丙型肝炎病毒翻译及调控机制

丙型肝炎病毒（ｈｅｐａｔｉｔｉｓＣｖｉｒｕｓ,ＨＣＶ）是单股正链ＲＮＡ病毒,有单一阅读框架,编码约３０１０个氨基酸的病毒前体蛋白。ＨＣＶ基因组结构和病毒蛋白的亲疏水性与黄病毒相似,因此将其归于黄病毒科丙型肝炎病毒群［１］。与黄病毒不同的是,ＨＣＶ５′...     

森林脑炎病毒分子生物学研究进展

森林脑炎（ＴＢＥ）病毒是黄病毒科中的成员,象其它的黄病毒一样,基因组ＲＮＡ含有单个开放阅读框架,在基因组的５′端编码病毒的结构蛋白,在３′端编码非结构蛋白,翻译成聚蛋白后,通过细胞和病毒编码的蛋白酶裂解产生单个的病毒蛋白,成熟的病毒是由两个相关的Ｅ和Ｍ膜蛋白脂质包膜所包围的立体对称的核衣壳组成。包膜Ｅ蛋白在病毒的感染周期中对细胞的识别和穿入细胞具有极其重要的功能,同时Ｅ蛋白诱导保护性的免疫反应,Ｅ蛋白内某一位点单个氨基酸的改变可引起病毒毒力的改变。因此,对ＴＢＥ病毒分子生物学的研究有助于了解病毒与宿主细胞相互作用的机理,为病毒感染的异性诊断、疫苗的研制和抗病毒药物的设计提供理论依据。     

黄病毒基因组非编码区的结构与功能研究进展

黄病毒科黄病毒属是由一组含单股正链RNA基因组的囊膜病毒组成,包括登革病毒、流行性乙型脑炎病毒、寨卡病毒、西尼罗病毒、黄热病病毒等,经由虫媒传播,可引起人类和动物的严重虫媒病毒病。黄病毒基因组由1个开放阅读框、5′非编码区和3′非编码区三部分组成。5′和3′非编码区含有病毒基因组复制所必需的启动元件;高度结构化的3′非编码区负责黄病毒亚基因组RNA的产生,从而有助于病毒逃避宿主免疫反应;此外3′非编码区还可作为疫苗研究的靶标。鉴于非编码区在黄病毒的蛋白翻译、基因组复制和免疫调节中发挥的重要作用,本文就黄病毒基因组非编码区的结构与功能最新研究进展作一简要综述。     

丙型肝炎病毒基因组的翻译及其产物的加工

丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）是一种单正链ＲＮＡ病毒,其５’非编码区（５’ＮＣＲ）是决定病毒蛋白表达的关键区。基因突变与报道基因表达技术研究表明５’ＮＣＲ有一内部核糖体进入位点（ＩＲＥＳ）。类似于微小ＲＮＡ病毒属。ＨＣＶＲＮＡ翻译成为一条多蛋白分子,对蛋白酶的裂解加工后形成１０余种结构和非结构蛋白。研究ＨＣＶＲＮＡ的翻译及产物加工,对ＨＣＶ及其抗原表达载体有重要意义。     

NS3蛋白在黄病毒科病毒生命活动中的作用

黄病毒科病毒包括三个属,即黄病毒属(Flavivirus),瘟病毒属(Pestivirus)和丙型肝炎病毒属(Hepacivirus).这些病毒均能引起人和动物患严重疾病.黄病毒属黄热病毒(Yellow fever virus,YFV)、登革病毒(Dengue virus,DEN)能引起发烧、出血,患者死亡率极高,瘟病毒属牛腹泻病毒(Bovine viral diarrhea petivirus, BVDV)、猪瘟病毒(Classical swine fever virus, CSFV)等能引起其各自宿主家畜患严重疾病.近年来,又发现丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus, HCV)与人类原发性肝癌和肝硬化密切相关.然而,目前仍没有对各种黄病毒科病毒有效的治疗方法.尤其是近年来干扰素对丙型肝炎治疗的疗效低,反复率高,使得研究更为有效的抗病毒药物成为各种病毒疾病治疗中亟待解决的问题之一.在BVDV的研究中发现,当非结构蛋白NS3蛋白与NS2蛋白一起以复合物的形式存在时,病毒对其寄主是非致病性的;而当NS3蛋白独立地存在时,病毒颗粒是致病性的[1].这提示NS3蛋白很可能与病毒的致病性密切相关.而且,序列分析表明非结构蛋白NS3(nonstructure protein 3)是黄病毒科病毒中最为保守的非结构蛋白.后来许多研究证明NS3蛋白参与蛋白质水解加工,以及病毒的复制,对病毒的生命循环是必需的.因此,NS3蛋白成为了人们研究的一个热点.     

