循环长链非编码RNA作为生物标志物在肿瘤分子诊断中的应用

长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)被发现广泛参与基因表达、表观遗传调控和X染色体失活等重要生命过程,还与肿瘤发生和发展密切相关。lncRNA可能以微泡、外泌体或蛋白质复合物形式进入人体循环系统中,形成循环lncRNA稳定而广泛存在于血液、尿液等体液中。文中简要回顾了近来关于循环lncRNA的来源,以及作为生物标志物的检测方法,着重总结分析了循环lncRNA作为潜在肿瘤生物标志物在肺癌、乳腺癌、胃癌、肝癌、结直肠癌和前列腺癌等常见恶性肿瘤中的早期诊断价值。与传统生物标志物相比,循环lncRNA具有作为新型生物标志物的独特优势和临床应用价值。     

lncRNA在肿瘤中的表达及作用机制

长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类转录本长度大于200 nt,不具有蛋白编码功能的非编码RNA.近年来,随着高通量测序技术的发展,越来越多的功能性lncRNAs逐渐被发现,且已成为研究的热点.研究发现,lncRNAs可以作为致癌或抑癌基因参与肿瘤的发生发展.通过比对肿瘤细胞和正常细胞的表达谱显示,多种lncRNAs在不同类型肿瘤中异常表达.除了表型上的研究,目前已有部分报道深入研究了lncRNAs在肿瘤中的作用机制.例如,lncRNAs与肿瘤细胞凋亡、转移及耐药等过程密切相关.此外,在肿瘤患者的临床常规检验中检测到lncRNAs,提示其能够作为一种潜在的肿瘤诊断和预后因子. lncRNAs有望成为新型肿瘤标志物和肿瘤治疗的靶点,用于诊断、治疗、预测预后.本文将通过对lncRNAs在肿瘤中的作用及其分子机制进行综述.     

长链非编码RNA与肿瘤的关系及其临床价值

长链非编码RNA（long non-coding RNA,IncDNA）是指长度超过200个核苷酸、具有调控基因表达作用的非编码RNA。近年来研究表明,长链非编码RNA在肿瘤的发生、发展过程中发挥着促癌或抑癌作用,它们参与了细胞凋亡调控、肿瘤浸润与转移等过程;另外,它们还通过表观遗传调控的方式影响肿瘤细胞的生长。它们有希望成为新型肿瘤标志物和肿瘤治疗的靶点,在肿瘤诊断和治疗方面显示出良好的临床应用前号。     

长链非编码RNAs与妇科肿瘤

长链非编码RNAs(long non-codiong RNAs,lncRNAs)是具有原始或是剪切转录本功能的RNA,并不符合小分子RNAs和结构RNAs的已知定义。它们分别在宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌、乳腺癌等妇科肿瘤中出现异常表达的现象,使其有希望成为未来妇科肿瘤的新型标志物和治疗靶点,但其作用机制有待于进一步探索。     

综述: 新型长链非编码RNA(lncRNA)的生物信息学研究进展

非编码RNA (noncoding RNA,ncRNA)是指不被翻译成蛋白质的一类RNA,近几年来关于它们的功能研究越来越引起人们的重视．现在已经发现了一些中小型ncRNA,比如microRNA、snoRNA、tRNA等,但是关于长ncRNA(lncRNA)的研究还不够完善．本篇综述回顾了 ncRNA特别是 lncRNA的生物信息学研究进展,包括它们的研究历程、基本特点、与疾病的关系,以及对已有的预测非编码RNA的计算机方法进行了分析和比较,并且介绍了利用机器学习模型整合新一代高通量测序数据的方法．     

lncRNA与miRNA相互调控作用及其与肿瘤的关系研究

长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200 bp的非编码RNA,可作为人类基因组中一类重要的调控分子通过多种方式发挥其生物学功能.近年来的研究表明,lncRNA也可以作为一种竞争性内源性RNA (competing endogenous RNA, ceRNA) 与miRNA相互作用,参与靶基因的表达调控,并在肿瘤的发生发展中发挥重要的作用.本综述在简要介绍lncRNA功能研究现状和主要研究方法的基础上,进一步分析了lncRNA与miRNA之间的互相调控关系及其在肿瘤发生发展中的作用,以便为后续的研究提供新的思路.     

