禽白血病病毒p19基因末端片段在大肠杆菌中的表达

根据禽白血病病毒（ALV）p19基因末端序列合成一条82bp的双链DNA片段,将其克隆到表达质粒pGE-MEX-1中,序列分析结果与设计的相符。重组表达质粒转化的大肠杆菌BL21（ＤＥ３）经ＩＰＴＧ诱导后产生３４kD融合表达产物,与理论值相符;Western-blot分析表明该表达产物能与兔抗ＡＬＶ血清发生反应。     

A亚群禽白血病病毒囊膜基因gp85片段在大肠杆菌中的表达

将RAV－1囊膜基因gp85片段来克隆到表达质粒pET-21d( )中得到重组表达质粒pET-21d-RAV-1env(BelⅡ/SalⅠ）序列分析表明该插入片段的核苷酸序列和阅读框都与RAV－1囊膜基因相应序列相同。用其转化大肠杆菌BL21（DE）3并经IPTG诱导,SDS－PAGE分析表明RAV－1囊膜基因融合蛋白表达产物约20kD,与理论值相符;IPTG诱导起始时间比诱持续时间对表达量的影响更大。     

禽白血病病毒J亚群囊膜蛋白env基因的克隆和表达

禽白血病病毒J亚群（ALV－J）是90年代鉴定出的ALV的新亚群,其囊膜蛋白env基因序列别与ALV A－E亚群的有相当大的差别。为ALV－J env基因及春表达产物的特点,用PCR方法扩增出ADOL－4817毒株的env基因,并克隆进TA载体,经电泳鉴定大小为1.7kb。将克隆出的env基因与杆状病毒pBlue-Bac4表达质粒DNA连接,构建成转移性载体pBac4817env,通过与Bac-N-Blue杆状病毒DNA共转染,区得了重组病毒rBac4817env-2。该重组杆状病毒感染Sf9细胞,能高效表达env基因产物,免疫荧光分析结果证明,单克隆抗体G2或多价兔抗env gp37血清能识别Sf9细胞,能高效表达env基因表达的特异性抗原;Western blotting分析结果表明,表达的重组基因产物的分子量大小约为90kD-94kD。用这些重组基因产物免疫鸡可以诱导鸡导鸡产生出高滴度的抗ALV－J特异性抗体。这一结果提示,这种杆状病毒表达的重组基因产物有助于ALV－J env基因生物学特性的深入研究。     

A亚群禽白血病病毒囊膜基因gp85片段在大肠杆菌中的表达

将RAV-1囊膜基因gp85片段亚克隆到表达质粒pET-21d(+)中得到重组表达质粒pET-21d-RAV-1env(BglII/SalI),序列分析表明该插入片段的核苷酸序列和阅读框都与RAV-1囊膜基因相应序列相同.用其转化大肠杆菌BL21(DE3)并经IPTG诱导,SDS-PAGE分析表明RAV-1囊膜基因融合蛋白表达产物约20kD,与理论值相符;IPTG诱导起始时间比诱导持续时间对表达量的影响更大.     

黑曲霉W3350脯氨酰内肽酶在大肠杆菌中的表达

目的：构建pET-PEP重组原核表达载体,并对表达产物进行鉴定。方法：采用RT-PCR技术从黑曲霉（Aspergillus niger）W3350中扩增出脯氨酰内肽酶（PEP）的基因,插入表达载体pET-22b（＋）,经EcoRⅠ和HindⅢ双酶切和DNA序列测定验证,将正确的重组质粒转入大肠杆菌BL21（DE3）中,IPTG（终浓度1mmol/L）诱导获得表达。结果：表达产物进行超声破碎,经SDS-PAGE电泳检测,PEP分子质量大约为57kDa,与理论值相符,通过酶活方法测定脯氨酰内肽酶酶活为0.656U/ml,约是出发菌株的5倍。结论：首次成功构建表达载体pET-PEP并在原核细胞中表达,为进一步研究PEP的生物学功能奠定了基础。     

球毛壳菌（Chaetomium globosum）过氧化物膜蛋白过敏原基因克隆、序列分析及原核表达

以球毛壳菌cDNA文库中获得过氧化物膜蛋白（pero）基因片段（GenBank Accn:BP099709）为基础,用RACE 技术获得该基因的全长cDNA序列。序列长747bp,由412bp的3′RACE产物和508bp的5′RACE产物拼接而成。开放阅读框501bp,编码166个氨基酸,蛋白分子量为17.5kD,理论等电点为5.75。利用cDNA两侧非编码区序列作引物克隆出该基因的DNA序列,序列分析表明该基因由2个内含子和3个外显子组成。ClustalX多序列比对表明：该基因与粗糙脉孢菌（Neurospora crassa）的过氧化物膜蛋白过敏原同源性最高（83%）。将pero基因编码区克隆到原核表达载体pET28a中,构建成表达质粒pET28a-pero并转化大肠杆菌BL21,IPTG诱导后SDS-PAGE检测表达情况,结果发现在21kD处有一特异性融合蛋白带,大小与预期相符,说明该基因已经在大肠杆菌中表达。克隆的cDNA序列、DNA序列及推测的氨基酸序列在GenBank登录(登录号分别为AY555771,AY584753,AAS66898)。     

