透骨川椒汤在妇科慢性盆腔炎治疗中的临床疗效观察

目的：探讨透骨川椒汤在妇科炎症治疗中的应用价值。方法：收集妇科慢性盆腔炎病例508例,分为治疗组和对照组各254例,两组除相同的基础治疗外,治疗组加用透骨川椒汤治疗,并对比两组疗效。结果：治疗组治愈率为50.4%,明显高于对照组的28.3%（P〈0.05）。治疗组与对照组的治疗无效率比较无显著性差异（P〉0.05）。结论：透骨川椒汤在治疗妇科慢性盆腔炎效果可靠,有着较好的应用前景。     

透骨川椒汤在妇科慢性盆腔炎治疗中的临床疗效观察

目的:探讨透骨川椒汤在妇科炎症治疗中的应用价值.方法:收集妇科慢性盆腔炎病例508例,分为治疗组和时照组各254例,两组除相同的基础治疗外,治疗组加用透骨川椒汤治疗,并对比两组疗效.结果:治疗组治愈率为50.4%,明显高于对照组的28.3%(P＜0.05).治疗组与对照组的治疗无效率比较无显著性差异(P＞0.05).结论:透骨川椒汤在治疗妇科慢性盆腔炎效果可靠,有着较好的应用前景.     

宁夏地区春季奶牛场牛舍土壤细菌群落特征

【背景】现代规模化生产模式下,牛舍环境管理是影响奶牛高效健康生产的重要因素。【目的】探讨牛场不同牛舍土壤细菌群落特征,为奶牛健康生产提供理论依据。【方法】采集宁夏某规模化奶牛场的哺乳犊牛岛、断奶犊牛舍、育成牛舍、低产泌乳牛舍、高产头胎泌乳牛舍、高产经产泌乳牛舍、干奶牛舍和病牛舍这8个不同牛舍的土样,每个牛舍6个重复,共48份土样。利用16S rRNA基因扩增子测序分析细菌群落结构与多样性,并对细菌群落的功能进行预测。【结果】不同牛舍土样细菌群落组成存在差异,并且8个牛舍中高产头胎泌乳牛舍土样的细菌群落多样性最高。哺乳犊牛岛土壤与其他牛舍土壤细菌群落在门水平上差异较大;泌乳期牛舍土样之间的细菌群落结构相似度较高。在门的水平上,拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)是这8个牛舍土样共有的优势菌门。在属的水平上,嗜盐碱的盐单胞菌属(Halomonas)、具有潜在降解特性的Fermentimonas和栖海面菌属(Aequorivita)及致病菌的鸟杆菌属(Ornithobacterium)是犊牛期牛舍土样的优势菌属;嗜盐碱的Truepera是育成牛舍土样的优势菌属;致病菌的不动杆菌属(Acinetobacter)和Parapedobacter、耐药菌的Pedobacter是泌乳期牛舍土样的优势菌属。【结论】致病菌和参与硝酸盐呼吸的细菌主要分布在哺乳犊牛岛,嗜盐碱菌主要分布在断奶犊牛舍和育成牛舍,产甲烷的细菌主要分布在高产头胎泌乳牛舍。本研究分析了不同牛舍土壤细菌群落多样性,为奶牛健康生产提供理论依据。     

Integrating metagenomic and amplicon databases to resolve the phylogenetic and ecological diversity of the Chlamydiae

In the era of metagenomics and amplicon sequencing, comprehensive analyses of available sequence data remain a challenge. Here we describe an approach exploiting metagenomic and amplicon data sets from public databases to elucidate phylogenetic diversity of defined microbial taxa. We investigated the phylum Chlamydiae whose known members are obligate intracellular bacteria that represent important pathogens of humans and animals, as well as symbionts of protists. Despite their medical relevance, our knowledge about chlamydial diversity is still scarce. Most of the nine known families are represented by only a few isolates, while previous clone library-based surveys suggested the existence of yet uncharacterized members of this phylum. Here we identified more than 22 000 high quality, non-redundant chlamydial 16S rRNA gene sequences in diverse databases, as well as 1900 putative chlamydial protein-encoding genes. Even when applying the most conservative approach, clustering of chlamydial 16S rRNA gene sequences into operational taxonomic units revealed an unexpectedly high species, genus and family-level diversity within the Chlamydiae, including 181 putative families. These in silico findings were verified experimentally in one Antarctic sample, which contained a high diversity of novel Chlamydiae. In our analysis, the Rhabdochlamydiaceae, whose known members infect arthropods, represents the most diverse and species-rich chlamydial family, followed by the protist-associated Parachlamydiaceae, and a putative new family (PCF8) with unknown host specificity. Available information on the origin of metagenomic samples indicated that marine environments contain the majority of the newly discovered chlamydial lineages, highlighting this environment as an important chlamydial reservoir.     

