应用PCR及寡核苷酸探针研究人原发性肺癌中Ki-ras点突变

应用PCR及寡核苷酸探针杂交方法研究了50例人原发性肺癌石蜡切片标本 中Ki-ras 12(Val),Ki-ras 13(Cys)点突变,发现13例为点突变阳性,突变率为26％,其中3例同时兼有二种点突变(Val/Cys);Ki-ras 12位的点突变率(20％)比Ki-ras 13位的点突变率(12％)高。同时还发现Ki-ras基因的点突变存在于腺癌、鳞癌、小细胞肺癌以及各种分化程度的肺癌中。     

一种检测细胞微量点突变的方法——等位基因特异的PCR

为了灵敏、方便地检测出细胞群体中含量极低的点突变,利用一β珠蛋白基因簇Gγ -202 C→G突变的杂合细胞株,优化传统的等位基因特异PCR的反应条件,以定量的PCR产物为模板,在含5%甲酰胺的体系中用半巢式的等位基因特异引物进行扩增.结果表明,该方法灵敏可靠,可快速检测到细胞群体中低于0.025%的点突变.     

用毛细管电泳技术检测DNA点突变

毛细管电泳(ＣＥ)是90年代初发展起来的新技术,具有分辨率高、重现性好、灵敏度高、快速和易于实现自动化的特点。后来又发展了激光诱导荧光检测器(ＬＩＦ),大大提高了分析灵敏度,对微量样品如单细胞分析等,具有很大的优势。通常,利用ＣＥ技术可以在20ｍｉｎ内分析完成几千个碱基的ＤＮＡ片段。ＣＥ可以应用于ＤＮＡ点突变的检测,目前在ＰＣＲ基础上利用ＣＥ技术对ＤＮＡ已知点突变及未知点突变的检测发展十分迅速。1.已知点突变的检测1.1　扩增抗拒突变系统ＰＣＲ(ＡＲＭＳＰＣＲ)和短串联重复ＰＣＲ(ＳＴＲＰＣＲ)　　ＡＲＭＳＰＣＲ和Ｓ…     

PCR－SSCP技术在基因点突变检测中的几种策略

ＰＣＲ－ＳＳＣＰ技术在基因点突变检测中的几种策略王吉伟,罗赛群（湖南医科大学分子生物学研究中心,长沙４１００７８）关键词ＰＣＲ－ＳＳＣＰ,点突变检测基因点突变的检测对于分子种群生物学的研究、遗传性疾病预测及分子水平的临床诊断等颇具实用价值。在众多的测...     

高灵敏度电化学发光PCR方法检测基因点突变研究

近年来发展了一种用于定量检测基因点突变的电化学发光PCR方法。该法采用三联吡啶钌标记的上游引物和生物素标记的下游引物对待测基因进行PCR扩增;随后,采用特定的限制性内切酶对扩增产物进行酶切,由于野生型样品和突变型样品间存在酶切位点的变化,其中只有一种基因型样品能被切断;通过生物素与链霉亲和素包被的磁珠连接,将生物素标记的DNA片段收集到样品池中;进行电化学发光检测,通过所得信号的有无可以判断其基因型。我们分别将该法用于Presenilin-1基因和H-ras癌基因的点突变检测,结果均可明显区分突变型样品和野生型样品。该法具有灵敏、快速、简便、安全等优点,是一种实用的基因点突变检测方法。     

一种改良的点突变检测法

错配化学裂解法 (ｃｈｅｍｉｃａｌｃｌｅａｖａｇｅｏｆｍｉｓｍａｔｃｈ ,ＣＣＭ )检测点突变的原理[1] 是 :野生型和突变型ＤＮＡ形成的异源杂合双链中含有错配碱基 ,其中错配的Ｔ和Ｃ可分别被四氧化锇 (ＯｓＯ4)和羟胺修饰 ,而哌啶能够裂解修饰后部位的核酸骨架 ,以变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定裂解片段即可判断突变的存在及大体位置。ＣＣＭ在突变检测中有肯定价值 ,因为理论上ＣＣＭ具有 1 0 0 %的突变检出率 ,基本不受待检ＤＮＡ片段长度的影响 ,且能给出突变位置信息。但ＣＣＭ需应用ＯｓＯ4等剧毒物质 ,且ＯｓＯ4对 1 / 3的Ｔ/Ｇ错…     