基于TCGA和GEO数据库的胃癌lncRNA筛选与ceRNA网络构建

胃癌(gastric cancer,GC)是我国最常见的恶性肿瘤之一,严重危害人类健康。胃癌发病机制复杂,缺乏特异性预后生物标志物。长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)可作为竞争性内源RNA (competing endogenous RNA,ceRNA),影响microRNA (miRNA)与mRNA的结合,从而影响胃癌的发生、发展。基于TCGA和GEO数据库的转录组数据,筛选GC 中差异表达的 lncRNAs,并构建基于 6 条 lncRNAs(HAGLROS、TMEM92-AS1、LINC01745、HOXC-AS3、SEMA3B-AS1、FEZF1-AS 1)的lncRNA-miRNA-mRNA网络。网络核心基因的KEGG/GO富集和蛋白质互作分析结果显示,lncRNA可能通过miRNA海绵吸附作用,调控胃癌的发生、发展与转移。AC011352.1、AC087636.1、AC093627.1、GAS1RR与胃癌患者的预后相关性具有统计学意义(P<0.05),并可能成为胃癌患者潜在的预后生物标志物。     

反义lncRNA在NSCLC中的作用及机制

非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)在我国发病率和死亡率非常高,严重威胁着公众健康。由于缺乏敏感有效的早期诊断指标、易复发、易产生耐药性等因素,NSCLC的临床治疗效果一直不佳,导致患者预后差及生存率低。反义长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的异常表达与NSCLC发生发展密切相关,在NSCLC的增殖、凋亡、侵袭、迁移、上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)和耐药等方面均发挥着重要作用,已成为近年来的研究热点。本文探讨反义lncRNA在NSCLC发生发展过程中的功能及具体调控机制,旨在为NSCLC患者提供更有效的治疗理论参考。     

miRNA和lncRNA在动物脂肪沉积中的研究进展

微小RNA(MicroRNA,miRNA)是一类由18–25个核苷酸组成的高度保守的核苷酸序列,它可以特异性结合信使RNA (mRNA)的3′-非编码区域,进而发挥降解mRNA或阻遏mRNA翻译的负调控作用。长链非编码RNA (Long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸、不能编码蛋白质或只能编码蛋白质微肽的核苷酸序列,它可以在表观遗传、转录水平和转录后水平调控基因表达。脂肪作为一种重要的储能物质,在调节动物体能量平衡过程中发挥着重要的作用,并与动物产肉量、肉品质等产肉性状密切相关。而脂肪功能的紊乱可导致高血脂、Ⅱ型糖尿病以及一系列心血管疾病发生,因此动物脂肪沉积的分子调控机制备受人们关注。近年来,越来越多的研究发现miRNA和lncRNA在动物脂肪沉积中发挥重要作用。文中就现阶段miRNA和lncRNA在动物脂肪沉积中的研究进展进行综述,以期为进一步揭示动物脂肪沉积的分子调控机制提供理论指导和新思路。     

长链非编码RNA-重编码调控因子与肿瘤的研究进展

长链非编码RNA(LncRNA)是一类长度超过200核苷酸且不编码蛋白质的RNA分子。肿瘤基因组学的快速发展使LncRNA在人类肿瘤研究方面的功能更加显著。基因间LncRNA(LincRNA)-重编码调控因子(ROR)作为一种新型LncRNA,其作用机制在结直肠癌、胰腺癌、乳腺癌的发生发展过程中有报道。我们就LincRNA-ROR在肿瘤中的相关调控机制以及在不同肿瘤中的研究现状做简要综述,以便对其有进一步了解。     

长链非编码RNA在调控EMT及肿瘤侵袭转移中的作用

上皮–间充质转化(EMT)是指在某些因素的作用下,上皮细胞失去极性,细胞紧密连接性丧失,转变成具有迁移能力的间充质细胞的生物学过程。EMT在肿瘤的侵袭转移过程中发挥着重要的作用。长链非编码RNA(lncRNA)在许多癌症中异常表达,在肿瘤的发生发展中发挥了重要的作用, lncRNA亦参与肿瘤侵袭转移,近年来越来越多的研究发现, lncRNA参与调控EMT进程,进而影响肿瘤的侵袭转移,逐渐成为临床肿瘤诊断及治疗的潜在靶点。该文将对lncRNA在调控EMT及肿瘤侵袭转移中的作用机制及相关临床治疗研究进行综述。     

lncRNA作为竞争性内源RNA在非小细胞肺癌中的作用

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)参与肿瘤的多种生理、病理进程.研究表明,lncRNA可通过与微小RNA (microRNA, mi RNA)反应元件相互作用,并与其他RNA分子形成竞争性内源RNA (competing endogenous RNA,ceRNA)的调控网络,参与基因的表达调控.lncRNA以ceRNA方式参与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的发生发展过程,为揭示NSCLC的分子机理开拓了新的思路,也为NSCLC的治疗提供新的靶点.本文在课题组前期发现NSCLC相关ceRNA基础上,主要讨论lncRNA作为ceRNA在NSCLC中高表达、低表达及治疗相关方面的作用.     

