乙型肝炎病毒前S基因区缺失突变发生机制的探讨

检测慢性乙型肝炎病毒(HBV)携带者和患者外周血内HBV前S区基因缺失突变的分子结构特点,探讨其发生机理.用聚合酶链反应方法从慢性乙肝患者和携带者血清中扩增出前S区基因片段,克隆、测序,分析缺失发生的结构特点,从而推测这些前S区基因缺失突变的产生机制.从262例慢性乙肝患者和103例无症状HBV携带者体内扩增出前S区片段,共在30例患者和携带者中检测出多种前S区基因缺失突变,主要集中于前S1区的3′端和前S2区的5′端.其中有9例患者和携带者体内存在完全一样的nt3019～nt3201 183bp的缺失突变,该缺失突变符合真核细胞mRNA剪接机制,在此位置上各基因型的序列高度保守.同时有另外两种缺失突变,即nt3019～nt3147 129bp缺失、nt3019～nt3109 91bp缺失也符合该剪接机制.有23种缺失突变部分于重复序列之间,符合逆转录过程中的模板转换机制所导致的缺失.根据前基因组RNA预测出二级结构,仅部分缺失突变在RNA二级结构中对应于局部的结构.此结果表明:HBV在外界因素mRNA的剪接机制和内在因素聚合酶蛋白的功能特点的共同作用下,产生各种突变,不同的机制将导致不同类型的缺失突变.除真核细胞mRNA剪接机制外,逆转录过程中的模板转换是主要机制之一.     

两种前S蛋白与HBV复制关系的初步研究

乙型肝炎病毒(HBV)前S基因及其产物的发现有助于认识HBV复制规律。一些研究提示:前S_1蛋白是完整病毒颗粒表面的必要成分,其存在与HBV复制密切相关,前S_1检测能敏感和特异地反映HBV复制状态。另一些研究则认为:前S_2蛋白含有人多聚白蛋白的结合位点,并提出前S_2蛋白为HBV复制的新标志。为探讨HBV复制与两种前S蛋白之间的联系,本研究应用原位分子杂交分析一组慢性肝炎患者肝细胞内HBV DNA,同时检测肝细胞内HBsAg、HBcAg与两种前S蛋白,综合分析两种前S蛋白在HBV复制中的地位和作用。     

一例乙型肝炎患者体内不同HBV克隆的序列差异

采用PCR扩增、噬菌体克隆和核苷酸序列分析的方法对一例乙型肝炎患者体内HBV的HBsAg编码区和部分前S2区进行序列分析.结果发现同一患者体内获得的不同HBV DNA克隆间存在个别碱基的差异,而这种差异并非方法学本身产生的.由此得出的结论是,这种碱基"突变"反映了乙型肝炎患者体内HBV基因组实际存在的多态性.     

乙型肝炎病毒宫内感染危险因素的病例对照研究

目的:探讨与乙型肝炎病毒宫内感染相关的产妇孕期危险因素.方法:采用病例对照的研究方法,选择连续收集的2005年10月至2006年10月在陕西省妇幼保健院产科行孕期检查并分娩的113例乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)阳性产妇及其所产新生儿为研究对象,以出生时血清HBsAg阳性的新生儿为病例组,其余均为对照组,收集产妇孕期及产时的相关资料,采用单因素分析、对数线性模型等方法分析与宫内感染相关的因素.结果:113例新生儿有3例发生宫内感染.病例组产妇孕中期有性行为、HBVDNA阳性与对照组之间存在统计学差异(P＜0.05),且交互作用分析显示二者之间符合相乘模型,OR值及95%CI为127.00(4.73-340.51),有协同作用.其他因素与HBV宫内感染无统计学关联.结论:孕中期性行为及产妇HBV DNA阳性可能增加新生儿HBV宫内感染的危险性.     