点突变的基因诊断方法的进展

本概述了近年来有关点突变用于疾病诊断的方法的原理和应用，着重介绍有关等位基因特异性扩增（ＡＳＡ）、连接酶链式反应（ＬＣＲ）、ＰＣＲ－ＥＬＩＳＡ法、直接测序法（ＤＳ）等的有关进展，并对各方法之优缺点进行了综合评价分析，以指导合理选用。     

优化重叠PCR法进行单链抗体基因扩增和点突变

利用重叠PCR技术扩增单链抗体基因或位点突变是抗体文库构建或稳定表达的关键和难点,国内外文献未见其方法学的系统报道.以不同VH、VL和Linker基因为拼接模板进行重叠PCR,针对影响重叠PCR扩增的拼接类型,引物设计,反应条件等进行优化.结果表明两段重叠连接比三段更容易实现,且扩增效果好;引物的互补序列长度一般应大于15 bp,且在18～24 bp 时扩增效果最好;退火温度在52～60℃,Mg2+浓度在1.5～2.5 mM时对拼接的效果影响较小;直接或间接使用拼接模板均可以实现重叠PCR的扩增.利用优化策略,首次构建了抗除虫菊酯的scFv基因文库并引入抗XAC糖蛋白scFv基因的点突变,为除虫菊酯抗体文库构建和抗XAC重组抗体的稳定表达奠定了基础.     

猪雌激素受体基因（ESR）点突变的PCR－SSCP检测

雌激素受体基因(ESR)是控制猪高产仔数的主效基因之一,具有明显的基因效应:BB型比AA型母猪胎总产仔数和产活仔数分别高出1.40～3.37和0.63～3.58头,是目前商品猪育种和生产中重点检测的主要基因之一。常规采用PCR－RFLPs方法区分该基因由点突变造成的3种不同的基因型。本研究建立1种基于PCR的SSCP(single－stranded conformation polymorphism)方法对猪ESR该位置的点突变进行检测,具有操作简便、灵敏度高和不需要酶切等优点,可以在育种实践中广泛应用。 Abstract:ESR is a major gene controlling litter size in swine.The sows of BB genotype produce 1.40～3.37 more piglets of the total number born and 1.07～2.40 piglets of the number born alive respectively comparing with those of AA genotype.ESR has been one of the widely detected genes in pig breeding and production.Usually the point mutation of ESR gene was detected by PCR-RFLP approach.The present study established a novel method based on PCR-SSCP,with the advantage of easy maniputation,high sensitivity and no necessity for restriction enzyme digestion.This method may be applied for commercial detection of the point mutation of ESR gene in swine breeding.     

液相杂交快速检测特异DNA

检测特异DNA片段的方法中,传统Southern blot技术由于其高度可重复性及能够显示条带大小的特性,一直是DNA检测的“黄金标准”.但是杂交时间长,步骤复杂,放射性污染等问题亟待解决.为了简化Southern blot,研究使用了一种液相杂交快速检测DNA的方法,即使用异硫氰酸荧光素(FITC)标记的dUTP掺入探针后,在溶液中与待检测DNA样本42℃下杂交,然后琼脂糖凝胶电泳检测荧光杂交信号.利用质粒为模板,优化了探针制作、杂交液组成、杂交时间和温度等参数.在FITC-dUTP∶ dTTP比例为1∶3、模板质粒浓度为50μg、1×杂交缓冲液(25 mmol/LTris,10mmol/L EDTA,8mmol/L Nacl,PH =8.0)中95℃变性5～9 min和42℃杂交3h的实验条件下,可检出1.2μg的质粒,探针灵敏度为7.3 ng/μl.这种方法不需要转膜,曝光,大大节约了时间,简化了操作,荧光检测也为该方法同时检测多色样本提供了可能,可广泛应用于核酸检测.     