Characteristics of the Cervicovaginal Microenvironment in Childbearing-Age Women with Different Degrees of Cervical Lesions and HR-HPV Positivity

Persistent infection with high-risk human papillomavirus (HR-HPV) is the most important determinate in the development of cervical cancer, and cervical microecology can modulate cervical viral infection. However, few studies have been conducted on the microecological analysis of cervical diseases using strict physiological factors. This study investigated the characteristics and dynamics of cervical microecology in childbearing-age Chinese women with different degrees of HR-HPV-positive cervical lesions. A total of 168 subjects were selected according to the selection criteria, including healthy HPV-negative individuals (n = 29), HR-HPV-infected individuals (n = 29), low-grade squamous intraepithelial lesion individuals (LSIL, n = 32), high-grade squamous intraepithelial lesion individuals (HSIL, n = 40), and cervical cancer individuals (n = 38). We sampled cervical secretions from each subject and performed comparative analysis using the 16S rRNA sequencing method. Comparison analysis showed that Lactobacillus and Ignatzschineria were the dominant genera in the healthy group, while Gardnerella and Prevotella were more enriched in the disease groups. Based on the taxa composition, we roughly divided the development of cervical cancer into two phases: phase I was from healthy status to HR-HPV infection and LSIL; phase II was from LSIL to HSIL and cervical cancer. Different interactions among different genera were observed in different groups. Prevotella inhibited the abundance of Lactobacillus in the healthy group, while Prevotella inhabited the abundance of Gardnerella in the other groups. In the HR-HPV infection group, Ignatzschineria and Enterococcus showed a positive interaction but dissociated with the increase in cervical lesions, which might eventually lead to a continuous decrease in the abundances of Lactobacillus and Ignatzschineria.     

应用短波疗法联合护理干预可改善慢性盆腔炎临床症状

为探讨短波疗法联合护理干预对慢性盆腔炎的治疗效果,本研究选取140例慢性盆腔炎病例患者,将患者按照随机数字表法进行分组,分为试验组和对照组,每组70例。两组患者均给予消炎、活血等基础治疗及常规护理措施,试验组同时给予短波及护理干预,对比两组治疗4周后的临床效果。研究发现,治疗前,试验组和对照组的临床症状、体征评分比较差异无统计学意义(p>0.05);治疗后,试验组的临床症状、体征评分显著的低于对照组(p<0.05);治疗前,试验组和对照组血清IL-6、TNF-α、CRP水平比较差异无统计学意义(p>0.05);治疗后,试验组的血清IL-6、TNF-α、CRP水平显著的低于对照组(p<0.05)。治疗后,试验组治愈率28.57%、有效率51.43%、无效率5.71%,对照组治愈率14.28%、有效率60.00%、无效率11.43%,两组疗效比较差异具有统计学意义(p<0.05)。研究表明,短波疗法联合护理干预治疗慢性盆腔炎患者能显著的缓解其临床症状及体征,减轻患者的炎症反应程度,提高临床效果,具备临床进一步推广应用的价值。     

细菌性阴道病及其合并盆腔炎患者的阴道菌群分析

目的 对比细菌性阴道病及其合并盆腔炎患者与健康个体的阴道菌群,分析阴道菌群的结构,为确定该疾病的特征细菌及研究致病机制奠定基础。方法 采用临床Amsel标准筛选的17例细菌性阴道病患者、13例细菌性阴道病合并盆腔炎患者和52例健康者,使用无菌拭子采集阴道后穹窿分泌物以提取细菌基因组DNA。采用PCR技术扩增上一步得到的16S rRNA片段,而后将扩增产物通过变形梯度凝胶电泳（DGGE）分离以得到阴道细菌种属结构图谱,应用Quantity One软件进行聚类分析,应用凝胶测序法进行特异条带分析。检测16S rRNA基因,具体研究样品中的物种分类。结果 细菌性阴道病及其合并盆腔炎患者的阴道菌群的构成与健康者相比较具有显著性差异。其中,Firmicutes等菌门细菌减少,Actinobacteria等菌门细菌增多;G. vaginallis、P. vaginallis等厌氧菌数量均增加,L.crispatus、L.iners等益生菌数量均有减少。结论 细菌性阴道病及其合并盆腔炎患者的生殖道内的合并感染改变了阴道内的原有微生态平衡。两组疾病组患者的阴道菌群构成相比于健康对照组变化明显。     

