肠杆菌科检索系统

肠杆菌为一群革兰氏阴性杆状,发酵型、周毛和氧化酶阴性的细菌。它在医学、农业和遗传学研究上都具有特殊的重要性。因此,人们都予以极大的注视。但在肠杆菌的鉴定中还存在着不少问题。虽然肠杆菌科与邻近菌科、属的界线较为明确,但在科内的属间很难区分,从伯杰氏细菌鉴定手册的不同版本都可反映出它们犹如“连续性光谱”形象化的描述,说明属间没有清晰的界线,因此,它们彼此不易鉴别。为此,我们     

肠杆菌科检索系统(续)

成团肠杆菌是一群符合肠杆菌科定义的产类胡萝卜素的黄色菌群,它来自植物标本(种子和果实等)、人的临床标本(类似伤寒病例)、低等动物等,过去曾命名为草生欧文氏菌。后又有许多同物异名包括山黧     

肠杆菌科检索系统(续)

J.运动乡间布丘氏菌Buttiauxella agrestis JJ.不运动K.鸟氨酸脱羧酶 肠道菌群17 Enteric Group 17 KK.鸟氨酸脱羧酶-肺炎克雷伯氏菌臭鼻亚种K.pneumoniac subisp. ozavnae HH.水杨素一I.脲酶 罗氏耶尔森氏菌Yersinia rohdei     

肠杆菌科的分类

肠杆菌科是细菌中的一大类群。它包括动物肠道寄生的致病菌和非致病菌,一些植物的致病菌和腐生型的细菌。这类细菌与人类生活关系密切。例如沙门氏菌属和志贺氏菌属等污染食品后引起人的感染和食物中毒,其他的多数菌属也都有一定的致病力,有的还引起肠道外的感染。此外,还可以利用能发酵乳糖的四个菌属,即所谓“大肠菌群”,作为检查粪便污染的卫生学指标。     

肠杆菌科单管生化鉴定法

肠杆菌科致病菌在鉴定过程中,需要双糖、三糖或赖氨酸铁琼脂培养基。但这类培养基的鉴别范围有限,为了扩大其鉴别范围,经不断改进,研制出肠杆菌科单管生化鉴别培养基。使用效果较好。介绍如下。材料和方法一、肠杆菌科单管生化鉴别培养基(简称综合培养基)     

肠杆菌科细菌鉴定的进展

本文以第９版伯杰鉴定细菌学手册（１９９４年）为基础,简述肠杆菌科细菌分类与命名历史、鉴定与鉴别特性,着重介绍１９８４￣１９９４年新增加的１０个属的生物学特性和鉴别要点。     

运用微型计算机进行肠杆菌科的鉴定

在微型计算机上采用BASIC语言和概率最大近似值模型法编制程序,以肠杆菌科为鉴定模式,用该科的20个种(属)的细菌为分类单位,将各分类单位的20个生化试验的阳性概率值编入程序。在未知菌生化结果输入后,计算出被鉴定菌与各分类单位相比较的相似值(PXn)和鉴定值(PXn/ΣPXn)。程序规定鉴定值大于0.995时,被鉴定菌与相比较的分类单位为同一细菌。运用该程序对248株肠道杆菌进行鉴定,符合率达93.9%。     

实蝇肠杆菌科共生菌的研究进展

实蝇与体内微生物的共生关系是目前较受关注的研究课题。其中,肠杆菌科细菌是这些内共生微生物中的重要一类,广泛存在于实蝇肠道和生殖系统中。研究证明,共生肠杆菌科细菌在参与实蝇的碳氮循环、营养代谢、生殖免疫及生物防治等方面都发挥着极大的作用。近年来,人们利用分子生物学技术已鉴定出部分实蝇内共生肠杆菌科细菌的类群,发现许多优势的益生肠杆菌种和代谢产物,它们能增强实蝇的健康,提高昆虫不育技术的应用高效性。本文对实蝇共生肠杆菌科细菌的种类、分布和作用,以及它们在不育昆虫技术中的应用进展作一综述,这不仅有助于人们更深入地了解宿主与共生菌群落间的互作关系,而且对人类开发新型实蝇防治饵剂以及将此类共生益生菌应用于实蝇不育技术有重要意义。     

肠杆菌科丝氨酸蛋白酶自动转运家族研究进展

肠杆菌科丝氨酸蛋白酶自动转运家族(SPATE)蛋白是指致病性肠道杆菌通过自动转运方式产生的一类毒性蛋白。此类蛋白的氨基酸同源性可达35%～55%,均由3个部分组成:N端信号肽序列,协助分泌性毒性蛋白穿越细菌内膜;中部载乘区域,是发挥各种生物学功能的主要结构域;C端转运单位,促使载乘结构域自细菌周浆间隙向胞外分泌。α螺旋的铰链区连接载乘区域和C端转运单位,其中14个氨基酸残基的组成序列EVNNLNKRMGDLRD非常保守,是蛋白酶水解位点,也是整个蛋白中最长的保守氨基酸序列,在SPATE蛋白的分泌和成熟过程中起着十分重要的作用,其改变往往会引起该蛋白家族不能正常分泌和成熟。目前,有研究将其作为药物作用的新靶点。     

