梨分子遗传图谱构建及生长性状的QTL分析

利用鸭梨和京白梨杂交得到的F1(145株)实生苗为作图群体,通过对AFLP和SSR两种分子标记的遗传连锁分析,应用Joinmap 3.0作图软件,368个AFLP标记、34个SSR标记构建了分属18个连锁群的梨分子遗传连锁图谱,各连锁群的LOD值在4.0～7.0范围之间,图谱总长度覆盖梨基因组1395.9cM,平均图距为3.8cM.采用区间作图法,对该群体与生长性状相关的调查数据进行QTL分析,检测到与新梢生长量、新梢茎粗、节间长度、节间数量、树干径、树高及皮孔密度7个农艺性状连锁的QTL位点35个,其中主效QTL位点11个(LOD≥3.5).与生长性状相关的农艺性状QTL位点多集中在LG16连锁群上.     

陆地棉遗传图谱构建与纤维品质性状QTL定位

以陆地棉(Gossypium hirsutum L.)品种Bar19/1和Acala1517-77杂交的108个F2单株为材料,应用85个标记(70个SSR标记和15个AFLP标记)构建了总长为814cM的遗传图谱,覆盖棉花基因组的18.3%。该图谱包含25个连锁群,分别对应到17条染色体和4个未知连锁群。应用复合区间作图法分析了该组合的108个F2单株和F3家系纤维品质性状,从遗传图谱上检测到19个纤维品质数量性状基因座(QTL),包括5个纤维长度、6个纤维比强度、4个伸长率及4个马克隆值QTL,分别解释各性状表型变异的15.11%~28.45%、8.46%~24.51%、11.08%~27.55%和9.23%~42.21%。纤维长度和伸长率的QTL以部分显性为主,少数具有超显性,比强度QTL以加性和部分显性为主,4个马克隆值QTL中有3个表现为超显性。研究结果表明,陆地棉Bar19/1和Acala1517-77间多态性位点丰富,有利于构建高密度遗传图谱,纤维品质性状的QTL分析从分子水平上揭示了纤维品质的遗传基础。     

豌豆遗传图谱构建及QTL定位研究进展

豌豆的许多性状是多基因控制的数量性状,QTL定位就是以分子标记技术为工具、以遗传连锁图谱为基础、利用分子标记与QTL之间的连锁关系确定控制数量性状的基因在基因组中的位置.本文对QTL定位原理、方法进行了简单介绍;对豌豆遗传图谱构建及主要性状,如产量、品质、抗病性等QTL定位、遗传效应分析等方面的研究进行综述;对目前基于QTL豌豆分子标记育种存在的问题、应用前景进行了探讨.     

甜瓜遗传图谱的构建及果实与种子QTL分析

以遗传性状差异较大的甜瓜材料日本安农二号与新疆哈密瓜K413杂交产生的143个F2单株为作图群体,以AFLP与SSR分子标记为主构建了包含12个连锁群、142个遗传标记位点的甜瓜遗传图谱,其中包括121个AFLP标记、16个SSR标记、3个STS标记、2个性状标记,连锁群总长度为1 014.2 cM。应用复合区间作图法对甜瓜果实的大小、长宽比、糖度、硬度以及甜瓜种子的长、宽、形状、重量等性状进行遗传定位与分析。基因定位结果显示控制果肉颜色的基因位于C9连锁群AFLP分子标记NDAA与NCFA之间。其他性状表现为数量性状控制,共检测到25个数量性状基因座,不同性状基因座位有重叠分布的特点。其中C5连锁群标记NCA-N73C区间检测到QTLs Sl5.1、Sw5.1和Swt5.1分别控制种子长、宽和千粒重,分别可解释表型变异的17%、19%和23%。该区域包含的来自母本安农二号的基因位点对甜瓜种子的长、宽、千粒重均有明显的抑制作用;位于C8连锁群标记N73A与NFDA间的QTL通过影响种子的宽度从而影响种子的形状与重量;同样位于C8连锁群的果实长宽比QTL Fs8.1在F2和F3中均检测到,分别解释表型变异的25%和19%,表现为部分显性,来自安农二号的等位基因抑制甜瓜果实伸长,生成圆形甜瓜;还发现控制甜瓜果实心糖、边糖、果实硬度的QTL各一个。     

大豆遗传图谱的构建和若干农艺性状的QTL定位分析

大豆许多重要农艺性状都是由微效多基因控制的数量性状,对这些数量性状进行QTL定位是大豆数量性状遗传研究领域的一个重要内容.本研究利用栽培大豆科新3号为父本、中黄20为母本杂交得到含192个单株的F2分离群体,构建了含122 个SSR标记、覆盖1719.6cM、由33个连锁群组成的连锁遗传图谱.利用复合区间作图法,对该群体的株高、主茎节数、单株粒重和蛋白质含量等农艺性状的调查数据进行QTL分析,共找到两个株高QTL,贡献率分别为9.15%和6.08%;两个主茎节数QTL,贡献率分别为10. 1%和8.6%;一个蛋白质含量QTL,贡献率为9.8%;一个单株粒重QTL,贡献率为11.4% .通过遗传作图共找到与所定位的4个农艺性状QTL连锁的6个SSR标记,这些标记可以应用于大豆种质资源的分子标记辅助选择,从而为大豆分子标记辅助育种提供理论依据.     