健康妇女及3例细菌性阴道病患者阴道菌群的非培养分析

根据Amsel标准及Nugent标准,确诊筛选健康妇女及细菌性阴道病(bacterial vaginosis,BV)患者各3例.提取其阴道分泌物样本的总DNA,构建16S rRNA基因克隆文库,并对阳性克隆进行ARDRA和测序分析.结果表明,健康妇女样本的基因文库中,分别以卷曲乳酸杆菌(L.crispatus)和惰性乳酸杆菌(L. iners)的克隆子占较大比例,另外存在少量的阴道乳酸杆菌(L.vaginalis)或詹氏乳酸杆菌(L.jensenii)的克隆子.BV患者样本的基因文库中,克隆子所代表的菌种类型明显增多,但均以阴道加德纳氏菌(Gardnerella vaginalis)和阴道阿托波氏菌(Atopobium vaginae)的克隆子占较大比例,且无乳酸杆菌克隆子.说明健康妇女阴道菌群的种类单一,以乳酸杆菌占优势,L. iners为优势菌种之一;BV患者阴道菌群的种类复杂多样,但均以Gardnerella vaginalis及Atopobium vaginae共同占优势.     

健康妇女及3例细菌性阴道病患者阴道菌群的非培养分析

根据Amsel标准及Nugent标准, 确诊筛选健康妇女及细菌性阴道病(bacterial vaginosis, BV)患者各3例。提取其阴道分泌物样本的总DNA, 构建16S rRNA基因克隆文库, 并对阳性克隆进行ARDRA和测序分析。结果表明, 健康妇女样本的基因文库中, 分别以卷曲乳酸杆菌(L. crispatus)和惰性乳酸杆菌(L. iners)的克隆子占较大比例, 另外存在少量的阴道乳酸杆菌(L. vaginalis)或詹氏乳酸杆菌(L. jensenii)的克隆子。BV患者样本的基因文库中, 克隆子所代表的菌种类型明显增多, 但均以阴道加德纳氏菌(Gardnerella vaginalis)和阴道阿托波氏菌(Atopobium vaginae)的克隆子占较大比例, 且无乳酸杆菌克隆子。说明健康妇女阴道菌群的种类单一, 以乳酸杆菌占优势, L. iners为优势菌种之一; BV患者阴道菌群的种类复杂多样, 但均以Gardnerella vaginalis及Atopobium vaginae共同占优势。     

基于16S rRNA基因测序分析微生物群落多样性

微生物群落多样性的研究对于挖掘微生物资源,探索微生物群落功能,阐明微生物群落与生境间的关系具有重要意义。随着宏基因组概念的提出以及测序技术的快速发展,16S rRNA基因测序在微生物群落多样性的研究中已被广泛应用。文中系统地介绍了16S rRNA基因测序分析流程中的四个重要环节,包括测序平台与扩增区的选择、测序数据预处理以及多样性分析方法,就其面临的问题与挑战进行了探讨并对未来的研究方向进行了展望,以期为微生物群落多样性相关研究提供参考。     

饮酒对健康成年男性肠道菌群的影响

目的寻找饮酒与不饮酒的成年男性肠道菌群的差异,探讨饮酒对健康成年男性肠道菌群的影响。方法收集前往湖北省人类精子库进行捐精前精液质量筛查的健康成年男性的粪便样本50例(饮酒组37例,不饮酒组13例),提取DNA后进行16S rRNA基因扩增子测序。结果饮酒组的肠道菌群α多样性与不饮酒组的差异无统计学意义但β多样性差异有统计学意义(PERMANOVA,F=0.544 9,P=0.014 0)。饮酒组中出现放线菌门和双歧杆菌科的显著富集,且出现了科与属水平种类的减少,相比不饮酒组少了12个菌科和27个菌属。通过差异性菌群分析发现放线菌门下Bifidobacterium spp.和厚壁菌门下的Blautia spp.、Dorea spp.和Ruminococcus spp.在饮酒组富集。结论饮酒可能会改变健康成年男性的肠道菌群,饮酒组与不饮酒组人群的肠道菌群在群落结构上存在差异。     

