成簇的规律间隔的短回文重复序列CRISPR 的研究进展

最近发现,在细菌和古菌中广泛存在的成簇的规律间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)及其相关蛋白是针对噬菌体、质粒等外源DNA的获得性和可遗传的免疫系统。本文综述了CRISPR系统的基本结构、多样性、作用机理及其区分自我与非我的机制,并对CRISPR研究和应用前景进行了展望。     

成簇的规律间隔短回文重复序列在致病菌中分型研究及应用

为全面深入了解CRISPR在致病菌中的最新进展,该文简介了CRISPR的结构与功能,深入论述其在各类致病菌中的分型研究及应用情况,剖析CRISPR分型研究现有问题和措施,并展望今后CRISPR重点研究方向。CRISPR分型在各类致病菌中有着不同程度应用,在结核分枝杆菌复合群、沙门氏菌、产志贺毒素大肠杆菌等致病菌中已获成功。加强多种致病菌的全基因组测序及扩充CRISPR数据库,CRISPR分型将会应用更广泛。     

副溶血性弧菌群中规律成簇间隔短回文重复序列的比较分析

规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)是大多数细菌和古细菌在生存压力下进化出的一套抵抗噬菌体干扰的防御系统。本研究主要采用生物信息学的方法,对24株分离自人体且已完成全基因组测序的副溶血性弧菌内CRISPR结构进行了分析,结果发现:只有16株细菌包含1个及以上的CRISPR结构,共计29个CRISPR;仅11个具有真座位特征的CRISPR结构含有前导序列;CRISPR结构中的重复序列所形成的RNA二级结构具有一大一小共两环或一大二小共三环的特征;目前未找到与区间序列高度同源的外源遗传物质;仅含前导序列的CRISPR结构侧翼区才存在cas基因。副溶血性弧菌的CRISPR结构可能以水平基因转移的方式整合到细菌的染色体中,CRISPR结构不适合作为细菌分类的一项指标。     

成簇的规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)基因组编辑技术研究进展

摘要:细菌和古细菌在与噬菌体的生存斗争中,进化出了获得性免疫系统———成簇的规律间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR),该结构能够通过其转录出的mRNA又称crRNA(CRISPR RNA)及CRISPR相关蛋白(CRISPR-associated,Cas)对外来某一特定单链或双链DNA实施高特异性地沉默或降解。近年来,这个存在于原核生物中的免疫系统成为了研究热点,并有着极为广泛的应用前景。特别是最近,研究人员又根据crRNA的特性和功能,利用人为改造后的sgRNA (small guideRNA)及Cas9蛋白,实现了对细菌乃至真核生物某一特定基因的精确敲除或沉默,这无疑会使基因组编辑技术进入一个更加方便而精确的新时代。     

蜡状芽孢杆菌群中规律成簇间隔短回文重复序列的生物信息学分析

规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)是最近发现针对噬菌体等外源遗传物质的获得性和可遗传性的新型原核生物防御系统。通过BLAST、多序列比对、RNA二级结构预测等生物信息学方法对已经完成全基因组测序的蜡状芽孢杆菌群24个菌株进行CRISPR的系统分析,结果表明:42%的菌株含有该结构;8个CRISPR座位的正向重复序列可以形成RNA二级结构,提示正向重复序列可能介导外源DNA或RNA与CAS编码蛋白的相互作用;31%的间区序列与噬菌体、质粒、蜡状芽孢杆菌群基因组序列具有同源性,进一步验证间区序列很可能来源于外源可移动遗传因子。由于大部分蜡状芽孢杆菌群菌株含有多个前噬菌体和质粒,通过对蜡状芽孢杆菌群CRISPR的分析,为揭示其对宿主菌与噬菌体,以及宿主菌与质粒间的关系奠定基础。     

规律成簇的间隔短回文重复：结构，功能与应用

规律成簇的间隔短回文重复(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPRs)是一类广泛分布于细菌和古菌基因组中的重复结构.最近研究表明,CRISPR与一系列相关蛋白、前导序列一起,为原核生物提供对噬菌体等外源基因的获得性免疫能力,其作用机制可能与真核生物的RNA干扰过程类似.作为基因组中高度可变的区域,CRISPR非常适合成为研究细菌种内分型和微进化的分子靶标.本文综述了CRISPR系统的结构、功能及其应用概况,并对CRISPR研究的前景进行了展望.     

