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相似文献
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1.
庚型肝炎病毒(HGV)NS5区部分基因的克隆和cDNA序列测定   总被引:3,自引:0,他引:3  
用RT-PCR技术从一例献血员血清标本中扩增出HGV非结构区的部分基因片段,克隆后测定。cDNA序列。该序列与国外三株HGV的核苷酸同源性在90%以上;与GBV—A和GBV—B的同源性分别为44.7%和33.17%;与已发表的23个HCV全序列的相应序列比较,同源性均小于40%。结果表明,克隆的病毒株为HGV中国株。同时,用RT—PCR检测了河北固安和南京地区的115份HCV感染者标本.HGVRNA阳性率为3.47%。表明我国某些特殊人群中HGV感染率较高,是一个不容忽视的问题。  相似文献   

2.
目的:对禽巴氏杆菌C48-3躺株编码成熟黏附蛋白的基因cpm39进行克隆和序列分析。方法:通过PCR从禽巴氏杆菌C448-3。基因组DNA中扩增出cpm39基因,克隆到pMD18-T载体中,转化大肠杆菌DH5d,并对目的基因进行核苷酸序列测定;用Clustal X和Mega 2.1软件将测定的序列与GenBank中已登录的16种血清型巴氏杆菌株核苷酸序列进行同源性分析。结果:测序结果表明cpm39基因大小为1002bp,与已知的16个血清型巴氏杆菌cpm39基因核苷酸序列的同源性为81.5%~100%。结论:克隆得到禽巴氏杆菌C。躺株编码成熟黏附蛋白的cpm39基因,该基因在不同血清型巴氏杆菌中具有很高的同源性,该蛋白可以作为研制预防巴氏杆菌病亚单位疫苗的候选抗原。  相似文献   

3.
猪瘟病毒中国际标准强毒株—F114株全长cDNA的构建   总被引:2,自引:0,他引:2  
  相似文献   

4.
用RT-PCRA法扩增分别获得了中国猪瘟病毒强毒石门株和免化弱毒株糖蛋白E0基因cDNA,并克隆到pGEM T载体中测定其核着酸序列和推导出其对应氨基酸序列;结果表明这两个毒株间的E0基因核着酸序列同源性为95.3%,氨基酸序列同源性为94%,有14个残基的差异;与几个代表毒株ALD株、GPE株、Brescia株、Alfort株和国外测得的免化弱毒C株相应序列进行比较,所测石门病毒核苷酸序列与上述各株对应序列的同源性分别为98.0%、97.1%、92.7%、86.8%和95.4%;氨基酸序列同源性分别为9  相似文献   

5.
研究新城疫病毒 ( NDV)核衣壳蛋白基因的生物学作用 ,以提纯的 NDV V4 株基因组 RNA为模板 ,化学合成 NP基因的特异核苷酸引物 ,RT- PCR扩增 NP基因 c DNA,得到一条 1 .5kb的DNA带 ,与 NDV NP基因大小一致 ,平端连接克隆到 p UC1 1 9质粒中 .阳性克隆经酶切鉴定及序列分析表明已获得新城疫病毒 V4 株 NP基因克隆 .将 NDV V4 株 NP基因碱基序列与已发表的NDV Beaudettec C株、La Sota株、D2 6株的 NP基因的碱基序列比较 ,同源性分别为 90 .64%、90 .1 7%、98.0 3% ,氨基酸序列差异率是 4.50 %、5.93%、2 .45% .NDV V4 株 NP基因与已发表的NDV Beaudettec C株、La Sota株、D2 6株的 NP基因有所不同 ,但具有高度同源性 .将 NDV V4 株NP基因 c DNA克隆到 pc DNA3 真核表达载体中 ,构建表达 NP蛋白真核质粒  相似文献   

6.
从伪狂犬病病毒Ea株基因组DNA中扩增到3.76kb的基因组片段,该片段包含UL31、UL32、UL33和UL34基因完整编码区,以及UL30和UL35基因部分序列。UL31、UL32、UL33和UL34基因G C含量为69.5%~73.4%,偏向于使用富含GC特别是第三密码子位置上核苷酸是C或G的密码子,Ala、Leu、Arg的利用率最高,占氨基酸残基总数的36.4%。PRV Ea株UL31和UL32基因与PRV Ka株核苷酸与氨基酸序列同源性都很高,在98%以上;而UL33和UL34基因与Ka株的氨基酸序列同源性较低,分别为95.7%和94.8%。UL31基因在疱疹病毒α—亚科所有成员之间都很保守,并且UL31基因与马疱疹病毒IV型同源程度最高。UL32、UL33和UL34基因均与牛疱疹病毒I型同源程度最高。UL31、UL32、UL33与UL34基因产物均有酪蛋白激酶2磷酸化位点和蛋白激酶C磷酸化位点,表明UL31、UL32、UL33、UL34蛋白质可能都是磷酸化蛋白质。  相似文献   

