REGULAR ARTICLES

Marginalized Models for Moderate to Long Series of Longitudinal Binary Response Data
Les modèles marginalisés (Heagerty, 1999) permettent l'inférence basée sur la vraisemblance lorsqu'on s'intéresse à des modèles marginaux de régression pour des données longitudinales binaires. Deux modèles de ce type sont le modèle de transition marginalisée, et le modèle à variable latente marginalisée. Le premier reflète la dépendance sérielle intra-sujet au sein des mesures répétées avec des termes de transition dans le modèle, tandis que le deuxième suppose l'échangeabilité ou la non-décroissance de la dépendance de la réponse avec des intercepts aléatoires. Dans cet article, nous étendons la classe des modèles marginalisés en proposant un modèle simple unifié décrivant à la fois la dépendance sérielle et la dépendance au long terme. Ce modèle est particulièrement utile dans des analyses longitudinales avec un nombre de mesures répétées par sujet modéré ou large, où aussi bien les formes sérielles et échangeables de la corrélation de la réponse peuvent être identifiées. Nous décrivons des approches bayésiennes et au maximum de vraisemblance pour l'estimation des paramètres et pour l'inférence, et nous étudions les caractéristiques opérationnelles pour de grands échantillons, sous deux types de mauvaise spécification du modèle de dépendance. On analyse les données de l'étude longitudinale de schizophrénie de Madras (Thara, 1994).     

Knowledge and discipline – knowledge as discipline: aspects of the oral history of Irish sexuality

This article examines the recent history of sexual morality in rural Ireland. My thesis is that this history can be defined as a process of structural change in which a normative model has been replaced by a cognitive model. Both models give rise to disciplinary systems but, I argue, they differ from each other in their respective objects: whereas a normative model has the body as its immediate object of discipline, in the cognitive model body discipline is mediated through the individual's self. Since the normative model is grounded in religious values, I consider that this transition can be also interpreted as an instance of the process of secularization.  

Résumé

L'auteur examine l'histoire récente de la moralité sexuelle dans l'Irlande rurale. Sa thèse est que cette histoire peut être définie comme un processus de changement structurel dans lequel un modèle normatif a été remplacé par un modèle cognitif. Les deux modèles donnent tous deux naissance à des systèmes disciplinaires mais, de l'avis de l'auteur, ceux-ci n'ont pas le même objet : alors que le modèle normatif définit le corps comme objet immédiat de la discipline, la discipline corporelle dans le modèle cognitif est médiée par le Soi de l'individu. Dans la mesure où le modèle normatif est ancré dans les valeurs religieuses, l'auteur considère que cette transition peut aussi être interprétée comme une manifestation du processus de sécularisation.     

The distribution and abundance of Cubiterrnes sankuvensis (Wassmann) (Isoptera; Termitidae) within a Miombo woodland site in Zimbabwe

The distribution of apogeal mounds of the humus feeding termite Cubitermes sankurensis (Wassmann) was studied in relation to small-scale variation in vegetation pattern on three permanent transects within a 5 ha stand of miombo woodland. The composition of vegetation did not have a significant effect on the abundance of C. sankurensis . There was an effect of habitat structure on mound distribution with increased aggregation in areas of open canopy. Factors such as colonization potential and the history of termite activity may be more important in determining the distribution of mounds than the heterogeneity of the vegetation.

Résumé

La distribution des termitieres épigées du termite mangeur d'humus Cubitermes sankurensis (Wassmann) a étéétudiée en rélation avec les variations à petite échelle du type de végétation dans 3 transects permanents d'une station de 5 ha dans une forêt de type Miombo. La composition de la végétation n'a pas d'effet significatif sur I'abondance de C. sankurensis . La structure de I'habitat a un effet sur la distribution des termitières, plus abondantes la où la canopée est éclaircir.
Des facteurs tels que le potentiel de colonisation et l'historique de l'activité des termites peuvent être plus importants pour dkterminer la distribution des termitières que I'hétérogénéité de la végétation.     

