幼机构流行性腮腺炎疫情的预防与控制,做好腮腺炎疫苗接种工作。     

Molecular Identification of Cryptosporidium spp., Enterocytozoon bieneusi,and Giardia duodenalis in Captive Pet Birds in Henan Province,Central China

Cryptosporidium spp., Enterocytozoon bieneusi, and Giardia duodenalis are common enteric pathogens that are capable of infecting humans and animals. Total of 1,005 fecal samples from captive pet birds were collected from seven locations in Henan Province, China. The results demonstrated that 9.9% (99/1,005) of the captive birds were infected with one of these three pathogens. Enterocytozoon bieneusi was the most prevalent species among the birds (45/1,005, 4.5%) followed by G. duodenalis (33/1,005, 3.3%) and Cryptosporidium spp. (21/1,005, 2.1%). Five Cryptosporidium species were identified, namely, C. baileyi (10), C. galli (5), C. meleagridis (4), C. andersoni (1), and C. parvum (1). Two known E. bieneusi genotypes were identified: Peru 6 (44) was identified in pigeons (34) and European turtle doves (10); whereas, the genotype PtEb I (1) was only identified in a pigeon. Only G. duodenalis assemblage E (33) was identified in some pet birds. To the best of our knowledge, this study is the first to undertake the molecular identification of G. duodenalis in birds in China. The identification of potentially zoonotic species/genotypes of the pathogens suggests that exposure to the excreta of these birds, either directly or via food and water, may pose a threat to human health.     

中国的炭疽杆菌DNA分型及其地理分布

炭疽广泛分布于中国各地,特别是西部地区,并经常造成人畜疾病,在一项合作研究中,用多位点VNTR分析（MLVA）对从1952-1998年自中国主要地理流行区域分离的病人,病畜和土壤等来源的炭疽杆菌进行了基因分型,MLVA分析结果揭示了21种新的基因型,其等位基因组合在以前世界范围分离物的研究中未曾发现,此外,分离物的分群显示,A3b组是地理上最广泛分布的基因组,说明该组可能是中国的“地方流行株”。而来自古丝绸之路重要贸易中心新疆的大量分离株其基因型特别分散。     

肠道病毒71型实验室诊断研究进展

肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)为手足口病(Handf,oot and mouth disease,HFMD)和相关疾病的主要病原体,多感染婴幼儿,少数病例可以并发呼吸道感染和心肌炎、无菌性脑膜炎、脑炎、急性弛缓性麻痹等严重疾病,可致残、致死。因此EV71实验室诊断对EV71引起疾病的治疗和防控具有重要意义。本文将从核酸检测、抗体检测及其他检测等三部分对EV71的实验室诊断方法研究进展进行了综述。