染色体三维结构重建方法研究

染色体三维结构重构问题是近年生物领域中基因组学的热点研究问题,是以二维交互频率数据为基础来预测其三维空间结构。最新相关实验表明染色质的三维空间结构对于基因表达、调控等方面都具有重要意义。而Hi-c数据能利用染色质交互信息形成二维接触矩阵重构出染色体三维结构。本综述以染色体三维结构重建方法为研究对象,通过对染色体三维结构重建方法进行比较分析,综述了目前基于Hi-c数据在染色体三维结构重建中的经典方法,系统介绍了染色体三维结构重建技术的发展脉络,以促进染色体三维结构重建的进一步研究。     

森林防护效益及计量方法的初步研究

一、研究目的本文试图通过黑龙江省森林防护效益的计算,来研究确定适宜的森林覆被率的计量指标,同时探讨森林防护效益计量研究的方法。二、研究方法目前国内外研究森林防护效益计量,主要是采取定位观测的方法。这对于确切的观察森林产生某些效能的过程和机理是必不可少的。而要研究森林宏观效益,则要设置大量的台站,要做长期的观测,这是比较困难的。为适应     

美国工业界在生物技术方面的应用研究开发活动

美国的科技研究开发投资,主要来自两方面:一是政府的研究发展(R&D)预算,二是工业界的研究开发投资。政府的研究预算支出,主要是用于基础研究和一部分基础应用研究。这些研究大部分是通过大学来进行。至于应用研究,则主要是靠工业界自己的投资和研究。美国公私这两方面的投资比例,以1985年前后生物技术的数字说,大体上各占一半。     

凤眼莲生物质热重分析研究

采用热重法（Thermogravimetry,TG）对凤眼莲生物质的热解、燃烧、气化特性进行了考察,研究了升温速率对生物质热解特性的影响,同时采用Kissinger法对实验数据进行了分析,建立了凤眼莲的热解、燃烧动力学模型。研究结果表明,凤眼莲在不同的气氛条件下,反应过程明显不同。氧气条件下发生了剧烈的氧化反应,产物以CO₂和H₂O为主。氮气气氛下,生物质主要发生的是分子结构中较弱的化学键受热分解的过程,气体产物以有机小分子为主。在二氧化碳的氛围下,生物质主要发生的是二次反应,气体产物主要以合成气和焦炭为主。生物质的热解和燃烧过程均可以用一级动力学方程来描述。     

利用三角帆蚌控制水华的初步研究

富营养化已成为全球面临的主要环境问题之一。目前,治理水体富营养化,主要从两方面来进行:一是控制外源性营养物质输入,如截污分流和污水集中处理,主要用于控制点源污染;二是减少内源性营养物质负荷,如微生物修复、底泥疏浚、化学法、人工湿地、水生植被恢复等,其目的是控制面源污染和加快湖泊的恢复速度[1—5]。上述研究方法单一或联合采用,已在一些湖泊取得一定的效果。本文以汉阳莲花湖为例,在实验室多次模拟试验的基础上,在富营养化水体中引入三角帆蚌,研究利用三角帆蚌控制浮游植物的过量生长。1材料与方法莲花湖已经严重富营养化,水质…     

计算生物学在RNA研究中的应用

计算生物学在非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)研究领域中发挥着重要的作用.计算生物学是利用计算机科学方法来研究和理解生命科学问题的交叉学科,而ncRNA作为一类数目庞大且功能多样的RNA分子,参与了广泛的生物学过程.本文对RNA计算生物学中的常用算法和工具进行综述,并着重介绍专家系统、机器学习、深度学习等计算生物学研究策略在ncRNA鉴定、ncRNA靶标预测、RNA修饰、RNA二级结构检测、RNA-蛋白质互作及RNA功能预测中的应用.     

