小鼠受精抗原1基因与人类同源基因的关系

参照已报道小鼠受精抗原1（FA1）基因序列设计引物,运用PCR和PCR产物克隆测序等方法,对人受精抗原1（FA1）基因进行了克隆,并对两者进行了比较,结果显示:（1）已报道的小鼠FA1基因序列在其可读框内可能存在两处错误。（2）人OTK27基因可能与小鼠FA1基因同源,即OTK27基因就是人hFA1基因,或FA1基因就是小鼠otk27基因。 Abstract:The cloning of human fertilization antigen 1 gene（FA1） ,the supposed counterpart gene of mouse fertilization antigen 1 gene (FA1),was performed using the PCR and PCR products cloned sequencing methods.The result shows that there might be two mistakes in the mouse FA1 gene open reading frame (ORF),and human OTK27 gene and mouse FA1 gene might be homogeneous genes in the two species.     

寡核苷酸DNA Microarray用于HLA DRB1基因分型的研究

对寡核苷酸DNA Microarray用于HLA DRB1基因分型的技术进行研究。常规的酚/氯仿法提取标准血样基因组DNA,在DRB1的exon2区域设计一对引物,经PCR扩增基因组相应区段并用Cy5-dCTP进行标记。设计寡核苷酸分型探针,将探针固定在APS-PDC法制作的DNA Microarray上,用标记的PCR产物与之杂交,扫描仪对杂交效果进行扫描,Imagene软件对杂交图像进行分析。共检测了33例标准血样的HLA DRB1基因型。检测结果证明研制的DNA Microarray准确、灵敏。DNA Microarray技术可以有效地检测DRB1等位基因,对比常规的PCR-SSP和PCR-SSO方法、分型基因芯片方法更为直观,并有集成化优势。     

中德生物STR荧光ZDgenetype 9+1基因分型试剂盒应用结果分析

目的:确证中德生物STR荧光ZDgenetype 9 1基因分型试剂盒应用于个体基因分型的准确性和重复性。方法:应用中德生物ZDgenetype 9 1 STR荧光基因分型试剂盒扩增100例无关个体样本,建立扩增产物在ABI 310遗传分析仪上基因分型的方法,相同样本扩增结果与AmpFLSTR Identifiler基因分型结果进行比较。结果:ZDgenetype 9 1荧光基因分型试剂盒对100例无关个体血样进行复合扩增并实现了在ABI 310遗传分析仪上进行基因分型,其结果与AmpFLSTR Identifile扩增相同样本的基因分型结果吻合率为100%。结论:中德生物ZDgenetype 9 1 STR荧光基因分型试剂盒适用于法庭科学日常办案和科研使用。     

HLA-DRB1基因多态性与新疆哈萨克族人群结核病易感性的研究

目的:研究HLA-DRB1基因多态性与新疆哈萨克族人群结核病(TB)的相关性。方法:采用病例-对照的研究方法,应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)技术对231例新疆哈萨克族肺结核患者和230例新疆哈萨克族健康对照者的13个HLA-DRB1等位基因进行分型,比较其等位基因频率(GF)并计算其比值比(OR)。结果:与新疆哈萨克族人群对照组相比,新疆哈萨克族人群结核病例组中HLA-DRB1*04显著增高(11.72%比6.75%,p0.05,OR=1.889),HLA-DRB1*10也增高(2.86%比1.09%),但统计学上无显著性差异(Pc0.05)。结论:HLA-DRB1*04可能是新疆哈萨克族人群结核病的易感基因。     

贵州地区汉族人群THO1、TPOX、CSF1PO基因座的遗传多态性

为了解贵州地区汉族群体中THO1、TPOX、CSF1PO基因座的遗传多态性,获得这3个基因座的群体遗传学数据和法医学相关数据。采自贵州地区汉族无关个体的110份EDTA抗凝血样用Chelex法提取DNA,应用PCR复合扩增技术扩增样本后,聚丙烯酰胺凝胶电泳分型。对3个STR基因座的等位基因频率进行了调查分析,并与其他汉族人群的等位基因频率进行了比较。在贵州汉族群体中,3个基因座的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。3个STR基因座总个体识别率为0.9986,累积非父排除率为0.832。表明这3个基因座在法医学个体识别及亲子鉴定中是很有价值的遗传标记系统。 Abstract:To understand the genetic polymorphism at THO1,TPOX,CSF1PO STR loci for Han population in Guizhou Province,and construct a preliminary database,EDTA-blood specimens were collected from the 110 unrelated individuals in Han population from Guizhou.The DNA samples were extracted with Chelex method and amplified by multiplex polymerase chain reaction.The PAGE was used to type the PCR products.The allele frequencies were compared with other Han populations.The genotype distributions of THO1,TPOX and CSF1PO were in accordance with Hardy-Weinberg equilibrium.The combined PD and PE were 0.9986 and 0.832 respectively.All of the three loci in this study provide useful marker for forensic paternity test and individual identification.     