REGULAR ARTICLES

Marginal Analysis of Correlated Failure Time Data with Informative Cluster Sizes
Nous nous intéressons à la modélisation de données de survie corrélées quand la connaissance de la taille des strates peut fournir une information sur le critère de jugement. Celle-ci est basée sur une approche de ré-échantillonnage au sein des strates et sur une méthode de fonction de score pondérée. Nous déterminons les propriétés asymptotiques pour les estimateurs de ré-échantillonnage au sein des strates dans le cadre d'un modèle à risques proportionnel de Cox. Nous établissons la convergence et la normalité asymptotique des estimateurs des coefficients de régression et la propriété de convergence faible des estimateurs de la fonction de base du risque cumulé. La méthode de fonction du score pondérée consiste à prendre l'inverse de la taille des strates comme poids dans la fonction de score. Nous procédons à des études de simulations pour déterminer et comparer le comportement des estimateurs pour des échantillons finis et appliquons les méthodes proposées à une étude dentaire.     

Detritus and energy consumption and conversion efficiency of Sarotherodon melanotheron (Cichlidae) in a West African lagoon

The growth, standing stocks and production of tilapia Sarotherodon melanotheron (Cichlidae) in the 1 km² Sakumo Lagoon near Tema, Ghana, are estimated by application of recently developed models to previously published data. The new estimates are used to obtain values of food (i.e. sediment) consumption, some related statistics, and to assess bioturbation as caused by S. melanotheron.

Zusammenfassung

Detritus, Energieverbrauch und Konversionseffizienz von Sarotherodon melanotheron (Cichlidae) in einer westafrikanischen Lagune
Das Wachstum, die Biomasse und die Produktion von Tilapia Sarotherodon melanotheron (Cichlidae) in der 1 km² Sakumo Lagune bei Tema, Ghana, wurden bestimmt auf der Basis von neueren Modellen und bereits veröffentlichten Daten. Die neuen Modellparameter werden benutzt, um die Nahrungs-, d. h. Sedimentkonsumption und verwandte Größen zu bestimmen, und um die Bioturbation zu schätzen, die S. melanotheron verursacht.

Résumé

Détritus, dépense d'énergie et efficience de la conversion de Sarotherodon melanotheron (cichlidés) dans une lagune en Afrique de l'ouest
La croissance, la biomasse et la production du tilapia Sarotherodon melanotheron (Cichlidés) ont été estimées pour le stock de la lagune de Sakumo (1 km²), près de Tema, Ghana, en utilisant des modèles recents et des données déjà publiées. Les nouvelles valeurs sont utilisées pour l'estimation de la consommation en nour re (= sediment) ainsi que quelques autres charactéristiques de S. melanotheron , et pour estimer le taux de bioturbation qui résulte de ses activités.     

READER REACTION

Quantifying the Effect of the Surrogate Marker by Information Gain
La validation statistique d'un marqueur de substitution a étéétudiée depuis plus de dix ans. Récemment, Alonso et al. ( 2004 , Biometrics, 60 : 724–728) ont proposé une quantité appelée le facteur de réduction de vraisemblance (LRF) pour évaluer la validité d'un marqueur de substitution. Cependant, comme nous le montrons dans le présent article, le LRF peut ne pas valider correctement un marqueur de substitution. C'est pourquoi nous proposons une nouvelle grandeur, la proportion de gain d'information (PIG) qui utilise l'information de Kullback-Leibler. Des simulations montrent que sous certaines hypothèses de modélisation, le PIG reflète précisément le rôle d'un marqueur de substitution.     

Hot air and the Colonialist 'Other': the 'German-English-Dutch Airship Expedition' to New Guinea

Il est largement admis en anthropologie que les images de «l'Autre>> exotique font partie de la «technologie intellectuelle>> grâce à laquelle le colonialisme a étendu et maintenu son contrôle sur les frontières impériales. Faute d'analyse, toutefois, un autre type d'Autre se languit encore en anthropologie : le Colon à demeure. Dans les narrations analytiques standard, cette figure et le milieu dans lequel elle agit sont encore dépeints en termes radicalement uniformisés. En réalité, le colonialiste maison était un agent complexe, obligé de naviguer et de négocier entre plusieurs conjonctures culturelles et sociales dans le cadre du développement de projets coloniaux appelés àêtre exportés au loin. Dans le présent article, les auteurs cherchent à mettre en lumière l'Autre colonisateur et sa place dans le colonialisme en s'intéressant à la destinée de l' oberleutnant Paul Graztz, «héros>> colonial allemand de la fin du XIX^e siècle, et à sa tentative (vouée à l'échec) d'expédition topographique en Nouvelle-Guinée dans un aéronef «à air chaud>>.     