福建省慢性HBV感染者HBV基因S区、基本核心启动子区和前C区基因变异特征分析

为研究福建省慢性HBV感染者HBV基因多样性及变异规律,了解该人群HBV-DNA的病毒学特征。收集慢性HBV感染者血清标本,通过巢式PCR法扩增其HBV基因序列,比对NCBI数据库中标准基因型序列,分析HBV基因S区,基本核心启动子区(BCP)及前C区的序列变异情况,并对这些变异可能造成的病毒抗原表达,疫苗逃逸,患者病症改变等情况进行探讨。最终成功扩增82例HBV全长基因序列,其中B基因型56例,C基因型26例。基因组特定功能区序列分析发现慢性HBV感染者HBV基因在S区(23.2%)、BCP区(61.0%)和前C区(29.3%)均出现了不同程度的变异。其中主蛋白(HBsAg)主要抗原决定簇a决定簇45.8%位点出现了变异,这些变异位点中包括与肝炎重症化及免疫逃逸密切相关的位点(aa126、aa129、aa145等)。位点G1896A(19.5%),G1764A(11.0%)和A1762T(9.8%)依然是BCP/前C区的主要突变位点。而位点A1752G(25.6%)高突变率的出现在BCP区应引起关注。此外位点G1764A(χ~2=5.742,P=0.030)、A1896G(χ~2=14.392,P=0.000)以及A1762T/G1764A(χ~2=7.289,P=0.012)的突变更容易发生在HBeAg阴性的样品中;而位点A1846T(χ~2=11.882,P=0.003)、A1762T(χ~2=6.561,P=0.038)和A1896G(χ~2=6.958,P=0.030)的突变与HBV-DNA的病毒载量存在一定相关性。总之,福建省慢性HBV感染者在HBV不同基因功能区域均存在不同程度的变异,一些与HBeAg表达情况、HBV-DNA载量、疫苗免疫逃避及肝细胞癌发生具有相关联的变异位点已经出现,BCP区A1752G位点的高频率出现应值得关注,对于这些变异位点的患者应加强监测。     

基于16S rRNA基因测序技术分析猪链球菌2型感染BALB/c小鼠粪便样本中微生物的变化

【目的】通过研究粪便样本的微生物特点间接探讨猪链球菌2型感染BALB/c小鼠后肠道微生物的变化。【方法】本研究采用IlluminaMiSeq测序技术,测定了健康小鼠和猪链球菌2型感染小鼠粪便中微生物16S rRNA V3-V4区序列,并对群落结构和多样性进行了比较分析。【结果】多样性分析表明,感染组和对照组小鼠的粪便中微生物多样性和群落组成均不相同,存在较大的差异,感染组展示了较高的物种丰度和种群差异性。在门水平上,相对于对照组,感染组增加厚壁菌门和拟杆菌门等有益微生物比例,以提高机体免疫力,但也同时增加了变形杆菌等条件致病菌的比例,增加了疾病发生的可能性。在科水平上,感染组和对照组优势菌均含有瘤胃菌科,但其所占细菌总序列的比例存在较大的差异,分别占感染组和对照组细菌总序列的36.58%和11.02%。在属水平上,感染组和对照组的优势菌属类别及占总微生物比例存在显著的差异。感染组主要以瘤胃菌科UCG-002和乳酸杆菌属为优势菌属,对照组以螺旋体科GWE2-31-10和密螺旋体属2为优势菌属。综上,BALB/c小鼠感染猪链球菌2型后存在肠道微生态失调。【结论】通过本研究,不仅对猪链球菌2...     

表面抗原和表面抗体检测双阳性CD重组型乙型肝炎病毒全基因组序列分析

西藏地区藏族人群乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染率较高,而针对感染者血清中HBV表面抗原(Hepatitis B surface antigen,HBsAg)和HBV表面抗原抗体(Hepatitis B surface antibody,HBsAb)双阳性的研究一直进展缓慢,尚无明确的研究结论。为探讨西藏地区藏族人群慢性HBV感染者血清中HBsAg和HBsAb双阳性与基因组核苷酸/氨基酸突变的关系,本研究在西藏选取7个地区作为研究区域,进行多阶段抽样,选取样本进行HBV血清五项指标检测,筛选HBsAg和HBsAb均为阳性的患者血清共24份作为双阳性组,以年龄和乙型肝炎e抗原(HBeAg)等感染指标进行匹配,选取96份HBsAg阳性,HBsAb阴性患者血清作为对照组。HBV全基因组序列通过聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)产物直接测序获得,并进行重组分析和突变分析。852名西藏HBV感染者中,HBsAg/HBsAb双阳性率为2.82%(24/852)。双阳性组在S蛋白N端和主要亲水区(Major hydrophilic region,MHR)的突变率以及PreS缺失发生率均显著高于对照组。T1753C、C1990T和C2002T等核苷酸突变;S蛋白中V224A、PreS区D103E等氨基酸突变在两组内分布存在显著差异。HBV/CD重组型的HBsAg/HBsAb双阳性发生率与中国乙肝主要流行区域接近。HBV感染者血清HBsAg和HBsAb共存可能与S蛋白,特别是MHR内的高氨基酸突变造成的免疫逃逸有关。PreS缺失、S抗原蛋白C端V224A突变和PreS区D103E突变可能对HBsAg/HBsAb双阳性的产生具有协同作用。     

