B组轮状病毒的分子生物学研究进展

除Ａ组轮状病毒外，引起人类腹泻的还有Ｂ组和Ｃ组轮状病毒。本文就Ｂ组轮状病毒的基因结构、功能、所编码的蛋白及其与Ａ组轮状病毒蛋白的对应关系以及Ａ、Ｂ、Ｃ组间和组内不同株轮状病毒主要基因片段之间的遗传同源性关系作一概述。     

生物素标记寡核苷酸探针检测B群轮状病毒

用５′端接氨基标记法,用生物素对Ｂ群轮状病毒（ＧＢＲＶ）ＩＤＩＲ株具有群特异性的３片段基因上２３ｂｐ寡核苷酸序列进行标记,经高效薄层层析板（ＨＰＴＬＣ）纯化,制备了Ｂ群轮状病毒生物素寡核苷酸探针,探针显色灵敏度达１０Ｐｇ,与ＧＢＲＶ、ＫＢ６３株基因杂交可检测到１００ｐｇ靶序列,而与Ａ群和Ｃ群轮状病毒及无关基因均不产生杂交信号,该探针可用于Ｂ群轮状病毒的检测、鉴定,以及同群不同毒株间基因相关性研究。     

用反转录—聚合酶链反应检测B组轮状病毒

轮状病毒（Ｒｏｔａｖｉｒｕｓ）是属于呼肠病毒科（Ｒｅｏｖｉｒｉｄａｅ）的双链ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）病毒。至今已将轮状病毒分为七个组（Ａ～Ｇ）。已经发现的Ｂ组轮状病毒分别来自人、大鼠、牛、猪、羊。近十年来,通过轮状病毒的研究,轮状病毒Ｂ组已被公认为引起人...     

少数民族新生儿及婴幼儿中人轮状病毒分子流行病学研究

用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对内蒙古自治区三个不同地理位置的少数民族自治旗及一个城市汉族对照区秋冬季采集的新生儿胎便及婴幼儿急性腹泻便进行轮状病毒ＲＮＡ基因组特点分析。共检测胎便标本１４６份,腹泻便标中１１６份。结果表明：几个少数民族地区流行的轮状病毒均以Ａ组第Ⅱ业组为士,并在一个地区有多种差异电泳型存在。新生儿胎便中可检出轮状病毒并显示了特征性Ａ组轮状病毒ＲＮＡ基因型。胎便小轮状病毒检出率高的地区,腹泻便检出率也相应高,轮状病毒的检出率与民族、地理位置尤明显关系,而与当地的卫生条件及地形有关。阳性标本使用Ａ组单克隆抗体酶标免疫试剂进一步证实。     

hGM－CSF基因及其调控研究进展

人粒细胞－巨噬细胞集落刺激因子基因表达受到转录调控与转录后调控。５＇非转录区的一些顺式调控成分,如ＣＡＴＴ（Ａ／Ｔ）重复序列,富含ＧＣ序列,ＣＫ－１、ＣＫ－２、ｋＢ特异序列与可诱导的ＣｓＡ敏感增强子成分等在转录水平上调控ｈＧＭ－ＣＳＦ的表达。３＇非翻译区有一６２ｂｐ富含ＡＵ序列,这与ｍＲＮＡ的稳定性相关,在翻译水平调控ｈＧＭ－ＣＳＦ的表达,细胞因子与一些刺激因子通过不同的机制作用于ｈＧＭ－ＣＳＦ基     

婴幼儿轮状病毒肠炎48例病原学检测及治疗

轮状病毒是婴幼儿秋冬季腹泻的最常见的病原。我们用ＥＬＩＳＡ试剂盒对５４例大便常规检查无ＷＢＣ或偶见的疑似轮状病毒腹泻患儿进行了轮状病毒病原学检测,从中检出轮状病毒阳性患儿４８例,被确诊为轮状病毒肠炎。结果显示粪便中轮状病毒滴度越高,其临床症状也相应越重。此４８例患儿均采用病毒唑、双歧杆菌活菌制剂、补液纠正脱水等综合治疗,其中３０例辅以消化道粘膜保护剂思密达治疗,治疗组显效率为６０％,而对照组为１１．１％,经ｔ检验两组间显效率及总有效率均有非常显著性差异。表明思密达用于轮状病毒肠炎的治疗是一种较为有效的方法。     