产NDM-1肠杆菌科细菌的研究进展

产新德里金属β-内酰胺酶-1(New delhimetallol-β-lactamase 1,NDM-1)肠杆菌科细菌对碳青霉烯类抗生素耐药,只对多黏菌素和替加环素敏感,接近于泛耐药菌株。此酶的blaNDM-1基因在肠杆菌科细菌间高效率的转移和人为因素(如旅游、卫生和食品的生产和制备)的影响,使其在全球迅速传播。目前有关其治疗的临床研究较少,为减缓NDM-1肠杆菌科细菌的传播,应加速开发诊断和治疗的相应措施。现就产NDM-1肠杆菌科细菌的分子生物学特点、诊断、治疗、新药研发和预防作一综述。     

肠杆菌科细菌群体感应系统的研究进展

细菌能够感受种群密度的变化,并通过调节自身某些基因的表达来作出应答,这种细菌种间和种内的沟通方式被称为群体感应(QS)。肠杆菌科细菌大多是食源性致病菌或食品腐败菌,且研究证明毒力因子的调控表达和食品的腐败变质均与QS密切相关。本文中,笔者综述了肠杆菌科成员中5种信号分子介导的群体感应系统,包括N-酰基高丝氨酸内酯(AHLs)介导的Ⅰ型QS系统、由自诱导物2(AI-2)介导的Ⅱ型QS系统、AI-3/肾上腺素/去甲肾上腺素介导的Ⅲ型QS系统、一种线型五肽(NNWNN) QS因子EDF(extracellular death factor)短肽介导的QS系统和吲哚介导的QS系统,并对其在毒力基因和食品腐败变质的调控机制中的研究进行了介绍。     

肠杆菌科细菌碳青霉烯酶基因的检测

摘要：目的 了解余姚地区耐碳青霉烯类药物肠杆菌科细菌的耐药情况和碳青霉烯酶耐药基因类型。方法 收集2014年3月至12月耐亚胺培南和厄他培南的肠杆菌科细菌18株,进行Hodge试验确认。对于阳性试验菌株采用PCR法检测blaKPC、blaNDM-1、blaMH、blaGES、blaSME、blaNmcA和blaSHV-387种基因。结果 18株耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌经改良Hodge试验确认阳性11株,占61.1%。经PCR检测显示11株均携带有blaKPC基因,其中肺炎克雷伯菌6株,大肠埃希菌3株,阴沟肠杆菌2株。结论 余姚地区耐碳青霉烯类药物肠杆菌科细菌的耐药机制主要是blaKPC型碳青霉烯酶。     

碳青霉烯耐药的肠杆菌科细菌诊断进展

碳青霉烯耐药的肠杆菌科细菌(Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)在全球快速上升,已出现了不同的基因型,为临床诊治提出新的挑战。CRE分为具有不同特点和耐药基因的三大类五大家族;诊断方法包括Kirby-Bauer法初筛试验,碳青霉烯类药物的协同试验(EDTA与美罗培南、苯硼酸与美罗培南的双纸片抑制法)、改良的Hodge试验、显色培养基检测等CRE筛选试验,而Carba NP比色微管试验、PCR及测序等为CRE确认试验。上述方法均各有其优缺点,可根据当地的主要流行CRE型别和实验条件选择应用。     

产ESBLs肠杆菌科细菌的检测及耐药性

目的对产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的病原菌分布及耐药性进行分析,进而为临床合理用药提供依据。方法应用西门子MicroScan autoSCAN4全自动细菌鉴定及药敏分析仪对2014年1月-12月在大连市妇幼保健院住院患者送检的标本进行菌株鉴定及药敏分析,对提示产ESBLs的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌进行纸片扩散法确认,统计分析其分布情况及耐药情况。采用ERIC-PCR法检测同源性。结果检测出125株产ESBLs的肠杆菌,包括大肠埃希菌88株,肺炎克雷伯菌37株。其病区分布情况:肺炎克雷伯菌主要分布在新生儿科,占67.6%,且存在流行感染。大肠埃希菌主要分布在各个产科病房,占48.9%。产ESBLs的肠杆菌对18种抗菌药物的分析表明对β-内酰胺类及第三代头孢菌素类抗生素耐药率达100.0%,对氨基糖苷类、喹诺酮类、四环素类和磺胺类药物出现不同程度的耐药,对碳青霉烯类抗生素敏感率较高。结论临床分离的产ESBLs的肠杆菌主要以大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌为主,且为多重耐药,甚至广泛耐药,因此临床治疗上应严格合理选用抗生素。     