黄病毒属病毒复制子载体研究进展

RNA复制子是一种能自主复制的RNA载体,保留了病毒非结构蛋白(复制/转录酶)基因,而结构蛋白基因缺失或由外源抗原基因替代,复制/转录酶可控制载体RNA在细胞质中高水平复制以及外源基因的高水平表达。在黄病毒属病毒感染性克隆基础上,其复制子载体得到了成功的构建。黄病毒属病毒复制子为病毒基因组结构功能研究、表达载体构建、假病毒包装及新型疫苗制备等提供了新的技术平台。本文综述黄病毒属病毒复制子的构建原理、方法及应用。     

HCV NS5A基因表达及其在血清学检测中的应用评估

人丙型肝炎病毒 (ＨＣＶ)感染可引起丙型肝炎、肝硬化和肝细胞癌[1] 。丙型肝炎病毒是单股正链ＲＮＡ病毒 ,基因组约长 9.5ｋｂ ,仅有一个开放阅读框 ,编码一个大的聚蛋白前体 ,由宿主蛋白酶和病毒编码的蛋白酶加工成多个成熟蛋白。非结构蛋白ＮＳ5Ａ分子量为 56ｋＤ/ 58ｋＤ。目前对ＮＳ5Ａ蛋白的功能尚不清楚 ,ＮＳ5Ａ蛋白可降低干扰素治疗效果[2 ] ;ＮＳ5Ａ蛋白含核定位序列 ,因此人们推测它在ＨＣＶＲＮＡ复制过程中可能起一定的作用[3～ 4 ] 。本研究在大肠杆菌中表达全长ＮＳ5Ａ蛋白 ,提纯后ＮＳ5Ａ蛋白能与大多数丙肝阳性血清起强烈…     

昆津病毒复制子——一种新型病毒载体

病毒复制子 (Replicon) 是指来源于病毒基因组的能够自主复制的RNA分子,保留了病毒非结构蛋白基因,而结构蛋白基因缺失或由外源基因替代。昆津病毒 (Kunjun virus) 为黄病毒科黄病毒属成员,其复制子具有表达效率高、细胞毒性低、遗传稳定等特点,在病毒基因组复制调控机制、外源蛋白表达、新型疫苗和基因治疗等领域得到了广泛应用。以下就昆津病毒复制子系统的构建、特性及应用方面的研究进展作一综述。     

RNA病毒的复制途径

ＲＮＡ病毒的复制途径聂剑初（北京师范大学生物学系１００８７５）ＤＮＡ病毒在其基因组复制和表达过程中利用许多的宿主蛋白质。ＲＮＡ病毒的复制则面临一个特殊的问题,即未受侵染的宿主细胞没有按照ＲＮＡ模板的指令合成ＲＮＡ的酶。因此,ＲＮＡ病毒必须含有合成这类...     

登革病毒感染性转录体技术

登革病毒 (Ｄｅｎｇｕｅｖｉｒｕｓ)属黄病毒科黄病毒属 ,基因组结构为单股正链ＲＮＡ ,全长约 1 0～ 1 1ｋｂ。登革病毒在复制过程中不形成ＤＮＡ中间体 ,因此要在基因水平研究其特征存在一定困难 ,因为突变、重组、克隆等分子生物学技术都是在ＤＮＡ水平上的操作。体外转录制备感染性ＲＮＡ(感染性转录体 )技术提供了解决这一难题的新途径[1]。该技术是把病毒ＲＮＡ逆转录成ｃＤＮＡ ,并置于ＲＮＡ聚合酶启动子的下游 ,在ＲＮＡ聚合酶的作用下体外转录出全长正链ＲＮＡ ,经转染易感细胞后复制出子代病毒颗粒。由于这种子代病毒来自ｃＤＮ…     