转化生长因子β1在脑积水发生中的作用

脑积水是以脑脊液流动障碍和脑萎缩为主要特点的神经系统疾病.遗传突变、先天性畸形、感染、颅内出血和肿瘤等均能导致不同程度的脑积水.转化生长因子β1(TGF-β1)是脑发育过程中一种重要的生长因子,该基因过表达小鼠可通过调节基质金属蛋白酶-9和基质金属蛋白酶组织抑制剂-1的表达,改变细胞外基质环境,从而导致脑积水形成.本文就TGF-β1在脑积水发生中的作用做一综述.     

转化生长因子β在细胞凋亡及抗凋亡中的作用机制

转化生物因子β（TGF-β）在生物发育,组织形成与更新、伤口的愈合、细胞增殖、迁移与免疫反应中起着重要的调节作用。TGF-β既能诱导某些类型细胞的凋亡反应,又能增强某些类型细胞的生存力,具有一定的抗细胞凋亡作用。TGF-β生物效应的这种显而易见的矛盾性质并不仅仅存在于细胞的生死和存活的调节过程中,还可见于TGF-β介导的其他细胞效应中。因此,TGF-β介导的广泛和对立的生物效应的机制成为人们关注和研究的焦点,最近几年人们已开始逐渐认识和了解对TGF-β诱导细胞凋亡和抗细胞凋亡的机制。在此,我们仅就某些研究进展作一简单的介绍。     

转化生长因子β在细胞凋亡抗调亡中的作用机制

转化生长因子β(TGF-β)在生物发育、组织形成与更新、伤口的愈合、细胞增殖、迁移与免疫反应中起着重要的调节作用.TGF-β既能诱导某些类型细胞的凋亡反应,又能增强某些类型细胞的生存力,具有一定的抗细胞凋亡作用.TGF-β生物效应的这种显而易见的矛盾性质并不仅仅存在于细胞的生死和存活的凋节过程中,还可见于TGF-β介导的其他细胞效应中.因此,TGF-β介导的广泛和对立的生物效应的机制成为人们关注和研究的焦点,最近几年人们已开始逐渐认识和了解对TGF-β诱导细胞凋亡和抗细胞凋亡的机制.在此,我们仅就某些研究进展作一简单的介绍.     

人转化生长因子β1 cDNA在COS－7细胞中的表达

在测定了ＴＧＦβ１全长序列的基础上,构建了两个ＴＧＦβ１的表达载体ｐＣＭＶβ和ｐＳＶＬβ;分别从转录水平和翻译水平检测了这两个载体在ＣＯＳ－７细胞中的表达。同时利用ＣＯＳ－７短暂表达系统,建立了ＴＧＦβ１的生物测活法;并分别研究了上清收获时间、表达载体、转染方法对ＴＧＦβ１表达的影响     

人转化生长因子β1cDNA在COS—7细胞中的表达

在测定了ＴＧＦβ１全长序列的基础上,构建了两个ＴＧＦβ１的表达载达ｐＣＭＶβ和ｐＳＶＬβ;分别从转录水平和翻译水平检测了这两个载本在ＣＯＳ－７细胞中的表达。同时利用ＣＯＳ－７短暂表达系统,建立了ＴＧＦβ１的生物测活法;并分别研究了上清收获时间、表达载体、转染方法对ＴＧＦβ１表达的影响。     

