泽泻对高脂高糖饮食大鼠肠道菌群多样性的影响

目的研究泽泻对高脂高糖饮食大鼠的降血脂作用与肠道菌群多样性的相关性,并测定高脂高糖饮食大鼠肠道菌群丰度与多样性的变化。方法将32只健康雄性SD大鼠随机分成正常组(control group,CON)、高脂高糖模型组(high-fat and high-sucrose diet group,HFS)、高脂高糖饲料加二甲双胍干预组(metformin treatment group,MET)和高脂高糖饲料加泽泻醇提取物干预组(Alisma orientale extract group,AOE)。每组8只,造模4周后分别灌胃给予相应药物,连续4周。CON组和HFS组灌胃给予生理盐水。检测血清TC、TG、LDL-C及HDL-C水平及其他指标,提取肠道菌群总DNA,分析肠道微生物的变化。结果 HFS组的TC、LDL-C水平明显高于CON组(Ps0.05),给药4周后,AOE组TC、LDL-C水平均显著性降低(Ps0.05)。高通量测序结果显示,AOE组中与脂质代谢、多聚糖生物合成与代谢相关的肠道菌群多样性及丰度增加显著,肠道菌群的生态环境得以改善,形成了新的肠道菌群稳态。结论泽泻醇提取物可以有效降低高脂高糖饮食大鼠的血脂水平,对其肝脏具有保护作用。泽泻醇提取物也能通过改变肠道菌群的丰度、多样性和功能类群等靶标进行脂质代谢调节。     

基于16S rDNA测序技术分析功能性便秘患者粪便菌群

运用16S rDNA测序技术分析功能性便秘（FC）患者粪便菌群特征,以期寻找FC特征菌,为FC诊治寻找新的治疗靶点。

收集福建中医药大学附属第二人民医院60例实验组（FC患者）和30例正常组的粪便,采用16S rDNA测序技术分析粪便菌群结构,并进行基因功能的预测。

两组在门水平上,主要由厚壁菌门和拟杆菌门组成;在属水平上,主要优势菌以粪杆菌属和拟杆菌属为主。实验组粪便菌群丰富度指数Chao1、Observed_OTUs较正常组升高（P＜0.05）,多样性指数Shannon指数和Simpson指数虽有上升趋势,但差异无统计学意义（P＞0.05）。布劳特菌属、罗氏菌属、Ruminococcus_gnavus_group、Ruminococcus_gauvreauii_group、Eubacterium_hallii_group、Anaerostipes、Lachnospiraceae_ND3007_group、Dorea、乳球菌属在实验组中丰度均显著降低（P＜0.01）。实验组特征菌为小杆菌属,正常组为布劳特菌属和埃希菌−志贺菌属。实验组蔗糖降解Ⅲ（PWY-621）、丙酮酸发酵成乙酸和乳酸（PWY-5100）和琥珀酸发酵成丁酸盐（PWY-5677）功能下降（P＜0.05）。

功能性便秘患者主要表现为肠道菌群丰度与多样性升高,FC的发病可能与菌群结构发生改变有关。

     

细菌性阴道病肠道菌群与阴道菌群16S rDNA测序分析

目的通过对细菌性阴道病(BV)患者肠道菌群及阴道菌群16S rDNA扩增子测序,分析其结构、多样性、相关性以及BV对肠道菌群的影响,为今后治疗BV提供新的思路。方法选取符合纳入标准的BV患者11例(BV组),健康者9例(C组),留存阴道分泌物及新鲜粪便进行16S rDNA基因检测分析。结果C组阴道菌群以乳杆菌属为主,BV与加德纳菌属、普雷沃菌属、Sneathia、窄食单胞菌属(Stenotrophomonas)、阿托波菌属、Shuttleworthia、巨型球菌属密切相关。BV组肠道、阴道菌群丰富度均高于C组。Alpha多样性分析中C组和BV组肠道菌群、阴道菌群的Shannon指数组间比较,χ²值为29.137, P=0.000<0.05,两组阴道菌群Shannon指数组间比较差异具有统计学意义(P<0.05),BV组高于C组。物种多样性曲线反映本研究样本测序数据量的合理性,表明BV组的肠道菌群多样性、丰富度均高于C组,主坐标分析表明C组肠道与阴道的菌群结构差距较大,BV组肠道与阴道的菌群结构有相似之处,且两组肠道菌群结构接近。BV组阴道菌群中厚壁菌门丰度较C组低,放线菌门、拟杆菌门较C组高;BV组肠道菌群中拟杆菌门丰度较C组低;C组肠道中拟杆菌门明显高于阴道,厚壁菌门明显低于阴道; BV组阴道菌群中放线菌门丰度高于C组,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论BV阴道菌群与肠道菌群具有相关性,BV可能引起肠道菌群结构比例和多样性的改变。     

