衣原体噬菌体衣壳蛋白3的结构、免疫原性及临床价值研究

分析衣原体微病毒Vp3蛋白在分子重组、分子进化及病毒野生株筛查的作用并挖掘生物信息,揭示其临床研究价值。以ProteinBlast的Multriple alignment程序比对各株衣原体微病毒衣壳蛋白Vp3序列;以Distance tree(ProteinBlast)程序完成种系发生树。以比对获得的高保守区的氨基酸序列为目标,应用Karplus-schulz法进行柔性区域分析;通过Gamier-robson法和Chou-fasman法分析该序列的二级结构;使用Emini法完成表位的表面可及性分析,并用Kyte-Doolittle法和Hopp-woods法完成蛋白亲水性研究;应用Jameson-Wolf法完成表位的抗原指数分析。6株衣原体微病毒Vp3蛋白序列高度保守,差异主要在Chp1与其他5株微病毒的Vp3蛋白之间。各株微病毒的Vp3蛋白均有以α螺旋为主的结构,蛋白序列高保守区存在多个细胞表位。Vp3蛋白结构性质保守,也是衣原体噬菌体衣壳的重要组分。其蛋白分子结构复杂,高保守区有较强的免疫原性,在分子重组、沙眼衣原体微病毒野生株筛查研究中有实际研究价值。     

副溶血弧菌噬菌体调控外周血单核细胞中IL-1β、IL-6、CD14的表达

目的观察高度纯化的副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)噬菌体Qdvp001和Vpp1对外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMCs)表达IL-1β、IL-6、CD14免疫基因的调控。方法①对噬菌体Qdvp001和Vpp1进行纯化;②分别用噬菌体低滴度组、中滴度组、高滴度组,Vp17802组和对照组作用于PBMCs后,用MTT比色法检测细胞增殖活性;③选取噬菌体中滴度组、Vp17802组、噬菌体+Vp17802组和对照组作用于PBMCs后,RT-PCR检测IL-1β、IL-6、CD14基因mRNA的变化。结果分别经两次纯化后,Qdvp001内毒素含量降低了644倍,Vpp1内毒素含量降低了652倍。噬菌体低、中、高滴度组作用于PBMCs一段时间后,细胞的增殖活性与对照组相比差异无统计学意义(P>0.05)。与对照组相比两种噬菌体对IL-1β和IL-6以及CD14的表达差异均无统计学意义(P>0.05)。与细菌组相比,噬菌体Qdvp001+Vp17802组先促进后抑制IL-1β的表达(P<0.05),一直抑制IL-6和CD14的表达(P<0.05);噬菌体Vpp1+Vp17802组一直抑制IL-1β和IL-6以及CD14的表达(P<0.05)。结论高度纯化的副溶血弧菌噬菌体对PBMCs增殖活性无明显影响且能够调节细菌引起的免疫应答。     

谷氨酸发酵中噬菌体的污染与防治

在谷氨酸发酵生产中,倘若污染噬菌体,轻则减产,重则倒罐,造成严重损失。所以防治噬菌体的污染是很重要的,现分述如下。一、噬菌体是什么? 噬菌体是病毒的一种,是一种极微小的生物,体积是细菌的1/1000左右,它可以通过细菌过滤器,只有在电子显微镜下才能看到。其特性如下: 1.从形态学角度分噬菌体为六群:1、2、3     

应用噬菌体肽库筛选能封阻霍乱噬菌体VP1转染菌细胞的寡肽

噬菌体感染细菌首先要吸附于细菌表面受体 ,从目前报道的细菌与噬菌体相互作用的研究中发现 ,这些受体包括细菌细胞外膜上的蛋白、糖脂结构和鞭毛等。霍乱弧菌是霍乱的病原体 ,高守一等 (副霍乱资料汇编 ,1 984,2 37～ 2 4 5 .)从国内分离并选择出 5株噬菌体 (VP1～VP5 ) ,根据霍乱弧菌菌株对噬菌体的敏感性不同 ,将埃尔托型霍乱弧菌分为 32个噬菌体型。结合生物学分型方法 ,可区分埃尔托型霍乱弧菌的两类不同菌株 (流行株和非流行株 )和不同菌型。对各种来源的菌株进行分型 ,可作为一种追溯传染来源、传播途径和分析流行形式的流行病学研…     

