计算识别microRNA及其靶基因

小RNA的发现为基因调控系统研究提供了新的方向。在多数物种中已经发现了大量的小RNA。这一领域已经成为了近来研究的热点,在研究起始阶段,计算学方法已经成为实验研究中不可或缺的工具,许多发现是由生物学实验与计算学方法共同合作来完成的。在这篇综述中,我们总结了前人关于小RNA及其靶基因识别的理论知识。最后,讨论了关于预测小RNA及其靶基因的计算学方法和相关软件。     

非编码RNA研究进展

非编码RNA是指不具备蛋白质编码能力的RNA,包括转运RNA、核糖体RNA、小核仁RNA(small nucleolar RNA, snoRNA)以及长非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)等.非编码RNA广泛参与生命活动中重要的生物功能,如生物个体的发育与分化、生殖、细胞凋亡和细胞重编程等,并且与人类疾病密切相关.近年来,随着我国经济的发展和人口老龄化,心血管疾病、肿瘤、代谢性疾病等疾病已成为威胁中国居民健康的重大慢性非传染性疾病,一些罕见病,例如小胖威利综合征(Prader-Willi syndrome, PWS)也随着人口基数的不断增大逐渐影响我国居民的身体健康.随着对这些慢性疾病及罕见疾病发生发展的相关机制研究,我国科学家发现非编码RNA与这些疾病密切相关.非编码RNA参与调控一系列的心血管疾病、肿瘤、代谢性疾病、感染免疫性疾病和PWS等疾病过程.本文对我国学者在非编码RNA领域的贡献进行综述,详细阐述了非编码RNA的加工形成和功能研究等主要进展,并对探究这些非编码RNA与PWS、心血管疾病、肿瘤、代谢性疾病和感染免疫性疾病等发生发展中的重要调控作用,以及我国科学家对该领域的贡献进行了详细的综述和总结.     

piRNA——一种新型的小分子RNA

小分子RNA已成为全球生物学研究关注的热点之一.最近,在哺乳动物的生殖细胞中发现了一种新型的小分子RNA：piRNA,比以往发现的小分子RNA稍长些,大小在30个核苷酸左右,piRNA必须与哺乳动物的Piwi蛋白结合才能发挥作用.目前对piRNA的研究还处于初始阶段,但鉴于piRNA主要分布在包括人类等数种动物体睾丸的精原细胞内,科学家们推测这类小分子RNA可能与动物体内精子的发育和维持的功能相关.     

2015年中国医学遗传学研究领域若干重要进展

2015年中国医学遗传学稳步发展,众多具有原创性的研究论文在国际顶级杂志上发表。中国科学家在医学遗传学的诸多领域,如罕见疾病的致病基因、复杂疾病的易感基因、癌症的体细胞突变、遗传学新方法新技术、疾病相关微小RNA(microRNA,miRNA)、疾病相关长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)、疾病相关竞争性内源RNA(Competing endogenous RNA,ceRNA)、疾病相关可变剪接和分子进化等研究领域均取得了突破性的进展。中国科学家在医学遗传学研究中逐步从常见变异延伸到罕见变异,从遗传学现象的描述到功能机制的确证,从单组学分析扩展至多组学数据整合,从基础研究走向临床应用。同时,中国科学家的研究成果引起了国际同行的高度关注。本文概括性综述了2015年中国科学家在医学遗传学领域取得的若干重要研究进展,旨在追踪当前中国医学遗传学领域发展的前沿,与国内读者分享我国科学家在该领域取得的重要成果以及研究思路。     

环状RNA翻译在癌症中的研究进展

环状RNA是一类有着独特环状结构的非编码RNA,它在生物体内有微小RNA分子海绵、蛋白质脚手架、调控基因转录、调控可变剪接、进入外泌体等多种经典功能机制。虽然环状RNA被定义成一种非编码RNA,但随着生物信息学和翻译组学的发展与应用,越来越多的研究发现,环状RNA是能够被翻译的。该文介绍了现在主要的环状RNA翻译的调控机制,总结了目前研究环状RNA翻译的常用数据库,汇总了环状RNA翻译的蛋白质和多肽在癌症中的最新发现,讨论了环状RNA翻译的应用前景和问题,旨在促进发现更多由环状RNA编码的与肿瘤相关的蛋白质和多肽。     

中国新生代海洋微体古生物学研究现状与发展

我国拥有辽阔的海域,其地理地貌类型齐全,生态与沉积环境多样,是进行微体古生物学研究的一个绝好天然场所.中国的海洋微体古生物学研究开始于20世纪50年代末,当时属于起始摸索阶段.真正发展并奠定基础的时期是在近30年以来,较为全面地开展了分类学、生态学、沉积学、生物地层学、古海洋环境分析与地质资源勘探应用研究等,基本摸清了各个主要类群的种类组成、生态环境、沉积分布及其历史过程的变化特征,提供了翔实的基础资料,并在古环境应用研究方面实现与国际接轨.文章简要回顾和分析这一历程的一些主要特点.     