谷子SSR分子图谱的构建及主要农艺性状QTL定位

试验拟对谷子重要农艺性状进行数量性状位点QTL分析。以表型差异较大的沈3/晋谷20F2作图群体为材料,观测其株高、穗长等性状,选用SSR做分子标记,利用完备区间作图法(BASTEN C J)进行QTL分析。结果显示,表型数据在作图群体中呈现连续分布,表现为多基因控制的数量性状,被整合的54个SSR标记构建10个连锁群,LOD阈值设置为2.0,检测到与株高相关的主效QTL2个,联合贡献率45.9637%,穗长主效QTL1个,贡献率14.9647%,与穗重、粒重相关的主效QTL为同一位点,贡献率分别为11.9601%和10.1879%。有6组QTL位点之间存在基因互作效应,大小范围为-0.4986-16.6407,对性状的贡献率在2.2716％至6.7478％之间。谷子表型控制复杂,相关QTL的检测受环境影响较大,不同连锁群QTL间互作明显。     

茄子基因遗传定位和遗传图谱构建的研究进展

基因定位有助于了解基因的功能,而遗传图谱构建不仅可以对多种性状进行遗传分析,同时也是开展基因定位、分子标记辅助选择育种以及图位克隆的基础。该文就近几年茄子基因遗传定位和遗传图谱构建进行了总结,并讨论了所发现的问题,结合当今分子生物学的前沿技术,对今后我国茄子分子生物技术辅助育种的前景进行了展望。     

油菜分子标记图谱构建及抗菌核病性状的QTL定位

以油菜品种０８５（抗菌核病）与湘油１３号杂交得到的Ｆ２代作为作图群体,以ＲＡＰＤ标记来构建油菜连锁图谱。通过对３００个１０－ｍｅｒ随机引物的筛选,共获得２００个多态性ＲＡＰＤ位点。经Ｍａｐｍａｋｅｒ／ＥＸＰ３．０软件处理,构建了１张含１９３个标记位点、１９个连锁群、覆盖长度为１３２４ｃＭ的连锁图谱。在此基础上利用Ｍａｐｍａｋｅｒ／ＱＴＬ １．１将抗菌核病基因定位在第四、八和十四３个连锁群上,即：Ｓ     

玉米SSR遗传图谱的构建及产量性状基因定位

利用中国农大培育的高产,多抗性玉米杂交组合农大3138的F2：3家系为材料,构建了具有80对SSR标记的玉米遗传图谱,标记间平均距离25．42,覆盖玉米基因组的2033.4cm,采用随机区组田间设计,考察了230个家系的穗长,秃尖长,穗粗,穗行数,千粒重,穗重,单株粒重,利用区间作图法分析了影响各性状的数量性状基因座位（QTL）,共检测到30个QTLs,单个性状的QTLs为3－5个,QTLs解释变异量占总变异量的比例变化范围为9．5％－55．3％。     

甘蓝分子连锁图的构建与品质性状的QTL定位

以两个不同生态型甘蓝(Brassica oleracea var．capitata)品种杂交得到的F2代为作图群体,用RAPD标记构建甘蓝分子连锁图。通过对520个随机引物进行筛选,236个引物在两亲本间表现多态性,多态性比例为47．7％。选取111个引物对群体进行分析,构建了一张含有135个标记位点,9个连锁群,覆盖长度为1023．7cM的分子连锁图。利用该图谱对甘蓝叶球紧实度和中心柱长两性状进行了QTL定位分析。检测到3个与叶球紧实度相关的QTL,总贡献率为62．5％;检测到4个与中心柱长相关的QTL,总贡献率为59．1％。     

Genetic Linkage Map Construction and QTL Mapping of Salt Tolerance Traits in Zoysiagrass (Zoysia japonica)