lncRNA在动物脂肪沉积中的研究进展*

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),是一种长度大于200个核苷酸的调控性非编码RNA,能在转录水平、转录后水平及表观遗传水平等多个层面影响基因的表达。脂肪生成是一个复杂而有序的过程。大量研究表明,lncRNA在脂肪生成过程中扮演着重要角色,它可以影响脂质代谢及成脂分化等多种生物过程,从而间接影响肉品质。这对于提高畜禽肉品质、避免养殖业饲料过多转化成脂肪所导致的浪费以及对预防和治疗与脂肪代谢相关的疾病都具有重要意义。对lncRNA的基本特征、在动物脂肪沉积中的作用进展进行了综述,以期为培育优质畜禽,预防和治疗与脂肪代谢相关的疾病提供理论依据。     

肿瘤外泌体lncRNA在肿瘤微环境中的作用

外泌体是细胞分泌的纳米级囊泡,富含多种生物活性物质,是细胞间通讯的重要媒介.长非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)可从多个方面影响肿瘤的发生发展,并能特异地分选入外泌体中.肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)是由肿瘤细胞及非肿瘤细胞(例如内皮细胞、免疫细...     

肿瘤发生过程中miRNA与lncRNA的相互作用

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是生物体内普遍存在,且对生命活动具有重要调控作用的生物分子.以微RNA（microRNA,miRNA）和长链非编码RNA（long non coding RNA,lncRNA）为代表的ncRNA分子在肿瘤发生和发展过程中都有重要的作用.越来越多研究发现,miRNA和lncRNA之间的关系是非常密切的,某些lncRNA(如H19和BIC)可以作为miRNA的前体,通过加工成miRNA而发挥作用.有些miRNA通过作用于lncRNA影响肿瘤的发生(如：miR-129与MEG3,let-7与H19);同样地,有些lncRNA通过作用于miRNA影响肿瘤的发生(如：HULC与miR-372,PTCSC3与miR-574-5p,ciRS-7与miR-7,Sry与miR-138).miRNA与lncRNA之间既可以直接相互作用,也可以通过其它分子（特别是蛋白质或蛋白质复合物）间接地影响着肿瘤的发生和发展.揭示miRNA和lncRNA相互作用在肿瘤发生中的作用可以为肿瘤的诊断和治疗提供新思路.     

长链非编码RNA在胃癌中的研究进展

长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的转录本,其转录本没有或少有蛋白质编码功能,参与调控多种生物生理功能。lncRNA可在表观遗传学、转录及转录后等多层面调控基因表达,对个体生长发育及肿瘤发生、发展过程至关重要。近年来,有诸多的研究发现lncRNA参与胃癌的发生、发展及转移等多个过程,且与患者的预后相关。对lncRNA在胃癌增殖、凋亡、侵袭和转移中的调控作用进行了综述,以期为胃癌临床诊断与治疗提供新的思路。     

miRNA在肿瘤分子诊断和治疗中的研究进展

微小RNA(miRNA)是一类真核生物内源性、长18~25个核苷酸的小分子单链RNA,能够通过与靶mRNA特异性的碱基互补配对引起靶mRNA的降解或者翻译抑制,miRNA调节的紊乱将对细胞产生重要的影响。在肿瘤中,抑癌性miRNA的缺失会增加其靶向致癌基因的表达,而致癌miRNA(被称为oncomirs)的升高能够降低其靶向肿瘤抑制基因的表达。这一认识使得应用靶向致癌性miRNA与恢复抑癌性miRNA的功能来治疗肿瘤成为可能。随着临床研究的不断深入,miRNA不断为肿瘤分子诊断和治疗提供新的思路和治疗手段。     

消化道肿瘤的循环血长链非编码RNA及其检测新技术

长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度大于200个核苷酸的非编码RNA分子,广泛参与细胞增殖、分化、凋亡、染色质重塑等重要生命过程。大量研究证实,lncRNA可以在血液循环中稳定存在,其表达水平与消化道肿瘤的发生、发展和转归密切相关。本文简要回顾了近年来消化道肿瘤循环血lncRNA的最新研究进展,着重讨论了循环血lncRNA在消化道肿瘤诊断和预后评估中的临床应用价值及其检测新技术。