不同保存方式下蝗虫组织DNA的提取及RAPD分析

为了开展蝗虫分子系统学研究,分别对冷冻、乙醇浸泡(100%、乙醇、70％乙醇)和干制蝗虫标本用饱和NaCl法进行了基因组DNA的提取,并用随机引物进行扩增,结果表明：70％乙醇固定的标本和部分干标本提取的总DNA得率较低,在琼脂糖凝胶电泳检测中大音琏分有明显降解,导致PCR扩增中信息缺失,甚至无扩增条带;而保存完好的干标本、-20℃冷冻标本和100%,乙醇浸泡标本提取的总DNA带型整齐,无拖尾,PCR扩增结果的稳定性好,成为蝗虫分子系统学研究中首选的三种保存方式。     

粉蚧标本保存与DNA提取方法的比较

【目的】探讨适合粉蚧的标本保存及DNA提取方法。【方法】采用改良CTAB法、改良SDS法、Gen Mag Bio动物细胞组织/细胞基因组磁珠法以及Gene JET Genomic DNA纯化试剂盒法4种方法分别对新鲜活体4℃、无水乙醇﹣20℃和无水乙醇4℃3种保存方式且保存一年以上的扶桑绵粉蚧Phenacoccus solenopsis成虫进行DNA提取,并对不同提取方法所获取的DNA纯度与质量浓度进行分析比较验证。【结果】3种保存方式中,新鲜活体效果最好,其次为无水乙醇-20℃。无水乙醇4℃效果和无水乙醇﹣20℃无明显区别,均存在一定程度的降解。对于新鲜活体标本,以CTAB法提取的DNA质量最高,其次为Gen Mag Bio磁珠法和SDS法,Gene JET试剂盒法最差;对于无水乙醇﹣20℃和4℃保存时间较长的标本,磁珠法提取的DNA质量明显优于其余3种方法。【结论】无水乙醇﹣20℃可用于粉蚧长期保存,可满足后续分子研究需要;改良CTAB法对新鲜粉蚧成虫DNA提取效果较好,磁珠法对长时间保存DNA存在一定程度降解的粉蚧成虫效果较好。     

蜘蛛基因组DNA提取方法的比较

分别用SDS法,SK251基因组DNA小量抽提试剂盒法,自制试剂盒法,对蜘蛛组织的基因组DNA进行了提取,经比较,自制试剂盒法对提取蜘蛛基因组DNA最简便面又有效的方法。     

药用植物艾纳香基因组DNA提取方法研究

以药用植物艾纳香为研究对象,以-20℃保存、4℃保存、室温自然干燥和硅胶干燥四种样品保存方式,并采用SDS法、CTAB法、SDS-CTAB法和改良CTAB法4种不同的基因组DNA提取方法进行了对比试验,以期建立艾纳香的较好的样品保存方法和基因组DNA提取方法。结果表明,-20℃保存是艾纳香的较理想的样品保存方式;改良CTAB法是艾纳香基因组DNA提取较适宜的方法,该方法提取的DNA经紫外检测,其A_(260)/A_(280)为1.8左右,明显优于SDS法(1.1～1.5)、CTAB法(1.2～1.5)和SDS-CTAB法(1.4～1.6),琼脂糖凝胶电泳、酶切检测和PCR扩增也得出了同样的结论。     

大青杨基因组DNA提取方法的比较

本研究采用改良SDS法、常规CTAB法和改良CTAB法(1.5×CTAB,2×CTAB,3×CTAB)提取大青杨基因组DNA,并用紫外光普分析、凝胶电泳、限制性内切酶消化和RAPD方法进行鉴定.结果表明:5种方法中,改良SDS法DNA提取率最高,但CTAB法比改良SDS法提取获得的DNA纯度高,OD260/OD280为1.73～1.81.与常规CTAB法比较,改良SDS法和改良CTAB法能有效去除蛋白、多糖、酚类及次生代谢物质.综合分析确定改良2×CTAB法为大青杨基因组DNA的最佳提取方法.     

