环状RNA翻译蛋白在癌症中的研究进展北大核心CSCD

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种单链环状闭合RNA分子,由线性RNA通过反向剪接形成,具有稳定、高度保守、组织特异性等特点。circRNA能够通过形成竞争性内源性RNA、结合蛋白等多种方式参与机体的生理、病理过程。最近发现,circRNA分子可以通过翻译形成多肽或蛋白参与癌症的发生和发展。circRNA是人类癌症中有前途的诊断和预后标志物,也是癌症治疗的潜在药物靶点。本文重点介绍了circRNAs编码的多肽和蛋白质在多种癌症中的相关研究进展。这些多肽和蛋白质分别依赖内部核糖体进入位点和m6A两种不同的机制进行翻译。我们还总结了circRNA编码的多肽和蛋白质在各种癌症的诊断、治疗、预后和机制研究中的潜在用途。     

m6A甲基化修饰识别蛋白YTHDF2在肝癌组织中的表达及临床意义

摘要 目的：探讨m6A甲基化修饰结合蛋白YTHDF2(YTH domain-containing family protein 2)在肝癌（Hepatocellular carcinoma, HCC）组织中的表达及临床意义。方法：1）采用Western blot和实时荧光定量PCR（Quantitative Real Time PCR, qRT-PCR）检测20对肝癌和癌旁组织中YTHDF2在蛋白和mRNA水平的表达情况。2）通过免疫组织化学（Immunochemistry, IHC）检测40对肝癌和癌旁组织芯片YTHDF2的表达情况,并以H-score评分法进行半定量分析。3）通过基因表达谱数据动态分析数据库GEPIA（http://gepia.cancer-pku.cn/）分析YTHDF2在肝癌组织中的表达及对患者生存预后的影响;通过肿瘤免疫评估资源数据库TIMER(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)分析YTHDF2与肝癌免疫微环境的相关性。结果：相比于癌旁肝组织,YTHDF2在肝癌组织中蛋白和mRNA水平均显著高表达（P＜0.05）;GEPIA数据库分析验证：YTHDF2肝癌组织表达水平高于正常肝组织,且YTHDF2在肝癌不同分期中表达水平均高于正常肝组织（P=0.0206）,Stage III期最为明显;YTHDF2高表达患者的总体生存率（Overall Survival,OS）和无复发生存率（Disease Free Survival, DFS）均较差（P=0.00027和P=0.013）;TIMER数据库分析表明：YTHDF2在肝癌免疫微环境中与各类免疫细胞呈正相关（P＜0.05）,但肝癌患者的累积存活率不受免疫细胞的影响（P＞0.05）,YTHDF2高表达对患者的生存预后具有不良影响（P=0.007）。结论：YTHDF2在肝癌组织中显著高表达,且YTHDF2高表达水平对肝癌患者生存预后具有不良影响,YTHDF2可作为肝癌临床预后判断的分子标志物,为今后肝癌治疗靶点提供新的策略。     

IGF2BP1对白血病干细胞特性维持的作用

[目的]探究胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1(IGF2BP1)调控HOXB4、MYB、ALDH1A1表达在白血病干细胞特性维持中的作用。[方法] K562细胞分为3组:对照组、IGF2BP1组、siIGF2BP1组。通过转染过表达或沉默IGF2BP1。分别对各组细胞的增殖、凋亡、体外干细胞成球能力进行检测。检测HOXB4、MYB、ALDH1A1 mRNA和蛋白水平。[结果]三组细胞的上述指标比较差异显著(P<0.05)。IGF2BP1组细胞的IGF2BP1增殖(0.75±0.07,1.34±0.12)、成球数量(98.23±4.16)个和大小(205.97±9.54)μm、HOXB4、MYB、ALDH1A1 mRNA和蛋白水平显著高于对照组,凋亡率(3.62%±0.35%)显著低于对照组(P<0.05)。siIGF2BP1组细胞的IGF2BP1、增殖(0.46±0.04,0.81±0.08)、成球数量(25.76±1.35)个和大小(85.44±2.37)μm、HOXB4、MYB、ALDH1A1 mRNA和蛋白水平显著低于对照组,凋亡率(18.34±0.27)%显著高于对照组(P<0.05)。[结论]过表达IGF2BP1上调了HOXB4、MYB、ALDH1A1 mRNA和蛋白表达,促进白血病干细胞特性的维持。     