16S rDNA高通量测序分析腹膜透析胃肠功能障碍患者肠道菌群特征

采用16S rDNA高通量测序技术分析腹膜透析（PD）胃肠功能障碍患者的肠道菌群变化特征,探讨肠道菌群在腹膜透析胃肠功能障碍中的具体作用。

收集25例PD胃肠功能正常者（PDGF组）、25例PD胃肠功能障碍者（PDGD组）和13例健康者（Normal组）的粪便样本,提取肠道菌群基因组,应用16S rDNA高通量测序技术对各组测序结果进行菌群多样性、物种组成差异和菌群功能分析。

3组的Observed species指数（H = 6.905,P = 0.032）和Shannon指数（H = 6.993,P = 0.030）差异具有统计学意义。与Normal组相比,PDGD组Shannon指数显著降低（P = 0.027）,PDGF组Observed species指数显著升高（P = 0.044）;与PDGF组相比,PDGD组Observed species和Shannon指数显著降低（P＜0.05）。PCoA结果显示3组各自聚集,区分较明显。UPGMA聚类分析结果显示3组大部分样本均在本组中聚类后再与其他组进一步合并。LEfSe分析结果显示,Normal组优势菌群包括颤螺菌目（Oscillospirales）、瘤胃菌科（Ruminococcaceae）、栖粪杆菌属（Faecalibacterium）、拟杆菌科（Bacteroidaceae）等;PDGF组优势菌群包括毛螺菌目（Lachnospirales）、毛螺菌科（Lachnospiraceae）、布劳特菌属（Blautia）;PDGD组优势菌群包括芽孢杆菌纲（Bacilli）、乳杆菌目（Lactobacillales）、链球菌属（Streptococcus）、链球菌科（Streptococcaceae）等。KEGG L1水平的功能组成集中在代谢、遗传信息处理和环境信息处理;KEGG L2水平的功能主要集中在碳水化合物、氨基酸代谢、遗传信息的复制和修复及转运、膜运输途径;与Normal组和PDGF组相比,PDGD组在碳水化合物、氨基酸代谢途径富集减少,感染性疾病、聚糖生物合成和代谢途径富集增加。

PD胃肠功能障碍患者存在肠道菌群失调,调整肠道微生态是防治PD患者出现胃肠功能障碍的潜在干预靶标。

     

基于16S rDNA测序绝经综合征抑郁患者肠道菌群结构与功能性分析

目的 通过16S rDNA测序技术对绝经综合征抑郁患者肠道菌群分布、多样性和基因功能进行分析,探讨肠道菌群与绝经综合征抑郁发生的关联。方法 选取2021年6月至2022年3月就诊于我院妇科门诊的绝经综合征抑郁患者19例为观察组（A组）,同期绝经综合征患者10例为对照组（C组）。利用16S r DNA基因测序法对患者肠道菌群进行物种注释分析和功能比较,统计两组肠道菌群分布、多样性和基因功能的变化。结果 两组肠道菌群差异明显。GraPhlAn物种组成图显示,患者肠道菌群总体以厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和变形菌门组成。在门水平,与C组相比,A组放线菌门、变形菌门相对丰度较低,拟杆菌门相对丰度较高。在属水平,与C组相比,A组拟杆菌属、小杆菌属、巨单胞菌属、Lachnospiracea＿incertae＿se相对丰度较高,而Gemmiger、布劳特菌属、普雷沃菌属、粪球菌属、粪杆菌属、双歧杆菌属相对丰度偏低。进一步在属水平上选取了10种相对丰度差异具有统计学意义的菌群（P<0.05）：韦氏球菌属、消化球菌属、巨单胞菌属、史雷克菌属在A组的相对丰度较高（P<0.05）,柯林斯菌属、C...     

