厌氧微生物研究的新进展（续）

厌氧微生物研究的新进展（续）凌代文（中国科学院微生物研究所,北京１０００８０）ｒＲＮＡ／ＤＮＡ和１６ＳｒＲＮＡ序列的测定已表明在系统发育上肠球菌和链球菌属、乳球菌属为同等相连群。当今使用反转录酶法分析测定１６ＳｒＲＮＡ全序列指示出肠球菌在系统发育上更...     

几种腹蛇12S rRNA和Cyt b基因片段序列的初步研究

首次对我国几种腹属蛇类的１２Ｓ ｒＲＮＡ和Ｃｙｔ ｂ基因的部分序列进行了测定。１２Ｓ ｒＲＮＡ基因片段序列结果揭示：中介蝮有较大的种下分化。本文为蝮属蛇类的分子系统学研究提供了一些资料。     

亚洲淡水和陆生龟鳖类12S rRNA基因片段的序列分析和系统发生研究

对亚洲产淡水和陆生龟鳖４科２３个种进行了ＤＮＡ序列水平的分子系统学研究，用ＰＣＲ技术扩增约４００ｂｐ的线粒体１２ＳｒＲＮＡ基因片段进行了序列分析，合并从ＧｅｎＢａｎｋ中检索到的其它龟鳖类的序列数据，在基于二级结构的对位排列基因上用邻结法地系统发生研究。结果表明，潮龟科与陆龟简拼要缘关系比龟科与陆龟科的近；支持将平胸龟属归为鳄龟上属；潮产是并系起源，从１２ＳｒＲＮＡ基因序列得到的系统发生关系不支持根     

L.sp.HXQ001菌株16SrRNA基因序列及聚类分析

目的 在表型鉴定的基础上使用遗传学方法鉴定一株明串珠菌属的细菌。方法 扩增Ｌ．ｓｐ．ＨＸＱ００１菌株１６ＳｒＲＮＡ基因并测序,将结果与同属,非同属的乳酸作同源性比较。结果 ｌｏｓｐＨＸＱＯＯ１菌株与同属的乳酸菌柠蒙色明串珠菌的同源性为９８％～９９％,与肠膜明串珠菌的同源性为９５％以上,与非同属的乳酸菌酒类酒球菌和类肠膜魏斯菌的同源性均小于７０％。结论 Ｌ．ｓｐ．ＨＸＱ００１菌为柠蒙色明串珠菌。     

用电镜原位杂交技术对玉米中期染色体中RNA的研究

用生物素标记的玉米１８ＳｒＲＮＡ、小麦５ＳｒＲＮＡ 及ｔＲＮＡ 的ｃＤＮＡ 作为探针,在Ｋ４Ｍ 树脂包埋的玉米（Ｚｅａ ｍ ａｙｓ）根尖超薄切片上进行原位杂交。杂交后,用与１０ ｎｍ 金颗粒相连的亲和素对杂交子在电镜下进行检测。结果发现,在玉米中期染色体中存在有１８ＳｒＲＮＡ、５ＳｒＲＮＡ 和ｔＲＮＡ 分子,这些ＲＮＡ分子在染色体中的分布是随机的,即这些ＲＮＡ 分子在染色体的内部和周边均有分布。５ＳｒＲＮＡ 和ｔＲ－ＮＡ 在染色体中和细胞质中的含量基本相等,而１８ＳｒＲＮＡ 在染色体中的含量则明显高于细胞质。这一结果表明染色体中的ＲＮＡ 一部分来自于核仁,而另一部分则来自于核质     

由部分核糖体RNA序列研究的绿僵菌属种系统发育关系

本研究应用特异寡聚核酸引物和双脱氧核苷酸终止法测定绿僵菌Ｍｅｔａｒｈｉｚｉｕｍ不同种的部分ｒＲＮＡ序列。这些序列分别选自小亚基（１８Ｓ）和大亚基（２５Ｓ）ｒＲＮＡ上的不同区域。校排的不同序列用于计算核苷酸的差异。绿僵菌的系统发育关系采用最大可能性方法分析。所有的分类单元聚类成二个分支。在产生圆柱状瓶形小梗的种中,Ｍ．ａｎｉｓｏｐｌｉａｅ ｖａｒ．ａｎｉｓｏｐｌｉａｅ．Ｍ．ａｎｉｓｏｐｌｉａｅ ｖａ     