应用系统发育树分析DDBJ基因库中HBV基因序列的基因型

为了充分利用核酸库中的HBV序列信息,探讨DDBJ核酸库中HBV基因序列的基因分型,采用Clustal X（1.8）软件比较HBV基因序列前S区序列差异并产生系统发育树。通过对下载的1471条HBV基因序列进行系统分析。获得了228条前S/S区完整的HBV基因序列,其中有66条序列的基因型已被各种方法所证实。利用软件分析绘制了基于228条HBV前S区基因序列的系统发育树。66条已知基因型HBV基因序列在系统发育树上的分型与其原有基因型完全吻合。在228条HBV基因序列中,有207条序列分别属于A、B、C、D、E、F和G等7个基因型,但另外21条序列不能归属于上述7个基因型的任何一种,而且它们又分为彼此相互独立存在的两群,暂分别称之为未分型I和未分型Ⅱ,经比较未分型I、Ⅱ和其他7个基因型前S区核苷酸序列,发现未分型I、Ⅱ和D型前S区都有33个核苷酸缺失,但三者基因缺失片段的位置和形式各不相同,但其它六型前S区无大片段基因缺失。结果说明采用基于前S区的系统发育树基因分型分析方法正确可靠,除了现已证实的7个基因型外,尚可能存在另外两个新的HBV基因型。     

乙肝病毒表面抗原的抗体双阳性者中病毒S区基因序列分析

为了解乙肝病毒（HBV）表面抗原和抗体双阳性患者中病毒的基因型及其HVB S区是否有变异。用放射免疫试剂检测HBsAg阳性样品中的抗－HBs抗体，用聚合酶链反应法检测双阳性样品中的HBV DNA，然后对阳性样品进行克隆和基因序列分析，并将所得序列与HBV不同基因型的代表株进行比较分析。结果显示389例HBsAg阳性样品中有10例为抗HBs抗体阳性；该10例双阳性样品中有5例为HBV DNA阳性；序列分析显示该5株HBV均为B基因型，其中4株为adw亚型，1株为adr亚型；其中有2株在S区的“a”决定簇的氨基酸发生了变异。     

白细胞介素-21与乙型肝炎病毒前S2S抗原融合蛋白在293T细胞中的表达

目的:构建白细胞介素-21(interleukin-21,IL-21)和乙型肝炎病毒前S2S抗原(S2S)的融合表达质粒,并研究其在293T细胞中的表达。方法:采用PCR方法扩增IL-21和HBV前S2S基因片段,分别克隆入pcDNA3真核表达质粒,用分子克隆方法构建融合表达质粒,并以脂质体2000转染293T细胞,分别应用ELISA法和Western Blot法检测细胞上清及细胞中IL-21和HBsAg的表达水平。结果:经酶切鉴定及DNA序列证实重组质粒内插入片段序列正确,三种重组质粒分别命名为pcDNA-IL-21、pcDNA-S2S和pcDNA-IL-21-S2S,并且重组质粒能在293T细胞内表达并分泌相关蛋白。结论:成功构建IL-21和乙型肝炎病毒前S2S抗原的融合表达质粒,重组质粒能在真核细胞内表达。     