IBS 60th ANNIVERSARY LECTURE

The Pedigree of the International Biometric Society
Pour le 60^ème anniversaire de la Société Internationale de Biométrie, nous proposons un regard en arrière sur la vision de la Biométrie posée par son premier Président, R. A. Fisher, à partir de notes prises dans un cours qu'il a donné en 1935-36.     

READER REACTION

On the Nonidentifiability of Population Sizes
Lorsqu'un modèle de mélange non paramétrique est utilisé pour prendre en compte l'hétérogénéité des probabilités de capture entre individus, la taille de la population n'est pas identifiable (Link 2003). Holzmann et al. (2006) ont discuté des conditions sous lesquelles une sous-famille de distribution de mélange est identifiable. Link (2006) a montré que la non-identifiabilité peut se produire dans des sous-familles identifiables. Je démontre qu'il existe une sous-famille dans laquelle chaque distribution de mélange est déterminée par son mélange et que la taille de la population admet une limite inférieure qui peut être utilisée pour construire un intervalle de confiance.     

Epizootics in brown trout (Salmo trutta fario) caused by VHSV-F1

Epizootics in brown trout have been observed in the course of the last three years in a fish farm in the North West of the Fed. Rep. Germany. Only in 1988 sick fish exhibited the typical pathological signs as described for the viral hemorrhagic septicemia of trout. The virus isolated from moribund and healthy looking brown trout was identified as VHSV strain F1.

Zusammenfassung

VHSV-F ₁ bedingte Fischsterhen hei Bachforellen (Salmo trutta fario)
Fischsterben während der letzten drei Jahre bei unter teichwirtschaftlichen Bedingungen produzierten Bachforellen, wurden in einem Forellenzuchtbetrieb im Nord-Westen der Bundesrepublik Deutsch-land beobachtet. Während der ersten zwei Jahre (1986/1987) zeigten die Fische keine eindeutigen klinischen Symptome und waren virologisch und bakteriologisch negativ; 1988 zeigten die erkrankten Fische pathologisch anatomische Anzeichen, wie sie für die virale hämorrhagische Septikämie beschrieben worden sind. Das von kranken sowie von gesundaussehenden Bachforellen isolierte Virus wurde als VHSV-F1 identifiziert.

Résumé

Epizooties causées par VHSV-F1 chez la truìte de rivière (Salmo trutta fario)
Des épizooties ont été observées au cours des trois dernières années chez la truite de rivière dans une aquaculture dans le nord-ouest de la R.F.A. C'est seulement en 1988 que les poissons montraient les signes pathologiques typiques décrits pour la septicémic hémorragique virale de la truite de rivière. Le virus isolé chez des truites moribondes et apparemment saines a été identifié comme étant VHSV, souche F1.     

The influence of man-made fires on large wild herbivores in Lake Burungi area in northern Tanzania

The effect of fire on the distribution of large wild herbivores during the late dry season was studied in northern Tanzania during October 1987. All species were attracted to burnt-over areas with 1–10 cm regrowth of grass. Recently burnt areas with no regrowth and areas not burnt during the dry season were avoided.
By the end of the dry season the study area was left as a fire mosaic, with different areas burnt at different times during the dry season. Thirty two percent was unburnt. The fires were mainly man-made but for purposes other than wildlife management. Such a fire mosaic has a positive effect on the larger herbivores by supplying protein-rich food during the dry season.

Résumé

On a étudié en octobre 1987, durant la deuxième saison sèche l'effet du feu sur la distribution de grands herbivores dans le nord de la Tanzanie.
Toutes les espèces sont attirées par les surfaces brûlées où les repousses sont de 1 à 10 cm. Les surfaces sans repousses et les zones non brúéees sont évitées. A la fin de la saison sèche, la zone étudiée ressemblait à une mosaïque due au feu, avec des endroits brûlés a des moments différents durant la saison sèche. Trente-deux pour-cents n'avaient pas brûlé. La plupart des feux avaient été allumes par l'homme, mais dans d'autres buts que la gestion de la faune. Une telle mosaïque a un effet positif sur les grands herbivores car elle fournit un complément de nourriture riche en protéines au cours de la saison sèche.     