PCR-微孔板杂交法检测不同人群TTV DNA

根据报道的TTV全序列设计引物和探针,建立PCR-微孔板杂交法,检测81例正常人群、92例职业献血员123例甲～庚型肝炎、32例非甲～庚型肝炎、48例原发性肝癌患者的TTVDNA.结果表明TTV在以上五种人群中的阳性率分别为3.7%、4.3%、21.1%、28.1%、52.0%,前者与后三者比较有显著性差异(P＜0.05),TTV合并HBV二重感染占重叠感染的54.0%.这揭示不同人群均存在TTV感染,正常人群和职业献血员存在健康携带状态,甲～庚型肝炎和非甲～庚肝炎病人为高危人群,TTV可与各型肝炎存在重叠感染,TTV除经血传播外,存在其它传播途径,TTV感染与ALT及TBIL的升高密切相关.     

电化学发光PCR方法检测结肠癌中K-ras癌基因点突变

发展了一种可用于快速检测K-ras癌基因点突变的电化学发光PCR(ECL-PCR)分析方法,该法采用三联吡啶钌标记的上游引物和生物素标记的下游引物对目的片段进行PCR扩增;随后,采用限制性内切酶MvaI对扩增产物进行酶切,由于突变导致酶切位点的丢失,所以只有野生型样品能被切断;通过生物素与链霉亲和素包被的磁珠连接,将生物素标记的DNA片段收集到反应池中进行电化学发光检测。采用该法对20例结肠癌组织中的K-ras癌基因第12位密码子进行点突变分析,得出其中有9例存在点突变,点突变率为45%。该方法操作简便、安全、快速、灵敏,可用于快速检测K-ras癌基因点突变。     

反向点杂交法快速检测HPV基因型的临床应用

应用反向点杂交法(RDB)的原理,针对HPV 6B, 11, 16, 18, 31, 33和35设计了7条序列作为未标记的特异性寡核苷酸(SSO)探针,分别固定在尼龙膜条上,形成7个点,再与经PCR扩增的样品DNA序列杂交,即可在一个膜条上分辨出这7型HPV中的任一型.此法快速简便,特异性高,不存在假阳性;且因PCR灵敏度高,亦不易出现假阴性.用PCR-RDB法检测保存的宫颈癌组织石蜡包埋标本32例,结果:HPV16阳性22例(68.8%),HPV18阳性5例(15.6%),HPV16/18双重感染2例(6.3%),阴性仅3例(9.3%).     

PCR-RFLP 方法测定 ras 癌基因点突变

曾使用 PCR-RFLP 方法分析过 c-Ha-ras 癌基因第12密码子的点突变.因N-ras 基因第12位密码子、K-ras 基因第12和13位密码子无已知的限制性内切酶的酶切位点,不能使用 PCR-RFLP 方法分析这些位点的突变.在 PCR 引物的3′端引入一个误配的碱基使之正好成为某限制性内切酶的酶切位点,这样便能使用PCR-RFLP 技术分析 c-Ha-ras 基因第61位、N-ras 基因第12位、K-ras 基因第12和13位密码子的点突变.     

人一β干扰素结构基因的定向点突变

用简单而高效的“缺口双链DNA”的定向点突变方法,将IFN-β结构基因编码17位cys的密码TGT改成编码ser的AGT。变异株用合成的诱变引物作为探针来筛选,由Hinf I酶切电泳图谱分析及DNA顺序的测定得到证实。变异率为11％。在大肠杆菌表达的lFN-βser17的抗病毒活力明显高于在相同宿主菌中表达的lFN-β的抗病毒活力。     

生物素标记DNA探针杂交条件探讨

DNA探针技术正越来越广泛地应用于医学基础研究和临床检测.生物素标记探针已在某些领域部分取代同位素标记探针而发挥作用。杂交是DNA探针技术中重要一环.各种杂交条件的变化均会对杂交结果并最终对检测结果产生影响。文献中关于杂交条     

PCR-RFLP检测猪源致病性沙门氏菌gyrA基因点突变

四川农业大学谭炳乾、王红宁和叶如俊等先生利用PCR-RFLP法检测猪源致病性沙门氏菌gyrA基因点的突变。他们测定了16株猪源致病性沙门氏菌对5种常用氟喹诺酮类药物的最低抑菌浓度（MIC）。结果表明对此5种药物的耐药率在31．2％～56．2％。分别以质粒和染色体为模板,应用PCR扩增16株沙门氏菌的gyrA基因,以后所有菌株均获得以染色体为模板的扩增产物,还从1株鼠伤寒沙门氏菌获得了以质粒为模板的扩增产物。