7.
利用反转录-PCR方法扩增了吉林省猪瘟病毒(HCV)两个野毒株gp55基因的主要保护性抗原编码区,并将其克隆到pGEM-T载体中,然后用Sanger双脱氧法测定了其核苷酸序列,并推导了其氨基酸序列。将测定的这两个HCV野毒株的部分序列(350bp)与国内外已知的HCV序列进行比较,结果表明:这两个野毒株的核苷酸序列的同源性为94.9%,氨基酸序列同源性为97.4%,与1985~1992年意大利中部分离4个野毒株的同源性明显高于其它HCV毒株,核苷酸同源性分别为97.2%~98.3%和94.0%~949%,氨基酸同源性分别为98.3%~991%和97.4%~98.3%,而与我国的HCV标准强毒株即石门株的核苷酸同源性仅分别为83.1%和83.1%,氨基酸同源性仅分别为90.6%和91.4%。因此认为吉林省这两个野毒株与意大利中部的4个野毒株具有密切的关系,而与石门株很可能来源不同。  相似文献   

8.
蜱传脑炎病毒东北株E蛋白的核酸和氨基酸序列   总被引:2,自引:1,他引:2  
从我国东北林区死者脑组织中,分离到蜱传脑炎病毒HLJ-1株,测定了它的E蛋白基因序列和推导的氨基酸序列,以及E蛋白抗原位点反应图谱。将该株与远东亚型Sofyn株和中欧亚型Neuderfl株做了同源性比较,HLJ-1株与Sofyn株E蛋白基因的核苷酸及氨基酸的同源性分别为94.3%和98.8%;与Neudoerfl的核苷酸和氨基酸的同源性分别为83.7%和96%。在E蛋白的核苷酸序列中,HLJ-1和  相似文献   

9.
用Rr190.70p-602n引物扩增了斑点热群立克次体(spottedfevergrouprickettsiae,SFGR)中国分离株(BJ-90株、Ha-91株和HLJ-054株)及SFGR国际标准株西伯利亚立克次体(Rickettsiasibiricu)246株和派克立克次体(R.parkeri)的rOmpA基因片段,将PCR产物克隆入pGEM-T载体中,用双脱氧法进行序列测定,并与SFGR的rOmpA基因已知序列进行了比较。结果表明,SFGR国际标准株间rOmpA基因片段的核苷酸同源性为90.06%~96.62%,推定氨基酸的同源性为83.05%~94.35%,中国分离株与国际标准株及参考株rOmpA基因片段比较的结果发现:BJ-90株及Ha-91株与西伯利亚立克次体标准株的核苷酸同源性分别为99.06%和98.31%,推定氨基酸的同源性则为98.87%和96.61%,HL-93株和HLJ-054株与日本立克次体(R.japonica)核苷酸同源性较高,分别为96.62%和95.68%,推定氨基酸的同源性为92.09%和89.27%。在中国分离株内,BJ-90株和Ha-91株的核昔酸同源性高达99.2…  相似文献   

10.
参考已发表的猪瘟病毒序列,设计并合成了一对引物,应用RTPCR 技术,扩增了猪瘟兔化弱毒(Hog cholera virus lapinized Chinese strain , HCLV) 和石门强毒株的E0 糖蛋白基因,并将其克隆到pGEMT 载体中,测定了其核苷酸序列,并推导了其氨基酸序列。结果表明我国这两株强弱不同毒株E0 糖蛋白核苷酸序列同源性和推导的氨基酸序列同源性分别为95-0 % 和94-3 % ,有13 个氨基酸的差异,HCLV 比石门株多了一个潜在的N糖基化位点。将我国这两株病毒与国外已报导的HCV 毒株E0 基因序列进行了比较,发现石门株与日本的两株毒株ALD 和GPE- 同源性较高,核苷酸序列同源性分别为97-4 % 和96-5 % ,氨基酸同源性分别为97-4 % 和96-0 % ,而与欧洲Brescia 株和Alfort 株同源性较低,核苷酸同源性分别为92-2 % 和86-5 % ,氨基酸同源性为95-2 % 和92-5 % , HCLV 与ALD、GPE- 、Brescia、Alfort 株核苷酸同源性分别为95-6 % 、94-9 % 、91-3 % 、85-5 % …  相似文献   

