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一种快速有效纯化DNA序列分析模板的方法 总被引:3,自引:0,他引:3
介绍一种DNA序列分析模板的快速、有效的纯化方法。该法对DNA模板的回收率可达95%以上。多次测序结果表明,此法与其他常规纯化方法相比,具有简便、快速、有效、可靠等优点,其测序结果电泳带清晰,无模糊带及“鬼带”出现,重复性及稳定性较好。 相似文献
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陈劲春 《生物化学与生物物理进展》1992,19(5):380-382
对取自同一摇瓶内的菌体,采用7种不同提取质粒的方法分离DNA,将分离的DNA做电泳观察、紫外吸收及序列分析,结果表明CTAB法具有快速、方便、可行的特点。 相似文献
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鳗弧菌毒力质粒DNA序列的测定 总被引:4,自引:0,他引:4
采用亚克隆法与引物步移法相结合的测序战略 ,对海洋鱼类重要病原菌鳗弧菌毒力质粒pEIB1进行序列测定 ,测得整个质粒序列长度为 6 6 16 4bp。序列的初步分析结果表明 ,G C含量为 4 2 .7% ,共有 4 4个可读框 (ORF) ,其中包括与铁载体合成、调节、运输以及质粒复制相关的基因。 相似文献
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目前 ,DNA测序的核心仪器是使用荧光染料标记的、具有CCD光学系统的DNA测序仪 ,其工作原理主要包括 :用不同的荧光染料确定A、G、C和T这 4种碱基的延伸反应 ,通过激光的激发 ,每种染料可以发射出不同的电信号 ,测序仪收集这些光波信号后 ,通过计算机数据分析 ,可得到相应的碱基序列。利用这种方法 ,所有 4种染料可在同一凝胶泳道中检测和辨别 ,消除了因泳道之间迁移率的差异所引起的误差 ,增加了测序的精确度 ;同时 ,可以增加在同一块凝胶上所能分析的模板DNA数量。毛细管电泳技术的应用可使测序样品的加样自动化 ,且无须用… 相似文献
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本文介绍了作者编制的一组用于分析DNA序列资料的计算机程序。程序用BASIC语言写成,在IBM微型机伤调试运行,包括序列打入、核苷酸频率统计、转译及限制酶切点查找等级部分。 相似文献
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用改良碱裂解法提取的质粒DNA,经RNA酶消化后做银染列分析的模板,所得测序结果清晰、准确,从而使银染法模板的制备更加经济简便。 相似文献
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本文介绍一种从重组质粒中快速提纯DNA插入片段的方法。质粒DNA的制备简单、快速、分离的质粒DNA可用于限制性酶切和转化大肠杆菌等。从琼脂糖凝胶中提纯DNA插入片段的方法操作简单,回收效率高,提纯的DNA片段可用于连接和制备杂交探针等。 相似文献
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质粒pXZ10145核苷酸序列测定和分析 总被引:3,自引:0,他引:3
以Sanger双脱氧中止法为原理,利用美国ABI公司370A自动核酸序列分析仪,我们测定了谷氨酸棒杆菌质粒pxzl0145全长4887bp的核苷酸序列,该质粒上存在包括ApaI等18种限制酶的单一切点,其它限制酶切点的数目和位置也被定出,质粒上有8个可能的阅读框架,通过序列分析,我们确定了pxzlO145断裂生成缺失突变体pNAT65的两侧位点,在两个断裂点上发现存在“ATCTAGC”7个碱基的同向重复序列。 相似文献
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一种提取质粒DNA的改良方法 总被引:16,自引:1,他引:16
本文详细介绍了一种改良碱裂解法提取质粒DNA的方法,该法采用NH4Ac代替苯酚和氯份的抽提过程,得率高,质量好,完全达到了分子生物学常规实验的要求,如酶切、连接、转化大肠杆菌、PCR等,甚至用于序列测定和植物遗传转化,该法重复性好,操作简单、实用. 相似文献