沙眼衣原体类噬菌体衣壳蛋白CtF的表达及多克隆抗体制备

[目的]预测沙眼衣原中类噬菌体衣壳蛋白CtF的空间结构,表达重组蛋白并制备多克隆抗体。[方法]采用SOPMA和I-TASSER等软件预测CtF的空间结构,利用MEGA6分析其系统发育关系;构建重组质粒pET-28a-CtF,转化至E.coli BL21(DE3)中进行克隆表达;纯化重组蛋白免疫ICR小鼠制备多克隆抗体。[结果]CtF蛋白包含八股β桶状核心结构和环形延伸结构,与已知的衣原体噬菌体VP1蛋白遗传距离较近;重组质粒表达相对分子量约为64 kDa的融合蛋白;免疫小鼠获得免疫血清效价达1∶12 800。[结论]CtF蛋白疑似为沙眼衣原体噬菌体的衣壳蛋白;重组质粒表达相对分子量约为64 kDa蛋白,该蛋白免疫原性良好,为进一步研究其功能奠定了基础。     

噬菌体编码的抑菌蛋白

噬菌体是细菌的天敌,它利用宿主的细胞机制完成自身的复制。在感染过程中噬菌体基因组进入细菌细胞后立即产生调节或重新定向宿主特定功能的蛋白质(即抑菌蛋白),以逃避多种细菌的防御机制或改变宿主的分子代谢机制。研究发现,这些噬菌体编码的抑菌蛋白可抑制细菌分裂,干扰细菌遗传物质的复制、转录及降解,影响CRISPR介导的细菌免疫以及代谢。明确噬菌体编码的抑菌蛋白如何影响这些宿主的防御或分子代谢机制可以优化目前基于噬菌体的抗菌策略,找出控制细菌感染的新途径,为抑菌药物的发现和设计打开新的大门。本文就近年来发现的噬菌体编码的抑菌蛋白及其抑菌机制的研究进展进行综述。     

什么是噬菌体、病原体、沙眼衣原体?

答:噬菌体又称菌病毒,无细胞结构,主要由蛋白质和DNA构成。它可以侵入细菌、放线菌体内,并在其中大量繁殖,引起细菌裂解。病原体是能引起人和动植物传染病的微生物和寄生虫的统称。如细菌、寄生虫、沙眼衣原体等。沙眼衣原体主要由蛋白质、DNA、RNA、脂类和多糖构成。具有象细菌类型的细胞壁,主要以分裂方式进行繁殖,行寄生生活,只能在活细胞内才能生长繁殖。衣原体是鸟类和哺乳动物、包括人类的许多     

重组伴侣蛋白60外膜蛋白免疫诱导抗脑膜炎奈瑟菌的杀菌抗体应答

<正>得自脑膜炎球菌定植个体的血清以及得自脑膜炎球菌性疾病患者的血清都含有针对奈瑟球菌热休克蛋白/伴侣蛋白60(Chp60)蛋白的特异性抗体。在这项研究中,作者用含在生理盐水中的重组Chp60、与氢氧化铝吸附的Chp60、含在脂质体中的Chp60以及含在去污剂微粒中的Chp60免疫小鼠,加或者不加单磷酰类脂A佐剂。结果表明能够诱导高度而且水平类似的(P0.05)的抗体,这种抗体能够识别外膜上的Chp60。FACS分析和免疫荧光试验测定表明Chp60是在脑膜炎球菌表面表达     

噬菌体吸附及受体结合蛋白(RBP)的研究进展与应用

噬菌体通过受体结合蛋白(Receptor binding protein,RBP)结合到细菌表面,其过程需要复杂的原子结构的参与和构象改变。针对噬菌体侵染,细菌发展了多种抗性机制,同时,噬菌体也进化出多种逃逸宿主抗性的机制。对噬菌体与细菌间"吸附-抗吸附-逃逸过程"的探索有助于我们理解噬菌体与细菌共进化的过程,对科学发展噬菌体治疗技术以及噬菌体的生物应用技术具有重要意义。本文概述了噬菌体吸附相关蛋白及吸附发生过程、基于RBP改变的噬菌体逃逸机制和RBP相关的生物技术研究进展。     