铜尾矿污染区土壤酶活性研究

对浙江省哩浦铜尾矿污染区土壤酶活性进行了研究,结果表明,尾矿区及其周边土壤环境受到不同程度的Cu、Zn、Pb、Cd污染,从尾矿库中心到外围重金属污染程度逐渐减轻,而土壤酶活性则不断提高,其中以脱氢酶和脲酶活性增加最明显,回归分析表明,单一脱氢酶、脲酶、酸性磷酸酶以及蛋白酶活性与重金属复合元素含量之间存在显著线性关系,主成分分析结果显示,尾矿区土壤酶信息系统的第一、二主成分方差贡献率之和达98．24％,以第一、二主成分建立了两个土壤总体酶活性指标,并用此指标对各供试样本进行空间分类,其结果与以重金属含量为依据的划分结果基本吻合,可见,采用酶活性构筑的土壤信息系统的总体酶活性来表征矿区土壤的重金属污染状况是可行的。     

螺旋霉素发酵的研究

抗菌素是微生物的次级代谢产物,就大多数抗菌素的深层发酵而言,一般可划分为两个阶段,即菌丝生长阶段和抗菌素合成阶段。这二个阶段对营养的需求是有区别的。本文主要报道螺旋霉素合成期对碳源、氮源、磷源的需要,以及通过补加营养物质来提高螺旋霉素产量的研究结果。     

山羊草属不同细胞质对小麦籽粒蛋白含量及组分的影响研究

以山羊草属（Aegilops)6种不同异源细咆质的异质小麦品系Chris为材料,与生产上广泛种植的9个常规小麦品种正反杂交,系统地研究了供试6种蚌源细胞质对其F1籽粒蛋白含量的影响,同时对单芒山草(Ae．uniaristata)、二角山羊草(Ae.bicorins)细胞质对籽粒蛋门组分含量的影响亦进行了研究。结果表明：(1)在以6种异源细胞质材料为母本的杂交组合中,78%的组合其蛋白含量高于反交对照。尤以单芒、二角山羊草细胞质的正效应最为显著,平均提高2个以上百分点,最高达3．7个百分点。(2)供试单芒、二角异源细胞质对籽粒清蛋白和球蛋白的含量影响最大,对醇溶蛋白和谷蛋白含量的影响相对较小,其效应值大小因特定组合而异。(3)供试异源细胞质对籽粒蛋白质含量和组成的影响均存在显著的核质互作效应。通过异源细胞质的途径来改良小麦籽粒的蛋白含量和组分是一条有效可行的方法,只要选择合适的核质组合即可达到改良目的。     

古生物学研究中的采样问题及多样性估计方法——以华夏正形贝动物群为例

传统的古生物学采样方法通常很少对同一化石层面展开进行,由此得到的多样性信息往往难以反映化石组合的真实情况。通过观察稀疏化曲线平缓程度来判断化石采样是否充分的经验方法并不严谨。本文在介绍古生物化石采样方法的基础上,提出采样是否充分的本质是采样获得的多样性与所属化石群落潜在多样性之间的接近程度。借鉴现代生物学中的多样性估计方法,以华夏正形贝腕足动物群为例,本研究采用EstimateS软件,定量估计4个化石点的潜在多样性;探讨客观判断采样充分的方法,同时通过曲线拟合法预测达到特定多样性可能需要的样本数量,为二次研究提供重要信息。该多样性估计方法是古生物研究中一个较新的领域,在多样性对比及特定化石群的多样性评估中均有较好应用前景。为得到更全面的多样性信息,文章建议相关研究在使用稀疏化的同时辅以多样性估计方法。     

广州市中心城区院前急救反应时间影响因素实证研究 ——基于分位数回归方法

目的 探讨影响广州市中心城区院前急救反应时间延长的因素。方法 采用分位数回归法分析影响2015年广州市中心城区院前急救反应时间的因素,其结果与普通最小二乘法得出的结果进行对比。结果　广州市中心城区院前急救反应时间的平均数为14.11分钟,中位数为13.25分钟。医院区位分布、妇产科医生、交通高峰期这三个解释变量是影响广州市中心城区院前急救反应时间延长的因素。结论　分位数回归方法能够较好地应用于院前急救反应时间的研究。我们可根据影响院前急救反应时间的因素来制定相关政策,以提高院前急救质量。     

