实时荧光定量PCR技术及其应用

实时荧光定量PCR技术是一种多色荧光检测核酸定量技术,该简要介绍实时荧光定量PCR技术的原理及其应用。     

实时定量PCR技术的介绍

实时定量PCR(real-timePCR)技术是近几年发展起来的新技术 ,既保持了PCR技术灵敏、快速的特点 ,又克服了以往PCR技术中存在的假阳性污染和不能进行准确定量的缺点。另外 ,还有重复性好、省力、低费用等优点。实时定量PCR技术是从传统PCR技术发展而来 ,其基本原理是相同的 ,主要不同之处是其定量的体系。下面简单介绍一下该技术定量的原理。1　荧光染料的应用荧光染料的应用是实时PCR技术能够进行定量检测的一个重要部分 ,在PCR反应体系中应用荧光标记物 ,通过监测荧光信号的累积实现对整个PCR循环进程的观察。目前主要有四种方法…     

实时荧光定量PCR技术在曲霉病诊断中的应用

实时荧光定量PCR技术自问世以来,因其具有高度的特异性和灵敏性、可定量、污染少等特点而得到了广泛的应用,此技术用于曲霉的研究也有近十年的历史。本文对近年来实时荧光定量PCR技术在曲霉病诊断中的应用情况进行综述。     

实时荧光定量PCR的数据分析方法

实时荧光定量PCR是目前检测目的核酸拷贝数及分析靶基因在mRNA表达水平相对变化的主流技术。研究表明,分析结果的准确性依赖于数据分析方法的可靠性。我们简要综述实时荧光定量PCR的数据分析方法。     

实时荧光定量PCR的应用和进展

实时荧光定量PCR技术通过检测PCR产物中荧光讯号强度来达到定量的目的,该技术不仅实现了PCR从定性到定量的飞跃,而且与常规PCR相比,它具有特异性更强、有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点,目前已在动植物基因工程,微生物和医学领域中得到广泛应用。本文对实时荧光定量PCR技术的原理、优缺点及近年来新兴起的荧光探针的原理、优缺点进行了评述,重点及创新点是对实时荧光定量PCR技术在动植物基因工程,微生物和医学领域的应用进行了比较全面的综述,并对实时荧光定量PCR技术的普及应用及在基因诊断领域的前景做了进一步的展望。     

实时荧光定量PCR 技术的原理及其应用研究进展

自从1983年Mullis发明聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)以来,PCR技术很快成为科研、临床诊断的热点技术。但是传统PCR技术在应用中一是不能准确定量,二是容易交叉污染,产生假阳性。直到近年来荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)技术     

实时荧光定量PCR技术在鱼类病害研究中的应用

实时荧光定量PCR技术是一种新的核酸定量技术,通过检测PCR产物中荧光信号强度达到定量的目的,与常规PCR相比,具有无污染、特异性强、检测灵敏、定量准确等特点,该技术在分子诊断、动植物检疫等方面得到了广泛的应用.目前水产养殖业处于飞速发展时期,其中鱼类的病害问题也日益突出,为了预防和控制鱼类病害,实时荧光定量PCR技术已逐渐应用于鱼类病害的研究中.该文将从实时荧光定量PCR的技术原理、主要类型以及实时荧光定量PCR技术在鱼类病害研究的应用研究作一综述.     

实时荧光定量PCR技术及其在植物转基因产品检测中的应用

实时荧光定量PCR技术因其实时、快速、高效和准确定量的优点,已经广泛用于转基因产品定量检测。本文介绍荧光定量探针技术的原理、特点及其在植物转基因产品检测中的应用情况。     

实时荧光定量PCR相对定量法检测循环miRNA的内参选择

microRNA(miRNA)是一类内源性非编码微小RNA,在调控细胞增殖、分化、凋亡等方面发挥重要作用。研究发现,miRNA能够稳定存在于细胞外液,被称为循环miRNA。在多种疾病状态下循环miRNA表达谱改变,具有成为非创伤性新型生物标志物的潜能。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)是检测miRNA表达变化的确证实验,其中内参的选择关系到相对定量结果是否真实可靠。我们简要综述国内外实验室常用的RT-qPCR内参及其特点。     