不同配方益生菌在高脂饮食诱导小鼠肥胖发生中的差异化作用

【目的】基于肠道微生物与宿主代谢的相互关系,研究不同配方的益生菌对小鼠肥胖的影响。【方法】50只C57BL/6J雄性小鼠随机平均分成10组,分别给予正常饲料、高脂饲料以及高脂饲料加8种不同配方的益生菌产品(50亿CFU/只),所有动物连续喂养9周,每周测量小鼠体重1次。最后一周测定空腹血糖、葡萄糖耐量试验(glucose tolerance test,GTT)、血脂相关指标,称取内脏重量,并留取小鼠盲肠内容物,提取小鼠肠道菌群总DNA,利用16S rDNA测序检测相关细菌含量。【结果】部分益生菌可引起小鼠体重增速加快,而部分益生菌可减缓小鼠肥胖和降低内脏脂肪重量,同时缓解高血脂症。丹尼斯克品牌益生菌配方组小鼠肠道中厚壁菌/拟杆菌比例(F/B)是正常饮食组的22.8倍,Akkermansia muciniphila(Akkermansia)细菌含量几乎为0;而菌拉丁品牌益生菌配方组小鼠F/B比例与正常饲料饮食组类似,Akkermansia含量为0.5%,为正常饮食对照组小鼠的一半左右。【结论】益生菌可影响小鼠体重和代谢,但不同配方的益生菌效果截然相反。特定的益生菌配方对肥胖和高血脂的改善可能是由于其选用的菌株本身的特性以及菌株之间的相互配比能够降低小鼠肠道中F/B比例以及升高Akkermansia的含量所带来的。此研究为进一步开发可改善代谢的益生菌产品提供了参考。     

基于16S rDNA技术研究隔药饼灸对高脂血症兔肠道菌群属水平的影响

研究隔药饼灸对高脂血症兔属水平肠道菌群的作用,筛选相关菌属。

将24只兔按随机数表法分为正常组、模型组和隔药饼灸组,每组8只;干预12周后,观察TC、TG、LDL-C水平的变化,采用16S rDNA高通量测序技术分析属水平菌落差异。

与模型组比较,隔药饼灸组兔血清LDL-C、TG、TC水平均下降（均P＜0.05）。隔药饼灸组肠道菌群结构发生改善,un_f_Muribaculaceae、un_o_Gastranaerophilales、瘤胃球菌科UCG-014属、阿克曼菌属相对丰度均显著提高（均P＜0.05）,毛螺菌属NK4A136、瘤胃梭菌属6、拟杆菌属相对丰度均降低（均P＜0.05）。

隔药饼灸能改善异常血脂及调整菌群结构,可能与上调un_f_Muribaculaceae、un_o_Gastranaerophilales、瘤胃球菌科UCG-014属、阿克曼菌属相对丰度,降低毛螺菌属NK4A136、瘤胃梭菌属6、拟杆菌属相对丰度有关。

     

基于16S rDNA高通量测序技术对克罗恩病患儿肠道菌群变化的研究

目的 研究克罗恩病(Crohn′s disease,CD)儿童和正常人群肠道菌群的分布,寻找与CD发生发展显著相关的菌属结构。 方法 纳入CD患儿36例和健康儿童21例,CD患儿分为活动期22例、缓解期14例,采用16S rDNA高通量测序技术,分析各组肠道菌群的生物多样性与结构组成。 结果 CD组患儿(活动期与缓解期)肠道菌群丰富度指数、香浓多样性指数较健康儿童组有明显下降,差异有统计学意义(F=8.829 0,P=0.001 0,P=0.004 5;F=8.890 0,P=0.000 3,P=0.035 6)。在门类水平,所有CD患儿肠道菌群的放线菌门数量减少,变形菌门数量增多。在菌属水平,与健康儿童组相比,所有CD组患儿Faecalibacterium相对丰度显著减低,Klebsiella(克雷伯菌属)、Enterococcus(肠球菌属)相对丰度显著升高。活动期CD组Blautia(布劳特菌属)、Bifidobacterium(双歧杆菌属)、Subdoligranulum、Lachnospira(毛螺旋菌属)、Anaerostipes(丁酸弧菌属)、Eubacterium_rectale_group(直肠杆菌属)的相对丰度明显下降。 结论 CD患儿肠道菌群结构及相对丰度较健康儿童存在显著差异。肠道菌群结构的异常与儿童CD的发生发展存在相关性。     