合浦珠母贝IGF2BP1基因的克隆与表达分析

胰岛素样生长因子2信使核糖核酸结合蛋白(insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein,IGF2BP)在脊椎动物体内功能很多,但在贝类中研究很少。为研究IGF2BP1是否参与了贝类的生物矿化过程,本研究通过RACE技术克隆获得合浦珠母贝(Pinctada fucata)IGF2BP1基因cDNA序列,命名为PfIGF2BP1。该基因全长2 980 bp,其中开放阅读框长1 737 bp,预测编码579个氨基酸,有4个KH结构域和2个RRM结构域。多重序列分析发现各物种的IGF2BP1氨基酸序列非常保守。实时定量PCR结果显示PfIGF2BP1在肠等8个组织和壳顶期等5个胚胎发育时期中均有表达,表达量最高的组织为珍珠囊(p0.05),说明Pf IGF2BP1可能参与了珍珠形成过程。Pf IGF2BP1在眼点期表达量最高,其次为壳顶期,说明PfIGF2BP1可能参与次生壳的形成过程。原位杂交表明PfIGF2BP1在外套膜边缘的外褶中表达,推测其可能参与棱柱层的形成。本研究为以后探讨IGF2BP1在贝类生物矿化过程中的作用奠定了基础。     

m6A修饰在肝纤维化中的研究进展

N⁶-甲基腺苷(N⁶-methyladenosine,m⁶A)作为真核生物中最丰富的RNA内部修饰,影响RNA的加工,调节mRNA翻译效率,并与多种表观遗传学机制发生交互作用,进而在多种生理过程中调控基因的表达。肝纤维化是细胞外基质(extracellular matrix,ECM)蛋白(主要是Ⅰ型和Ⅲ型胶原蛋白)积累形成的纤维瘢痕取代正常组织的过程,是肝脏对慢性损伤的病理性修复反应。m⁶A修饰直接参与肝细胞损伤、炎症细胞募集和肝星状细胞激活等肝纤维化过程,并通过降低HBV蛋白的表达、与微RNA (microRNA)和肠道菌群相互作用等途径间接影响肝纤维化的发生发展。由于肝脏的再生能力较强,当慢性炎症或肝损伤的主要病因去除后,早期已经发生纤维化的肝脏可逆转为正常肝脏。m⁶A修饰在肝纤维化中的双重作用可为平衡机体纤维化过程提供思路。该文综述了m⁶A修饰在肝纤维化中的功能和作用机制,以期为相关疾病的诊疗提供新的思路。     

m6A RNA甲基化修饰在心血管疾病中的作用

N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）是发生在腺嘌呤N6位的甲基化修饰,它是真核生物信使RNA(messenger RNA, mRNA)中最丰富的转录后修饰。m6A修饰是由甲基化酶、去甲基化酶以及结合蛋白质共同调控的动态可逆的过程,并且影响mRNA的生命周期各个阶段,包括稳定性、剪接、核输出、翻译和降解。近年来,有研究报道m6A连续动态调节在心血管疾病中发挥着重要的作用,包括动脉粥样硬化、心肌缺血再灌注损伤、心肌肥厚、心力衰竭、高血压以及腹主动脉瘤等。本文主要对m6A RNA甲基化修饰的作用机制及其在心血管疾病中的最新研究进展进行概述,此外,同时介绍了m6A 单核苷酸多态性（m6A-associated single-nucleotide polymorphisms, m6A-SNPs）在心血管疾病中的应用,以期为心血管疾病的预防及治疗提供新的思路和途径。     

