5′-核苷酸的合成方法比较

5′-核苷酸在农业、食品和医药行业有着广泛的用途。比较了目前5′-核苷酸的工业和实验室合成方法,包括化学合成法,微生物发酵法,酶解法和酶催化法。     

5'-核苷酸的合成方法比较

5'-核苷酸在农业、食品和医药行业有着广泛的用途.比较了目前5'-核苷酸的工业和实验室合成方法,包括化学合成法,微生物发酵法,酶解法和酶催化法.     

人脑胶质瘤细胞质膜的制备和鉴定

 本文介绍以手术摘除的人脑胶质瘤为标本,应用蔗糖梯度离心建立的一种较为简便的人脑胶质瘤细胞质膜制备法。经标记酶测定,化学组成分析及电镜检查,证实质膜具有一定的纯度。质膜中5’-核苷酸酶(质膜标记酶)活性为全匀浆的8.2倍,其它亚细胞组份污染较小。质膜收量为24.6％。生化测定还显示质膜5’-核苷酸酶活性随着胶质瘤恶性程度升高而下降。     

两种3’,5’---环核苷酸磷酸二酯酶的制备

3’,5’-环核苷酸磷酸二酯酶[EC3·1·4·17](以下简称PDE)首先从牛心中分离得到。PDE在生物体中有重要功能,它水解环核苷酸为5’-核苷酸,与核苷酸环化酶共同维持细胞内环核苷酸水平。根据性质不同,PDE可分为多种形式。其中主要的两种为:依赖于 ca~(2+)的PDE,可以被钙调节蛋白     

3′-半分子5′-末端双链结构阻止tRNA连接酶酶促反应

用定点突变技术将不同核苷酸引入酵母苯丙氨酸tRNA反密码子环32,37和38位.体外转录制备tRNA前体,其32,37和38位的核苷酸与野生型tRNA前体相应位点的核苷酸不同.用纯化的酵母tRNA内切酶和tRNA连接酶对这些tR-NA前体进行剪接加工.结果说明,这些位点的核苷酸不仅影响tRNA内切酶对tR-NA前体的酶切效率,而且3’-半分子5’-末端双链结构阻止tRNA连接酶将相应的tRNA半分子连接成整分子tRNA.     

用于肝癌检测的酶底物——5′-(5-碘吲哚酚-[3])胸腺嘧啶核苷酸的制备

检测人血清中5′-核苷酸磷酸二酯酶同工酶谱的变化,是诊断人类原发性肝癌的一个有效的血清酶学方法。和甲胎蛋白诊断法协同,可使肝癌的诊断符合率自80％提高到约94％。减少了甲胎蛋白诊断肝癌存在的假阴性问题,具有重要的临床诊断意义。 检测5′-核苷酸磷酸二酯酶(5′-NPDase)同工酶的底物,5′-(5-碘吲哚酚-[3])胸腺嘧啶核苷酸,我所潘禄兴等已有直接合成法报道。本文在潘禄兴等工作基础上对工艺作了改进,使产率有了明显提高。     

栝楼核糖核酸酶的性质研究

关于栝楼核糖核酸酶的性质已经研究.它对核糖核酸和多聚尿嘧喧核苷酸所显示的酶活性,有很大的相似性:(1)栝楼核糖核酸酶的最适度应pH在5左右;(2)稳定的pH范围在5-12之间;(3)最佳反应温度为55℃左右;(4) 热稳定性:在15分钟内,60℃以下酶活性基本稳定,在65℃左右时大约有50%的活性丧失;(5)金属离子中,除CU~(2+)和Ag~+有明显的抑制作用外、一般作用不明显.另外,酸对其它合成的多聚核苷酸的水解作用,显示有碱基特异性;对双链RNA(CPV RNA)也显有活性.实验中未发现该酶有磷酸单酯酶的活性及降解DNA的活性.因此,该酶可能是一种具有碱基特异性的核糖核酸酶.     

