转录调控因子WRKY超级家族:起源、结构和功能

WRKY蛋白质是一个植物特有的超级转录调控因子家族,在拟南芥和水稻基因组中分别拥有至少74个和97个成员。最占老的WRKY转录调控因子拥有2个高度保守的WRKY结构域,可能起源于15～20亿年前的真核牛物。虽然所有WRKY蛋白质主要通过特异地结合靶基因启动子区域的W盒序列而调控其表达,但各家族成员基因的生物学功能存在着各自的特异性。本文详细总结了WRKY蛋白质在调控植物发育和逆境诱导反应的信号转导途径建立等方面的分子生物学功能。     

WRKY转录因子功能研究进展

植物各种诱导型基因的表达主要受特定的转录因子在转录水平上的调控.转录因子结构和功能的研究近年来成为植物分子生物学、细胞分子生物学和分子遗传学研究领域的重要内容.WRKY转录因子在拟南芥中有74个成员,水稻中有100多个成员,在生物胁迫及非生物胁迫方面发挥着非常重要的作用.该文就近年来国内外关于WRKY转录因子家族的结构与起源进化和在植物损伤、衰老、发育及代谢等过程中参与的调控功能,以及在植物防御反应中对防御相关基因表达的调控及参与的植物激素类信号途径等方面的研究进展进行了综述,为全面解析WRKY转录因子家族的结构与功能提供了新的视点.     

植物转录因子 WRKY家族的结构及功能

WRKY家族结构上的共同特点是:至少含有一段60个左右的高度保守的氨基酸序列,称为WRKY区,其中有一七肽WRKYGQK存在于所有的成员中,故而得名.WRKY蛋白通过与其目标基因启动子中的顺式元件(T)TGAC(C/T)结合调节该基因的表达,参与(或可能参与)植物对病原体的防卫反应、非生物胁迫反应以及植物的某些生理过程.该文介绍了植物转录因子WRKY家族的结构及功能的研究进展.     

转录因子AKNA 功能调控的研究进展

转录因子AKNA是具有AT-hook模体的核内蛋白质,与富含AT碱基的DNA区域相结合调控靶基因的转录。AKNA主要在B淋巴细胞、T淋巴细胞、自然杀伤性细胞和干细胞上表达,介导免疫反应的发生。转录因子AKNA的单核苷酸多态性(SNP)可增加宫颈癌的风险,AKNA功能的丧失导致子宫颈肿瘤性病变。敲除AKNA基因可导致炎性因子、蛋白酶和趋化因子的富集,诱发中性粒细胞介导的炎性反应。本文从转录因子AKNA的结构特征、生物学功能和功能调控三方面进行综述,旨在为后续关于AKNA转录调控网络和信号通路的研究提供依据。     

酵母转录调控因子PHO81的结构与功能

本文发现ＰＨＯ８１蛋白上的碱性区和酸性区附近的微小变化可导致ｒＡＰａｓｅ的表达向组忝型转化,且这两个区域是协同作用的,而酸性区的净负电荷的降低能使ｒＡＰａｓｅ的活力降低。     

植物转录因子与基因调控

转录因子是一群DNA结合蛋白,在调控基因表达上起着重要作用。典型的转录因子含有DNA结合区、转录调控区、寡聚化位点及核定位信号区等功能区。有关转录因子结构和功能的研究是植物分子生物学研究的前沿领域,其研究成果对农作物性状的改良具有重要的意义。     

植物WRKY转录因子结构及功能研究进展

WRKY蛋白是植物所特有的转录因子家族.因WRKY结构域中的N-端均含有高度保守的WRJKYGQK氨基酸序列而得名.它能够与(T)TGACC(A/T)序列(W*box)发生特异性作用,调节启动子中含W-box元件的调节基因或功能基因的表达,从而参与植物的各种防卫反应,调节植物的发育和代谢等.近些年来.有关WRKY转录因子的研究很多,如模式生物中的拟南芥和水稻基因组中拥有大量的WRKY成员.主要介绍WRKY转录因子的结构特点及生物学功能.     

细菌DeoR家族转录调控因子的研究进展

细菌基因组中存在大量的转录调控家族,这些转录调控家族在细菌的生长、代谢、外界信号感知与传递等方面发挥着至关重要的作用.DeoR家族是一类广泛分布于原核生物中的转录调控因子,主要参与调控细胞中多个生理过程,包括核苷酸类代谢、糖类代谢、致病菌的毒力以及链霉菌的次级代谢等.DeoR蛋白C末端的配体结合结构域,通常能够以相关代...     

细菌GntR家族转录调控因子的研究进展

GntR家族转录调控因子是细菌中分布最为广泛的一类螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix,HTH)转录调控因子,此家族转录调控因子包含两个功能域,分别是N端的DNA结合结构域和C端的效应物结合结构域/寡聚化作用结构域.DNA结合结构域的氨基酸序列是非常保守的,但效应物结合结构域/寡聚化作用结构域的氨基酸序列...     