胰岛素生长因子2 mRNA结合蛋白3与肿瘤的相关性研究进展

RNA结合蛋白是生物体生命周期中重要的调节物质。作为RNA结合蛋白中的一种,胰岛素生长因子2 mRNA结合蛋白3（insulin growth factor 2 mRNA binding protein 3,IGF2BP3）介导癌症细胞的发生、发展及疾病预后和转归,因此对于IGF2BP3致癌作用的发生机制、通路传导作用机制以及基于IGF2BP3分子治疗靶点的探究具有重要意义。通过阐述IGF2BPs家族具有的生物学功能,IGF2BP3在肿瘤和疾病的相关性,以及IGF2BP3在现代临床治疗的应用前景,以期为IGF2BP3基因的进一步研究提供理论依据。     

N6-甲基腺苷修饰(m6A)在乳腺癌中的研究进展

乳腺癌是女性最常见的癌症之一,也是导致女性癌症死亡的最主要原因.尽管早期乳腺癌的治疗已经取得了极大进展,但晚期伴转移乳腺癌治疗效果较差,具有高复发率和高死亡率.因此,鉴定新的用于诊断和预测乳腺癌转移的分子标记、开发新的治疗策略成为迫切需要.近年来,mRNA的异常N⁶-甲基腺苷修饰(N⁶-methyladenosine,m⁶A)对癌基因功能和表达水平的表观遗传学调控逐渐成为恶性乳腺癌研究的焦点.本文分析和总结了m⁶A甲基化修饰及其调节蛋白参与调控乳腺癌发生发展的最新研究进展,以期为乳腺癌中m⁶A甲基化修饰研究提供新的思路和参考,进一步为乳腺癌的诊断、治疗、预后及监测提供新的有效策略.     

m6A甲基转移酶METTL3在胚胎发育中的作用研究进展

胚胎发育调控机制是一个非常重要的生物学基础问题,而其中的表观遗传学机制成为最近的研究热点。研究发现,甲基转移酶样3 (methyltransferase-like 3,METTL3)催化产生的m⁶A修饰在卵母细胞成熟、母源-合子转化、胚胎干细胞命运调控以及血管生成等胚胎发育过程中发挥重要作用。同时,靶向METTL3的化合物也不断被发现与合成,有望应用于m⁶A相关疾病的靶向治疗。本文就METTL3的结构、催化机制、调控机制、在RNA代谢和胚胎发育中的作用以及METTL3靶向化合物进行介绍。     

去甲基化酶FTO在心血管疾病中的研究进展

脂肪和肥胖相关蛋白(fat mass and obesity-associated protein,FTO)是N6-甲基腺苷(m6A)调控系统中关键的去甲基化酶.既往研究发现,FTO可参与肥胖、糖尿病以及昼夜节律等增加心血管疾病的患病和发病风险.FTO在心肌梗死、心肌肥厚以及心力衰竭的发生发展中均具有重要调控作用,可能...     

RNA m6A修饰在肿瘤发展及免疫治疗中的研究进展

N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m⁶A)是指在腺苷的N6位置发生的甲基化修饰,是真核m RNA中最常见的表观遗传修饰方式。m⁶A甲基化的紊乱会导致基因转录和翻译过程异常,从而促进癌症的发生和发展。最近的研究表明,m⁶A甲基化不仅可以影响肿瘤的细胞增殖和抑制信号网络,还能调节肿瘤免疫原性。该研究聚焦于探讨m⁶A调节因子在调控肿瘤关键信号通路中的相关机制,并阐述了m⁶A表观遗传修饰调节免疫检查点的表达方式。这将为理解m⁶A表观遗传修饰在调节肿瘤免疫逃逸中的作用和机制提供一个新的思路。此外,该文还强调了基于m⁶A修饰的靶向联合免疫治疗策略的前景和发展方向,这有望提高免疫检查点抑制剂的治疗效果。     