大熊猫精液和包皮菌群组成及潜在致病菌调查

[目的] 大熊猫是我国国家一级保护动物,其种群面临着传染病和栖息地破碎化等持续威胁,其中生殖系统的细菌感染和菌群失衡会影响大熊猫生殖健康,严重者可导致流产,是引起大熊猫繁殖障碍的原因之一。本研究对精液与包皮分泌物样本的菌群组成情况及分离培养潜在致病菌开展研究。[方法] 通过采集13份大熊猫包皮分泌物和12份精液样本,采用16S rRNA扩增子测序技术、细菌培养及PCR鉴定的方法,确定样本中的细菌种类。[结果] 菌群组成分析结果显示,在门水平上,厚壁菌门（Firmicutes）的细菌丰度在大熊猫包皮与精液中均为最高;在属水平上,不同时期的雄性大熊猫包皮的菌群可能会发生改变,棒状杆菌属（Corynebacterium）和Dolosicoccus是Ⅰ期包皮样本中最丰富的微生物菌群,相对丰度分别为15.45%和12.40%;链球菌属（Streptococcus）和埃希氏菌属（Escherichia）是Ⅱ期包皮样本中最丰富的微生物菌群,相对分度分别为37.94%和9.68%;拟杆菌属（Bacteroides）和普雷沃氏菌属（Prevotella）是精液样本中最丰富的微生物菌群,相对丰度分别为14.40%和12.88%。菌群多样性分析结果显示,精液样品高于Ⅰ期包皮样品和Ⅱ期包皮样品,Ⅰ期包皮样品和Ⅱ期包皮样品之间无显著差异。通过细菌分离培养得到肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumonia）在内的多种潜在性致病菌。[结论] 本研究分析了大熊猫精液和不同时期包皮分泌物的菌群组成,其优势菌属存在差异,大熊猫包皮与精液中存在潜在性致病菌,这可能对大熊猫的生殖系统健康带来威胁,其致病性有待进一步研究。     

金英胶囊联合阿奇霉素对慢性盆腔炎患者盆腔血流动力学、炎症细胞因子和T淋巴细胞亚群的影响

摘要 目的：观察金英胶囊联合阿奇霉素对慢性盆腔炎患者盆腔血流动力学、炎症细胞因子和外周血T淋巴细胞亚群的影响。方法：按照随机数字表法,将2020年3月~2022年9月期间湖南省妇幼保健院收治的147例慢性盆腔炎患者分为对照组（阿奇霉素片治疗,73例）和研究组（金英胶囊联合阿奇霉素片治疗,74例）。对比两组临床指标、盆腔血流动力学、炎症细胞因子和外周血T淋巴细胞亚群水平,同时观察两组不良反应发生情况。结果：与对照组相比,研究组乏力、腰骶疼痛、白带量多等症状缓解时间更短（P<0.05）。与对照组相比,研究组治疗后白细胞介素-10（IL-10）更高,白细胞介素-1β（IL-1β）、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）更低（P<0.05）。与对照组相比,研究组治疗后CD8⁺更低,CD3⁺、CD4⁺、CD4⁺+/CD8⁺更高（P<0.05）。与对照组相比,研究组治疗后卵巢动脉、子宫动脉的阻力指数（RI）更低,卵巢动脉、子宫动脉的脉搏指数（PI）、收缩期峰值流速（PSV）更高（P<0.05）。两组不良反应发生率组间比较无差异（P>0.05）。结论：金英胶囊联合阿奇霉素治疗慢性盆腔炎患者,可促进临床症状改善,可能与改善患者的盆腔血流动力学、炎症细胞因子和外周血T淋巴细胞亚群水平有关。     