新成人腹泻轮状病毒J19株的全基因组克隆和VP4、VP6和VP7基因序列分析

为了进一步了解新成人腹泻轮状病毒J19株的基因和蛋白特征,利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增J19株的11个基因,克隆到pMD18-T载体中并进行测序。在此基础上,将主要抗原蛋白VP4、VP6和VP7的蛋白序列与其它轮状病毒的相关蛋白序列进行比较分析并对VP6蛋白序列做遗传进化分析。结果获得J19株11个基因的全长基因序列。基因序列分析表明J19株的第3、6和第9基因分别长2 512bp、1 287bp和820bp,它们分别预测编码抗原蛋白VP4(823aa)、VP6(396aa)和VP7(258aa)。组成J19株的VP4、VP6和VP7蛋白序列对B组轮状病毒的CAL株、IDIR株以及ADRV株的相关蛋白序列的一致性分别是27.6%、38.5%和22.3%。对分组抗原蛋白VP6的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置靠近外群蛋白分支以及A、B和C组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向于B组轮状病毒的分支。J19株的VP4、VP6和VP7蛋白序列与其它轮状病毒的相应蛋白序列存在显著差异。VP6蛋白序列的遗传进化分析表明J19株可能是一个新组轮状病毒的代表性毒株;同时,它也可能是一个与B组轮状病毒的起源和进化密切相关的毒株之一。关于新成人腹泻轮状病毒J19株11个基因的克隆及VP4、VP6和VP7基因的序列分析,这是第一次报道。     

人类轮状病毒基因DNA免疫的初步研究

本文研究人类轮状病毒基因ＤＮＡ免疫及应用。通过构建重组质粒ｐＣＩ／ｖｐ７,ｐＣＩ／ｖｐ４及ｐＣＩ／ｖｐ６,以肌注法导入ＢＡＬＢ／ｃ小鼠肌肉组织,其中ｐＣＩ／ｖｐ７及ｐＣＩ／ｖｐ４能　有效引起机体免疫应答,而且对轮状病毒Ｗａ株有一定中和效应。从本次试验的结果来看　,人类轮状病毒ＤＮＡ疫苗能作为预防病毒性小儿腹泻的一种手段。     

不数民族新生儿及婴幼儿中人轮状病毒分子流行病学研究

用降丙烯酰胺凝胶电泳技术,对内蒙古自治区三个不同地理位置的少数民族自治旗及一个城市汉族对照区秋冬季采集的新生儿胎便及婴幼儿急性腹泻便进行轮状病毒ＲＮＡ基因组特点分析。共检测胎便标本１４６份,腹泻便标本１１６份。结果表明;几个少数民族地区流行的轮状病毒均以Ａ组Ⅱ亚组为主,并在一个地区有多种差异电泳型存在,新生儿胎便中可检出轮状病毒并显示了特征性Ａ组轮状病毒ＲＮＡ基因型。胎便中轮状病毒检出率高的地区,     

新成人腹泻轮状病毒J19株VP2、VP3的编码基因序列分析

利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法,从新成人腹泻轮状病毒J19株的核酸中扩增基因,克隆至pMD18-T中并进行测序和基因序列分析。J19株的VP2、VP3的编码基因为基因2、4,分别长2 969bp、2 204bp,它们分别编码973个氨基酸和719个氨基酸。J19株的VP2蛋白序列对B组人轮状病毒IDIR株的一致性为47.2%;J19株的VP3蛋白序列对C组人轮状病毒Cowden株一致性为25.1%。对J19株VP2的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置靠近外群蛋白以及A、B和C组轮状病毒分枝的根部,并且它比较偏向于B组轮状病毒的分枝。这与VP6的遗传进化分析结果相一致。根据上述结果推测J19株可能是一个与B组轮状病毒的起源和进化密切相关的毒株之一;同时,这表明VP2在研究轮状病毒的遗传进化上具有重要价值。关于新成人腹泻轮状病毒J19株VP2、VP3的编码基因的序列分析,这是首次报道。     