Economies of affect

Cet article développe le concept des «économies de l'affect>> pour attirer l'attention des anthropologues sur le rôle de l'affect dans la facilitation des transformations économiques. Il s'appuie sur les résultats de deux projets de terrain ethnographiques, l'un au Mexique et l'autre en Indonésie, pour montrer comment l'affect a été mobilisé pour créer des sujets pouvant être appréhendés selon les normes néolibérales. Les auteurs montrent comment l'étreinte, les pleurs et les discours sur l'amour et le chagrin ont été associés à des transformations impliquant la cessation de prestations de l'État et l'application des lois du marché. En faisant de l'affect et de son articulation avec le changement économique un objet d'étude anthropologique, l'article affirme l'utilité d'une notion d'affect se démarquant d'autres approches qui mettent l'accent sur l'émotion. Les auteurs affirment que l'affect est utile parce qu'il est, par nature, réflexif et intersubjectif. L'affect renvoie aux relations pratiquées entre les individus, à la différence de l'émotion, toujours marquée par le spectre d'un individualisme psychologique.     

The Virgin of Guadalupe: a nexus of affect

Par le biais d'une analyse des célébrations actuelles de la Vierge de Guadalupe à Rome, l'auteure discute de la manière dont la Vierge fait écho aux inquiétudes pour «la patrie et la foi>> ( patria y fe ) ainsi que sur la mobilisation de la foi catholique en réaction aux sécularisme. Les célébrations performatives de la Vierge révèlent une unité fantasmatique de la nation et de la famille par le biais de l'affect et de tensions raciales subtiles au sein, d'une part, de la migration transnationale religieuse liée à la politique diocésaine et missionnaire, et d'autre part à la diffusion à l'étranger de narrations culturelles et indigènes d'une identité mexicaine. En s'intéressant aux traces de la guerre des Cristeros au Mexique (1926-1929), remises en récit sous un angle affectif dans la Rome du XXI^e siècle, l'auteure affirme que la célébration de la Vierge de Guadalupe ne manifeste pas une religiosité liée au retour des dépossédés et à un symbole de libération (comme cela semble faire être le cas à la frontière entre le Mexique et les États-Unis) mais elle devient plutôt, dans ce contexte, un point de fusion des affects qui signale la montée en puissance d'une Église catholique transnationale empreinte d'orthodoxie ultramontaine.     

BIOMETRIC METHODOLOGY

Matching in Studies of Classification Accuracy: Implications for Analysis, Efficiency, and Assessment of Incremental Value
Dans les études cas-témoins qui visent àévaluer une classification effectuée à partir d'un marqueur, il est courant d'apparier les témoins aux cas sur des facteurs liés à la maladie et au marqueur. Dans ce type d'études, par opposition aux études étiologiques, l'appariement n'a pas fait l'objet de travaux rigoureux. Nous étudions les implications de l'appariement sur le choix d'un modèle d'analyse statistique, sur l'efficacité et sur l'évaluation de l'apport supplémentaire du marqueur par rapport aux variables d'appariement. Nous observons que l'ajustement sur les variables d'appariement est essentiel car les mesures non ajustées des qualités du marqueur peuvent être biaisées. Dans de nombreuses situations, l'appariement est la plus efficace des méthodes d'échantillonnage en fonction des covariables et nous donnons une expression du rapport optimal nombre de cas/nombre de témoins. En revanche, nous montrons également que l'appariement complique sérieusement l'évaluation de l'apport supplémentaire du marqueur. Nous recommandons d'envisager l'intérêt d'un appariement à la lumière de ces résultats.     