大肠杆菌中的小分子RNA

迄今为止,已知由大肠杆菌基因组编码的小分子ＲＮＡ（ｓＲＮＡ）除了５ＳｒＲＮＡ和ｔＲ－ＮＡ外,共有１０种,其中大多数是调控ＲＮＡ,可调控细菌的某些代谢过程。１．ｓＲＮＡ的发现用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析３２Ｐ标记的大肠杆菌总ＲＮＡ,发现除５ＳｒＲＮＡ和ｔＲ...     

核糖体RNA拓扑学与RNAN－糖苷酶研究进展（上）

核糖体ＲＮＡ拓扑学的研究对阐明核糖体ＲＮＡ（ｒＲＮＡ）在蛋白质生物合成中的作用具有重要的意义。ＲＮＡＮ－糖苷０酶是一类核糖体失活蛋白．它只水解ｒＲＮＡ特定位置上一个腺苷酸的糖苷键,释放一个腺嘌呤碱基,使核糖体失活。ＲｉｃｉｎＡ链是研究得最早和最详细的ＲＮＡＮ－糖苷酶,迄今已发现有二十五种核糖体失活蛋白具有ＲＮＡＮ－糖苷酶活性。ＲＮＡＮ－糖苷酶作用于２８ＳｒＲＮＡ的α－ｓａｒｃｉｎ结构域,改变核糖体的构象而使其失活。     

荧光原位杂交法检测双歧杆菌

检验荧光原位杂交法在双歧杆菌属鉴定方面的调途。方法：采用对数生长期的８株双歧杆菌和１０析其他厌氧、需氧杆菌在相同的条件下分别与双歧杆菌属特异性１６ＳｒＲＮＡ寡核苷酸基因探针和细菌界通用１６ＳｒＲＮＡ寡核苷酸基因探针在载玻片上进行原位杂交,在荧光显微镜下观察杂交结果,拍摄同一视野的荧光显微镜照片和相关显微镜照片,计算杂交率。结果所用的双歧杆菌菌株均与两种基因探针杂交,在荧光显微镜下发校菌与黑暗背景对     

16S rRNA序列分析法在医学微生物鉴定中的应用

１６Ｓ ｒＲＮＡ序列分析作为微生物系统分类的主要依据已得到了广泛认同,随着微生物核糖体数据库的日益完善,该技术成为细菌分类和鉴定的一个有力工具。本文概述了 １６５ ｒＲＮＡ序列分析法的技术步骤以及该技术在医学微生物研究中的应用,总结了目前文献报导的各种致病微生物种属特异性 １６５ ｒＲＮＡ引物和探针序列,同时分析了该技术在应用中存在的一些问题。     

新菌——吉林链梭菌的分类学研究

从７例阴道炎患者阴道分泌物分离出７株细菌,均具有相同的生物学特性,Ｇ－梭状菌,单、成对或链状。无荚膜,无芽抱,无鞭毛。兼性厌氧菌,在大气中培养不生长,在５％～１０％ＣＯ２中或烛缸培养１８～２４ｈ才能形成菌落,ＭａｃＣｏｎｋｅｙ培养基不生长,最适生长温度３５℃－３７℃。氧化酶阴性,接触酶阴性,不还原硝酸盐,发酵糖类（指示剂用溴甲酚紫）,克氏双糖铁高层和斜面均发生产酸反应,七叶苷水解试验阳性,马尿酸盐水解试验阴性。经ＢｉｏｌｏｇＭｉｃｒｏｓｔａｔｉｏｎＳｙｓｔｅｍ自动化细菌鉴定系统检测无确定结果,ＤＮＡＧ＋Ｃ含量为４２．３ｍｏｌ％、１６ｓｒＲＮＡ序列测定结果经计算机检索国际基因菌库ＥＭＢＬ和ＧｅｎＢａｎｋ所有序列进行比较,表明该白与已知科、属亲缘关系较远,结合其表型特征,建议建立新属,命名为吉林链梭菌（Ｓｔｒｅｐｔｏｆｕｓｉａｇｅｎ．ｎｏｖ．Ｊｉｌｉｎａｓｐ．ｎｏｖ．）该菌已收藏在中国微生物菌种保藏中心ＣＧＭＣＣＮＯ．０２１５Ｔ（Ｔ＝ｔｙｐｅｓｔｒａｉｎ）．该菌１６ＳｒＲＮＡ片断已被国际基因库收录,接收号为Ｕ３４３６５。     