应用SSP-PCR/SSO方法进行中国辽宁汉族人HLA-DRB1基因的遗传多态性研究

对１５９名中国辽宁汉族个体的基因组ＤＮＡ进行分析,共检出４２种等位基因,其中以ＤＲＢ１０９０１２（１２．８％）、０７０１（１０．７％）、１５０１（１０．４％）最为常见,其次为ＤＲＢ１１２０１（７９％）、１２０２（７５％）、１１０１（６６％）、０３０１（５．０％）。并发现辽宁汉族人ＤＲＢ１等位基因频率与白种人间存在明显差异,揭示不同人种有其自己的主要等位基因。同时对本技术在ＨＬＡ－ＤＲＢ１分型应用中的优点进行了讨论     

中国汉族人群人类白细胞抗原HLA不同基因座位间的基因重组

人类白细胞抗原(human leucocyte antigen, HLA)复合体基因座位间的重组、重组热点、连锁不平衡与疾病易感性的关联性研究已成为免疫遗传学与人类后基因组学等研究领域的研究重点与焦点. 本文报道了在中国汉族人群中发现的10例HLA复合体中的基因重组家系. 采集重组家系的2~3代家庭成员的外周血标本, 首先对其HLA-Ⅰ, Ⅱ类区域的5个经典基因位点进行PCR-SSP低、高分辨率基因分型及SBT分析, 然后再进行遗传家系分析研究, 确定HLA基因重组相关位点, 并对重组家系的单体型进行了群体统计学分析. 结果发现, 在10例HLA重组家系中有8例重组发生在HLA-A/Cw位点之间, 其中4例重组发生在A*02-Cw*03单体型中, 2例重组发生在A*24-Cw*03单体型中; 1例重组发生在HLA-B/DRB1位点之间, 还有1例重组发生在HLA-B/Cw位点之间. 群体统计学分析发现, A*02-Cw*03单体型呈一定程度的连锁不平衡但不是很强(Δ/δ_(Δ) = 3.0, Δ_(r) = 0.30); 另有3个单体型虽呈强连锁不平衡却发生了重组事件, 即A*33-Cw*03 (Δ/δ_(Δ) = 7.22, Δ_(r) = 0.51), A*30-Cw*06(Δ/δ_(Δ) = 10.37, Δ_(r) = 0.93)和 B*13-Cw*03(Δ/δ_(Δ) = 7.69, Δ_(r) = 0.38), 这说明重组可能是打破旧的连锁不平衡来产生新的连锁不平衡的重要原因. 本文绘制了每个重组家系成员的HLA单体型, 并建立了中国汉族人群的HLA重组遗传图谱, 初步定位重组发生的范围并分析了位点间重组与连锁不平衡的关系, 这为更深入地研究HLA重组事件奠定了基础.     

汉坦病毒核壳蛋白重组抗原的制备和基因分型的研究

根据HFRSV汉滩型(HTN)代表株76-118和汉城型(SEO)代表株R22基因资料,设计了两组引物,用电脑软件分析证明设计符合引物标准.以一组引物克隆全长S基因片段和N端的部分S基因片段,并使它们在T7系统进行融合表达和非融合表达.非融合表达产量虽不及融合表达高,但生物活性好.以非融合表达的两个S基因片段产物作间接ELISA的包被抗原,其工作浓度均达1:10 000.用另一组引物建立了逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR),检测我国不同地区由8种主要宿主分离的37个HFRSV毒株,2个阳性标准对照毒株和5个阴性对照标本,并与cELISA法比较,二者阳性检出率分别为100%和84.6%,符合率为84.6%,但前者比后者敏感性高15.4%.对其中20个毒株的PCR扩增产物先后用RsaⅠ和HindⅢ作二级酶切,建立了逆转录-聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析(RT-PCR-RFLP)分型法.被定为HTN型的9株,SEO型的8株,余3株未能定型.此20个毒株曾用血清学方法分型,仅11株分型成功,与RT-PCR-RFLP法结果符合.分型成功率RT-PCR-RFLP法比血清法高30%.     