高效液相色谱法在脱氧核糖核酸酶解动力学

为了更好地对脱氧核糖核酸酶解动力学过程进行研究,建立脱氧核糖核酸(DNA)酶解液中4种脱氧核苷酸(腺嘌呤脱氧核苷酸(dAMP)、鸟嘌呤脱氧核苷酸(dGMP)、胞嘧啶脱氧核苷酸(dCMP)、胸腺嘧啶脱氧核苷酸(dTMP))的高效液相测定方法,能将酶解液中4种脱氧核苷酸完全分离并准确定量.在此基础上,对DNA酶解的动力学进行初步研究,其反应机理为不存在底物和产物抑制的双底物顺序反应,动力学方程为x=1/bln(1+abt)(其中a=0.372 3ρ0-0.974;b=-0.049 3ρ20+1.115 3ρ0 - 1.110 3),该方程可以很好地描述DNA酶解过程,误差仅为3.31%.     

高活力5′-磷酸二酯酶制备及水解RNA的研究

目的:获得高活力5′-磷酸二酯酶液,提高核酸RNA酶解效率。方法:采用超滤和盐析技术对从麦芽根浸提液中纯化5′-磷酸二酯酶工艺进行研究,采用单因子试验法优化酶解工艺条件。结果:浸提液依次经过5万Da超滤膜浓缩、40%饱和度硫酸铵盐析、5万Da超滤膜脱盐后,酶活力可达1 500U/ml;第1次超滤膜透过液可作为浸提液循环使用,酶活力是水浸提的1.15倍;第2次超滤膜透过液浓缩5倍后,可回收56.46%硫酸铵,浓缩母液可按1∶2比例循环使用;在底物浓度5.8%、酶用量8%、反应时间2h条件下,RNA酶解率可达95%。结论:初步建立了适合工业化规模的核苷酸生产新工艺。     

香蕉果实特异性ACC合酶的cDNA克隆及序列分析

根据ACC合酶高度保守区氨基酸序列设计两种兼并引物。通过RTPCR,克隆了香蕉果肉ACC合酶1693bp的cDNA片段。再根据其序列测定结果进行5′RACE(RapidamplificationofcDNAends)。最终确定香蕉果肉中ACC合酶的mRNA全长为1752个核苷酸。其中5′非翻译区74个核苷酸,编码区1461个核苷酸,3′非翻译区217个核苷酸,编码产物为486个氨基酸。通过Northern杂交分析,证明此ACC合酶基因的表达具有果实特异性     

高效液相色谱法在脱氧核糖核酸酶解动力学研究中的应用

为了更好地对脱氧核糖核酸酶解动力学过程进行研究,建立脱氧核糖核酸（DNA）酶解液中4种脱氧核苷酸（腺嘌呤脱氧核苷酸（dAMP）、鸟嘌呤脱氧核苷酸（dGMP）、胞嘧啶脱氧核苷酸（dCMP）、胸腺嘧啶脱氧核苷酸（dTMP））的高效液相测定方法,能将酶解液中4种脱氧核苷酸完全分离并准确定量。在此基础上,对DNA酶解的动力学进行初步研究,其反应机理为不存在底物和产物抑制的双底物顺序反应,动力学方程为x=1／bin（1＋abt）（其中a=0．3723p0—0．974;b=-0．0493p0^2＋1．1150p0-1．1103）,该方程可以很好地描述DNA酶解过程,误差仅为3．31％.     

一种简单高效的5'-突出末端平端化方法

目的:报道一种利用Pfu DNA聚合酶延伸法补平限制片段5’-突出末端的平端化方法。方法:Pfu DNA聚合酶是用于PCR扩增的常规高保真DNA聚合酶,可在DNA模板和dNTPs存在条件下,沿5’→3’方向催化寡聚核苷酸聚合。由于终产物为平末端,可利用这一特点进行限制片段5’-突出末端补平。本文采用这一方法消除pAN7-1潮霉素抗性标记末端的XbaⅠ位点,以便载体构建中能够利用这一常见位点。pAN7-1先用XbaⅠ酶切成线性化载体,产生的5’-突出末端再用Pfu DNA聚合酶延伸法补平,通过平端化载体自连后XbaⅠ位点的消除来评价Pfu DNA聚合酶的平端化效果。结果:随机挑取3个重组子提取质粒均不能再用XbaⅠ切开,表明XbaⅠ位点成功消除。结论:Pfu DNA聚合酶具有高效率及高保真特性,因此本法简单高效而且经济适用。     