豌豆5SrRNA的cDNA克隆、全序列及结构特征分析

以赤霉素（ＧＡ）处理后的Ｇ２豌豆为材料,构建了一个２．０×１０６的ｃＤＮＡ文库,用随机筛选法从该ｃＤＮＡ文库中得到一个完整的ｃＤＮＡ．其中１１１５ｂｐ全序列分析表明,它编码了豌豆５Ｓ核糖体ＲＮＡ（５ＳｒｉｂｏｓｏｍａｌＲＮＡ,５ＳｒＲＮＡ）,基因内部存在着与核糖体蛋白Ｌ５及５ＳｒＲＮＡ结合蛋白（５ＳｒＲＮＡＢｉｎｄｉｎｇＰｒｏｔｅｉｎ）同源的区段,这些同源区段是蛋白与ＲＮＡ结合的位点．基因内部还存在着大量的重复序列．     

中国钩端螺旋体rRNA基因多态性分析

以ＤｉｇｄＵＴＰ标记的１６ＳｒＲＮＡ及２３ＳｒＲＮＡ基因为探针,分析了八个血清群５４个血清型６４株国内外致病性钩端螺旋体参考株和２７株野生株染色体经限制性内切酶ＥｃｏＲⅠ消化后的ｒＲＮＡ基因限制性图谱。结果发现,９１株菌中共有５６个核糖核酸型（Ｒｉｂｏｔｙｐｅ,简称ＲＴ）,除部分血清群中少数不同的血清型有相同的ＲＴ型外,大部分血清型都有独特的ＲＴ型,同一血清群往往拥有共同的核心片段;除黄疸出血群的黄疸出血型外,同一血清型的国内和国际参考株的ＲＴ型不相同;大多数野生株的ＲＴ和相应血清型国内参考株相同,差异也只表现为谱形上个别带型的缺少和增加,所研究的波摩那型野生株的ＲＴ型和国际参考株相同而和国内参考株不同     

16S rRNA序列分析法在大气微生物检测中的应用

随首微生物核糖体数据库的日益完善,１６Ｓ ｒＲＮＡ序列分析技术已应用于海洋、湖泊和土壤等环境微生物多样性的分析,但尚未见其在大气微生物菌群分析中的应用报道。本研究选择５株大气中采集分离的菌株,通过细胞１６Ｓ ｒＲＮＡ通过引物ＰＣＲ扩增其对应序列,直接对ＰＣＲ产物进行测序,分析鉴定其对应细胞的种属,并将该结果同细胞表型鉴定、全自动微生物分析仪以及相色谱分析结果加以比较。结果表明１６Ｓ ｒＲＮＡ序列分     

现代分子方法在细菌分类学方面的应用

现代分子方法在细菌分类学方面的应用李颐,陈锡时（沈阳农业大学土化系,１１０１６１）分子方法应用于细菌分类始于六十年代初。这些方法的应用对改进和扩大细菌分类学领域作出了积极的贡献,并越来越受到微生物学界的重视。其中ＤＮＡ：ｒＲＮＡ杂交技术在属及超属的水...     