寨卡病毒蛋白结构与功能研究进展

2015年以来,南美暴发大规模寨卡疫情,因其与新生儿小头症等严重神经发育疾病密切相关,被世界卫生组织列为国际关注的突发公共卫生事件。与其他虫媒黄病毒类似,寨卡病毒为单股正链RNA病毒,其基因组编码的3种结构蛋白构成病毒颗粒,7种非结构蛋白参与病毒复制生活周期的调控。在全球科学家的共同努力下,寨卡病毒蛋白结构与功能的研究取得了突破性进展,极大地促进研究者对病毒复制与致病机制的认识,也为疫苗和药物研发提供了重要科学依据和潜在靶标。本文将对寨卡病毒蛋白的结构与功能的最新研究进展作一综述,并讨论当前面临的挑战和机遇。     

牛病毒性腹泻病毒分子生物学特性研究进展

牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)是引起牛黏膜病的病原,该病原给养牛业造成重大的损失,致病机理十分复杂。与丙肝病毒同属黄病毒科,二者有很高的同源性,所以被用作HCV的模式病毒。其基因组为一单股正链RNA分子,编码4种结构蛋白和8种非结构蛋白,这些蛋白质在病毒的复制、翻译及与宿主细胞的相互作用中发挥重要作用。随着对该病毒及同属的其他病毒研究的深入,人们对该病毒的致病机制、免疫逃避、遗传特性等方面有了一定的认识。本文综述了该病毒及其同科病毒编码的蛋白质的主要功能,为该病的防治及其他病毒的深入研究提供参考依据。     

黄病毒NS2B-NS3pro蛋白酶的结构研究进展

黄病毒能引起严重的人类疾病,但是并无特定药物来治疗病毒感染。黄病毒非结构蛋白NS3的N端区域及其辅因子NS2B构成蛋白酶,该酶切割病毒的多聚蛋白形成成熟的结构蛋白和非结构蛋白来帮助病毒完成增殖过程。NS2B-NS3pro蛋白酶在黄病毒生命周期中起关键的作用,使之成为抗病毒药物研发的重要靶标。本文综述了黄病毒属中寨卡病毒、登革热病毒、西尼罗病毒的NS2B-NS3pro蛋白酶结构的研究进展,并介绍了相关抑制剂与蛋白酶形成的复合物结构,以期为研发抗黄病毒药物提供必要的参考。     

虫媒黄病毒亚基因组RNA

黄病毒是一大科人类致病性的单股正链RNA病毒。黄病毒包括登革病毒、西尼罗脑炎病毒及日本脑炎病毒等成员,主要径通过节肢动物的叮咬进行传播,即为虫媒黄病毒。研究发现,在虫媒黄病毒复制过程中,除病毒基因组正链RNA、互补的负链RNA及两者的杂合RNA分子外,在病毒感染细胞后还能产生一种病毒亚基因组RNA(subgenomic RNA,sgRNA)。近年对这种sgRNA展开了比较多的研究,结果表明,其产生机制与已知的其他病毒sgRNA产生机制并不相同。该sgRNA的产生与虫媒黄病毒基因组3’非编码区所形成的保守二级结构有关,同时宿主核酸酶对其的不完全降解亦有重要作用。虫媒黄病毒基因组3’非编码区中带有多个与病毒复制相关的RNA元件,而sgRNA的发现有助于全面地认识病毒RNA与宿主RNA代谢途径间的相互作用,为最终阐明病毒的致病机制奠定基础。     

猪瘟病毒兔化弱毒株cDNA片段的克隆及序列分析

猪瘟是猪最重要的传染病之一,往往给养猪业造成重大经济损失,猪瘟的病原为猪瘟病毒（ＨＣＶ）,属黄病毒科,瘟病毒属成员,其基因组为单股正链ＲＮＡ,长度为１２３ｋｂ,仅含有一个大的开放阅读框架,编码一个含３８９８个氨基酸残基（ＡＡ）的多聚前体蛋白［１,２］。目前已经定位的蛋白有５种,即Ｎｐｒｏ、Ｃ、Ｅ０、Ｅ１和Ｅ２,它们均由ＨＣＶＲＮＡ５′端所编码,除Ｎｐｒｏ外,其它４种均为ＨＣＶ的结构蛋白［３］。Ｎｐｒｏ为具有自我催化功能的蛋白水解酶,也是多聚蛋白Ｎ端的第一个蛋白水解酶,分子量为２３ｋＤ,Ｃ为构成…     