放线菌的单酶切AFLP基因分型研究

使用MseI限制性内切酶对放线菌链霉菌属中的12株菌基因组DNA进行酶切,与接头连接后,引物使用一个选择性碱基对模板进行PCR扩增,PCR产物在琼脂糖凝胶上进行电泳检测。结果表明,对于MseI内切酶产生的模板,选择性碱基采用A、T、C和G都能够获得清晰丰富的条带。MseI内切酶产生的图谱上有72个位点,多态性位点71个,达98．6％。因此,使用MseI内切酶适合构建放线菌的单酶切AFLP指纹图谱。     

兰州地区女性感染HPV及其基因类型分析

目的:了解兰州地区成年女性感染人乳头瘤病毒(humanpapillomavirus,HPV)及其基因类型分布状况,为本地区HPV分子流行病学研究提供理论依据。方法:利用PCR技术分别对100例妇科门诊就诊者进行HPV基因亚型检测。结果:100例样品中,HPV DNA检出率为19%(19/100),其中HPV16 DNA感染率15%(15/100),HPV58 DNA感染率3%(3/100),HPV18 DNA感染率2%(2/100),HPV 16与HPV18双重感染1例。结论:本地区成年女性HPV感染主要以HPV16多见,而HPV16与恶性肿瘤密切相关,因此对HPVDNA阳性者定期随访,有利于宫颈癌的防治。     

皮肤性病患者人乳头瘤病毒基因分型检测的临床分析

目的:了解皮肤性病患者不同病变类型中的HPV感染型别。方法:选择2014年6月~2015年6月我科门诊就诊者368例,分为4个组别:尖锐湿疣患者组242例,鲍温样丘疹病患者18例,男性冠状沟珍珠疹和女性假性湿疣70例,未见任何皮疹且醋酸白试验阴性的体检者38例。采用PCR-反向点杂交法检测皮损或外阴局部HPV-DNA亚型,并用SPSS11.0软件进行统计学分析。结果:(1)HPV-DNA的总检出率为72.9%,其中单一型别感染率57.1%,多重感染率15.8%;(2)268例HPV阳性标本中,高危型感染占51.9%,低危型和混合型的阳性率分别为33.2%、14.9%;(3)尖锐湿疣组和鲍温样丘疹病患者组HPV-DNA的阳性率分别为97.9%、88.9%,而男性珍珠疹和女性假性湿疣组以及要求体检人群的阳性率分别为14.3%和13.2%;从感染型别分析,尖锐湿疣主要是6、11、16、18、31、33、35、43和66亚型,鲍温样丘疹病患者主要是16亚型,男性珍珠疹和女性假性湿疣以及要求体检人群的感染型别主要是低危型感染,分别是6、42、43、81和6、42、83;(4)在被检测的18个高危HPV亚型中,最常见类型依次为HPVl6、18、58、56、33、52、68、31、39,未检测出HPV35、45、51、53、59、66、73和82亚型;在被检测的5个低危HPV-DNA亚型中依次为HPV6、11、42和43,未检测出81亚型。结论:HPV感染以单一型别感染为主,且以高危型为主,应该重视临床HPV感染亚型的检测,尤其是高危型HPV感染者的随访管理。     

新疆维族妇女感染的HPV 型别分布的研究

目的:探讨人乳头瘤状病毒(Human papillomavirus,HPV)在新疆南部维族妇女人群中的型别分布情况。方法:以年龄在30-59岁的新疆伽师县夏普吐勒乡维吾尔族妇女人群为基础进行筛查,签署知情同意书后,采集受试者宫颈脱落细胞,利用PCR和基因芯片技术检测HPV DNA并分型。结果:共2473名妇女入选。HPV总的感染率为9.1%,高危型中HPV-16的感染率最高为6.9%,其他高危型的感染率从高到低依次为:HPV-59、HPV-56、HPV-18、HPV-33、HPV-58、HPV-51、HPV-31、HPV-45、HPV-52、HPV-68、HPV-35、HPV-39。低危型中HPV11感染率最高,其他低危型的感染率从高到低依次为HPV-42、HPV-43、HPV-6、HPV-53、HPV-66、HPV-73。HPV-44、-83、-MM4没检测到。多重感染率为34.2%。结论:新疆维吾尔族妇女人群中以HPV16感染为主,其次为HPV59、56、18、33等。HPV59可能是新疆维吾尔族妇女较易感染的类型。体现了新疆维吾尔族妇女感染HPV的特殊性。     

Application of Human Adenovirus Genotyping by Phylogenetic Analysis in an Outbreak to Identify Nosocomial Infection