Frankia菌在非豆科放线结瘤植物根际内的存活与分布

提取Ｆｒａｎｋｉａ菌１６ＳｒＲＮＡ,制备具专一性的寡核苷酸探针,通过同源杂交,在人工接种的木麻黄根际内检测出痕量Ｆｒａｎｋｉｓ菌结果表明,Ｆｒａｎｋｉａ可在环境因子的作用下被动迁移不论接种点的位置如何,经６个月的时间稳定后,其分布状态基本相同,主要集中于土层下８～３０ｃｍ处     

立克次体分类研究的进展

由于分子生物学在立克次体分类研究中的应用,立克次体的分类发生了很大的变化,原属立克次体科,立克次体族的罗沙利马体属和柯克斯体属,均因１６ＳｒＲＮＡ序列分析表明与其它立克次体亲椽关系较远,而建议它们不属于立克次体科,前者近年来已改称巴通体属,立克次体属中的恙虫病立克次体亦因其表型和基因型特点而有另立一新属的建议,埃立克体属中亦增加了对人致病的新成员。     

乙醛磺酸对小鼠胚胎细胞遗传和胚胎发育影响的研究

本文报道乙醛磺酸（ＳＡＤ）不仅会降低小鼠胚胎细胞的ｒＲＮＡ基因转录活性,而且还明显提高了胚胎细胞姐妹染色单体互换（ＳＣＥ）频率,导致胚胎发育停滞和胎儿死亡,最终使幼鼠出生率明显下降。当ＳＡＤ浓度为１０－５ｍｏｌ／Ｌ时,小鼠胚胎细胞ｒＲＮＡ基因转录活性降低为正常值的１５％,并引起ＳＣＥ频率成倍增加,幼鼠出生率仅为正常值的５０％;当ＳＡＤ浓度增至１０－３ｍｏｌ／Ｌ时,此时ｒＲＮＡ基因转录活性完全被抑制,而且ＳＣＥ频率增加为正常值的４．８倍,幼鼠出生率从正常值１００％降为４％。ＳＡＤ对小鼠胚胎细胞这种细胞遗传学效应和对胚胎发育影响的程度与该药浓度成正相关。此外,我们还对ｒＲＮＡ基因转录活性和ＳＣＥ的改变与哺乳类胚胎发育之间的关系进行了初步的讨论。     

青藏高原近缘野生大麦5S rRNA基因染色体原位杂交定位

采用原位杂交技术,以５Ｓ ｒＲＮＡ基因为探针,对产于青藏高原的４份近缘野生大麦和栽培大麦,即：二棱野生大麦Ｈｏｒｄｅｕｍ ｖｕｌｇａｒｅ Ｌ．ｓｓｐ．ｓｐｏｎｔａｎｅｕｍ（Ｋｏｃｈ）Ｈｓｕｅ,六棱野生大麦Ｈ．ｖｕｌｇａｒｅ Ｌ．ｓｓｐ．ａｇｒｉｏｃｒｉｔｈｏｎ（Ａｂｅｒｇ） Ｈｓｕｅ,六棱瓶形野生大麦Ｈ．ｖｕｌｇａｒｅ Ｌ．ｓｓｐ．ａｇｒｉｏｃｒｉｔｈｏｎ ｖａｒ．ｌａｇｕｎｃｕｌｉｆｏｒｍ（Ｂａｋｈｔ） Ｈｓｕｅ,栽培大麦Ｈ．ｖｕｌｇａｒｅ．Ｌ．进行了研究,将杂交结果进行观察与统计,并建立起５Ｓ ｒＲＮＡ基因定位的模式图。结果表明５Ｓ ｒＲＮＡ基因在染色体上的位点呈现动态变化,由二棱野生大麦、六棱瓶形野生大麦到六棱野生大麦、栽培大麦、位点数目有递增的趋势,而且位置也发生了某些改变。探讨了５Ｓ ｒＲＮＡ基因进化     

ITS序列同源性在苏云金芽孢杆菌分型中的应用研究

ＰＣＲ扩增了苏云金芽孢杆菌９个亚种的１６Ｓ－２３Ｓ ｒＲＮＡ基因转录间隔（ＩＴＳ）片段,它们的长度均为１４４碱基;序列同源性分析结果批出这９个亚种及其它亚种的ＩＴＳ序列高度相似,说明１６Ｓ－２３Ｓ ｒＲＮＡ基因的ＩＴＳ序列不适于苏云金孢杆菌亚种的分型。