沙眼衣原体CT-249基因编码蛋白为一包涵体膜蛋白

使用融合蛋白GST-CT249的抗体对假想蛋白CT249的特性进行研究。使用PCR方法从L2型沙眼衣原体的基因组中扩增编码CT249蛋白的开放读码区基因,限制性内切酶BamHⅠ和NotⅠ消化、T4连接酶连接导入pGEX-6p2载体,进一步把重组质粒pGEX-6p2-CT249转化到XL1-blue细菌,并诱导表达融合蛋白GST-CT249。在融合蛋白GST-CT249免疫小鼠制备抗体后,应用直接免疫荧光技术对衣原体感染细胞内的CT249基因表达的内源性蛋白进行初步定位。成功克隆出沙眼衣原体基因CT249,全长为351bp,并表达了融合蛋白GST-CT249,分子量为38.2kDa。制备了融合蛋白GST-CT249的抗体并初步定位假想蛋白CT249于沙眼衣原体包涵体膜蛋白上。总之,使用融合蛋白GST-CT249的抗体,鉴定假想蛋白CT249为一种新的沙眼衣原体包涵体膜蛋白。该发现将为进一步深入研究衣原体与宿主细胞间某些机制提供了有用的途径。     

Non-specific immunoprecipitation of rotavirus Vp6 protein with Staphylococcus aureus

The specificity of Staphylococcus aureus and protein A-Sepharose (PA-S) were compared in the radioimmunoprecipitation assay for the characterization of monoclonal antibodies (mAbs) against rotavirus proteins. Five mAbs directed against bovine rotavirus Q17 proteins Vp6 and Vp7 and one mAb directed against human rotavirus protein Vp4 were used in this study. mAbs directed against other viruses, NS-1 culture supernatant and ascitic fluid, were used as control reagents. A non-specific immunoprecipitation of the viral protein Vp6 was always found with S. aureus, but not with PA-S. mAb 74 reacted with rotavirus antigens in ELISA and in indirect immunofluorescence assay but did not immunoprecipitate a viral protein with PA-S. This mAb immunoprecipitated the viral protein Vp6 when S. aureus reagent was used. This false positive reaction was always present and could lead to confusing results in the analysis and characterization of mAbs against rotavirus.     

Magma intrusion in the upper crust of the Abu Dabbab area, South East of Egypt from Vp and Vp/Vs tomography

3-Dimages of P-wave velocity and Vp/Vs ratio have been produced for the upper crust of the Abu Dabbab area, North Mars Alam city. The inversion of local travel times of high quality data recorded at eleven mobile seimic stations around the study area is carried out. The best, in the least-squares sense, 1-D Vp model and the average value of Vp/Vs (1.72) were computed as prerequisites of the 3-D inversion that reaches a depth of 14 km. From the 3-D model it is evident that the distributions of Vp and Vp/Vs are characterized by marked lateral and vertical variations delineating structural heterogeneities. Due to the presence of a thin layer of sedimentary rocks saturated with surface water, low P-wave velocity and high Vp/Vs values are noticed near the surface. At greater depths, high Vp and low Vp/Vs zones may indicate crustal rocks with relatively higher rigidity and brittle behavior, while high Vp/Vs and low Vp may identify zones of relatively softer rocks, with ductile behavior. Low P-wave velocity values are observed at the intersections among the faults. A possibility of some magma intrusion could be associated with the high Vp/Vs values which form an elongated anomaly, in the central part of the study area, which extends from a depth of 12 km to about 1–2 km of depth. If the obtained 3-D model is used in the relocation of selected events, they turn out to be strongly clustered in correspondence with the high velocity anomalies detected in the central part of the study area. Most of the seismicity tends to occur at the boundaries between the high and low velocity anomalies and at pre-existing weakness zones, i.e. the areas of intersection among different faults. The occurrence of the seismic activity in the vicinity of low velocity anomalies and at the boundary between velocity contrast could also be explained by the occurrence of serpentinization processes in the crust of the study area.      