乙型肝炎病毒外膜大蛋白和HBVDNA血清学诊断价值

目的探讨乙型肝炎病毒外膜大蛋白和HBV-DNA在乙肝患者中的血清学诊断价值。方法收集乙肝两对半(HBV-M)中HBsAg阳性血清标本260例作为乙肝研究组,乙肝两对半(HBV-M)阴性血清标本100例作为正常对照组;在不同乙肝模式中采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清HBV-LP和Pre-S1,荧光定量PCR检测HBV DNA;比较HBeAg血清中HBV-LP与HBV-DNA和不同HBV-DNA拷贝数的条件下HBV-LP与HBV-DNA剂量关系。结果HBsAg阳性血清中HBV-LP、HBV-DNA和Pre-S1阳性率分别为68.46%、63.08%和24.23%;HBeAg阳性标本中HBV-LP、HBV-DNA和Pre-S1阳性率分别为94.87%、94.87%和79.49%;HBeAg阴性标本中HBV-LP、HBV-DNA和Pre-S1阳性率分别为62.64%、49.45%和0.55%,HBV-LP和HBV-DNA二者检出一致率为67.03%[(50+72)/182];HBV-LP吸光度(A值)与HBV DNA呈正相关。结论HBV-LP与HBV-DNA在HBeAg阳性血清中代表病毒复制具有较高检出一致率;HBV-LP与HBV-DNA在HBeAg阴性血清中具有较大的差异性,HBV-DNA阴性血清中检测HBV-LP反应乙肝病毒复制对乙肝抗病毒治疗更有重要意义;HBV DNA拷贝数与HBV-LP含量呈正相关系。     

HBV感染免疫状态与HBV基因型关系研究思路

HBV感染免疫状态不同,临床意义不同;HBV基因型不同,导致病毒致病性、变异、抗病毒等临床疗效及预后不同.HBV感染临床意义的不同,是宿主与病毒共同作用的结果.将HBV感染免疫状态与HBV基因型结合在一起研究,探索广西桂北地区不同免疫状态下基因型的分布情况及HBV感染免疫状态与基因型的关系,并希期望能针对宿主免疫状态、病毒特性,为每一位HBV感染患者制订最好的治疗方案.     

Interaction between nucleophosmin and HBV core protein increases HBV capsid assembly

Host factors are involved in Hepatitis B virus (HBV) genome replication and capsid formation during the viral life cycle. A host factor, nucleophosmin (B23), was found to bind to HBV core protein dimers, but its functional role has not been studied. This interaction promoted HBV capsid assembly and decreased the degree of capsid dissociation when subjected to denaturant treatments in vitro. In addition, inhibition of B23 reduced intracellular capsid formation resulting in a decrease of HBV production in HepG2.2.15 cells. These results provide important evidence that B23 acts on core capsid assembly via its interaction with HBV core dimers.     

HBV转基因小鼠--乙型肝炎研究的重要工具

HBV感染具有严格的种属特异性和组织亲嗜性,所以可用于研究的动物模型很少。随着转基因技术的出现和发展,人们通过研制转基因动物模型来研究病毒致病机理。把HBV的DNA或其片段转入小鼠受精卵建立起来的HBV转基因小鼠,已被广泛地应用于乙型肝炎的研究中,主要体现在以下3个方面：研究HBV的致病机制、与肝细胞癌的关系及寻找、评价治疗乙肝的方法。     

HBV genotypes and antiviral-resistant variants in HBV infected subjects in Northern Italy

HBV genotypes were investigated in sera/plasma from 97 HBV positive subjects. Genotype D was revealed in 80.4% followed by E in 6.2%. Genotypes A, B, and C were also found, as well as for the first time a new combination of HBV D and G genotypes. In a cohort of subjects of this population, the relationship with lamivudine and/or famciclovir-resistant HBV mutants was also investigated. Among 12 untreated subjects, 25% carried HBV drug-resistant strains suggesting that drug-resistant variants naturally exist in untreated Italian HBV chronically infected subjects.     

与HBV感染可能有关的microR-122的筛选及其作用的靶点预测

应用基因芯片技术筛选到与HBV感染可能有关的microRNA——miR-122,利用计算机软件分析预测microR-122作用HBV的可能靶点。分析结果认为miR-122与HBV的感染可能有关,并且作用靶点可能为HBV1689-1711nt。     