人转化生长因子β1在大肠杆菌中的分泌表达研究

根据表达产物在大肠杆菌细胞中的定位,可将外源基因的表达分成胞内直接表达和分泌表达两种形式:其中分泌表达又可进一步分成周质分泌表达和胞外培养基外泌(excretion)表达两种方式。采用分泌表达可获得具有天然一级结构、正确折叠、组装的重组蛋白,但因表达水平低一直难以用于工程研究。近年来的研究表明,新生多肽链的跨内膜转运     

瘦素和转化生长因子β1在大鼠肝纤维化过程中的作用

目的探讨瘦素和转化生长因子β1（transforming growthβ1,TGF-β1）在肝纤维化发生、发展过程中的作用。方法雌性Wistar大鼠随机分为正常对照组和纤维化模型1周组、2周组、4周组、6周组。纤维化模型各组以CCl4造成化学性肝损伤。常规HE染色观察肝脏病变;检测血浆和肝组织瘦素及TGF-β1水平;天狼猩红胶原染色和肝组织羟脯氨酸（Hyp）含量测定观察肝纤维化程度,并对肝组织瘦素水平、TGF-β1水平及肝纤维化指数（FI）进行相关性分析;赖氏法测定血浆丙氨酸氨基转移酶（ALT）。结果与正常对照组比较,纤维化模型各组血清和肝组织瘦素和TGF-β1水平显著升高（P〈0.05）,且纤维化模型各组肝组织瘦素水平、TGF-β1水平及FI之间两两均呈显著正相关。结论肝组织瘦素在肝纤维化发病过程中具有独立的致病作用,并可能通过激活TGF-β1通路导致肝维化的形成。     

β-转化生长因子在哮喘气道重塑中的作用

哮喘是一种慢性气道炎症性疾病.哮喘患者体内表达较高水平的B一转化生长因子(TGF-β).TGF-B可加重上皮细胞受损,促进气道平滑肌细胞,肌成纤维细胞增殖,通过促进细胞外基质的合成、诱导结缔组织生长因子表达从而导致气道上皮下纤维化,气道壁增厚,进而直接参与哮喘气道炎症和重塑的发生、发展过程.TGF-β在哮喘的气道重塑中有着极其重要的作用,因此针对其治疗已经成为防治哮喘气道重塑的新的研究方向.     

人转化生长因子β1在大肠杆菌中的分泌表达

为了研究双体形式生长因子的原核基因工程,尝试了人转化生长因子β１（ｈＴＧＦβ１）基因的分泌表达．通过缺失突变,构建了能表达具有天然一级结构的ｈＴＧＦβ１单体蛋白的周质分泌表达质粒．采用双顺反子表达系统,使ＴＧＦβ１在周质中获得了高效可溶性表达．研究了改善转运通路对重组蛋白分泌表达的影响,发现共表达σ３２基因和ｄｓｂＡ基因,可促进周质中ＴＧＦβ１双体分子的形成;而共表达ｓｅｃＥ／Ｙ基因对ＴＧＦβ１的分泌表达则没有明显影响．通过共表达ｋｉｌ基因,使ＴＧＦβ１在胞外培养基中获分泌表达,并在胞外折叠、组装形成具有生物活性的双体分子     

腺病毒介导转化生长因子β1 诱导结肠癌细胞凋亡的研究

目的:探讨腺病毒介导的转化生长因子β-1(TGF-β1)对结肠癌细胞凋亡的诱导作用。方法:结肠癌细胞系HCT116细胞培养后分实验组及对照组,实验组以腺病毒为载体将TGF-β1转染,逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)以及免疫组织化学检测其m RNA及蛋白的表达,MTT法检测细胞生长抑制率,流式细胞仪检测细胞凋亡的情况。结果:实验组的TGF-β1 mRNA以及蛋白的表达明显增强;实验组细胞的吸光度波动较小,在低值区相对稳定,各时相点无明显变化,24 h的细胞增殖抑制率为50%,其后在70%-80%之间;对照组细胞吸光度显著升高,与实验组各时相点比较,差异有统计学意义(P0.01)。实验组24 h、36 h、48 h、60 h、72 h的凋亡率分别为(7.55±0.03)%、(8.53±0.11)%、(13.47±0.23)%、(15.51±0.26)%、(16.59±0.26)%,与对照组细胞各时相点比较差异有统计学意义(P0.01)。结论:TGF-β1能够显著地抑制HCT 116细胞的增值及诱导其凋亡。     