N6-甲基化腺嘌呤RNA甲基化修饰在中枢神经系统中的作用研究进展

mRNA存在多种转录后修饰,这些修饰调控mRNA的稳定和剪接、翻译、转运等多个过程,进而影响细胞发育、机体免疫、学习认知等重要生理功能。其中m⁶A修饰是转录后修饰中最丰富的一种,广泛存在于mRNA中,调控mRNA的代谢活动,影响基因表达。m⁶A修饰的稳态对神经系统的发育和功能维持至关重要。近年研究发现,在神经退行性疾病、精神疾病和脑肿瘤中均存在m⁶A修饰的身影。因此本文对近几年m⁶A甲基化修饰在中枢神经系统发育、功能及相关疾病中的作用进行总结,为神经系统疾病提供潜在的临床治疗靶点。     

H19／IGF2基因印记调控机制研究进展

H19／IGF2基因是目前发现的为数不多的印记基因之一,两基因定位相近,表达调控相关,对个体的生长、发育及行为发展有重要作用,H19／IGF2印记异常与许多肿瘤的发生有关。H19／IGF2基因印记调控机制非常复杂,近年的研究发现与其共同竞争一套增强子、等位基因的差异性甲基化、染色质构型以及转录周期有关,但尚未形成公认的统一调节机制。     

IGF—I及其受体,IGF结合蛋白—2和LH受体mRNA在卵泡中的表达

利用原位杂交和原位ＤＮＡ－３’末端标记的方法研究了胰岛素样生长因子－Ｉ（ＩＧＦ－Ｉ）,ＩＧＦ－Ｉ受体,ＩＧＦ结合蛋白－２,和促性腺激素受体的信使核糖核酸（ｍＲＮＡ）在不同生长与闭锁阶段的大鼠卵巢卵泡中表达的变化,结果表明：ＩＧＦ－Ｉ主要在正常生长的初级卵泡,窦前卵泡和小窦状卵泡中表达。在各生长与成熟阶段的卵泡中都检测到ＩＧＦ－Ｉ受体ｍＲＮＡ,闭锁卵泡的ＩＧＦ－Ｉ受体表达降低,窦前与窦状的生长和闭锁     

酒精性肝病的表观遗传学调控

酒精性肝病(alcohol liver disease,ALD)是由长期大量饮酒导致的一系列不同程度的肝脏疾病,其症状通常由早期的酒精性脂肪肝进展为酒精性肝炎、肝硬化和肝纤维化,严重时会导致肝功能衰竭。ALD是我国最常见的肝脏疾病之一,严重危害人民健康,目前临床尚无有效的治疗药物。ALD的发生涉及到长期的、多种细胞之间的复杂相互作用,因此目前对于其具体的分子机制尚不十分清楚。近些年随着表观遗传学研究的进展,人们渐渐了解到表观遗传调控这一沟通外界环境和基因转录调控的重要桥梁在ALD进展过程中的重要作用。本文系统性总结了包括DNA甲基化、组蛋白修饰,microRNA和mRNA m⁶A修饰等表观遗传调控在酒精性肝病中的研究进展,并讨论了其作为临床治疗靶点的可能性和意义。     

N6-腺苷酸甲基化修饰在脂质代谢紊乱疾病中调控作用研究进展

脂质代谢是一个复杂的生理过程,与营养调节、激素平衡和内分泌作用密切相关,它涉及多种因子和信号转导通路的互作。脂质代谢紊乱是诱发多种疾病的主要机制之一,如肥胖症、糖尿病、非酒精性脂肪肝病、肝炎、肝细胞癌及其并发症等。目前越来越多的研究发现RNA上发生的N⁶-腺苷酸甲基化(N⁶-adenylate methylation, m⁶A)“动态修饰”代表了一种全新的“转录后”调控方式,mRNA、tRNA、ncRNA等均可发生m⁶A修饰,m⁶A修饰异常调控基因表达变化和可变剪切事件发生。据最新文献报道,m⁶ARNA修饰参与了脂质代谢紊乱的表观遗传学调控。本文基于脂质代谢紊乱诱发的主要疾病,综述m⁶A修饰在其发生和发展中的调控作用。这些发现从表观遗传学的角度为进一步深入研究脂质代谢紊乱发病的潜在分子机制提供了依据,为相关疾病的卫生预防、分子诊断和治疗提供参考。