测序平台在母婴肠道菌群结构分析中产生的可能偏倚

目的将两个不同的二代测序平台及其生物信息学流程进行的相同标本的微生物群分析结果的异同进行比较。方法在同一实验室采用相同的生物信息学分析方案,使用两个不同的测序平台(Ion Torrent S5-xl和Illumina HiSeq 2500)对56个(28对)母婴粪便样本进行16S rRNA扩增子测序,采用相关性分析、主成分分析(PCA)、主坐标分析(PCoA)以及MRPP分析比较两个平台产生的微生物群落结构的异同。结果 Alpha多样性除Shannon指数外,Chao1指数(t=1.96,P=0.001 1)、Observed species指数(t=2.13,P0.001 0)、PD_whole tree指数(t=2.07,P0.001 0)、Simpson指数(t=1.87,P=0.003 1)和Good coverage指数(t=2.32,P0.001 0)差异存在统计学意义。对不同分类水平下的菌群相对丰度进行分析,测序和注释的细菌种类越多,两个平台间建立的细菌相对丰度的相关性越低。PCA结果显示,超过87%的样本被聚类。通过PCoA结果将两个平台的56个样本分为两个集群(cluster),两个平台之间的重叠率为71.43%。MRPP差异分别显示了两个测序平台的菌群数据在科水平、属水平上差异存在统计学意义(A=0.094 1,P=0.001 0;A=0.085 2,P=0.002 1)。当考虑样本来源时,在科水平上,母亲组的菌群组成没有明显的测序平台差异(A=0.006 3,P=0.149 1),新生儿组差异则有统计学意义(A=0.035 2,P=0.006 1);在属水平,母、婴组的菌群组成有显著的测序平台差异(A=0.021 6,P=0.004 2;A=0.098 1,P=0.001 0)。结论相同样本在不同平台进行扩增子测序,其菌群结构相对丰度基本相似,但其多样性和相关性仍然有很大差异。为了队列研究数据的可重复性和可靠性,建议使用相同的测序平台和分析流程以减少菌群分析中的偏倚。     

基于16S rDNA测序分析枳术丸水煎液对慢传输型便秘脾虚证模型小鼠肠道菌群的影响

基于16S rDNA测序分析慢传输型便秘（STC）脾虚证小鼠肠道菌群结构特征,初步探讨枳术丸对STC肠道菌群的可能干预机制。

40只小鼠随机分成正常组、模型组、枳术丸组与莫沙必利组。造模组（模型组、枳术丸组与莫沙必利组）采用番泻叶灌胃,随后控制饮食饮水采用饥饱失常的方法造成脾虚便秘小鼠模型。造模成功后,枳术丸组给予中药水煎剂灌胃,莫沙必利组给予莫沙必利悬浊液灌胃,正常组与模型组给予蒸馏水灌胃。连续给药7 d后测定小鼠肠道推进率和血清D−木糖水平,采集小鼠结肠内粪便进行16S rDNA检测,分析样本菌群的多样性与丰度,分析门、属、种水平的物种组成。

模型组肠道菌群丰富度指数（Chao1指数）与多样性指数（Shannon指数）较正常组均显著降低（P＜0.05）,说明STC发病过程中伴随肠道菌群物种丰富度水平和菌群物种数目的降低以及菌群多样性水平的降低。在门水平上,正常组与模型组均以厚壁菌门（Firmicutes）和拟杆菌门（Bacteroidetes）为主;在属水平上,模型组肠鼠杆菌属（Muribaculum）、拟杆菌属（Bacteroides）、乳杆菌属（Lactobacillus）和粪杆菌属（Faecalibaculum）丰度显著升高（P＜0.05）,Lachnoclostridium和艾森伯格菌属（Eisenbergiella）丰度降低（P＜0.05）;在种水平上,模型组产酸拟杆菌（Bacteroides acidifaciens）、Faecalibaculum rodentium和约氏乳酸杆菌（Lactobacillus johnsonii）丰度较正常组显著升高（P＜0.05）,Eisenbergiella sp.丰度显著降低（P＜0.05）。以上提示STC脾虚证小鼠肠道菌群多样性发生改变。经枳术丸治疗后,枳术丸组肠鼠杆菌属、拟杆菌属、乳杆菌属、粪杆菌属、Faecalibaculum rodentium和约氏乳酸杆菌丰度显著降低（P＜0.05）,Lachnoclostridium、艾森伯格菌属和Eisenbergiella sp.丰度升高（P＜0.05）。