转化生长因子-β激活激酶1在病理性心肌肥大中的作用研究进展

转化生长因子-β激活激酶1 (transforming growth factor-β-activated kinase 1, TAK1)是促分裂原活化蛋白激酶激酶激酶(mitogen-activated protein kinase kinase kinase, MAPKKK)家族的成员之一,参与调节一些重要的生物功能。心肌肥大分为生理性心肌肥大和病理性心肌肥大,它们的发生机制和蛋白表达不同。TAK1既参与正常心肌的发育,也在调节病理性心肌肥大发生和发展中发挥着重要的作用。血管紧张素II (angiotensin II, AngII)或压力负荷通过不同的方式,如经低氧诱导因子-1α(hypoxia-inducible factor-1α, HIF-1α)促进TAK1转录和表达,或经转化生长因子-β1 (transforming growth factor-β1, TGF-β1)、甲状腺激素及泛素蛋白酶等促进TAK1磷酸化或泛素化,诱导病理性心肌肥大。本文就TAK1在病理性心肌肥大发生和发展中的作用进行综述,为临床心肌肥大的防治提供重要策略和潜在靶点。     

甘草甜素对肾脏转化生长因子β1作用的实验研究

目的:探讨甘草甜素对肾小球硬化模型中转化生长因子β1(TGFβ1)作用.方法:采用尾静脉注射阿霉素方法建立大鼠肾小球硬化模型.实验随机分为模型组、治疗组和对照组.检测各组第4和8周各项指标的变化.包括①24h尿蛋白定量,血尿素氮(BUN)、肌酐(Scr)、胆固醇(Cho)和白蛋白(Alb).②各组肾皮质进行光镜等病理学检测.③应用免疫组织化学方法检测肾组织内转化生长因子β1(TGFβ1)蛋白质的表达.④采用标准曲线法进行荧光定量PCR检测肾组织内TGFβ1 mRNA的表达.结果:①治疗组与模型组相比较,24h尿蛋白定量、BUN、Scr、Cho和Alb均有不同程度改善(p<0.05).②肾皮质病理学改变肾小球硬化程度治疗组明显轻于模型组.③肾组织内TGFβ1蛋白和mRNA表达治疗组与模型组比较表达峰值均有不同程度降低(p<0.05).结论:从蛋白和mRNA水平同时证实甘草甜素对TGFβ1蛋白和mRNA的表达有明显的抑制作用,对大鼠肾小球硬化有早期保护作用,为临床应用提供了依据.     

人转化生长因子β1成熟肽基因的克隆及序列测定

转化生长因子β1(transforming growth factor β1,TGF β1)作为细胞主要的负调控生长因子,参与了哺乳动物各种细胞的病理和生理过程。此外,TGF β1可望应用于创伤愈合、免疫抑制、肿瘤抑制等方面,具有潜在的临床应用前景。我们在完成了人TGF β1基因的克隆及其在真核细胞中的表达后,准备进行其在大肠杆菌中的高效表达研究。     

人转化生长因子β1在大肠杆菌胞内表达的研究

转化生长因子β(transforming growth factor β,TGFβ)是细胞增殖、分化的重要调节蛋白之一,同时还参与了细胞外基质形成、胚胎发育、骨重建等多项病理和生理过程,并在创伤愈合、免疫抑制、肿瘤抑制等多方面具有广阔的