犬腺病毒基因组缺失VA RNA编码区的发现

将两株１型犬腺病毒（Ｃａｎｉｎｅ ａｄｅｎｏｖｉｒｕｓ ｔｙｐｅ １,ＣＡｄｌ）ＤＮＡ片段（２９￣４０ｍ．ｕ．）和两株２型犬腺病毒（ＣＡｄ２）ＤＮＡ片段（２８￣４４ｍ．ｕ．）,分别克隆到质粒ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＳＫ中。经核苷酸序列测定和计算机分析表明,在上述克隆片段内,两株ＣＡｄｌ（ＣＬＬ和Ｇｌａｘｏ）的序列相同,两株ＣＡｄ２（Ｔｏｒｏｎｔｏ和Ｃｈｉｎａ）的序列也相同;ＣＡｄ１与ＣＡｄ２具有９     

两种AFP阳性肝癌细胞专一基因表达调控序列的构建

构建了由人胰蛋白酶抑制基因的增强子和大鼠ａｆｐ基因启动子与沉默子组成的杂合基因表达调控序列;还构建了１．２ｋｂ的由大鼠ａｆｐ基因增强Ⅲ和ｒＰＳ组成的调控序列。将报告基因－氯霉素乙酰转移酶基因置于这些序列控制之下,构建成ＣＡＴ表达载体ＡＴｒＰＳ－ｐＣＡＴ和ｒＡＦＰ－ｐＣＡＴ。     

轮状病毒LLR株VP7抗原表位的预测与验证

在GenBank中检索A组轮状病毒不同血清型的VP7基因信息,在氨基酸水平上与G10血清型LLR株的VP7序列进行序列对比,分析其血清型特异的氨基酸保守序列位点。结合蛋白质二级结构预测理论方案,设计合成3条具有轮状病毒G10血清型特异性氨基酸序列的多肽。通过检测合成肽对轮状病毒免疫血清与LLR抗原的结合抑制,证实三条多肽均具备了LLR表位属性。     

人端粒酶RNA基因的克隆与鉴定

以人血基因组ＤＮＡ为模板,合成两段２０个寡聚核苷酸为引物,经过ＰＣＲ扩增,得到４８０ｂｐ的片段,克隆到ｐＭＤ１８－Ｔ载体中,经电泳、酶切、ＰＣＲ鉴定后测定序列。序列分析表明氙克隆的人端粒酶ＲＮＡ（ｈｕｍａｎ ｔｅｌｏｍｅａｓｅ ＲＮＡ,ｈＴＲ）基因含有４８０ｂｐ,包括约４５０ｂｐ的编码模板区主序列和约３０ｂｐ的上游调控区序列,其中模板区的１１个核苷酸（５’－ＣＵＡＡＣＣＣＵＡＡＣ－３’）合成端粒亚     

一组丝瓜籽小分子核糖体失活蛋白LuffinS的分离,纯化 …

通过硫酸铵分级沉淀、ＣＭ－５２阳离子交换层析、ＨＲＬＣ分子排阻层析及ＦＰＬＣ Ｍｏｎｏ Ｓ离子交换层析等步骤,从丝瓜籽中分离到一组分子量为８ｋＤ左右的小分子核糖体失活蛋白－ＬｕｆｆｉｎＳ１、ＬｕｆｆｉｎＳ２、ＬｕｆｆｉｎＳ３。末端分析结果表明,它们的Ｎ端氨基酸分别为Ａｌａ、Ｐｒｏ和Ｔｈｒ。氨基酸序列分析确定了ＬｕｆｆｉｎＳ２的Ｎ端９个氨基酸的序列是Ｐｒｏ－Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ｇｌｎ－Ａｌａ－Ｐｈｅ－Ａ     

不同型犬腺病毒纤突蛋白基因序列的比较分析

根据已发表的ＣＡＶ纤突基因序列,用ＰＣＲ方法,对４个ＣＡＶ－２毒　株和４个ＣＡＶ－１毒株的纤突基因进行了扩增和测序,测定的核苷酸序列经推导得到分别编　码５４３和５４２个氨基酸的ＣＡＶ纤突蛋白全序列。测定的ＣＡＶ－２比较表明：我国流行的ＣＡＶ－２　ＳＹ　强毒株与国外标准强毒株Ｔｏｒｏｎｔｏ　Ａ２６／６１株相同,其驯化致弱的毒株与驯化前相比在１１３４位　发生碱基颠换。测定的ＣＡＶ－１比较表明：我国流行的ＣＡＶ－１株与标准强毒ＲＩ２６１株差异相对　较大,而国内ＣＡＶ－１毒株互相之间相对差别较小。ＣＡＶ－２与ＣＡＶ－１纤突基因的同源性为８０．４８％。     