Nosocomial infections are common in pediatric patients and can be fatal in infants and immunocompromised patients. In September 2018, a high positive rate of human adenovirus HAdV was occurred among hospitalized children in the Children's Hospital Affiliated to the Capital Institute of Paediatrics in Beijing. To investigate whether this outbreak of HAdV was related to nosocomial infections or the result of community infections, we collected respiratory specimens from patients with acute respiratory infections in a respiratory ward during June to December 2018, and screened for respiratory viruses. Among 1,840 cases included, 95(5.2%, 95/1840) were positive for HAdV and 81 were genotyped based on phylogenetic analysis, including seven as HAdV-1(8.6%), 30 HAdV-3(37.0%), two HAdV-6(2.5%), and 42 HAdV-7(51.9%). More HAdV-positive samples were collected in August(4.7%, 12/255), September(15.0%, 41/274) and October(6.9%, 17/247), with a peak in September 2018. By combining the results of HAdV phylogenetic analysis with clinical data of patients, there were 77 cases(4.2%, 77/1840; 81.1%, 77/95) excluded from nosocomial infections, eight cases representing possible infections transmitted by visitors or attending parents, three cases without sequences that might have been due to infection transmitted by roommates positive for HAdV, one case of a roommate without an HAdV sequence, and six cases that shared highly homologous sequences with those of their roommates, for which nosocomial infections might be considered. In conclusion, genotyping of HAdVs based on phylogenetic analysis combined with clinical information provides a powerful method to distinguish nosocomial infections from community acquired infection, especially when tracing the origins of nosocomial infections.     

Identification of Tumor Antigens Among the HLA Peptidomes of Glioblastoma Tumors and Plasma

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Highlights

• •The plasma-soluble HLA peptidome of Glioblastoma contains many tumor antigens.
• •This sHLA peptidome may serve as a rich source for disease biomarkers.
• •The sHLA peptidomes are highly correlated with the tumor's membranal HLA peptidomes.
• •The HLA peptidomes differ significantly from the proteomes of the tumors.

     

汉坦病毒核壳蛋白重组抗原的制备和基因分型的研究

根据HFRSV汉滩型（HTN）代表株76－118和汉城型（SEO）代表株R22基因资料,设计了两组引物,用电脑软件分析证明设计符合引物标准。以一组引物克隆全长S基因片段和N端的部分S基因片段,并使它们在T7系统进行融合表达和非融合表达。非融合表达产量虽不及融合表达高,但生物活性好。以非融合表达的两个S基因片段产物作间接ELISA的包被抗原,其工作浓度均达1：100000用另一组引物建立了逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）,检测我国不同地区由8种主要宿主分离的37个HFRSV毒株,2个阳性标准对照毒株和5个阴性对照标本,并与cELISA法比较,二者阳性检出率分别为100％和84．6％,符合率为84．6％,但前者比后者敏感性高15．4％。对其中20个毒株的PCR扩增产物先后用RsaⅠ和HindⅢ作二级酶切,建立了逆转录-聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析（RT-PCR－RFLP）分型法。被定为HTN型的9株,SEO型的8株,余3株未能定型。此20个毒株曾用血清学方法分型,仅11株分型成功．与RT-PCR－RFLP法结果符合。分型成功率RT-PCR－RFLP法比血清法高30％。     

Human platelet electrorotation changed induced by activation: inducer specificity and correlation to serotonin release

Electrorotation of single platelets was compared with [¹⁴C]serotonin release, aggregation and electron microscopy. Activation of washed and degranulated platelets was induced by thrombin, arachidonic acid, collagen, adrenaline, platelet activation factor (PAF (PA), ADP and A23187. A strong correlation between electrorotation decrease and serotonin release was found. Electrorotation did not correlate with aggregation. It was concluded that an increase of the specific conductivity of the platelet membrane by three orders of magnitude (approx. 1.0–10⁻⁷ S · m⁻¹ to 1.0·10⁻⁴ S · m⁻¹) upon activation was responsible for the observed decrease of anti-field rotation and the shift of the first characteristic frequency towards higher values. Electrorotation allowed for time-dependent measurements of activation. Characteristic activation times in the order of minutes were found. There was the following sequence of activators classified by increasing activation time constants: A23187 was the fastest followed by thrombin, collagen, PAF, arachidonic acid, adrenaline, and ADP.     

FDP相关肽修饰物合成与抗栓活性研究

采用多肽固相合成法合成了ＦＤＰ相关肽的修饰产物ＨＰＡ,经ＨＰＬＣ鉴定,其纯度为８５．５％,氨基酸组成分析及质谱法测定分子量结果均与理论值相符合。生物活性研究表明,在体外,该肽能有效地抑制ＡＴＰ引起的人血小板聚集作用．在体内,该肽能显著增强家兔血纤溶酶的活性,并能有效抑制家兔实验性血栓的形成。