实时荧光定量PCR检测凡纳滨对虾proPO基因标准曲线构建

酚氧化酶原(proPO)系统属于一种酶联级系统,在凡纳滨对虾抵抗病原菌侵袭过程中具有重要作用。Real-time PCR检测技术已经成为国际上检测基因表达通用的方法,能对低丰度mRNA水平进行定量,可在体外对细胞活性进行评估,选择该方法进行外界环境因子胁迫下的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)组织proPO表达分析。在实时荧光定量PCR中,标准曲线法是最为简单、准确的定量方法。为了快速、准确的定量proPO基因在逆境下的表达水平,构建了正确、可靠的proPO基因表达标准品质粒和标准曲线。结果表明,该法所构建的标准曲线能够保证数据的精确性,满足实时荧光定量试验的要求,完全可以作为proPO基因荧光定量检测的参照标准。     

转基因定量检测的不确定度研究

目前,欧盟、日本对转基因产品都实行基于转基因含量(阈值)强制标识制度。世界各国都采用实时荧光PCR方法来开展食品成分的相对定量检测工作,以样品的内、外源基因的拷贝数之比来近似代表样品中的转基因质量分数。为了便于用户正确理解检验结果,在转基因定量检测结果报告中必须报结果的不确定度,分析了转基因定量的不确定度来源,参照化学分析中的有关方法,给出了转基因定量检测中外源基因和内源基因的标准曲线的不确定度测算公式,并以转基因大豆为试材,利用方法的室内验证数据进行不确定度计算,可供相关实验室参考。     

JEV-DNA实时荧光定量标准品的构建

利用TaqMan荧光定量PCR技术,建立JEV-DNA定量标准品的制备方法。通过处理JEV减毒活疫苗提取病毒RNA,进行RT-PCR扩增目的片段,与T载体连接,转化感受态细胞,T-A克隆,测序鉴定后定量。获得预期的重组质粒,建立的标准曲线有较大的线性范围。此法制备的重组质粒标准品可用于对病毒载量进行测定。     

实时定量PCR构建法夫酵母内参基因β-actin、 gpd、18S rRNA标准品质粒和标准曲线

为建立检测法夫酵母JMU-MVP14中虾青素合成相关基因在不同生长时期表达水平的实时定量PCR方法,构建法夫酵母JMU-MVP14的管家基因β-actin、gpd、18S rRNA的标准质粒,进行实时定量PCR,制作标准曲线及回归方程.β-actin基因标准曲线相关系数（R2）=0.9956,扩增效率（E） =96.93％;gpd基因标准曲线相关系数（R2） =0.9901,扩增效率（E） =93.78％;18S rRNA基因标准曲线相关系数（R2） =0.9981,扩增效率（E）=98.76％.3个基因片段的熔解曲线均呈单峰;扩增曲线呈典型的S型动力学曲线,指数期和平台期明显,为理想的熔解曲线和扩增曲线.用geNorm软件对三个管家基因的稳定性进行分析,三个基因的稳定性排序为β-actin＞ 18S rRNA＞ gpd,故β-actin和18S rRNA较适合作为研究法夫酵母JMU-MVP14定量实验的内参基因.     

实时荧光PCR技术诊断人偏肺病毒检测效果分析

目的：比较实时荧光PCR检测技术与直接免疫荧光检测技术及间接免疫荧光检测技术在呼吸道人偏肺病毒（hMPV）的检测效果,探讨实时荧光PCR检测技术的应用前景。方法：选取2010年4月至2013年1月因呼吸道感染在我院儿科门诊和住院部接受治疗的患儿鼻咽分泌物标本,共831份（男523例,女308例）。标本按年龄分0~6月龄（68例）、6月~1周岁（153例）、1~3周岁（281例）、3~6周岁（198例）、〉6周岁（131例）五组。采用实时荧光PCR检测技术与直接免疫荧光检测技术及间接免疫荧光检测技术进行检测与分析。结果：采用实时荧光PCR法共检测出221例hMPV阳性（26.6%）,直接免疫荧光法检出121例hMPV阳性（14.6%）,二者相比有统计学意义（X2=5.19,P〈0.05）;间接免疫荧光法检测出103例HMPV阳性（12.4%）与实时荧光PCR法相比有统计学差异（X2=7.17,P〈0.05）;1~3周岁组hMPV感染率与其它组相比差异有统计学意义（X2=12.89,P=0.01）。结论：实时免疫荧光技术hMPV的检测率明显高于直接免疫荧光法和间接免疫荧光法,对hMPV具有很高的临床诊断价值。     