我国兽医寄生虫学的发展

从基本发展历程、取得的成就、学科现状与水平评述和学科未来发展展望4个方面综述了我国兽医寄生虫学的发展。第一方面讲述了我国兽医寄生虫发展历经的3个阶段,即描述寄生虫学阶段、实验寄生虫学阶段和免疫寄生虫学与生化-分子寄生虫学阶段。第二方面从科研、教材与专著和学会的建立的角度陈述了所取得的成就。在学科现状与水平评述方面,指出我国在分类区系和实验寄生虫学方面基本与国际水平相当,但我国在寄生虫学研究方面资金注入渐趋不力,传统研究被忽略,前沿研究缺乏后劲,人才外流现象严重,令人堪忧。最后,从新的诊断技术、寄生虫病生物防制、新的寄生虫病或旧病新流行、寄生虫基因组工程、受体理论和海洋寄生虫学等6个侧面展望了我国兽医寄生虫学的发展方向。     

RNA组学：后基因组时代的科学前沿

历史表明,每当DNA研究取得重大突破后,都会出现一个RNA研究的高潮.1953年DNA双螺旋结构的解析掀起了在RNA转录和翻译水平解读遗传信息的高潮,导致mRNA,tRNA和rRNA的发现以及遗传密码和“中心法则”的建立.1977年分裂基因（split gene）的发现极大地促进了在RNA转录后加工水平解读遗传信息表达的过程及机制．     

RNA研究的前沿与挑战

核糖核酸(RNA)是生命科学“中心法则”的三大核心分子之一, RNA调控细胞生命活动规律的机制研究已成为生命科学发展最为迅速的前沿领域之一,是未来生物技术革命的重要驱动力。加强RNA领域原创理论、原创技术和转化应用的突破,促进学科交叉,符合当前生物医学与农业科学发展的需求,也是实现高水平科技自立自强、促进经济社会发展和确保国家安全的必要之举。该文基于国家自然科学基金委员会(简称自然科学基金委)第337期双清论坛“RNA研究的前沿与挑战”研讨,结合RNA研究领域的历史、RNA研究在生物技术革命中的重要地位,阐述了RNA研究的科学价值与战略意义、中国RNA研究的主要进展和重要成果,提出了自然科学基金委未来5～10年在该领域亟需解决的关键科学问题与部署的研究方向,并对促进RNA基础研究与应用基础研究的变革性发展提出了政策建议。     

军事医学科学院近年RNA研究进展

RNA研究一直是生命科学最重要的领域之一.军事医学科学院在RNA研究方面主要集中在RNA病毒的基础研究、RNA相关技术平台的建立和应用、核酶研究及反义核酸等几个方面.在非编码微小RNA（miRNA）和RNA的生物信息学方面也开展了许多工作,取得了较好的成绩.多种功能RNA组学研究中的关键技术平台在军事医学科学院建立并得到广泛应用,培养了一批RNA研究专业技术人才,为进一步深入开展功能RNA研究奠定良好基础.     

计算RNA组学:非编码RNA结构识别与功能预测

真核生物基因组中包含大量非编码RNA基因,计算RNA组学采用信息科学等多学科方法解析ncRNA的结构与功能.本文就ncRNA数据存储与管理、ncRNA基因识别与鉴定、ncRNA靶标识别与功能预测等问题,对目前计算RNA组学的主要研究方法和内容进行了评述.     

探知远古世界揭秘生命演化——2016年度中国古生物学十大进展发布

中国古生物学会3月22日在北京发布2016年度中国古生物学十大进展."志留纪古鱼揭秘脊椎动物颌演化之路"和"绘制冰河时代欧亚人群的遗传谱图"等11项科研成果入选(含并列),内容涉及早期生命、古生代鱼类、早期陆生植物等研究领域,反映了我国科技工作者在古生物学各个分支领域所取得的具有国际影响力的高水平创新研究成果,推动了对地质历史时期生命演化历程的认识.这是中国古生物学会成立88年来,首次组织全国性的科技创新成果评选,旨在推动学科创新发展,展示我国古生物学领域取得的重大发现和科研成果,推动科学研究、科学传播等工作.     