枳术丸对STC脾虚证小鼠肠道菌群多样性改变有明显的调节作用,并且其作用机制与调节特定菌群有关。

     

主动脉弓缩窄术诱导心力衰竭大鼠的肠道菌群变化特征

目的 探讨主动脉弓缩窄术（TAC）诱导心力衰竭（简称心衰）大鼠的肠道菌群变化特征。方法 将30只SD大鼠分为空白组（Norm组）、模型组（Mod组）和假手术组（Sham组）,每组6只。Mod组大鼠采用TAC术制备为慢性心衰大鼠,对Sham组大鼠仅予开胸后缝合处理,Norm组则不予任何处理。造模10周后,采用超声心动图测量三组大鼠心功能情况,ELISA法检测血清氨基末端脑钠肽前体（NT-proBNP）水平,心肌和小肠组织行HE染色,收集肠道内容物行16S rRNA测序。结果 与Sham组相比,Mod组左室射血分数（LVEF）和左室短轴缩短率（LVFS）明显下降（P<0.01）,NT-proBNP明显升高（P<0.01）。α-多样性分析显示,与Sham组比较,Mod组大鼠的OTU数量增加。PCoA分析显示,Mod组和Norm组菌群明显分开,Norm组和Sham组菌群分离不明显。在属水平上,与Sham组相比,Mod组埃希菌-志贺菌属（Escherichia-Shigella）、Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia、棒状杆菌属（Cor...     

高脂饮食对雄性SD大鼠肠道菌群的影响

目的探讨通过膳食饲喂高脂饲料诱发的高脂血症大鼠肠道菌群结构的变化。方法 24只SD（Spra-gue Dawley,SD）雄性大鼠随机分为A、B两组,分别连续饲喂基础饲料和高脂饲料42 d,并于第0、9、18、30和42天采集大鼠粪便,应用DGGE（Denaturing gradient gel electrophoresis）和q-PCR技术对肠道菌群进行定性定量分析。结果第42天时A、B组大鼠血清总胆固醇值（TC）分别为（2.01±0.14）mmol/L、（5.16±0.22）mmol/L,B组TC水平较A组明显增高（P〈0.05）。DGGE电泳图谱显示B组42 d时肠道菌群构成较0 d时变化显著,而A组不同时期肠道菌落构成无明显差异。q-PCR定量结果显示,随着饲喂高脂饲料天数的增加,B组小鼠肠道内乳杆菌属和双歧杆菌属较0 d明显降低（P〈0.01）,而拟杆菌门数量呈递减趋势且趋势比较平缓;梭菌属呈递增趋势且增幅相对拟杆菌门的变化较大。结论高脂饮食可导致肠道菌群结构的改变,这种改变会进一步促进高脂血症的形成。     

裕固族血脂异常人群肠道菌群结构特征分析

探究生活在相同环境下的同一民族血脂异常人群与健康人群的肠道菌群差异,为血脂异常的精准预防和治疗提供参考。

收集甘肃肃南县裕固族血脂异常人群和健康人群粪便样本,提取细菌总DNA,通过16S rDNA高通量测序和生物信息学技术,分析2组人群肠道菌群的差异。

裕固族健康组人群肠道菌群分属26个门,73个纲,169个目,301个科,709个属,门水平上丰度＞1%的物种有4个,属水平上丰度＞1%的物种有22个。裕固族血脂异常组人群肠道菌群分属29个门,75个纲,280个目,304个科,702个属,门水平上丰度＞1%的物种有4个,属水平上丰度＞1%的物种有15个。裕固族血脂异常组人群肠道菌群与健康组间拟杆菌门、厚壁菌门、放线菌门水平以及F/B比值存在显著差异,Р＜0.05的差异物种有5个,Subdoligranulum、Christensenellaceae_R-7_group及Dialister与血脂水平呈负相关,Lachnoclostridium、Parasutterella与血脂水平呈正相关。

肃南县裕固族血脂异常组人群肠道菌群结构与健康组存在差异,为下一步关联分析肠道菌群与血脂异常及环境因素提供了基础数据。

     