人类肠道菌群DNA提取影响因素的研究

目的研究提取人类粪便中细菌基因组DNA的影响因素。方法采用溶菌酶和十二烷基磺酸钠(SDS)+石英砂+酚-氯仿抽提法提取粪便标本中细菌DNA,用PCR扩增细菌16SrDNA。比较不同粪便量,不同放置时间,不同放置温度下的粪便细菌DNA浓度及纯度改变;用Chao index评测高通量测序的结果。结果采用20mg粪便量提取出的细菌DNA的浓度最高;常温下放置3h后,提取的细菌DNA的浓度开始下降;在-20℃放置12h后,细菌DNA的浓度开始下降;-70℃放置48h后细菌DNA的浓度开始下降;样品纯度均在1.8以上;Chao index曲线趋于平缓表明测序数据量足够大。结论提取肠道细菌基因组DNA时,粪便标本取样量以20mg为宜,常温下粪便标本放置不超过2h,本研究所使用的方法所提取的DNA浓度可以达到高通量测序的样本要求。     

单粒干燥大豆种子基因组DNA提取的有效方法

大豆基因组DNA的提取是进行大豆分子生物学研究的基础.以大豆干燥的种子为材料,将SDS法和CTAB法结合在一起并进行了一定的改进,有效的提取了基因组DNA.通过电泳、紫外分光光度计检测和ISSR标记分析验证这种方法是提取大豆干种子基因组DNA的有效方法.     

5种常见植物DNA提取效率的比较

以小麦、玉米、甘蓝、花生、菠菜的幼嫩叶片为实验材料,采用高盐低pH值法、SDS法和CTAB法3种不同的DNA提取方法,提取其总DNA,用琼脂糖凝胶电泳检测和紫外分光光度法对所得DNA进行比较分析.结果表明:玉米和菠菜采用SDS法提取基因组DNA效果明显优于CTAB和高盐低pH法.CTAB法对高脂肪花生的DNA提取,所得浓度较高.而高盐低pH值法建议减少使用.     

适于涡虫基因组DNA快速制备的改良的CTAB法

提取得到高质量的DNA样品是进行分子生物学研究的必要前提。为了找到一种适用于提取涡虫基因组DNA的常规方法,我们以东亚三角头涡虫为材料,分别用改良的CTAB法、SDS法、SDS-蛋白酶K法对涡虫的基因组DNA进行了制备,并对3种方法制备的涡虫基因组DNA进行了检测与比较。根据比较结果,我们认为改良的CTAB法最适合于涡虫基因组DNA的快速制备,为涡虫的分子生物学研究打下了基础。     

四种提取芸芥基因组DNA方法的比较

以芸芥为材料 ,分别用CTAB法、SDS法、尿素法、NaOH法四种方法对芸芥基因组DNA进行了提取 ;并用紫外光分光光度计法、琼脂糖电泳法和RAPD分析法对所提取的DNA进行检测 ,将它们在DNA的产量、质量和耗时、耗费等方面的优缺点进行比较 ,以便在实际工作中根据不同的试验条件选取最合适的提取方法。通过四种方法的比较 ,研究认为尿素法是芸芥基因组DNA的最佳提取方法。     

天堂的危机——野性之河亚马逊——对“聚宝盆”的不同解读

2006年11月．互联网上一则在亚马逊的森林小镇发现黄金的消息．引发了巴西沉寂了20年的最疯狂的淘金热。该金矿位于马瑙斯450公里的阿普镇,金矿纯度98％。于是在短短两个月内一万名淘金客蜂拥而至．掘得黄金150公斤．价值300万美元。     

Different Placebos,Different Mechanisms,Different Outcomes: Lessons for Clinical Trials

