东北虎微卫星DNA遗传标记的筛选及在亲子鉴定中的应用

利用18个家猫微卫星基因座,在东北虎(Panthera tigris sibilia)DNA中扩增结果有4个基因座没有产物,8个基因座为单态,6个基因座为多态性。同时利用苏门答腊虎的微卫星序列设计了8对引物,在东北虎DNA中有4对具有多态性。微卫星基因座的多态性百分率为38．5％。在供试的27只东北虎中,发现等位基因间的变异均为偶数碱基长度变化,对有准确谱系记录的个体研究表明,这10个微卫星DNA遗传标记符合孟德尔遗传规律,所以这些微卫星DNA可以有效的应用于东北虎的亲子鉴定。利用这10对多态性引物,我们成功地鉴定了7个父子关系不清的后代。收集的样品包括23只毛发样品和4只血液样品,实验结果表明,毛发和血液样品均可以得到清晰的微卫星条带[动物学报49(1)：118—123．2003]。     

DNA条形码在膜翅目昆虫中的应用分析

DNA条形码的提出,实现了分类学的一次质的飞跃,简便、快捷以及精确的优点使其被广泛应用在物种的分类工作中。膜翅目为昆虫纲的第3大目,其物种具有高度的多样性,种类鉴定工作复杂艰巨。DNA条形码在膜翅目中得到广泛应用。本文针对DNA条形码在膜翅目昆虫的物种分类鉴定、物种发现和隐存种、食物网与生物多样性等方面研究情况予以综述。     

DNA条形码及其在生物多样性研究中的应用

DNA条形码是利用生物体内标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段对物种进行快速准确鉴定的技术。自2003年DNA条形码相关概念提出以来广受关注,国内外相继开展了DNA条形码及信息系统建设研究,为DNA条形码技术的发展提供了坚实的研究基础和生物信息学分析平台。DNA条形码技术弥补了传统分类学的不足,为生物多样性研究提供了新的思路和方法。本文介绍了DNA条形码的产生与发展过程,国内外DNA条形码技术与信息系统建设研究进展,重点阐述了DNA条形码技术在物种鉴定、濒危物种保护、隐存种发现、生物多样性评估等研究领域中的应用。最后结合DNA条形码技术目前存在的问题,对其在相关研究领域的应用前景进行了展望。     

DNA鉴定技术在法科学中的应用

人类基因组遗传多态现象研究的深入,导致了法科学领域个体识别和亲权鉴定发生根本性变化。本就新的遗传标记和各种DNA鉴定技术在法科学中的研究进展,应用前景与亟待解决的问题进行了探讨。     

DNA条形码技术在物种识别与产品鉴定中的应用

DNA条形码技术作为一种有效的物种鉴定和产品寻址溯源的分子生物学方法,其高特异性的溯源能力在动植物及微生物的快速鉴定、近缘性物种识别方面的应用正趋向成熟。条形码技术为食品、药品等相关产品的掺假鉴定以及合成产品的示踪溯源提供了一种有效的鉴定手段。现有的DNA条形码技术包括常规条形码、迷你条形码、超级条形码以及封装条形码。综述DNA条形码技术在物种识别与产品鉴定中的应用,比较不同条形码技术的应用范围和技术特点,为选择适合的DNA条形码作为产品标签和识别工具提供有价值的思路。     

DNA技术在海洋食品物种鉴定中的应用

随着分子生物学技术的发展, 海洋食品物种鉴定方法由原来的蛋白质水平深入到了DNA水平。目前应用于海洋食品物种鉴定的DNA技术主要是FINS(Forensically informative nucleotide sequencing)、PCR-RFLP和物种特异性PCR标记技术等, 能够实现对新鲜、冰冻、腌制或灌装食品物种进行鉴定, 而对混合样本的鉴定及量化分析是尚待解决的一个问题。基因数据库对物种鉴定的影响也越来越大, 是海洋加工食品物种鉴定可利用的另一种重要信息资源。文章综述了DNA技术在海洋食品物种鉴定中的应用研究进展, 并展望DNA技术在海洋食品检测中的发展趋势。     

DNA条形码技术在常见水生动物分类中的应用

DNA条形码(DNA barcoding)技术是逐渐发展起来的新兴分子技术,它通过利用生物体内一段特异的DNA序列快速而精确进行物种识别。DNA条形码技术不仅可以用于物种的鉴定和分类,同时也帮助生物学家深入了解物种之间的亲缘关系以及生态系统内的相互作用,提供了一种迅速而有效的分类学方法来细化分类学上现存的标准,因而成为分类学领域的前沿技术。本文概述了DNA条形码技术在部分水生物种中的广泛应用以及对未来的展望。     

环境DNA技术在鱼类生态学中的应用研究进展

全球渔业衰退是21世纪人类面临的重要挑战之一。为了有效地遏制鱼类资源的衰退,精确的鱼类生态调查是其首要任务。传统的鱼类监测以渔获物采集与形态学鉴定为主,往往耗时耗力且效果不佳,已无法满足现阶段大尺度上的精确调查。环境DNA （eDNA）技术作为一种近年来新兴的鱼类生态调查方法,其与传统方法相比具有灵敏度高、经济高效、采样受限小且对生态系统无干扰的优势,目前其已被广泛地应用于鱼类物种监测、多样性调查、生物量评估以及繁殖活动监测等方面的研究。然而,eDNA技术在鱼类生态学研究的具体应用中暴露出的一些问题将会影响其监测结果的精确性,诸如操作流程的不规范、基因数据库的不完善以及eDNA在环境中生态学过程的不明确等。鉴于上述原因,首先对eDNA技术的发展历程、分析流程以及eDNA技术在鱼类生态学研究领域中的研究进展进行了综述,而后着重分析了eDNA技术的发展当前所面临的困难与挑战,并提出了相应的解决方案,最后对eDNA技术未来在鱼类生态学研究领域中的发展趋势做出了展望。通过本研究,以期能够为eDNA技术在鱼类生态学领域中的准确应用提供理论基础。     