基于16S rRNA和非靶向代谢组测序分析结直肠癌患者肠道菌群及代谢物的变化

目的 采用16S rRNA和非靶向代谢组测序分析的方法探讨结直肠癌患者肠道菌群和其代谢产物的变化。方法 新鲜粪便为实验样品,收集10个结直肠癌患者组样本和6个正常对照组样本进行16S rRNA测序,分析肠道菌群的组成、多样性和物种差异,并对预测差异肠道菌群代谢功能;取8个结直肠癌组样本和6个正常对照组样本进行LC-MS非靶向代谢组学测序,分析代谢产物变化情况并进行功能预测。结果 结直肠癌组的菌群多样性较正常对照组无显著差异（P>0.05）。结直肠癌组的优势菌群为疣微菌门,结直肠癌组葡萄球菌、嗜冷杆菌属、毛螺菌科NK4A136、梭状芽孢杆菌vadinBB60和CAG-56相对丰度增加（P<0.05）,CAG-352、瘤胃球菌属、粪球菌属和挑剔真杆菌相对丰度降低（P<0.05）。KEGG富集分析发现,差异菌群在环境信息处理、遗传信息处理和新陈代谢等通路中发挥重要作用。非靶向代谢组学测序检测出两组样本有367种代谢物存在显著差异,对差异代谢物进行功能预测发现与咖啡因、嘌呤、氨基糖和核苷酸糖和生物素等的代谢相关。结论 结直肠癌患者的肠道菌群和代谢物与健康个体存在差异,结直肠癌...     

大鼠肥胖抑郁模型建立及肠道菌群多样性的性别差异研究

目的 肥胖抑郁大鼠模型建立并对比研究肠道菌群多样性的变化。方法 采用高脂饲料喂养和CUMS经典造抑郁方法建立肥胖抑郁模型。将SD大鼠随机分为正常组(C组)、单纯肥胖组(F组)、单纯抑郁组(Y组)和肥胖抑郁组(FY组),整个造模持续5个月,通过糖水偏好实验、旷场实验和强迫游泳实验来评估大鼠抑郁样行为,检测模型鼠血清雌激素水平和血脂4项,并采集各组大鼠粪便样品,通过16S rDNA高通量测序法和生物信息分析软件分析测序结果,比较各组大鼠肠道菌群多样性的变化。结果 高脂饮食和CUMS方法成功制作肥胖抑郁鼠模型,肥胖和肥胖抑郁雌性大鼠雌激素水平明显升高,而雄性各组间雌激素水平无显著性差异。雌雄鼠的FY组肠道菌群α多样性具有显著差别,拟杆菌门和厚壁菌门B/F比值下降,且雄鼠肥胖抑郁B/F值只有雌鼠的一半左右。在属水平,研究结果表明雌雄鼠FY组和F组肠道菌群中Blautia等8个菌群变化一致,但是雌性与雄性在拟杆菌属等各有少量菌群的变化不一致。雌雄肥胖抑郁模型中,肠道菌群革兰氏阳性菌和阴性菌的组成出现差异,G⁺的构成,雌性和雄性均由由厚壁菌门和放线菌门构成,但构成比例不一样。...     

基于16S rDNA测序技术分析薏苡附子败酱散对急性溃疡性结肠炎小鼠肠道菌群的影响

目的 从肠道菌群的角度探索薏苡附子败酱散治疗溃疡性结肠炎(UC)的作用机制.方法 将24只雄性SPF级C75BL/6J小鼠随机分为空白组、模型组、阳性药对照组、中药组4个组别,通过自由饮用3％DSS溶液的方法制作急性UC小鼠模型.造模成功后,中药组予以1.048 g/mL的薏苡附子败酱散溶液,阳性药对照组予以0.031...     

基于16S rRNA基因高通量测序的太原地区健康成年人肠道菌群结构分析

目的 探讨太原地区健康成年人的肠道菌群结构及多样性。方法 采集太原地区20份健康成年人的粪便样本,提取DNA、构建菌群16S rRNA基因克隆文库、高通量测序并进行生物信息学分析。结果 测序获得优质序列1 383 680条,平均序列为69 184条±551条,归类于455个OTUs;所有样本共含有10个菌门,101个菌属,141种菌;其中核心菌门3个,依次为拟杆菌门（63.13%）、厚壁菌门（31.14%）和变形菌门（5.10%）,占所有样本微生物总量的99.37%;丰度最高的前10个菌属依次为拟杆菌属（43.34%）、普氏菌属（15.51%）、栖粪杆菌属（4.92%）、罗氏菌属（4.73%）、毛螺菌属（3.27%）、萨特菌属（2.50%）、粪球菌属（2.38%）、布劳特菌属（2.31%）、瘤胃球菌属（2.18%）和副杆状菌属（1.61%）,占样本微生物总量的82.75%,未分类的菌属占6.84%。结论 健康成年人肠道微生物群落复杂,但主要菌群相对稳定,为进一步研究人体肠道菌群结构与功能提供了参考依据。     