天然抗癌药物紫杉醇的研究进展

紫杉醇是一种二萜类化合物,具有独特的抗癌活性。近年来围绕紫杉醇所进行的高水平研究越来越多。综述了紫杉醇来源的研究进展,主要涉及化学合成和生物合成方法,并对其发展前景进行展望。     

折迭三维列联表的临床应用

在医学研究中,我们会遇到多指标的问题,就是多变量的问题。如果这些变量是定量的,可用多元分析方法。如果这些变量是定性的,那么就需要采用多维列联表,然而分析多维列联表的工作是相当繁重的,许多研究工作者设法从多维表导出一系列二维列联表,用对它们进行分析来代替对多维表的分析。我们把合并除了指定的两个变量外的所有变量的各种取值来导出二维列联表的方法称为就某些变量来折迭多维列联表。问题是在什么条件下将多维表折迭为二维表能保持不破坏它的结构。     

三维城市景观生态研究

城市景观元素的三维分析是城市景观研究发展的重要趋势之一。城市形态的结构特征与功能的空间作用不仅体现在二维空间中,同时在三维向度上表现出城市社会经济发展态势与空间演变的相互作用,因此在城市空间格局、过程与功能的讨论中,不能局限于二维平面。首先由三维视角提出城市景观格局及功能网络特征,并结合对航空摄影测量、卫星遥测、机载激光扫描等三维信息获取方法的认识,介绍目前城市景观三维信息提取的相关方法;其次,在三维城市景观生态研究内容方面,重点介绍城市景观要素提取、格局特征及其动态变化、生态环境效应和城市景观功能等相关研究,探讨城市内部的三维建成景观以及绿地景观要素提取与应用,并在传统景观格局分析方法基础上,提出了三维城市景观格局特征测量方法、动态变化监测方法以及动态模拟等相关内容,进一步对三维城市景观在生物多样性、局部气候变化等生态环境效应方面的研究进行了归纳总结;最后借助构建三维景观功能网络的思路,以作为三维城市景观功能优化研究的切入点。     

灵长类性别二态的比较方法及其变异和进化的数学模式

动物的性别二态(Sexual dimorphism)在国外是一研究热门,有关论述甚为普遍(Leytenegger et al.,1977、1982、1985;Leutenegger,1978、1981、1982;Slender,1972;Ralls,1977;Lande,1980;Pikford et al.,1986;Schultz,1949;Senut,1986;Jablonski,1986;Borgognini-Tarli,1986)。但在我国,专门性的研究还不多(吴汝康,1987;吴汝康等,1987)。开展动物的性别二态研究可以对被研究种类的行为、生态、社会开展动物的性别二态研究可以对被研究种类的行为、生态、社会结构、活动节律及进化等问 题作出某些推测或假说, 并为系统分类及进化的研究提供较科学的依据（吴汝康,1987;Slender,1972;Clutton-Broock et al.,1977;Ralls,1977;Leutenegger,1982;Leutenegger et al.,1985;Junggers,1985;Jablonski,1986）。不同的种间,或同一种的不同群体间所存在的性别二态表现程度不尽相同(Stern,1983)。但是,在进行系统分类时, 特别是亚种之间分类时,一些作者往往只从整体的外部特征来考虑,没有把更多的注意力放在性别二态的研究上。对化石的研究更是如此。也就是说,对于一些群体的差异只从整体上进行比较,常常忽视群体内部的差异,特别是群体内的性别差异。实际上,有时这种群体内的差 异还会大于群体间的差异。如出现这种情况,再把这两个群体分为不同的分类单元是没有道理的。因此,开展对性别二态的研究将为传统的分类方法（特别是亚种的分类）提供一个很好的辅助手段。对化石研究时还可探讨其动物生活时期的行为、食性、进化趋势以及与其它 种类之间的亲缘关系（吴汝康等, 1987）。但目前在对性别二态研究时,我们往往缺乏较系统和完整的统计分析方法。本文试图对目前常使用的一些多变量统计方法作一些简单介绍, 以引起大家的关注。较详细的计算过程参阅有关专业书。本文还对性别二态的变异和进化模 式作一些概述。     