兔出血症病毒遗传变异分析及RT—PCR检测方法的建立

目的获得兔出血症病毒（浙江分离株）近20年间遗传变异概况,建立兔出血症病毒的RT—PCR检测方法。方法对1989～2006年间的7株RHDV浙江分离株的衣壳蛋白基因（VP60）进行了克隆与测序,并与国内、外RHDV的基因组序列进行了遗传比对和分析;根据兔出血症病毒株的VP60设计引物,对20只人工感染兔的实质脏器、全血和350只实验兔全血样本进行了检测。结果7株RHDV的VP60基因均由1740个核苷酸组成,编码580个氨基酸。它们与参考序列之间的氨基酸同源性为94.0%～99.8%。系统发生树分析结果显示,RHDV可划分为2个大的基因群,浙江（中国）的RHDV分离株主要集中于C亚群。RT—PCR检测方法表明20只实验兔全部扩出预期条带,而350只实验兔全血检测中出现13只RHDV可疑样本。经血凝抑制试验检测,13例PCR阳性样品中有10个HAI阳性,3个阴性。检测敏感度达100%,特异性为99.12%,经统计检验,kappa=0.865,表明PCR检出RHDV的结果与HAI高度一致。结论RHDV基因群之间的遗传距离有逐渐加大的趋势。我们建立的RT—PCR法可用于RHDV浙江分离株的检测,用RT—PCR检测全血中RHDV方法的建立为活体检测RHDV打下了基础。     

猪A组轮状病毒Vp6基因与乳酸菌非抗性表达载体的重组及在大肠杆菌中的表达

以猪A组轮状病毒mRNA为模板,应用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,扩增了1194bp的Vp6基因,通过T-A克隆技术,将PCR产物克隆至克隆载体pGEM-TVector中,构建克隆质粒pGEM-T-Vp6。用SacⅠ和KpnⅠ双酶切pGEM-T-Vp6和以胸苷酸合成酶基因(thymidylate synthase,thyA)为选择压力的非抗生素抗性的穿梭表达载体pW425t,并将纯化的Vp6基因亚克隆至表达载体pW425t中,构建出可以在乳酸菌与大肠杆菌之间穿梭表达的原核表达重组质粒pW425t-Vp6。将pW425t-Vp6转化至thyA基因缺陷型的大肠杆菌感受态E.coliX13中,经生长功能弥补筛选阳性克隆,通过SDS-PAGE分析,可见约44.88kD的融合蛋白。由Western blot分析,表明该蛋白具有与轮状病毒多克隆抗体的反应原性,从而为pW425t-Vp6在乳酸菌受体菌株中表达提供理论基础和实验依据。     

大熊猫轮状病毒PCR检测方法的建立及应用

轮状病毒是威胁大熊猫健康的主要病原微生物之一。为了对大熊猫轮状病毒进行快速、方便且准确地检测,研发适合于基层饲养单位和保护区的检测方法是非常有必要的。本研究通过合成大熊猫轮状病毒Vp7基因序列,构建了PUC-VP7的重组质粒,并将其作为阳性对照对大熊猫轮状病毒样本进行PCR检测和分析。结果表明,在进行PCR扩增分析时,该质粒和病毒cDNA二者均在340 bp处出现了特异性条带。此外,对收集到的45份大熊猫粪便样本进行轮状病毒抗原检测时,其中2份样品在340 bp处出现条带,该基因片段与大熊猫轮状病毒CH-1株的相似性为99.89%。本研究构建的PUC-VP7质粒不但可以作为大熊猫轮状病毒PCR检测中的阳性质控品,而且还能有效地促进该PCR病毒检测技术在基层饲养单位和保护区的推广和应用。     