世界水生植物科属检索系统的设计与建立

生物分类学涉及海量数据 ,而且随着研究的不断深入 ,各类相关信息还在以惊人的速度增长 ,这为利用传统方法和管理模式处理复杂的数据带来了很大困难。随着计算机技术的发展 ,其特有的高效性、稳定性等特点为大量生物信息的处理带来了革命性的变化。利用计算机技术管理生物信息不仅可以大幅度提高工作效率 ,而且对充分发挥其管理信息的作用具有重要的意义。人们已经在分类学方面进行了许多工作 ,也取得了不少成绩。例如英国的国立植被分类系统 ( Na-tional Vegetation Classification) ,它全面系统地总结了整个英国的植被类型 ,其支撑系统…     

概率在肠杆菌科菌属鉴定中的应用

作者应用概率原理,使传统的定性鉴定细菌的方法数值化,增加了鉴定结果的把握性。根据十项生化试验结果,对肠杆菌科作出属的鉴定,效果较满意,现介绍如下。     

肠杆菌科细菌碳青霉烯酶基因的检测

目的了解余姚地区耐碳青霉烯类药物肠杆菌科细菌的耐药情况和碳青霉烯酶耐药基因类型。方法收集2014年3月至12月耐亚胺培南和厄他培南的肠杆菌科细菌18株,进行Hodge试验确认。对于阳性试验菌株采用PCR法检测bla_(KPC)、bla_(NDM-1)、bla_(MH)、bla_(GES)、bla_(SME)、bla_(NmcA)和bla_(SHV-38)七种基因。结果 18株耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌经改良Hodge试验确认阳性11株,占61.1%。经PCR检测显示11株均携带有bla_(KPC)基因,其中肺炎克雷伯菌6株,大肠埃希菌3株,阴沟肠杆菌2株。结论余姚地区耐碳青霉烯类药物肠杆菌科细菌的耐药机制主要是bla_(KPC)型碳青霉烯酶。     

碳青霉烯耐药肠杆菌科细菌主动筛查研究进展

耐碳青霉烯类抗菌药物的肠杆菌科细菌（carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE）的感染已成为威胁全球人类健康的严重问题。预防CRE感染已迫在眉睫。人体肠道是绝大多数细菌的储存库,而导致院内感染主要的危险因素之一是肠道中定植的耐药菌。CRE定植一般先于或同步于CRE感染,对入院48 h内患者进行CRE主动筛查并对阳性结果的患者采取主动干预措施是预防CRE感染与传播的有效途径。该文就CRE传播与流行、需要筛查的人群、主要的筛查样本及主要的筛查方法等作一综述。     

肠杆菌科细菌医院感染调查及耐药性分析

目的了解我院肠杆菌科细菌医院内感染情况及临床特点,为临床治疗提供参考依据。方法回顾性分析2016年1月～2017年8月我科临床分离的肠杆菌科细菌的临床分布特点、院内感染与耐药情况。结果在820株肠杆菌科细菌中,大肠埃希菌446株(54.39%),肺炎克雷伯菌158株(19.27%),阴沟肠杆菌91株(11.09%),产气肠杆菌47株(5.73%),其他种类肠杆菌科细菌78株(9.51%)。从痰液中分离出380株(46.34%)占比最大,其次是尿液183株(22.32%)、支气管灌洗液63株(7.68%)。大肠埃希菌对氨苄西林、哌拉西林、四环素、头孢唑啉和复方新诺明有较高耐药率,分别为93.05%(415/446)、84.75%(378/446)、83.18%(371/446)、74.89%(334/446)和73.09%(326/446);阴沟肠杆菌对亚胺培南、美罗培南、阿米卡星的耐药率最低(9.89%)。结论肠杆菌科细菌医院内的感染以大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和阴沟肠杆菌为主,对常用抗菌药物呈现不同程度耐药,而对碳青霉烯类最敏感,其次是阿米卡星,但碳青霉烯类药已出现耐药株,故应加强对肠杆菌科细菌耐药性的监测,以指导临床合理使用抗菌药,控制医院感染的发生。     

肠杆菌科AcrAB多药外排泵分子演化分析

目的：分析肠杆菌科AcrAB多药外排泵的分子演化规律,为多药耐药性病原菌的防治提供基础数据。方法：从NCBI获得肠杆菌科物种AcrAB多药外排泵相关蛋白和核酸序列,采用分析软件,分析肠杆菌科物种AcrAB多药外排泵相关序列。结果：在肠杆菌科各物种AcrA、AcrB和AcrR与大肠埃希氏菌同源性在55%、75%和43%以上。AcrA保守位点分散,在N端和C端较少,在分子一级结构中段较多。AcrB跨膜序列保守性较高,与质子转移相关的三个位点D407、D408和K940以及稳定这三者结构的T978在肠杆菌科完全保守,其一级结构上相邻位点也保守。AcrR序列整体保守性较低,但HTH区域保守性高。与AcrR结合的回文结构及周围序列保守性高,在＂茎＂结构中仅存在一个氨基酸的差异。结论：AcrAB多药外排泵在肠杆菌科中广泛存在,有一定的保守性。分析肠杆菌科AcrAB多药外排泵有助于病原菌多药耐药性的防治。