丙型肝炎病毒中国株非结构蛋白2~3部分基因cDNA克隆序列分析及表达

丙型肝炎病毒 (ＨｅｐａｔｉｔｉｓＣｖｉｒｕｓ,ＨＣＶ)是输血后和许多社区获得性非甲非乙肝炎的主要致病因子。ＨＣＶ为单股正链ＲＮＡ病毒 ,其基因组长约 9.5Ｋｂ ,编码区含一个大开放读码框架 ,编码 30 1 0 30 33氨基酸残基的多蛋白前体 ,经宿主蛋白酶和病毒蛋白酶加工成具有生物学功能的成熟蛋白。ＨＣＶ各区域的分布顺序是 :Ｃ Ｅ1 Ｅ2 ｐ7 ＮＳ2 ＮＳ3 ＮＳ4Ａ ＮＳ4Ｂ ＮＳ5Ａ ＮＳ5Ｂ[1] 。本文我们应用ＲＴ ＰＣＲ方法从ＨＣＶ患者血清中扩增编码病毒蛋白酶的非结构蛋白 (ＮＳ2 ＮＳ3)部分基因 ,对其核苷酸序列进行了分析 ,…     

双链RNA病毒的复制机制

本文对双链ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）病毒复制机制的研究进展进行了综述。根据ｄｓＲＮＡ病毒复制周期,分以下几方面对其复制的有关分子进行分析：转录、转录本释放和“满头”复制模型、（＋）ＲＮＡ转译、病毒包装、（－）ＲＮＡ合成等。此外,还简要分析了宿主基因及其产物在病毒复制中的作用。     

寨卡病毒NS1的结构研究进展及其应用

寨卡病毒感染与小头畸形和神经系统并发症紧密相关,甚至可能损伤男性生殖系统,引起了全球性的关注,研究其结构和致病机制以及开发有效的诊断治疗方法成为当务之急。寨卡病毒的非结构蛋白NS1是病毒与宿主相互作用的重要蛋白,在病毒复制、发病机制及免疫逃逸中起着关键作用。本文总结了寨卡病毒NS1的空间精细结构,并将其与其它黄病毒NS1进行比较。本文也分析了寨卡病毒基于NS1的致病机理,总结了NS1在疾病诊断中的应用。     

黄病毒属病毒E蛋白结构和功能研究进展

黄病毒属病毒是单股正链RNA病毒,病毒基因组编码至少三种结构蛋白(衣壳蛋白C、膜蛋白M和包膜蛋白E)和七种非结构蛋白。其中E蛋白是病毒的重要抗原成分,包含有中和抗原表位和型特异性抗原表位,决定了病毒的细胞嗜性和毒力,与病毒的吸附、穿入、致病等作用密切相关,并且具有血凝活性,能刺激机体产生中和抗体和血凝抑制抗体。研究E蛋白的结构与功能对于深入了解黄病毒致病机制和免疫应答特点,研发疫苗和特异性抗病毒药物均有重要的指导意义。为此,综述了近年来黄病毒E蛋白有关结构与功能的研究进展及其生物学意义。     

甜菜坏死黄脉病毒内蒙分离物自然缺失突变体缺失区域的定位分析

以甜菜坏死黄脉病毒内蒙分离物（ＢＮＹＶＶ ＮＭ）总ＲＮＡ为模板,经ＲＴ－ＰＣＲ扩增,分别获得ＲＮＡ２、ＲＮＡ３和ＲＮＡ４自然缺失突变体ｃＤＮＡ克隆。序列分析结果表明,ＲＮＡ２自然缺失突变体在７５ｋＤ通读蛋白编码区Ｃ端缺失３４８个核苷酸（缺失位置ｎｔ１４８８￣ｎｔ１８３５）。ＲＮＡ３在其２５ｋＤ蛋白编码区内缺失３６０个核苷酸（缺失位置ｎｔ７２９￣ｎｔ１０８８）。ＲＮＡ４的自然缺失区域位于３１ｋＤ蛋白