Rights violations, rumour, and rhetoric: making sense of cannibalism in Mambasa, Ituri (Democratic Republic of Congo)

In January 2003, in the midst of civil war, Mbuti pygmies from Mambasa, Ituri, informed human rights organizations and the media that relatives had been killed, cooked, and eaten by soldiers of the Mouvement pour la Libération du Congo (MLC). Nearly two years later, spectacularly, the accusers withdrew their testimonies. This article tries to make sense of the allegation and subsequent retraction by reviewing how the Congolese print media covered the story. Against the backdrop of turbulent politics and moral crisis, it is argued that 'Cannibalism in Mambasa' needs to be understood first and foremost as a politically driven metaphor of extreme violence and suffering, even though acts of cannibalism cannot be ruled out.  

Résumé

En janvier 2003, en pleine guerre civile dans l'Ituri, des Pygmées Mbuti de Mambasa informèrent les organisations humanitaires et les médias que des membres de leur tribu avaient été tués, cuits et dévorés par les soldats du Mouvement pour la Libération du Congo (MLC). Deux ans plus tard, les accusateurs se rétractaient spectaculairement. Le présent article tente de donner un sens à ces accusations puis aux rétractations, à travers la couverture de cette affaire par la presse congolaise. L'auteur affirme que dans ce contexte de grave crise politique et morale, le « cannibalisme à Mambasa >> doit être d'abord, et avant tout, compris comme une métaphore politique de violence et de souffrance extrêmes, bien que l'on ne puisse pas exclure la possibilité que des actes de cannibalisme aient bien été commis.     

Etude Ultrastructurale de la Sporulation de Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n., Parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas)

RESUME. L'individualisation de 2 spores bicellulaires à partir d'un měme pansporoblaste caractérise la sporulation du parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas) précédemment décrit sous le nom de Marteilia sp. Cette sporulation le distingue des espèces du měme genre parasite d'Hutres qui sont toutes caractérisées par la production de spores tricellulaires. Les conditions semblables dans lesquelles les pansporoblastes paraissent se differencier à partir d'une cellule souche dans laquelle ils poursuivent leur évolution vers la sporogenèse ainsi que divers caractères cytologiques communs, nous incitent à maintenir tous ces parasites dans une měme famille mais à placer celui de l'Amphipode dans un genre différent. Nous proposons de le nommer Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n.
Ces parasites ne peuvent ětre maintenus dans les Protozoaires en raison de leur évolution vers la pluricellularité et de l'individualisation de ces éléments somatiques que représentent la cellule souche primaire, les pansporoblastes et cellules sporales (à l'exception des sporoplasmes). Il semble logique de les inclure dans l'embranchement des Myxozoaires créé par Grassé pour les Myxosporidies et Actinomyxidies qui différencient également des spores pluricellulaires et des éléments somatiques. Les centrioles à 9 singlets de P. orchestiae ainsi que les cellules primaires uninucléées, quel que soit le nombre de pansporoblastes qu'elles contiennent, peuvent ětre considérés comme des caractères résiduels d'Unicellulaires.     

CONSULTANT'S FORUM

The DNA Database Search Controversy Revisited: Bridging the Bayesian--Frequentist Gap
Deux quantités différentes ont été proposées pour mesurer l'évidence dans les cas où un suspect est identifiéà partir d'une base de données de profils ADN. Le rapport de vraisemblance, habituellement développé dans le cadre bayésien, est préféré par de nombreux experts du domaine. La règle dite np a été suggérée sur des arguments fréquentistes par l'American National Research council (NRC) et Stockmarr (1999). Ces deux quantités différent considérablement et sont à la source d'une controverse sérieuse sur l'utilisation des bases d'ADN. Bien que plusieurs auteurs aient critiqué ces différentes approches, une explication claire sur le pourquoi de ces différences observées n'a jamais été proposée. Dans cet article, nous montrons que le degré de signification P dans un contexte fréquentiste est approximativement égal au résultat de la règle np . Nous soutenons cependant qu'une procédure plus raisonnable consiste à utiliser une stratégie de test conditionnel qui génère un P directement lié aux probabilités a posteriori ainsi qu'un rapport de vraisemblance. Cette façon d'aborder le problème construit un pont entre les approches bayésienne et fréquentiste et indique également que la règle np ne doit pas être utilisée pour quantifier l'évidence.     