11.
中国人丙型肝炎病毒结构基因cDNA分子克隆及序列分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
王宇  陶其敏 《病毒学报》1992,8(4):315-320
  相似文献   

12.
In testing for antibodies to the hepatitis C virus (anti-HCV) in 112 patients with primary hepatocellular carcinoma, 10 of 33 white patients (30%) and 15 of 79 Asian patients (19%) had a positive response to the antibody. The antibody profile to individual hepatitis C viral antigens and the presence of circulating hepatitis C viral RNA were determined in the 25 patients. The anti-HCV antibodies most frequently detected were toward the antigens from the core (C22) and NS3 regions. Serum hepatitis C viral RNA was present in 17 of the 25 patients (68%), and these patients tended to have serum levels of alanine and aspartate aminotransferases higher than those patients without viremia (136 +/- 22 U per liter versus 64 +/- 11 U per liter and 161 +/- 26 U per liter versus 79 +/- 14 U per liter, respectively, both P < .05). Of the 15 Asian patients with hepatocellular carcinoma and anti-HCV, 4 (27%) had coexisting hepatitis B surface antigen (HBsAg) and 13 (87%) had antibodies to either hepatitis B core or surface antigen. Of the 10 white patients with anti-HCV, however, only 1 (10%) had hepatitis B virus antibodies (P < .01). Among 4 Asian patients with coexisting anti-HCV and HBsAg, 1 was found to have serum hepatitis B viral DNA and the other 3 had hepatitis C viral RNA. A history of blood transfusion was obtained from 12 of the 25 patients with anti-HCV (48%); 20 (80%) had coexisting cirrhosis. Our findings support the hypothesis that hepatitis C virus is an important etiologic agent in the development of primary hepatocellular carcinoma in both white and Asian patients in the United States.  相似文献   

13.
丙型肝炎病毒(Hepatis C virus,HCV)感染者的血液中病毒含量极低,还没有适当的方法可以直接检测病毒。现在常用免疫学方法测定特异性抗体[1]或利用 PCR 技术检测病毒核酸。由于 HCV基因组变异高达33%,PCR检测易发生假阳性和假阴性。同时由于丙肝抗原高度的变异性[2],虽然目前ELISA方法应用广泛,但是单一的诊断抗原已不能满足临床要求,需要多价抗原联合应用作为诊断试剂。目前,在我国流行的丙型肝炎病毒主要是Ⅱ型和Ⅲ型,国外的丙型肝炎诊断试剂研制单位主要是以Ⅰ型为主[3],而且进口的丙型肝炎诊断试剂昂贵,不适合在我国大量使…  相似文献   

14.
王文亮  王春杰等 《Virologica Sinica》2001,16(4):325-329,F003
采用原位分子杂交方法检测HCV RNA及HBV X基因;采用免疫组织化学方法研究HCV核心抗原,非结构区C33c抗原及HBxAg在肝细胞肝癌中的定位及分布。结果表明(1)HCV RNA、HBV X基因在肝细胞肝癌组织检出率分别为40%(55/136)和82%(112/136)。HCV RNA定位于癌细胞的胞浆内,阳性细胞呈散在、灶状及弥漫分布三种形式;HBV X基因在肝癌细胞中的分布呈胞浆型、核型及核浆型,阳性细胞也呈上述三种分布形式;(2)HCV C33c抗原、核心抗原在肝细胞肝癌中的阳性率为81%(133/164)及86%(141/164)。C33c抗原定位于癌细胞及肝细胞的浆内;核心抗原毁定位于癌细胞核中,又可定位于胞浆中。C33c抗原阳性细胞以灶状分布为主;而核心抗原阳性细胞在癌组织以弥漫核阳性常见,在癌旁肝组织以胸浆阳性为主;(3)HBxAg在肝细胞肝 癌中的检出率为75%(123/164),C33c和HBxAg二者同时阳性占63%(103/164)。HCV感染在我国肝细胞肝癌中比较普遍,HCV和HBV重叠感染占相当比例,可能在肝细胞肝癌的发生中起着重要作用。  相似文献   