转录因子KLF8基因结构及其功能研究进展

随着分子生物学研究的进展,机体各种生物学特性的影响都在分子水平上寻求到原因。转录因子作为调节基因转录的重要蛋白质,一直在被人们进行种类发掘及功能鉴定。KLF8(Krüppel-like factor 8)是属于KLFs(Krüppel-like factors)家族中的一种转录因子,对细胞侵袭和上皮-间质转化、细胞致癌性转化和肿瘤、细胞周期循环、脂肪细胞分化等方面有着深远影响。由于其在生物学功能上的多方面影响,使其逐渐成为科研人员探究的热点。对该转录因子的结构和作用已经有了深入的了解。现就KLF8基因与蛋白质的分子结构和生物学特性研究进展进行综述,可为该基因作为遗传标记奠定基础并以期为相关研究如癌症调控、肥胖治疗及基础研究等提供参考。     

植物bHLH转录因子的结构特点及其生物学功能

bHLH(basic/helix-loop-helix)转录因子在真核生物的生长发育过程中起着重要的调控作用,它们组成了转录因子中的一个大家族。bHLH转录因子不仅普遍参与了植物的生长发育,包括毛状体的发生、光形态建成和光信号转导,而且在植物响应逆境胁迫和次生代谢方面也具有重要作用。对植物bHLH转录因子的结构特点及其生物学功能进行综述。     

北京中医药大学中药学院

转录因子是能够结合某基因上游特异核苷酸序列上的蛋白质,活化后从胞质转位至胞核,通过识别和结合基因启动子区的顺式作用元件,启动和调控基因表达。真核生物在转录水平上的基因表达调控,影响和控制着细胞和生物个体的许多生物学过程。本文综述了转录因子的结构、分类以及其在植物干旱胁迫中发挥的作用。     

干扰素调节因子新剪接异构体IRF7-e的结构及功能

干扰素调节因子7是诱导玉型干扰素表达的最主要的转录因子。寻找IRF7新的剪接异构体,研究其结构及功能,为探索IRF7参与调控玉型干扰素机制的多样性提供基础。通过PCR和Sanger测序获得了IRF7一种新的剪接形式IRF7-e,并通过RACE获取了IRF7-e 基因全长。IRF7-e全长为1994 bp,含5'-UTR 410 bp,3'-UTR 120 bp,开放阅读框1464 bp,编码487个氨基酸的蛋白,预测其等电点为6.659,蛋白分子量为52.8 kD。双荧光素酶报告分析表明过表达IRF7-e能够提高玉型干扰素IFNα和IFNβ启动子的活性,其中对IFNα启动子活性提高了12.18倍,对IFNβ的启动子活性提高了2.99倍。表明IRF7-e可能参与玉型干扰素的调控。     

A genome-wide analysis of sumoylation-related biological processes and functions in human nucleus

Protein sumoylation is an important reversible post-translational modification of proteins in the nucleus, and it orchestrates a variety of the cellular processes. Genome-wide analysis of functional abundance and distribution of Small Ubiquitin-related MOdifier (SUMO) substrates may shed a light on how sumoylation is involved in nuclear biological processes and functions. Two interesting questions about sumoylation have emerged: (1) how many SUMO substrates exist in mammalian proteomes, such as human and mouse, (2) and what are their functions and how are they involved in a variety of biological processes? To address these two questions,we present an in silico genome-scale analysis for SUMO substrates in human. Based on the pattern recognition and phylogenetic conservation, we retrieved a list of 2683 potential SUMO substrates conserved in both human and mouse. Then, by functional enrichment analysis, we surveyed the over-represented GO terms and functional domains of them against the whole human proteome. Besides the consistence between our analyses and in vivo or in vitro work, the in silico predicted candidates also point to several potential roles of sumoylation, e.g., perception of sound. These potential SUMO substrates in human are of great value for further in vivo or in vitro experimental analysis.     

Binding of Erythroagglutinating Phytohemagglutinin Lectin from Phaseolus vulgaris to the Epidermal Growth Factor Receptor Inhibits Receptor Function in the Human Glioma Cell Line, U373 MG

Abstract: Little is known about the role of the N -linked oligosaccharides in the function of the epidermal growth factor (EGF) receptor (EGF-R). In a human glioma cell line, U373 MG, EGF-Rs contain the bisecting N -linked oligosaccharide sequence recognized by erythroagglutinating phytohemagglutinin lectin from Phaseolus vulgaris (E-PHA). Incubation of E-PHA with cultured U373 MG cells results in inhibition of EGF binding to its receptor and consequently inhibition of EGF-induced autophosphorylation of the receptor. Consistent with the inhibitory effects on the EGF-R, phenotypic events that depend on EGF-R signaling, such as cell spreading and proliferation, were also found to be modified. The effect of this lectin seems to be specific because leukoagglutinating phytohemagglutinin lectin from P. vulgaris (L-PHA), an isolectin of E-PHA, had no effect on EGF-R activity or the biological functions of these cells even though L-PHA was able to bind to the EGF-R. These findings suggest the presence of an important bisecting N -linked oligosaccharide structure in close proximity to the EGF binding site on the receptor. Furthermore, these results suggest the possibility that E-PHA lectin binding may provide an additional approach to blocking EGF-dependent glioma cell growth.