简并PCR及其应用

简并PCR技术是根据同源蛋白的氨基酸序列扩增到同源基因的核苷酸序列,具有独特的优点。成功进行简并PCR的关键是设计好两组引物库和对反应条件进行优化。由于简并PCR自身的特点,在新基因的克隆、基因表达检测、病毒检测和基因组研究中有其广泛而独特的应用。     

TAIL-PCR技术及其在植物基因中的克隆

热不对称性PCR(thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR)是一种用来分离与已知序列邻近的未知DNA序列的分子生物学技术.该技术利用3个根据已知序列设计的嵌套特异性引物分别和简并引物组合进行PCR反应,选择恰当退火温度对目标片段进行PCR扩增.TAIL-PCR技术作为一种使用技术简单易行,反应高效灵敏,产物特异性高,重复性好,能够在较短的时间内获得目标片段,已经在分子生物学研究领域广泛应用.本文从TAIL-PCR技术原理出发,对该技术特异性引物设计、随机引物组合选择、PCR反应条件等关键性问题进行综述,并介绍TAIL-PCR技术在植物基因克隆上的应用现状及发展前景.     

简并引物在PCR扩增甘油—3—磷酸转酰酶基因中的应用

应用高简交引物,结合ＰＣＲ扩增技术从南瓜Ｃｕｃｕｒｂｉｔａ ｍｏｓｃｈａｔａ 总ＲＮＡ的逆转录产物中得到ＧＰＡＴ基因保守区。在ＰＣＲ反应中,简并引物之间的浓度配比是影响扩增效率的关键。用脱氧次黄苷替代简并引物中的高简交位中大幅度降低简并程度,显著提高扩增产物的特异性及扩增效率。     

PCR及其衍生技术在基因突变检测中的应用

许多人类遗传性疾病及某些抗艾滋病药物的抗性乃至细菌对某些抗生素的抗药性通常源于基因突变。本文对近年来在基因突变检测中应用日益广泛的各种PCR 衍生技术作一综述;重点介绍了错配PCR技术,以及我们实验室近期报道的一种快速检测喹诺酮类药物耐药大肠杆菌的错配PCR方案。 Abstract:Many inherited diseases and drug resistance have been attributed to mutations in corresponding genes.In this paper,several techniques based on PCR used in diagnosis were concluded.The development and research progress of Mismatch PCR were discussed in details.Some information about an assay that we developed for detection of antimicrobial resistance to quinolones was also described.     

简并引物在黑木耳交配型因子研究中的应用初报

交配型因子控制着异宗结合担子菌单核体之间交配的可亲和性、核配和子实体正常发育。对几种四极性担子菌的研究表明,交配型因子A、B对应于不同染色体上的两个交配型座位(mating type locus),每个座位又包含α和β两个亚单位,每个亚单位内部又有许多基因(李莉云等,1998)。对二极性担子菌大麦坚黑粉菌Ustilago hordei和光滑环锈伞Pholiota nameko的研究显示,二极性担子菌的A因子同样由两个亚单位组成(Lee et al.,1999,Ratanatragooldacha et al.,2002)。在已克隆的所有担子菌A交配型基因中,都存在与同源盒(Homeobox)类似的序列。同源盒序…     

PCR反应混合液的冻干处理及其应用

本研究将除模板DNA以外的PCR反应混合液,经过真空浓缩冻成干粉状后,分别置于室温和4℃贮存,经过一定的贮藏时间后进行PCR反应,发现经冻干处理的样品能在较长的贮存时间内保持扩增活性,这将给实际工作带来很大的便利。 Abstract:In this paper we introduce a new storage method of PCR ingredient.PCR mixture except DNA template has been frozen to dry powder by the DNA-Plus system.This kind of powder was stored at room temperature or 4℃.PCR has been run in different period of storage.It was discovered that the samples of lyophilization could keep activity for a long time.     

简并引物PCR技术研究洋水仙PVY组病毒初报

利用简并引物ＲＴ－ＰＣＲ扩增技术,结合ＲＴ－ＰＣＲ扩增片段ＲＥＬＰ分析,对洋水仙１４个病毒病样品进行分组检测,结果表明洋水仙植物上存在有四种以上ＰＶＹ组病毒侵染。它们可能是ＴＢＶ、ＮＹＳＶ、ＮＳＳＶ和ＯｎＹＤＶ等。     

RAP-PCR技术及其应用

RAP-PCR是以PCR为基础构建RNA指纹图谱,研究基因差异表达的有效方法.所显示的种系特异性差异可用于对基因的遗传作图;所揭示的组织特异性差异可用于研究特异基因的表达.该法可检测各种情形下RNA群体间的差异.本文简介其基本原理及在基因差异表达研究领域的最新应用。 Abstract:RAP-PCR is a useful method based on PCR to display fingerprint of RNA populations and to study differential gene expression.The strain-specific differences revealed should be useful for genetic mapping of genes.The tissue-spe-cific differences revealed might be useful for studying differential gene expression.In this review,we introduce the theory of RAP-PCR and its recent applications.     