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提出一种能识别DNA重复顺序的序列装配方案。首先通过预筛选和序列联配来判断两处 否真正重叠。然后把来自不同重复区域的所有片段组建成一个重复重叠群(repeat contig),而其余片段建成单拷贝重叠群(nonrepeat contig)。接着重复重叠群被拆分成两个重叠群并与其余的单拷贝重叠群连接成全序列片段顺序。最后按照该全序列片段顺序进行序列多重联配,得到全序列。经过8个目标序列库的验证,表明 相似文献
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在 2 0 0 0年 1 2月 1 4日英国出版的NATURE杂志上 (Vol.4 0 8:796~ 81 5) ,发表了植物分子遗传研究的模式开花植物拟南芥 1 1 5.4Mb的全序列图谱 ,原文的中文译名为“开花植物拟南芥的基因组序列分析”。拟南芥DNA全长 1 2 5Mb ,只剩下 1 0Mb的中心着丝区DNA ,因为多重复序列所含基因很少 ,还未全测出。拟南芥全基因组DNA包含 2 5498个功能基因组及其所对应的 1 1 0 0 0个蛋白质家族。这是人类首次全部破译出一种高等植物的全基因序列 ,是在分子水平上向植物生命奥秘探索的又一里程碑式的工作。拟南芥植物基因组… 相似文献
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蓝藻(blue-green algae)也称蓝细菌(cyanobacteria),具高等植物型放氧光合作用.蓝藻在原初生产力和固氮方面的重要性已得到充分证明,一些蓝藻的固氮作用与光合放氧过程同在一个细胞中进行.有些蓝藻富含蛋白质,可作为天然的蛋白质来源.蓝藻在环境保护中也有重要意义.正因为如此,近年来蓝藻基因工程蓬勃兴起.
相似文献
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一种快速有效的识别DNA重复序列的方法 总被引:1,自引:0,他引:1
按统计的相应分析方法设计和编制了基因组重复序列的识别软件。经众多Alu序列的回顾性分析,错报率为4.8%,漏报率为5.8%,又地剪入编码区的Alu序列的细致检查和对T细胞受体基因组的Alu序列的大尺度搜索,证实本程序是一种快束速和良好的识别DNA重复序列的工具。 相似文献
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随着基因工程研究的发展,近年来酵母质粒作为基因工程载体的研究已获得明显进展。因此,开展酵母质粒DNA快速检测方法的研究,将是很有意义的。目前质粒在啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中研究较多。1982年龚启蕙等报道了啤酒酵母7209—1A及1984 相似文献
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新型的NDA序列测定策略:PCR产物直接测序 总被引:1,自引:0,他引:1
DNA序列的测定在现代分子生物学中的应用越来越广泛 ,传统的模板制备方法是将待测序列的DNA片段插入质粒或病毒载体中 ,然后让其在宿主细菌细胞中增殖。尽管这套方法已被简化和标准化 ,但由于其涉及到活细胞的保存和使用 ,不可避免地会带来诸如载体和宿主细胞基因发生突变等不利影响。而用PCR技术直接从基因组或克隆片段制备测序模板 ,可以完全避免细菌培养、模板提取等重复性操作 ,也克服了以上弊端 ;由于PCR技术快速、简便 ,在检测人类遗传病的基因突变时 ,需要比较患者和正常人中的突变分布情况 ,应用PCR直接测序技术就能… 相似文献
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比较了单链和双链DNA(ss和dsDNA)模板和两种不同的聚丙烯酰胺凝胶电泳对DNA序列测定的影响。结果表明:在相同的条件下,ssDNA模板明显优于dsDNA模板;缓冲液梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳测定DNA序列的长度在40cm长的胶上可达350nt。而一般的线性聚丙烯酰胺凝胶电泳才可测150nt。对于基因组序列分析,采用单链DNA模板和缓冲液梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳是一种有效的测定方法。 相似文献