微卫星DNA标记技术及其在遗传多样性研究中的应用

微卫星DNA的高突变率、中性、共湿性及其在真核基因组中的普遍性,使其成为居群遗传学研究、种质资源鉴定、亲缘关系分析和图谱构建的优越的分子标记。本研究系统介绍了微卫星DNA在结构和功能上的特点,并对微卫星DNA标记技术应用的遗传学机理和一般方法进行了扼要的阐述。另外,本研究还探讨了微卫星DNA标记技术在遗传多样性研究中的应用现状,并进一步提出其发展前景。     

Genotyping success of historical Eurasian lynx (Lynx lynx L.) samples

Historical samples, like tanned hides and trophy skulls, can be extremely important for genetic studies of endangered or elusive species. Selection of a sampling protocol that is likely to provide sufficient amount and quality of DNA with a minimum damage to the original specimen is often critical for a success of the study. We investigated microsatellite genotyping success of DNA isolated from three different types of Eurasian lynx historical samples. We analysed a total of 20 microsatellite loci in 106 historical samples from the endangered Dinaric lynx population, established from re-introduction of three pairs of lynx in 1973 from Slovakian Carpathians. Of the three tested sample types, turbinal bone and septum from the nasal cavity of the trophy skulls had the lowest percentage of samples successfully genotyped for all 20 microsatellite loci. Footpad samples, collected using a cork drill, exhibited better results in polymerase chain reaction amplification and genotyping than samples of footpad epidermis cut with a scalpel. We report simple and efficient sampling protocols, which could be widely applied for future studies utilizing historical samples.     

Use of oligonucleotide fingerprinting and faecal DNA in identifying the distribution of the Chinese tiger (Panthera tigris amoyensis Hilzheimer)

Chinese tiger (Panthera tigris amoyensis Hilzheimer) was once distributed in the Zhejiang Province, China, but there have not been any tiger sightings in this province since 1985. Fortunately, within the boundaries of the Fengyangshan-baishanzu State Natural Reserve, gamekeepers have found tiger footprints and tiger faeces many times since 1998. However, these tracks may have been left by the leopard or clouded leopard, which leave similar tracks. The presence of the Chinese tiger in Zhejiang Province was demonstrated using DNA fingerprinting and faecal DNA. The study not only revealed a new habitat for Chinese tigers, Zhejiang Province, but also provided an effective scatology method to identify the distribution of tigers and other wild felines.     

分子生物学方法在鲸类学研究中的应用

80年代以来,随着分子生物学的迅猛发展,涌现出一批分子进化和种群遗传分析方法和技术。     

同胞侵犯对猞猁幼仔行为的影响

研究了非自由生活的4窝11只猞猁幼仔的玩耍行为、亲和及入侵关系的变化.观察到36-57日龄幼仔的同胞打斗行为,这些打斗减少了这些幼仔之间游戏性接触的频次.这个"打斗期"与游戏行为和食性的变化同步发生.打斗后,幼仔游戏性接触的非对称性以及同胞之间的偏爱更加清楚.这些打斗导致了不同窝的幼仔之间等级结构的建立.     

草地植物群落物种多样性取样强度的研究

本文以羊草(Leymus chinensis)-杂类草群落和贝加尔针茅(Stipa baicalensis)-线叶菊(Filifolium sibiricum)群落为代表,在东北松嫩平原研究了草地植物群落物种多样性的取样强度。巢式样方种-面积曲线结果表明：两个群落的最小面积均为1/4～1/2 m²。 Pielou积累样方多样性指数-取样数曲线结果表明：羊草-杂类草群落1、1/4、1/6 m²正方形样方最小取样数分别在12、22、28个左右; 贝加尔针茅-线叶菊群落分别在10、18、25个左右。群落水平结构的复杂性导致取样数目的增加。当积累样方数超过最小取样数后,多样性指数-取样数曲线进入平衡状态,上述3种取样面积的结果趋于一致,并在概率95%水平差异不显著。赞成小面积大数目的取样策略。     

Rhinanthus plants found in calcareous fens on Gotland (Sweden): Are they related to Rhinanthus osiliensis from Saaremaa (Estonia)?

Rhinanthus osiliensis is a narrow endemic growing in calcareous spring fens on the island Saaremaa, Estonia. Plants very similar to R. osiliensis have been found in Sweden on the island of Gotland. Fifteen microsatellite markers were used to characterize genetic variation within R. osiliensis and the unknown taxon from Gotland. Results were compared with common Rhinanthus minor and Rhinanthus angstifolius. Our results showed that genetic diversity was remarkably lower in the Rhinanthus sp. from Gotland compared to Estonian endemic R. osiliensis. The microsatellite loci we used distinguished four studied species. In total, 46 species-specific alleles were found. The Neighbor-Joining dendrogram based on Nei's genetic distances, the Bayesian clustering analysis and the principle coordinate analysis showed that R. osiliensis and Rhinanthus sp. from Gotland are genetically differentiated and could not be the same species. In addition, endemic R. osiliensis was closer to widespread R. angustifolius. Further genetic comparison between unknown Rhinanthus sp. and local R. angustifolius and R. minor from Gotland is necessary for determine the species status and checking the possible alternative hypothesis about the origin of the unclear taxon.