实时三维超声心动图诊断心脏多发性粘液瘤5例并文献分析

目的：探讨实时三维超声心动图对心脏多发性粘液瘤诊断和术前风险评估及手术方式选择的临床意义。方法：回顾性分析我院2007年1月至2012年12月收治的经手术病理确诊为心脏多发性粘液瘤5例患者的二维超声心动图（two-dimensionale echocardiography,2DE）、实时三维超声心动图（real-time three-dimensional echocardiography,RT-3DE）声像图特征,并结合相关文献进行分析。结果：5例患者的超声心动图均在心腔内探及多个活动性团块,各团块均与一蒂相连接,RT-3DE较2DE能准确显示粘液瘤整体形态、位置及与周围组织清晰的界限,并定量测定其大小。结论：RT-3DE弥补了2DE不能显示粘液瘤立体形态图像的缺点,可更为准确、简便、快捷地对心脏多发性粘液瘤做出诊断,并为术前风险评估及手术方式的选择提供了更可靠的依据。     

实时三维超声心动图诊断心脏多发性粘液瘤5 例并文献分析

目的：探讨实时三维超声心动图对心脏多发性粘液瘤诊断和术前风险评估及手术方式选择的临床意义。方法：回顾性分析 我院2007 年1 月至2012 年12 月收治的经手术病理确诊为心脏多发性粘液瘤5 例患者的二维超声心动图(two-dimensionale echocardiography,2DE)、实时三维超声心动图(real-time three-dimensional echocardiography,RT-3DE)声像图特征,并结合相关文献 进行分析。结果：5 例患者的超声心动图均在心腔内探及多个活动性团块,各团块均与一蒂相连接,RT-3DE 较2DE 能准确显示粘 液瘤整体形态、位置及与周围组织清晰的界限,并定量测定其大小。结论：RT-3DE 弥补了2DE 不能显示粘液瘤立体形态图像的 缺点,可更为准确、简便、快捷地对心脏多发性粘液瘤做出诊断,并为术前风险评估及手术方式的选择提供了更可靠的依据。     

实时荧光定量PCR在猪肺炎支原体检测中的应用

实时荧光定量PCR技术是一种利用荧光检测方法来定量核酸的技术,具有高度的灵敏性、特异性和精确性.综述了荧光定量PCR技术的基本原理及其在猪肺炎支原体检测中的应用.     

Robust regression methods for real-time polymerase chain reaction

Current real-time polymerase chain reaction (PCR) data analysis methods implement linear least squares regression methods for primer efficiency estimation based on standard curve dilution series. This method is sensitive to outliers that distort the outcome and are often ignored or removed by the end user. Here, robust regression methods are shown to provide a reliable alternative because they are less affected by outliers and often result in more precise primer efficiency estimators than the linear least squares method.     

转基因烟草荧光定量检测方法研究

依据实时定量PCR原理,参照35S启动子、NOS终止子、GUS基因和NPTII基因序列设计TaqMan引物和荧光标记探针。采用美国MJ公司OpticonTM2荧光定量PCR检测系统对烤后烟叶进行转基因定量检测技术研究,从中筛选出扩增效率高,灵敏度好的PCR引物和探针序列,同时通过对扩增体系,扩增条件的梯度实验,优化出荧光定量检测的最佳反应体系和反应条件,从而建立了转基因烟草定量检测方法。该方法经验证其检测灵敏度达到0.05％。在2003年6月参加CORESTA(国际烟草科研与合作中心)组织的国际烟草转基因定量检测合作试验中,该优化转基因烟草定量检测技术获得了较好成绩,对盲检样品检测结果评价(Z-score)列国际12家实验室之首,证明此法灵敏度高、稳定性好。