Clinical trials use placebos with the assumption that they are inert, thus all placebos are considered to be equal. Here we show that this assumption is wrong and that different placebo procedures are associated to different therapeutic rituals which, in turn, trigger different mechanisms and produce different therapeutic outcomes. We studied high altitude, or hypobaric hypoxia, headache, in which two different placebos were administered. The first was placebo oxygen inhaled through a mask, whereas the second was placebo aspirin swallowed with a pill. Both placebos were given after a conditioning procedure, whereby either real oxygen or real aspirin was administered for three consecutive sessions to reduce headache pain. We found that after real oxygen conditioning, placebo oxygen induced pain relief along with a reduction in ventilation, blood alkalosis and salivary prostaglandin (PG)E2, yet without any increase in blood oxygen saturation (SO2). By contrast, after real aspirin conditioning, placebo aspirin induced pain relief through the inhibition of all the products of cyclooxygenase, that is, PGD2, PGE2, PGF2, PGI2, thromboxane (TX)A2, without affecting ventilation and blood alkalosis. Therefore, two different placebos, associated to two different therapeutic rituals, used two different pathways to reduce headache pain. The analgesic effect following placebo oxygen was superior to placebo aspirin. These findings show that different placebos may use different mechanisms to reduce high altitude headache, depending on the therapeutic ritual and the route of administration. In clinical trials, placebos and outcome measures should be selected very carefully in order not to incur in wrong interpretations.     

高原林蛙不同部位皮肤组织结构比较

高原林蛙(Rana kukunoris)是青藏高原特有的两栖类动物,已适应青藏高原高海拔低温、缺氧、强紫外线的自然环境。采用石蜡切片技术和H.E染色及扫描电镜技术对青藏高原东北部地区高原林蛙头部、背部、腹部、侧部皮肤结构进行观察。高原林蛙各部位皮肤均由表皮和真皮组成,表皮是角质化的复层扁平上皮,不同部位表皮层厚度接近,真皮层厚度不同,头部真皮层的厚度最厚,为(197.86±29.73)μm,侧部最薄,为(55.33±5.22)μm。高原林蛙真皮疏松层中分布有颗粒腺、黏液腺和嗜酸腺。颗粒腺主要分布于头背部;黏液腺在头部数目最多,侧部最少;嗜酸腺在机体各部位均匀分布。高原林蛙头部、背部、侧部色素细胞含量丰富,腹部色素细胞含量较少。毛细血管分布于真皮疏松层腺体周围,表皮中也有少量分布。这些结构特征可能是高原林蛙对青藏高原环境的适应策略。     

Photodegradation of Fleroxacin Injection: Different Products with Different Concentration Levels

Photodegradation of fleroxacin is investigated in different injections and solutions. After UV irradiation, fleroxacin was degraded to afford two major products in large-volume injection (specification, 200 mg:100 ml), while degraded to afford another major product in small-volume injection (specification, 200 mg:2 ml). The photodegradation products were detected and isolated by reversed-phase HPLC. Based on the spectral data (FT-IR, MSⁿ, TOF-MS, ¹H/¹³C, DEPT, and 2D NMR), the structures of these products were: 8-fluoro-9-(4-methyl-piperazin-1-yl)-6-oxo-2,3-dihydro-6H-1-oxa-3a-aza-phenalene-5-carboxylic acid (impurity-I); 6-fluoro-1-(2-fluoro-ethyl)-7-(2-methylamino-ethylamino)-4-oxo-1,4-dihydro-quinoline-3-carboxylic acid (impurity-II); and 6,8-difluoro-1-(2-fluoro-ethyl)-7-(2-methylamino-ethylamino)-4-oxo-1,4-dihydro-quinoline-3-carboxylic acid (impurity-III), respectively. Different photodegradation pathways of fleroxacin were proposed, which led to the different stability characteristics of fleroxacin in the injections. The fluorine atom at C8 is more photolabile in dilute injection, so defluorination and cyclization reactions are prone to take place, whereas photo irradiation only cause ring-opening oxidation reaction of piperazine side chain in concentrated injection.