HBV Genotypic Variability in Cuba

The genetic diversity of HBV in human population is often a reflection of its genetic admixture. The aim of this study was to explore the genotypic diversity of HBV in Cuba. The S genomic region of Cuban HBV isolates was sequenced and for selected isolates the complete genome or precore-core sequence was analyzed. The most frequent genotype was A (167/250, 67%), mainly A2 (149, 60%) but also A1 and one A4. A total of 77 isolates were classified as genotype D (31%), with co-circulation of several subgenotypes (56 D4, 2 D1, 5 D2, 7 D3/6 and 7 D7). Three isolates belonged to genotype E, two to H and one to B3. Complete genome sequence analysis of selected isolates confirmed the phylogenetic analysis performed with the S region. Mutations or polymorphisms in precore region were more common among genotype D compared to genotype A isolates. The HBV genotypic distribution in this Caribbean island correlates with the Y lineage genetic background of the population, where a European and African origin prevails. HBV genotypes E, B3 and H isolates might represent more recent introductions.     

HBV Pre-S1与DNA及其他血清学标志物的相关性研究

目的研究乙型肝炎病毒血清前S1抗原、HBV-DNA与其他乙型肝炎血清标志物HBs-Ag、HBeAg的相关性。方法采用实时聚合酶链反应(Real-Time PCR)技术检测血清中HBV-DNA的含量,用酶联免疫法(ELISA)检测PreS1Ag、HBsAg和HBeAg。采用SPSS 13.0统计软件进行分析,成组设计资料,率比较采用配对的χ2检验,结果的关联性采用独立性的χ2检验。结果以HBV-DNA1.000E+03Copy/ml为阴性组;HBV-DNA≥1.000E+03Copy/ml为阳性组。600例HBsAg阳性的乙型肝炎患者中241例HBV-DNA阳性,283例Pre-S1阳性。其中241例HBV-DNA阳性患者中,Pre-S1阳性222例,阳性率为92.12%。显著高于HBV-DNA阴性组的Pre-S1阳性率(16.99%)。经配对的差异性检验P=0.000(确切概率)。经独立性检验,χ2=326.573,P=0.000。241例HBsAg、HBV-DNA阳性组,HBeAg阳性191例,Pre-S1阳性222例,其中191例HBeAg阳性患者中,Pre-S1Ag阳性185例,阳性率为96.86%。显著高于HBeAg阴性组的Pre-S1Ag阳性率(61.67%)。经配对的差异性检验P=0.000(确切概率)。经独立性检验,χ2=28.511,P=0.000。结论 Pre-S1Ag与HBV-DNA阳性高度相关,有好的一致性和互补性,较HBeAg更敏感。可作为乙肝病毒存在和复制的可靠标志,是反映HBV是否具有传染性的观察指标。     

比较不同血清型AAV携带HBV基因组建立乙肝小鼠模型效果

近年来,用8型腺相关病毒携带1.3拷贝HBV(Hepatitis B virus)基因组建立的HBV持续感染小鼠模型受到越来越多的关注。本研究比较了除AAV8之外的其他4种血清型重组腺相关病毒(Recombinant adeno-associated virus,rAAV)建立乙肝小鼠模型效果。首先,将携带1.3拷贝ayw亚型HBV基因组的1型、2型、5型、8型、9型腺相关病毒分别以1×10~(11) vg/只(Viral genome,vg)的剂量尾静脉注射C57BL/6J小鼠;利用ELISA方法监测小鼠血清中HBeAg和HBsAg表达水平;用定量PCR方法检测小鼠血清和肝脏中HBV DNA拷贝数;用免疫组化方法检测小鼠肝脏中HBc Ag的表达;用HE染色检测小鼠肝脏病理变化。结果显示,在持续8周中,5组小鼠血清中都检测到HBeAg和HBsAg的表达,血清和肝脏中均检测到HBV DNA的存在。HBeAg、HBsAg、HBV DNA表达水平高低依次为AAV8AAV9AAV1AAV5AAV2。5组小鼠用免疫组化方法都检测到肝脏中HBcAg表达,HE染色病理检测均观察到不同程度的肝损伤。本研究扩大了能用于建立乙肝小鼠持续感染模型可选择的AAV载体种类,发现虽然AAV1、2、5、9的建模效果不如AAV8,但它们都可以介导建立持续感染的乙肝小鼠模型,建模效果依次为AAV8AAV9AAV1AAV5AAV2。其中AAV9介导的建模效果与AAV8载体最为接近,可以替代AAV8载体用于有效地建立HBV持续感染的小鼠模型。