丹黄祛瘀胶囊联合阿奇霉素对慢性盆腔炎患者血液流变学和血清炎症因子的影响

摘要 目的：观察阿奇霉素联合丹黄祛瘀胶囊在慢性盆腔炎患者中的应用价值。方法：研究病例选自2019年6月至2021年6月期间我院收治的慢性盆腔炎患者127例,采用随机数字表法将符合要求的患者分为对照组（63例,阿奇霉素治疗）和观察组（64例,丹黄祛瘀胶囊联合阿奇霉素治疗）,两组均治疗2周。对比两组疗效、临床症状消失时间、血液流变学和血清炎症因子变化情况,观察两组不良反应的发生情况,并作记录。结果：观察组临床总有效率高于对照组（P<0.05）。观察组的腰骶胀痛、下腹疼痛、带下异常等症状消失时间短于对照组（P<0.05）。观察组治疗2周后的白介素-6（IL-6）、白介素-1β（IL-1β）、C反应蛋白（CRP）低于对照组（P<0.05）。观察组治疗2周后的全血高切黏度、全血低切黏度、纤维蛋白原及红细胞沉降率低于对照组（P<0.05）。两组患者的不良反应发生率组间对比无统计学差异（P>0.05）。结论：慢性盆腔炎在阿奇霉素治疗基础上联合丹黄祛瘀胶囊,症状得到明显缓解,同时还可改善机体血液流变学和炎症因子水平,临床应用价值较好。     

Genotypic characterization of bacteria cultured from duck faeces

AIMS: To characterize the bacterial composition of mallard duck faeces and determine if novel bacterial species are present that could be utilized as potential indicators of avian faecal contamination. METHODS AND RESULTS: Combined samples of fresh faeces from four ducks were serially diluted and plated onto six different media selected to allow the growth of a range of organisms at 42 degrees C under three atmospheric conditions: aerobic, microaerophilic and anaerobic. Forty-seven morphologically dissimilar isolates were purified and partial sequencing of the16S rRNA indicated at least 31 bacterial species. Twenty of these could be identified to the species level including pathogenic species of Bacillus, Campylobacter, Clostridium and Streptococcus. Other species identified included: Enterococcus, Escherichia, Megamonas, Cellulosimicrobium, Neisseria, Staphylococcus and Veillonella. Potentially novel species, which could represent bacteria specific to avian fauna included Bacillus, Corynebacterium, Macrococcus and Peptostreptococcus, while four isolates had <97% similarity to known bacterial species in the available databases. CONCLUSION: A survey of the natural microflora of the mallard duck and its hybrid with the grey duck identified both bacteria that are potentially human pathogenic and putative novel bacteria species as determined by 16S rRNA sequencing. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: This study provides further evidence that duck faeces is a potential human health hazard, and has identified bacteria potentially useful for distinguishing duck faeces from other faecal sources.     

基于16S rRNA基因扩增子测序分析日本囊对虾肠道菌群结构与功能的特征

【背景】肠道菌群在对虾的生理活动中起关键作用。日本囊对虾是我国海水养殖虾类中的主要品种之一,迄今为止有关其肠道菌群结构与功能的研究还鲜有报道。【目的】利用高通量测序技术探究日本囊对虾肠道菌群的组成结构与功能作用,揭示虾体肠道菌群与外源菌群结构间的相关性。【方法】60 d的养殖周期结束后,分别采集日本囊对虾肠道样品(归为虾肠组,n=3)、养殖水体样品(归为水体组,n=3)和对虾饲料样品(归为饲料组,n=3),提取各样品总DNA进行16SrRNA基因扩增子测序,基于生物信息学方法分析与比较样品间的菌群结构特征,并使用PICRUSt软件预测日本囊对虾肠道菌群功能。【结果】3组样品测序共获得822 713条有效序列,抽平处理后可聚类为3 416个OTU。虾肠组样品中有28.49%、59.30%的OTU可以依次在水体组、饲料组样品中检测到。门水平上,虾肠组样品中的优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和梭杆菌门(Fusobacteria)。水体组、饲料组与虾肠组样品中的优势菌门结构不尽相同,但均由变形菌门和拟杆菌门组成。属水平上,虾肠组样品中的优势菌属包括弧菌属(Vibrio)、另类弧菌属(Aliivibrio)、假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)、假黄棕杆菌属(Pseudofulvibacter)、科尔韦尔氏菌属(Colwellia)、小纺锤状菌属(Fusibacter)、发光杆菌属(Photobacterium)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)以及弓形杆菌属(Arcobacter)。水体组和饲料组中检出的核心菌属结构与虾肠组相比有明显差异,其中海命菌属(Marivita)和假单胞菌属(Pseudomonas)分别为养殖水体及对虾饲料样品中的最优势菌属。PICRUSt预测结果显示,日本囊对虾肠道菌群的基因功能主要与新陈代谢类功能有关,包含氨基酸代谢、碳水化合物代谢与能量代谢等。【结论】日本囊对虾肠道菌群与其他种类对虾肠道菌群的结构间存在共性,其形成在一定程度上受到了外源菌群的干预,并在虾体的日常代谢活动中发挥了一定的作用。