家蚕蛹表达的重组Vp28疫苗对克氏原螯虾免疫反应的影响

将含有对虾白斑综合征病毒囊膜蛋白Vp28基因的重组杆状病毒HyNPV-Vp28感染家蚕(Bombyx mori)蛹,配制成药饵持续口服免疫克氏原螯虾35天后,螯虾血细胞的吞噬百分比和吞噬指数比对照组显著提高(P＜0．05);血清中的抗菌活力、溶菌活力、酚氧化酶活性、超氧化物歧化酶活性以及血清和肝胰腺组织中的酸性磷酸酶、碱性磷酸酶活性均显著提高(P＜0．05)。免疫35天后进行口服攻毒,20天内rVp28疫苗组的累积存活率达66．67%,与对照组和对照蚕蛹组比差异显著(P＜0．05),PRP分别达64．29%和58．33%。rVp28疫苗组存活虾的胃、肠、鳃、甲壳下上皮和肝胰腺等病毒侵染的靶组织进行组织病理检测均无病毒感染,DIG标记核酸探针斑点杂交和PCR检测也呈阴性反应;而试验濒死虾的组织都呈现典型的病变特征,病毒DNA检测均为阳性反应。本研究表明,口服免疫家蚕蛹表达的囊膜蛋白Vp28具有增强螯虾机体免疫功能的作用,对应用免疫措施预防对虾的病毒性疾病具有重要意义。     

表达轮状病毒SA11株Vp4的抗原表位诱导病毒中和抗体生成

以昆虫病毒Flockhousevirus（FHV）外壳蛋白为载体的外源抗原表位表达系统（FHV-RNA2载体系统）．在重组杆状病毒和重组pET系统中构建和表达了SA11Vp4胰酶切割位点两侧和重叠切割位点3个抗原表位氨基酸序列（抗原表位A,aa223~242;抗原表位B,aa243～262;抗原表位C,aa234～251）,并对其免疫原性进行了研究。结果表明：这3个抗原表位能诱导动物产生抗同源氨基酸序列的抗体和抗同源病毒（SA11）感染性的血清中和抗体。研究结果提示：RVVp4胰酶切割位点区氨基酸序列除了具有胰酶切割增强病毒感染力外,还具有诱导动物机体产生血清中和抗体的能力,是RV重组抗原表位亚单位疫苗研究中重要的抗原表位氨基酸序列。     

家蚕蛹表达的重组Vp28疫苗对克氏原螯虾的抗病毒保护效应

对虾白斑综合症病毒(WSSV)的致病性强、危害性大、地域分布和宿主范围广泛,目前还不能有效地控制疫情。将含有WSSV囊膜蛋白Vp28基因的重组杆状病毒HyNPV-Vp28感染家蚕(Bombyx mori)蛹,对发病蚕血淋巴进行SDS-PAGE和Western blotting分析,结果表明Vp28在家蚕体内得到了表达。将重组病毒囊膜蛋白rVp28疫苗配制成药饵,持续口服免疫75天,对克氏原螯虾进行预防WSSV,实验虾分为2%重组Vp28疫苗、2%普通蚕蛹组织匀浆(阳性对照)和普通饵料(阴性对照)3个处理组。免疫35天后进行口服攻毒,20天内rVp28疫苗组的累积存活率为63.33%,与阳性和阴性对照比差异显著(P<0.05),PRP分别达54.16%和59.26%;注射攻毒后20 天内rVp28疫苗组的累积存活率与阳性和阴性对照组比差异不显著(P>0.05),PRP分别为46.12% 和49.99%。第55天对存活虾再口服攻毒,20天内rVp28疫苗组与阳性和阴性对照组比累积存活率差异显著(P<0.05),PRP分别为55.80%和63.16%;二次注射攻毒后,rVp28疫苗组的PRP均为31.25%。对vVp28疫苗组存活虾的胃、肠和肝胰腺组织进行病毒的原位杂交检测均呈阴性反应,而对照组死亡虾组织都呈阳性反应。本研究表明,口服免疫家蚕蛹表达的病毒囊膜蛋白Vp28能诱导螯虾产生抗病毒保护作用,对应用疫苗预防对虾的病毒性疾病具有重要意义。