人类进入个体化医疗时代——全基因组测序支持治愈美国双胞胎多巴反应性肌张力障碍

2011年6月15日,美国贝勒人类基因组测序中心和有关机构联合发布一份报告称,贝勒大学医学院的研究人员及来自圣地亚哥和密歇根大学安娜堡分校的专家通过对一对双胞胎及其家人进行全基因组测序和对比分析,找到了引起这对患有多巴反应性肌张力障碍(Dopa-Responsive Dystonia)疾病的突变基因,使医生能够对病症进行针对性治疗,并取     

利用siRNA高通量测序技术筛查蚊子体内携带的RNA病毒

昆虫可以利用小干扰RNA(siRNA)机制干扰体内RNA病毒的增殖,从而获得对该病毒的免疫能力。通过第二代测序技术对蚊子的小RNA进行高通量测序,再通过生物信息学方法寻找其中的RNA病毒序列,发现在我国云南地区的白纹伊蚊和致倦库蚊体内存在Marayo,Omsk hemorrhagic fever和Ilheus等RNA病毒的基因片段。至此建立了发现媒介昆虫体内携带病毒的一种新方法,可用于媒介昆虫携带RNA病毒的本底调查。     

应用全外显子组测序筛查一高原肺水肿家系易感基因

高原肺水肿(high-altitude pulmonary edema, HAPE)是一种高原特发性疾病,其发病与遗传因素有一定关联。本研究对一个HAPE相关的家系展开遗传学调查,然后利用外显子组测序筛查了包括先证者在内的6名HAPE病史成员以及先证者的母亲共7个成员的遗传变异,结果发现18个HAPE相关的潜在遗传变异(9个SNVs和9个Indels)。利用SIFT,PolyPhen-2和PROVEAN等3种软件对这些遗传变异进行蛋白功能危害性分析,结果发现定位于CFHR4基因的SNV(p.L85F)以及定位于OXER1基因的SNV(p.R176C)具有高危害性,且OXER1的功能与HAPE低氧诱导通路存在高度关联,它们可作为该家系中HAPE相关的候选病理性变异。此外,还有部分SNVs(NMB p.S150P、APOB p.I4194T和EIF4ENIF1 p.Q763P)以及Indels(KCNJ12 p.EE333-334E、ANKRD31 p.LMN251-253LN和OR2A14 p.HFFC175-178HFC),其遗传变异同样具有一定危害,可作为潜在的HAPE相关遗传变异。本研究首次通过外显子组测序直接筛选与一中国HAPE家系相关的遗传变异,为后续揭示HAPE发病机制提供了新线索。     

16S rDNA高通量测序分析腹膜透析胃肠功能障碍患者肠道菌群特征

采用16S rDNA高通量测序技术分析腹膜透析（PD）胃肠功能障碍患者的肠道菌群变化特征,探讨肠道菌群在腹膜透析胃肠功能障碍中的具体作用。

收集25例PD胃肠功能正常者（PDGF组）、25例PD胃肠功能障碍者（PDGD组）和13例健康者（Normal组）的粪便样本,提取肠道菌群基因组,应用16S rDNA高通量测序技术对各组测序结果进行菌群多样性、物种组成差异和菌群功能分析。

3组的Observed species指数（H = 6.905,P = 0.032）和Shannon指数（H = 6.993,P = 0.030）差异具有统计学意义。与Normal组相比,PDGD组Shannon指数显著降低（P = 0.027）,PDGF组Observed species指数显著升高（P = 0.044）;与PDGF组相比,PDGD组Observed species和Shannon指数显著降低（P＜0.05）。PCoA结果显示3组各自聚集,区分较明显。UPGMA聚类分析结果显示3组大部分样本均在本组中聚类后再与其他组进一步合并。LEfSe分析结果显示,Normal组优势菌群包括颤螺菌目（Oscillospirales）、瘤胃菌科（Ruminococcaceae）、栖粪杆菌属（Faecalibacterium）、拟杆菌科（Bacteroidaceae）等;PDGF组优势菌群包括毛螺菌目（Lachnospirales）、毛螺菌科（Lachnospiraceae）、布劳特菌属（Blautia）;PDGD组优势菌群包括芽孢杆菌纲（Bacilli）、乳杆菌目（Lactobacillales）、链球菌属（Streptococcus）、链球菌科（Streptococcaceae）等。KEGG L1水平的功能组成集中在代谢、遗传信息处理和环境信息处理;KEGG L2水平的功能主要集中在碳水化合物、氨基酸代谢、遗传信息的复制和修复及转运、膜运输途径;与Normal组和PDGF组相比,PDGD组在碳水化合物、氨基酸代谢途径富集减少,感染性疾病、聚糖生物合成和代谢途径富集增加。

PD胃肠功能障碍患者存在肠道菌群失调,调整肠道微生态是防治PD患者出现胃肠功能障碍的潜在干预靶标。

     

A型肉毒毒素治疗偏侧面肌痉挛和头颈部肌张力障碍的疗效观察

为评估Ａ型肉毒毒素治疗偏侧面肌痉挛和头颈部肌张力障碍的疗效,本文对４２例偏侧面肌痉挛及３４例头颈部肌张力障碍（后者包括１８例眼睑痉挛,１２例Ｍｅｉｇｅ氏病、４例痉挛性斜颈）病人进行Ａ型肉毒毒素肌肉多点注射治疗,并治疗前后的病情分级对比。结果表明,Ａ型肉毒毒素治疗有效率为１００％,疗效持续８～２６周,可重复注射,并再次取得疗效。部分病人局部出现轻度肌无力,数周后均可恢复,无全身毒副作用。结论认为Ａ型肉毒毒素能治疗偏侧面肌痉挛和头颈部局限性肌张力障碍,不失为一种有效安全简便易行的治疗手段。