Being good in Ramadan: ambivalence, fragmentation, and the moral self in the lives of young Egyptians

So much has been written in recent years on Muslims who consciously and consistently aim to be pious, moral, and disciplined that the vast majority of Muslims who – like most of humankind – are sometimes but not always pious, at times immoral, and often undisciplined have remained in the shadow of an image of Islam as a perfectionist project of self-discipline. Taking the month of Ramadan, as a time of exceptional piety, as a starting-point, this paper tries to account for the different views and experiences that young people of Muslim faith in a northern Egyptian village articulate, the models of action and subjectivity they have access to, and the contradictory outcomes that the Islamic revivalist ideal of perfection has for some of them.  

Résumé

Il a tellement été question, ces dernières années, de musulmans consciemment et constamment soucieux d'être pieux, moraux et disciplinés que la grande majorité des musulmans, qui sont parfois pieux mais pas toujours, parfois immoraux et souvent indisciplinés, comme le reste de l'humanité, est restée dans l'ombre de cette image de l'islam comme projet d'autodiscipline perfectionniste. En prenant pour point de départ le Ramadan, période de piété particulière, l'auteur tente de rendre compte de différents points de vue exprimés par les jeunes musulmans d'un village du Nord de l'Égypte, des modèle d'action et de subjectivité qui leur sont ouverts et des résultats contradictoires que donne pour certains d'entre eux l'idéal de perfection portée par l'idée d'un renouveau islamique.     

Organochlorine residues in fish from Lake Victoria, Kenya

Eighty-two samples of either nile perch fish fat or muscle were collected from the Kenyan region of Lake Victoria for detection of organochlorine residues. Nine organochlorine residues were detected in the following percentages: α-BHCIHCB-40%; P-BHC/HCB-40%; y-BHC/HCB/lindane-4%; aldrin-9%; dieldrin-1%; p, p'-DDE-73%; p, p'-DDD-9%; o, p'-DDT-170; and p, p'-DDT-11%. All levels of organochlorine residues were below the Extraneous Residue Limit (ERL), apart from just one sample of fish fat which had 4.51 ppm of sum DDT above ERL. There was a higher level of organochlorines from Mbita than from Luanda fishing point.

Résumé

Eighty-two échantillons de graisse ou de muscle de perche du Nil ont été récoltés dans la région kényane du lac Victoria pour rechercher des résidus organochlorés. On a détecté 9 résidus organochlorés, avec les pourcentages suivants: α-BHC/HCB-40%; β-BHC/HCB-40%;γ-BHC/HCB/lindane-4%;aldrine-9%; dieldrine-1%; p, p'-DDE-73%; p, p'-DDD-9%; o, p'-DDT-1%; and p, p'-DDT-11%. Tous les taux de résidus organochlorés ktaient infkrieurs a la 'Extraneous Residue Limit' (ERL) sauf pour un seul échantillon de graisse de poisson qui contenait 4,51 ppm de DDT total au-dessus de 1'ERL. I1 y avait un taux plus élevé d'organochlorés a Mbita qu'au point de pêche de Luanda.     

CONSULTANT'S FORUM

Time-Varying Coefficient Models for the Analysis of Air Pollution and Health Outcome Data
Nous présentons un modèle à coefficient dépendant du temps pour étudier la relation entre exposition aiguë (à court terme) à la pollution atmosphérique et altérations de la santé. Ce modèle permet au risque relatif de varier en fonction du temps comme cela peut se produire en cas d'interaction avec la température ou de modification de la composition en polluants, par exemple en particules solides. Le modèle fournit une estimation lissée de ces effets dépendant du temps sans qu'il soit nécessaire de spécifier une forme paramétrique particulière. Cette forme est estimée à partir des données à l'aide de fonctions spline cubiques pénalisées. Nous développons des modèles de régression de Poisson dont les coefficients sont estimés soit en maximisant une quasi-vraisemblance par une procédure itérative de moindres carrés repondérés, soit par une approche bayésienne utilisant une méthode de Monte Carlo par chaîne de Markov (MCMC). L'efficacité de ces approches pour estimer différents effets dépendant du temps est évaluée par simulations et les modèles sont appliqués aux données recueillies dans quatre villes pour l'enquête NMMAPS (Enquête Nationale Morbidité, Mortalité et Pollution Atmosphérique).