第四届全国核糖核酸（RNA）研讨会召开

由中国生物化学与分子生物学会核糖核酸（RNA）专业委员会（筹）和军事医学科学院基础医学研究所联合主办的第四届全国核糖核酸（RNA）研讨会于2005年6月4-7日在北京召开。研讨会邀请了国内外知名专家学做专题学术报告,并有来自全国各地科研大专院校和生物技术公司的专家和学生一百余人围绕核糖核酸（RNA）领域最新发展趋势和我国RNA领域科学的工作动态,就6个专题方面展开交流与探讨：1．RNA的调控功能;2．RNA的看家功能;3．RNAi与siRNA的应用研究;     

新世纪中国菌物新名称发表概况(2000-2020)

2000-2020年间,我国菌物学研究取得了丰硕的成果,在新物种发现、重要类群新分类系统、资源保护与开发利用等多方面取得了重要进展.本文通过对世界菌物名称信息库Index Fungorum、Fungal Names和MycoBank进行数据整理,从中国学者的研究产出和中国的菌物新物种发现的角度展开分析,揭示我国菌物分类...     

RNA甲基化修饰调控和规律

表观遗传学修饰包括DNA、RNA和蛋白质的化学修饰,基于非序列改变所致基因表达和功能水平变化。近年来,在DNA和蛋白质修饰基础上,可逆RNA甲基化修饰研究引领了第3次表观遗传学修饰研究的浪潮。RNA存在100余种化学修饰,甲基化是最主要的修饰形式。鉴定RNA甲基化修饰酶及研发其转录组水平高通量检测技术,是揭示RNA化学修饰调控基因表达和功能规律的基础。本文主要总结了近年来本课题组与合作团队及国内外同行在RNA甲基化表观转录组学研究中取得的主要前沿进展,包括发现了RNA去甲基酶、甲基转移酶和结合蛋白,揭示RNA甲基化修饰调控RNA加工代谢,及其调控正常生理和异常病理等重要生命进程。这些系列研究成果证明RNA甲基化修饰类似于DNA甲基化,具有可逆性,拓展了RNA甲基化表观转录组学研究新领域,完善了中心法则表观遗传学规律。     

中国中生代昆虫化石研究新进展

回顾了1990年以来中国中生代昆虫化石研究的新进展,简述了我国学者在古昆虫分类学、昆虫内部形态学、昆虫系统学、古生态学、昆虫生物地层学、昆虫区系的历史演变、生物古地理学、昆虫与植物的关系等8个方面取得的突出贡献,并给出了我国发现的世界最低层位昆虫科级类群表。     

民族植物学研究二十年回顾

对我国民族植物学研究在二十年问的发展进行了简要综述.民族植物学于1896年诞生于美国,1982年被引入中国,1987年我国第一个民族植物学研究室在中国科学院昆明植物研究所成立,经过二十年的发展,我国民族植物学已经形成了自身的研究理论体系、内容、方法和途径,将民族植物学从基础描述性研究推进到了应用研究,在植物资源可持续利用、牛物多样性保护和农村区域发展协调发展等领域开展研究,取得了若十进展.本文对昆明植物研究所民族植物学的发展历史,取得的研究进展与成果,学科建设和人才培养,民族植物学的理论创新与发展,以及推进民族植物学在我国的发展等进行了回顾和简述,并提出我国民族植物学未来发展三个方而的建议.     

微生物转录组学技术研究进展

随着分子生物技术的不断进步,转录组学技术已广泛应用于生物基因表达水平的研究。近年来,针对微生物转录组学的研究技术也在不断发展。在基因层面上,由片段RNA与微生物样本进行互补验证,发展到直接对全长RNA进行测序得到序列信息;在空间上,由传统群体转录组发展到空间、单细胞以及表观等层面的研究。随着转录组学技术在微生物研究领域中的应用,相应的缺陷也逐渐显现并不断被完善。本文主要是对微生物研究方面传统的和新型的转录组学技术进行了总结归纳,为微生物转录组学研究提供参考。     

中国植物花粉形态的研究进展

中国植物花粉形态研究经历了3个发展阶段;从1953年建立国内第一个孢粉学实验室到1960年我国第一部花粉形态学专著的出版为起步阶段;1961-1980年由于历史的原因,国内的研究发展较慢;80年代以来,中国植物花粉形态学研究进入了一个高速发展阶段。迄今已系统研究过花粉形态的在中国裸子植物中占63.64%。在双子叶植物中占36.36%,在单子叶植物中占33.33%。     

第六届全国酶学学术讨论会在北京延庆举行

由中国生物化学与分子生物学会酶学专业委员会、中国科学院生物物理研究所和清华大学生物科学与技术系主办的第六届全国酶学学术讨论会于 2 0 0 2年 5月 15 - 17日在北京延庆举行 .本次会议是我国酶学领域在新世纪首次召开的全国性学术研讨会 ,该领域的著名专家、学者与会议代表 130余人欢聚一堂 ,相互交流酶学的最新研究成果及研究方法与技术 ,共同探讨新世纪我国酶学研究领域的发展方向与应用前景 .中国生物化学与分子生物学会理事长、上届酶学专业组长许根俊院士主持了 15日上午的开幕式并作了开场报告 ,中国科学院生物物理研究所王志珍…