用PCR扩增和克隆鸡传染性贫血病毒全基因组DNA

根据已发表的序列,分别在鸡贫血病毒（ＣＡＶ）环形基因组ＤＮＡ（全长２．３ｋｂ）的ＥｃｏＲＩ位点和ＢａｍＨＩ位点的两侧选择适当序列合成两对引物,用ＰＣＲ技术,从斑点杂交检测到病毒核酸的ＣＡＶ感染的ＭＤＣＣＲＰ１细胞基因组ＤＮＡ中,分别扩增出包含ＥｃｏＲＩ和ＢａｍＨＩ分割开的病毒基因组两部分（１．５ｋｂ和０．８ｋｂ）约１．５ｋｂ和约１．２５ｋｂ的两个片段。再将其中相应序列拼接克隆进ｐＵＣ１８载体,获得包含ＣＡＶ全基因组序列ＤＮＡ片段的克隆质粒ｐＣＡＶ２．４。酶切分析表明,该质粒具有预期的ＢａｍＨＩ位点、ＰｓｔＩ位点、ＨｉｎｄⅢ位点,而预期的ＥｃｏＲＩ位点消失。重组质粒插入ＤＮＡ片段的两端序列分析表明,质粒ｐＣＡＶ２．４是包含ＣＡＶ全基因组序列的重组质粒,插入ＤＮＡ片段序列中的ＥｃｏＲＩ位点序列发生了一个碱基突变。     

B组轮状病毒RT—PCR来源的cDNA探针核酸诊断方法的建立

近十年来,国内外学者相继报道在人以及牛、羊、猪、大鼠的腹泻粪样中检出Ｂ组轮状病毒〔１－３〕。洪涛等于１９８３年首次报道成人腹泻轮状病毒（ＡＤＲＶ）属于Ｂ组轮状病毒〔４〕。目前,轮状病毒Ｂ组已被公认为引起人及不同动物腹泻的流行病学的重要因素。由于Ｂ组轮...     

乙型肝炎病毒核心抗原基因序列的启动子活性

将核心抗原基因起始码下游的序列,构建两个ＣＡＴ报告基因表达质粒,即ｐＣＡＴＮ Ｉ和ｐＣＡＴＮⅡ,转染ＨｅｐＧ２与ＣＶ－１细胞后,均可使ＣＡＴ报告基因表达,表现出启动子活性。     

草鱼(Ctenopharyngodon idellus)线粒体DNA控制区及其两侧tRNA基因的克隆与结构分析

动物线粒体ＤＮＡ控制区是线粒体基因组复制与基因表达的最主要的调控区．采用杂交和测序的方法对草鱼线粒体ＤＮＡ控制区进行定位、克隆并测定了控制区及其旁侧的ｔＲＮＡＰｈｅ、ｒＲＮＡＰｒｏ和ｒＲＮＡＴｈｒ三个基因的序列,与多种脊椎动物的相应序列进行了比较,并进行了结构分析．草鱼线粒体控制区全长９２７ｂｐ,含有与酵母和爪蟾线粒体启动子相似的序列,其ＣＳＢⅠ、ＣＳＢⅡ和ＣＳＢⅢ序列与其他几种动物的ＣＳＢ比较相当保守,ＴＡＳ与其回文基序可形成稳定的茎环结构,成为Ｈ－链复制的终止信号．草鱼线粒体ｔＲＮＡＰｈｅ、ｔＲＮＡＰｒｏ和ｔＲＮＡＴｈｒ可折叠成三叶草形二级结构,其基因具有许多不同于细胞质ｔＲＮＡ基因的结构特点,可能反映了线粒体ｔＲＮＡ与线粒体核糖体具有不寻常的作用方式