作物数量遗传学基础 二、遗传力及其估算

两栖类染色体的研究,过去多使用以生殖 细胞和端蚌尾部上皮细胞为材料的水低渗压片 法^[6]。然而,生殖细胞和峪蚌组织受季节的限 制颇大,所得的中期分裂相亦不甚多。随着 低等脊稚动物组织培养技术^[1,2]与血液培养技 术^[3]的发展,近年来已更多的使用离体培养的 细胞来进行研究。     

简并PCR法用于白色念珠菌MAPK新基因的筛选

ＭＡＰＫ很可能在白色念朱菌形态发生中起作用。根据所有ＭＡＰＫ保守区域ＶＩＢ和ＩＸ的氨基酸序列合成了两个简并的引物,以ＳＣ５３１４染色体ＤＮＡ作为模板,在非严谨条件下（３７℃）进行ＰＣＲ以筛选白色念球菌中新的ＭＡＰＫ基因,一共测定了１００个ＰＣＲ基因片段的序列,在２５个新基因片段中,筛选到两个新的ＭＡＰＫ基因片段,以这两个基因片段为控针从染色体基因库中克隆了对应的全长基因,序列分析表明它们是新的ＭＡ     

PCR技术应用的新进展

近年来,随着PCR技术方法学的逐步改进和完善,更加显示出它的实用性.这不仅扩大了其用武之地,也促进了分子生物学的快速发展.文章着重介绍PCR在基因工程和蛋白质工程应用中的某些新进展,包括不需连接的克隆技术、随机引导／定位PCR、cDNA末端随机快速扩增、重组PCR和大引物PCR．     

抑制性消减杂交技术（SSH）及其在基因克隆上的应用

简要概述了抑制性消减杂交技术的基本原理、基本过程、优越性、主要缺陷及其在基因克隆方面的应用进展。     

白腊DREB基因克隆中简并引物的设计

根据拟南芥DREB2A基因序列进行GenBank内Blastx序列同源性查询,对其中同源性较高的25个氨基酸序列进行了分析,设计简并引物,应用RT-PCR技术克隆白腊DREB2A基因,得测长2473bp,与拟南芥DREB2A同源性为96.94%的基因片段,并在GenBank登记,注册号为AY536056。     

单引物预掺入PCR与抗体可变区基因的体外放大

用针对引导序列的5′-引物和针对恒定区的3′-引物,常规PCR程序只使所选5株单抗10个可变区cDNA中的4个得到放大.新设计的程序增设了一个反应时相:94℃ 1 min,37℃ 6-8min,循环1-3次,只加入5′-引物,补充3′-引物后,转入常规PCR循环,10个可变区cDNA均获放大.此程序被命名为“单引物预掺入PCR”.     

细菌视紫红质的基因克隆与表达

细菌视紫红质的基因克隆与表达卢春林,汪俭,梅祺,韦钰（东南大学吴建雄实验室,南京２１０Ｏ１８）叶寅,田波（中国科学院微生物研究所,北京１０００８０）关键词细菌视紫红质基因;聚合酶链反应（ＰＣＲ）;基因克隆与表达细菌视紫红质（ｂａｅ快ｒｉｏｒｈｏｄｏＰ...     

西伯利亚蓼PsGRX基因的克隆及其在NaHCO_3胁迫下的表达

采用cDNA末端快速扩增（RACE）技术从西伯利亚蓼叶cDNA文库中克隆到谷氧还蛋白基因（PsGRX）的完整编码区cDNA序列（GenBank注册号为GU139794）,长度为465bp,编码106个氨基酸。根据与其他植物谷氧还蛋白的氨基酸序列的比对以及系统进化分析的结果,初步确定此基因为谷氧还蛋白基因家族成员。实时定量PCR的结果显示,PsGRX在西伯利亚蓼的叶、茎、地下茎中均有表达,叶中表达量最高,地下茎和茎中较低。在NaHCO3胁迫的过程中,此基因在叶、茎和地下茎中的表达模式也有较明显的差异。     

虹鳟MC4R基因的PCR扩增及其应用

黑素细胞皮质激素受体(MC4R)是跨膜G蛋白偶联受体。MC4R在人和鼠的体重、能量稳态和采食量的调控中具有重要作用,是第一个发现的与人类显性遗传疾病性肥胖相关的靶位点。虹鳟(Oncorhynchus mykiss)属于冷水性鱼类,具有很好的药用和食用价值,但生长缓慢。本研究根据斑马鱼的MC4R基因保守区的核苷酸序列设计引物,通过PCR扩增出虹鳟的MC4R基因,纯化后测序。本实验测出虹鳟MC4R基因968bp,并发现其与其它鱼类的MC4R进行了同源性分析,构建基因进化树。