一种简单高效的5＇-突出末端平端化方法

目的：报道一种利用Pfu DNA聚合酶延伸法补平限制片段5’-突出末端的平端化方法。方法：Pfu DNA聚合酶是用于PCR扩增的常规高保真DNA聚合酶,可在DNA模板和dNTPs存在条件下,沿5’→3’方向催化寡聚核苷酸聚合。由于终产物为平末端,可利用这一特点进行限制片段5’-突出末端补平。本文采用这一方法消除pAN7-1潮霉素抗性标记末端的XbaⅠ位点,以便载体构建中能够利用这一常见位点。pAN7-1先用XbaⅠ酶切成线性化载体,产生的5’-突出末端再用Pfu DNA聚合酶延伸法补平,通过平端化载体自连后XbaⅠ位点的消除来评价Pfu DNA聚合酶的平端化效果。结果：随机挑取3个重组子提取质粒均不能再用XbaⅠ切开,表明XbaⅠ位点成功消除。结论：Pfu DNA聚合酶具有高效率及高保真特性,因此本法简单高效而且经济适用。     

应用磷酸二酯酶定量测定植物钙调素

钙调素(Calmodulin,简称CaM)研究工作中一个重要手段是其定量测定。目前国内外CaM定量方法主要有3类:酶法(如PDE酶、NAD激酶等);免疫学方法(如放射免疫法等)和聚丙烯酰胺凝胶电泳法。其中环核苷酸磷酸二酯酶(Phosphodiesterase简称PDE酶)法因为可以测定活性态CaM,无需特殊设备或试剂,灵敏度虽低于放免法,但高于电泳法,是目前最为普遍应用的CaM定量方法。下面介绍我们在定量测定植物CaM中的做法与体会。     

绞股蓝法呢基焦磷酸合酶基因的克隆及其序列分析

目的:克隆并分析绞股蓝法呢基焦磷酸合酶(FPS)基因的全长序列。方法:参照罗汉果法呢基焦磷酸合酶基因,设计扩增绞股蓝FPS基因的3′RACE引物,采用3'RACE和5'RACE法克隆绞股蓝FPS基因全长cDNA。结果:获得绞股蓝FPS基因全长cDNA序列共1288个核苷酸,包含一个1026核苷酸的开放读框,编码342个氨基酸残基,推断该蛋白的相对分子质量为3.94×104。NCBI Blast结果显示绞股蓝FPS基因编码蛋白的氨基酸序列与已知的植物FPS氨基酸序列的同源性为91%~74%,核酸序列的同源性为88%~78%。结论:克隆了绞股蓝FPS基因全长cDNA序列,为进一步研究绞股蓝FPS基因的表达及三萜皂苷合成通路关键酶分子的进化奠定了基础。     

胸腺嘧啶新的生物合成路径

胸腺嘧啶是由胸苷酸合成酶合成的,这种酶催化“2’-脱氧尿苷-5＇-单磷酸盐”的尿嘧啶部分的甲基化。传统的胸苷酸合成酶,包括人体的这种酶,利用1个活性点氨基酸侧链在该反应的这一阶段激发基质。     