采用高通量测序技术研究抗生素对小鼠肠道菌群的影响

目的 探讨不同浓度抗生素对小鼠肠道菌群多样性和结构的影响,并预测相关功能变化。方法 15只SPF级ICR小鼠随机分为正常组、低浓度抗生素组和高浓度抗生素组,连续灌胃5 d后,采集小鼠新鲜粪便样本。利用Illumina MiSeq测序平台,对细菌的16S rRNA V3‒V4区进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学分析。结果 高、低浓度抗生素组小鼠肠道菌群组成与正常组存在明显差异。与正常组相比,高剂量组小鼠肠道肠球菌属、志贺埃希菌属相对丰度显著升高（t=‒2.71,P=0.026;t=‒2.30,P<0.05）;分节丝状菌属、拟普雷沃菌属相对丰度显著降低（t=2.88,P=0.020;t=2.49,P=0.037）,理研菌属极显著降低（t=3.79,P=0.005）。低剂量组小鼠肠道菌群变形菌纲成为优势菌,芽胞杆菌属、粪球菌_2、苏黎世杆菌属、普雷沃菌属_2、普雷沃菌属_7、志贺埃希菌属、沙雷菌属和放线菌属等相对丰度显著升高（均P<0.05）;梭杆菌属、泛菌属极显著升高（t=‒3.19,P=0.013;t=‒3.50,P=0.008）;分节丝状菌属、理研菌属相对丰度显著降低（t=2.69,P=0.028;t=2.33,P=0.048）。PICRUSt功能预测分析显示,抗生素组显著增加人类疾病、细胞过程和环境信息处理功能层的基因拷贝数,显著降低有机系统、遗传信息处理和代谢功能层的基因拷贝数。结论 广谱抗生素能破坏小鼠肠道的微生态平衡,有必要深入研究抗生素对心血管、免疫性、感染性及神经退行性疾病发展的潜在作用。     

口服益生菌对根治性放疗宫颈癌患者放疗相关性腹泻及肠道菌群的影响

评价口服益生菌预防根治性放疗宫颈癌患者放疗相关性腹泻（RE）的有效性,并探讨益生菌对根治性放疗宫颈癌患者肠道菌群的影响。

选取2020年1月—2022年12月于广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科行根治性放化疗宫颈癌患者46例,随机分为口服益生菌组（OP组）和非口服益生菌组（NOP组）,每组各23例。采集两组放疗前后粪便标本,通过16S rDNA测序检测肠道菌群,分析肠道菌群多样性和组间的菌群差异。

OP组RE发生率为8.7%,NOP组RE发生率高达47.8%,两组差异具有统计学意义（P=0.009）。口服益生菌能够增加放疗病人肠道菌群丰富度,但不能逆转肠道菌群α−多样性下降（P=0.012）。放疗前后肠道菌群β−多样性差异不显著（P＞0.05）。物种丰度分析显示放疗后肠道菌群在门、科、属、种水平的组成均发生改变;特别是腹泻患者与非腹泻患者比较：放疗前惰性乳杆菌相对丰度较高,但在放疗后惰性乳杆菌相对丰度较低。

宫颈癌患者根治性放疗期间口服益生菌可有效预防放疗相关性腹泻的发生。放疗影响肠道菌群的组成,特别是显著降低肠道厌氧菌的相对丰度。

     

山西省东南部地区胃癌患者肠道菌群分布的配对病例对照研究

目的 观察胃癌患者肠道菌群的变化,为研究其发病机制和治疗措施提供依据.方法 按照1∶1配对原则(年龄、性别、民族、居住地等)在长治某医院根据胃镜检查结果分别选取尚未进行过治疗的10例胃癌患者(胃癌组)和10例健康人群(对照组),面对面调查填写基本信息表,留取粪便样本,采用微生物16S rDNA扩增子测定技术检测粪便菌群...