15.
作者应用抗HCVNS3区C33c抗原2B6株单克隆抗体和抗HBxAg多克隆抗体,采用ABC法对102例人原发性肝细胞肝癌(PHC)组织进行了HCV及HBV抗原定位研究。HCVC3。抗原及HBxAg在PHC中的阳性检出率分别是81.4%及74.5%,C33c抗原或HBxAg阳性占所检病例94.1%,相同病例二者同时阳性为61.8%。102例PHC中50例有癌旁肝组织,其C33c抗原和HBxAg的阳性检出率分别是62%和92%。HCVC33c抗原定位于肝癌细胞的胞浆内,胞核未见阳性信号。C33c抗原阳性细胞在PHC中呈散在、局灶分布为主,在癌旁肝组织呈弥漫分布为主。本文结果提示HCV感染在PHC的发生中可能起重要作用。  相似文献   

16.
More than 100 independent strains ofThiobacillus ferrooxidans were isolated from six different domestic mining sites. Although there was some variation according to sampling site, about 73% of all strains carried more than one plasmid ranging in size from about 2.0 to 30 kilobase-pairs(kb). Among these, four plasmids of 2.4, 4.7, 5.1, and 8.9 kb, designated pTNA33, pTSY91, pTSB121, and pTSB122, respectively, were cloned intoEscherichia coli plasmids. pTSB121 and pTSB122, originated from the sameT. ferrooxidans strain, showed weak homology by Southern blotting, whereas pTSB121 showed high homology with pTSY91 from a different strain. It seems that the occurrence of the plasmid homologous to pTSB121 or pTSB122 is more ubiquitous inThiobacillus. On the other hand, pTNA33 is a unique plasmid because it showed no significant homology with other plasmids.  相似文献   

17.
丙型肝炎病毒是与输血有关的非甲非乙肝病毒[1] ;是全世界输血后获得性肝炎的重要病因之一 ,并与急慢性肝炎、肝硬化和肝癌有关。由于主要通过输血的传播 ,会给人民的身体健康尤其输血事业带来极大危害。采用基因工程技术 ,表达含有多段抗原的融合蛋白作为HCV检测试剂的抗原 ,可以简化多种抗原的表达及纯化过程 ,并提高了试剂的均一性[2 ] 。研究表明 ,在HCV的抗原基因中 ,核心蛋白Core、NS3区的C33c抗原、NS4区基因编码的抗原免疫原性最强 ,相应抗体出现早 ,分布广 ,亲和力强。因此 ,我们构建了含有中国人HCV序列的Co…  相似文献   

18.
肝硬变中丙型肝炎病毒C33c抗原及HBxAg的分布及意义   总被引:2,自引:0,他引:2  
应用抗HCVC33c抗原2B6株单克隆抗体和抗HBxAg多克隆抗体。以ABC法对86例肝硬变组织进行HCV及HBV相关抗原定位研究,HCVC33c抗原及HBxAg在肝硬变中的阳性率分别为76.7%及62.8%,C33c抗原和HBxAg阳性占所检病例88.4%,二者同时阳性为51.2%,HCVC33c抗原位于肝硬变组织的肝细胞胞桨内,充满整个胞桨,细胞核及胸膜未见阳性;阳性细胞呈弥温、局灶及散在分布  相似文献   

19.
通过逆转录(RT)-聚合酶链式反应(PCR),从中国人丙型肝炎病毒(HCV)携带者的血清中扩增并克隆到2段cDNA片段,即HCV基因组C区抗原基因C831cDNA片断(约530bp)和NS3区抗原基因C33ccDNA片段(约860bp)。C33ccDNA片段同C831cDNA片段经连接   肽Ser-Pro-Gly-Ser连接成为基因嵌合体C33c-C831(约1400bp)。C33c-C831基因嵌合体同温控型原核表达载体pBV220重组,构建成表达质粒pBV/C33c-C831,并在大肠杆菌细胞中获得了重组嵌合抗原C33c-CL的表达。通过酶切分析和Western免疫印迹法,对约占菌体可溶性蛋白9%的表达产物做了鉴定。采用TritonX-100和盐析处理,获得粗提表达产物。粗提的表达产物经尿素裂解和离子交换层析纯化,得到可用于检测抗HCV核壳蛋白和抗NS3区抗体的重组嵌合抗原C33c-CL。对C33c-CL做抗原性分析发现,它同时具有完整的C33c抗原和C22抗原的免疫反应活性,完全能替代单纯的C33c和C22抗原。该嵌合抗原在血清学诊断中有重要的应用价值,可望成为新一代HCVEIA诊断试剂的优选抗原。  相似文献   

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