小鼠早期胚胎移植技术的研究

哺乳动物胚胎移植技术是实验胚胎学、遗 传学、发育生物学研究中的一项重要技术。在 卵母细胞的体外培养、卵的体外受精及对早期 胚胎进行显微手术等研究中,往往是通过观察 卵在体外培养中的卵裂情况来鉴定实验效果。 但是更理想的方法就是将有发育能力的胚胎移 入受体子宫或输卵管内,以观察胚胎能否继续 发育直至胎儿出生。为此,我们对小鼠早期胚 胎进行了外科、非外科手术移植的研究。     

唑来膦酸延缓骨转移癌放射治疗的临床研究

目的以帕米膦酸二钠为对照,研究唑来膦酸对延缓骨转移癌放射治疗事件发生的临床疗效。方法对118例骨转移癌患者,随机分为病例组60例,对照组58例,以疼痛持续加重,X线或CT证实骨转移病灶进展或有可能导致病理性骨折而行放射治疗为观察终点,研究唑来膦酸延缓骨转移癌放射治疗事件出现时间的临床疗效。结果近期止痛有效率和获益率在唑来膦酸组分别为55.36%,65.18%;帕米膦酸组为35.19%,44.44%,P<0.05;放疗事件发生率在唑来膦酸组为34.21%,帕米膦酸钠组为54.28%,P>0.05;发生放疗事件中位时间在唑来膦酸组为121天,帕米膦酸钠组为189天,P=0.041。结论唑来膦酸近期止痛的临床有效率、获益率和总体骨相关事件(SRE)危险性降低的比例均高于帕米膦酸二钠。     

低温电子显微技术在膜蛋白结构研究中的应用和展望

介绍了蛋白质电子晶体学和单颗粒分析技术这两种低温电子显微技术在膜蛋白和膜蛋白复合体结构研究中的具体方法和近10~20年来的实际应用,并分别分析了这两种方法的优势和瓶颈。此外,还介绍了Amphipol替代、Streptavidin二维晶体锚定脂质体和纳米球包被脂质体等近两年来出现的新的用于低温电镜成像的膜蛋白样品制备方法。最后对膜蛋白的低温电子显微研究的未来发展做了展望。     

基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究

利用复杂网络的方法来探索序列特征因素对蛋白质结构的影响。由于蛋白质的序列对结构具有重要且复杂的影响,因此将蛋白质的结构以及序列特征之间的关系模拟成一个复杂系统,通过利用互相关系数、标准化互信息和传递熵等方法来建立以序列特征为节点的加权网络,进而利用网络中心性的方法来分析不同蛋白质结构类型对应加权网络的中心性分布的差异,探索不同结构类型蛋白质的序列特征差异。发现不同的蛋白质结构类型对应的序列特征网络既有共性又有差异,文章将针对每一种结构类型的网络中心性分布,以及不同结构类型之间的共性与差异进行详细地讨论。研究结果对蛋白质序列与结构之间关系的研究,特别是结构分类研究具有重要的意义。     

滩羊胚胎期皮肤及毛生长的初步研究

滩羊为我国一种珍贵的裘皮羊品种。从不同学科领域来研究滩羊的生物学特性,具有一定的理论和实践意义。 滩羊的经济价值除生产毛、肉外,主要是生产轻暖而花穗美观的裘皮——二毛皮。其质量的优劣受到许多因素的影响,如遗传因素、环境因素(地理、气候)和饲养管理等。就个体发育来看,胚胎期对二毛皮质量