Zoysiagrass (Zoysia Willd.) is an important warm season turfgrass that is grown in many parts of the world. Salt tolerance is an important trait in zoysiagrass breeding programs. In this study, a genetic linkage map was constructed using sequence-related amplified polymorphism markers and random amplified polymorphic DNA markers based on an F₁ population comprising 120 progeny derived from a cross between Zoysia japonica Z105 (salt-tolerant accession) and Z061 (salt-sensitive accession). The linkage map covered 1211 cM with an average marker distance of 5.0 cM and contained 24 linkage groups with 242 marker loci (217 sequence-related amplified polymorphism markers and 25 random amplified polymorphic DNA markers). Quantitative trait loci affecting the salt tolerance of zoysiagrass were identified using the constructed genetic linkage map. Two significant quantitative trait loci (qLF-1 and qLF-2) for leaf firing percentage were detected; qLF-1 at 36.3 cM on linkage group LG4 with a logarithm of odds value of 3.27, which explained 13.1% of the total variation of leaf firing and qLF-2 at 42.3 cM on LG5 with a logarithm of odds value of 2.88, which explained 29.7% of the total variation of leaf firing. A significant quantitative trait locus (qSCW-1) for reduced percentage of dry shoot clipping weight was detected at 44.1 cM on LG5 with a logarithm of odds value of 4.0, which explained 65.6% of the total variation. This study provides important information for further functional analysis of salt-tolerance genes in zoysiagrass. Molecular markers linked with quantitative trait loci for salt tolerance will be useful in zoysiagrass breeding programs using marker-assisted selection.     

Virus-induced Gene Silencing in Eggplant(Solanum melongena)

Eggplant(Solanum melongena)is an economically important vegetable requiring investigation into its various genomic functions.The current limitation in the investigation of genomic function in eggplant is the lack of effective tools available for conducting functional assays.Virus-induced gene silencing(VIGS)has played a critical role in the functional genetic analyses.In this paper,TRV-mediated VIGS was successfully elicited in eggplant.We first cloned the CDS sequence of PDS(PHYTOENE DESATURASE) in eggplant and then silenced the PDS gene.Photo-bleaching was shown on the newly-developed leaves four weeks after agroinoculation,indicating that VIGS can be used to silence genes in eggplant.To further illustrate the reliability of VIGS in eggplant,we selected Chl H,Su and CLA1 as reporters to elicit VIGS using the high-pressure spray method.Suppression of Chl H and Su led to yellow leaves,while the depletion of CLA1 resulted in albino.In conclusion,four genes,PDS,Chl H,Su(Sulfur),CLA1,were down-regulated significantly by VIGS,indicating that the VIGS system can be successfully applied in eggplant and is a reliable tool for the study of gene function.     

茄子种质遗传多样性及群体结构的SRAP分析

采用SRAP标记法对183份茄子(Solanum melongena)种质资源的遗传关系和群体结构进行分析。结果表明, 33对多态性SRAP引物组合共扩增出215条清晰稳定的多态性条带, 平均每对引物组合产生7条多态性条带。183份茄子种质的遗传相似系数介于0.276-0.813之间, 平均值为0.623, 表明茄子种质资源间遗传背景存在一定的差异。在遗传距离为0.345 6处可将183份茄子种质分为4组。通过群体结构分析可将种质划分为4个群体, 不同群体间的界限十分明显, 且群体间的基因渗透较高。     

Anthocyanase and Anthocyanins Occurring in Eggplant,Solanum melongena L. (I)

Anthocyanins present in eggplant were decolorized by anthocyanase from flesh of eggplant. The anthocyanins consisted of at least three different anthocyanins containing delphinidin as common aglycone, and that a main component of those was nasunin, delphinidin-3-diglucoside acylated with p-coumaric acid.

Using the anthocyanin as substrate, the anthocyanase action was optimal at pH 6.0 and 35^°C, and was inhibited by potassium cyanide, thiourea, and sodium chloride. The data obtained so far show that anthocyanase acts on the following anthocyanidin derivatives in order of increasing rate of decolorization; pelargonidin-=peonidin-<cyanidin-<delphinidin-<delphinidin-glucoside acylated with p-coumaric acid.     

茄子品种遗传多样性的RAPD检测与聚类分析

用RAPD分子标记的方法对来自不同国家的34份茄子品种进行遗传多样性分析,从120条RAPD引物中筛选出有效的22条引物分别对34份茄子品种进行扩增,共检测出232个等位基因位点,每条引物平均检测出10.5个,其中192个为多态位点,多态位点比率为82.76%。POPGENE结果分析表明,Nei's基因多样性H为0.2756,Shannon指数为0.4145,显示出丰富的遗传多样性。计算得出的Jaccard相似系数变化范围为0.331～0.805,根据Jaccard相似系数和组内连接法建立的系统聚类图,34份茄子大致可分为两大类型:圆茄类型和长茄类型,这与经典的形态学分类基本上相符,从而从分子水平上支持了以果形作为茄子品种分类指标的观点。     

Structural Characterization and Expression Analysis of SmCSD1 Gene in Eggplant (Solanum melongena)

Russian Journal of Plant Physiology - Superoxide dismutases (SODs) are crucial for plants for stress tolerance. They convert the superoxide anion into oxygen and hydrogen peroxide, providing the...     

茄子子叶和下胚轴的组织培养和植株再生

以4种茄子品种——六叶茄、七叶茄、九叶茄和长茄的子叶和下胚轴为外植体,探讨了不同生长调节物质对外植体分化的影响和不同品种、不同外植体以及外植体不同苗龄的分化能力差异。观察到外植体分化呈极性,并建立了4个品种茄子下胚轴的高效再生体系。