多核苷酸合成的研究 Ⅱ.CpUpCp、GpUp和CpUpCpGpUp的合成

本文报道了酵母丙氨酸转移核糖核酸3’-端茎区顺序中CpUpCpGpUp五核苷五磷酸的合成。_(HO)U(OBz)-p-NHC_6H_5同_(MMT)GA~(AC)(OAc)-p或_(MMT)G~(iBu)(OiBu)-p用DCC缩合再脱去5’-MMT后可分别得到_(HO)G~(Ac)(OAc)-p-U(OBz)-p-NHC_6H_5和_(HO)G~(iBu)(OiBu)-U(OBz)-p-NHC_6H_(50) _(HO)U(OBz)-p-NHC_6H_5同_(Bz)C~(Bz)(OBz)-p用DCC缩合再脱去3’-末端磷酸的苯胺保护基得到_(Bz)C~(Bz)(OBz)-pU(OBz)-p,此保护二核苷酸再同_(Ho)C~(Bz)(OBz)-p-NHC_6H_5用DCC缩合,然后再脱去3’-末端磷酸的苯胺保护基得到_(Bz)C~(Bz)(OBz)-p-U(OBz)-p-C~(Bz)(OBz)-p。此保护的三核苷酸同_(Ho)G~(Ac)(OAC)-p-U(OBz)-p-NHC_6H_5用DCC缩合,然后脱去3’-末端磷酸的苯胺保护基和全部酰基保护基并经7M尿素柱层析纯化,最后得到自由的五核苷酸CpUpCpGpUp。产物经纸电泳、薄板层析鉴定为均一,用牛胰核糖核酸酶水解后得到预期的核苷酸组成比例。     

树脂在生化物质分离纯化上的应用——Ⅲ 核酸和氨基酸

<正> 五、核苷酸1、5’—单核苷酸分离核糖核酸经酶降解为四种单核苷酸(即5’—AMP、5’—CMP、5’GMP、5’—UMP),可应用离了交换树脂将其一一分离开来。使用阳树脂和阴树脂,只要控制一定条件,即可达到分离目的。图1,2是应用阳树脂和阴树脂分离四种单核苷酸的色谱曲线。     

寿光鸡ADSL基因5′调控区的克隆、序列分析以及单核苷酸多态性的研究

腺苷酸琥珀酸裂解酶(ADSL)是双功能酶,催化嘌呤核苷酸的起始合成与嘌呤核苷酸的循环。通过对寿光鸡ADSL 5′调控区1035bp的序列进行克隆和测序分析,发现其具有典型的管家基因特征：没有真核基因明显的TATA盒和CAAT盒出现,并且位于起始密码子(ATG)前234个碱基具有非常高的GC含量达72．65％。在邻近起始密码子“ATG”处,5′调控区含有两个核呼吸因子-2(NRF-2),在相同位置上人类ADSL基因也具有与此类似的两个核呼吸因子-2结合位点,被认为在嘌呤核苷酸合成途径起到重要作用。值得一提的是位于寿光鸡5′侧翼调控区-27号碱基发生C→T突变,存在于所有研究的寿光鸡个体中,频率为1。该突变使得本来不是NRF-2(核呼吸因子2)结合位点的CTCC突变为NRF-2结合位点CTTC。而人类却恰恰与此相反第一个NRF-2结合位点发生了突变(CTTC→CTCC),并导致出现ADSL缺陷症状。     

杂花和紫花苜蓿原生质体分离培养条件的筛选

以杂花苜蓿‘甘农1号’和紫花苜蓿‘甘农4号’、‘阿尔冈金’及‘清水’4个适宜西北内陆黄土高原地区栽培的苜蓿愈伤组织为材料,研究酶解时间、酶液组合、酶液渗透压、愈伤组织继代培养时间、预处理措施及不同培养方法等对原生质体分离和培养效果的影响,并对培养条件进行优化。结果表明:(1)适宜4个苜蓿品种愈伤组织酶解的最佳预处理措施为0.55mol/L蔗糖或CPW溶液中预质壁分离1h,最佳继代时间均为12d。(2)‘甘农1号’、‘甘农4号’和‘清水’的最佳酶液组合均为2%纤维素酶+0.5%果胶酶+0.3%崩溃酶;‘阿尔冈金’的最佳酶液组合为2%纤维素酶+0.5%果胶酶+0.3%半纤维素酶+0.3%离析酶+0.3%崩溃酶;‘甘农1号’和‘阿尔冈金’的最佳酶解时间为12h,‘甘农4号’和‘清水’分别为14h和10h。(3)适宜4个品种酶解的甘露醇浓度分别为‘甘农1号’0.75mol/L,‘甘农4号’0.65mol/L,‘阿尔冈金’0.6mol/L,‘清水’0.55~0.6mol/L。(4)经液体浅层培养和固液培养方式均可获得4个苜蓿品种的再生愈伤组织,且固液培养法较液体浅层培养法更有利于苜蓿原生质体早期的培养和再生。