刚地弓形虫RH株果糖1，6-二磷酸醛缩酶的基因序列分析与融合表达

目的：对编码刚地弓形虫（Toxoplasma gondii）RH株果糖1,6-二磷酸醛缩酶基因进行克隆和序列分析,并构建原核栽体pETcFN融合表达该重组蛋白,以研究该分子在弓形虫速殖子入侵中的作用。方法：从刚地弓形虫RH株速殖子cDNA中扩增编码果糖1,6-二磷酸醛缩酶的基因,并克隆到T载体上,测序确认;通过PCGENE及在线工具对此编码序列进行分析;将该基因亚克隆到表达栽体pET30a（＋）上,构建质粒pETcFN;表达产物用Western blot进行进一步确认。结果：经PCR鉴定和质粒双酶切鉴定后测序,确认插入T栽体的序列为所需的目的序列。根据序列分析,推断蛋白的预计分子量为39．2kDa,等电点为7．75;BLAST分析,发现同源性52％以上的序列32条;模序分析发现其分别在223～233、21～147及15～363位置隐含有与PS00158（PmfileScan）、PD001128（BlastProDom）及PF00274（HMMPfam）相似的模序,这些序列分子功能均为果糖二磷酸醛缩酶活性。该编码片段亚克隆到栽体上成功构建融合表达质粒pETcFN,转化到大肠杆菌BL21（DE3）中诱导表达,得到分子量为43kDa的融合蛋白。Western blot的结果与预测相符。     

大鼠OB基因克隆及其在大肠杆菌中的表达

采用ＲＴＰＣＲ技术扩增大鼠ＯＢｃＤＮＡ编码区序列。ＰＣＲ产物酶切后定向克隆至ｐＵＣ１９质粒。经核苷酸序列测定表明与文献报道的大鼠ＯＢｃＤＮＡ编码区序列一致。继之构建了ｐＢＶ２２０ｒＯＢ表达质粒并获得了ＯＢ基因在大肠杆菌中的特异表达。大鼠ＯＢ基因产物的获得为研究肥胖与某些非传染性疾病（如糖尿病、高血压病）间的关系提供了条件     

牛肠激酶催化亚基工程菌的构建

目的：构建牛肠激酶催化亚基工程菌。方法：将带有牛肠激酶催化亚基（bEKL）的结构基因进行克隆,将克隆产物纯化后,构建bEKL克隆质粒,后构建bEKL表达质粒,并将表达质粒制导入备感受态细胞,进行蛋白表达。结果：琼脂糖电泳验证牛肠激酶催化亚基基因已经成功地插入表达载体,序列与预期设计一致。结论：表达质粒构建成功。     

Ⅰ型单纯疱疹病毒 gD基因片段的高效表达及抗原性分析

目的 获得高表达的Ⅰ型单纯疱疹病毒(HSV)被膜糖蛋白gD（简称gD1）基因的工程菌。方法 通过计算机分析,筛选出疱疹病毒gD1中优势抗原决定簇的基因片段。将克隆的基因片段插入表达载体pTrxA内,转化大肠杆菌Rosetta,以异丙基-β-D-硫代半乳糖苷诱导表达。十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析表达产物。　结果　PCR扩增出约930bp的gD1编码基因目的片段,与预期片段大小相符,经测序鉴定无基因突变;所构建pTrxA-gD1重组表达质粒阳性克隆经PCR与双酶切鉴定,与预期结果一致;含有pTrxA-gD1重组质粒的大肠杆菌Rosetta诱导后得到了高效达,SDS-PAGE显示表达产物约Mr48000（Dalton）。免疫印迹结果表明表达产物具有较好的抗原性。结论　成功构建了pTrxA-gD1表达质粒,实现了成熟gD1蛋白在大肠杆菌中的高效表达,表达产物具有好的抗原性。     

The CAR1 Gene Encoding a Cellular Receptor Specific for Subgroup B and D Avian Leukosis Viruses Maps to the Chicken tvb Locus

Host susceptibility to subgroup B, D, and E avian leukosis viruses (ALV) is determined by specific alleles of the chicken tvb locus. Recently, a chicken gene that encodes a cellular receptor, designated CAR1, specific for subgroups B and D ALV was cloned, and it was proposed that this gene was the s3 allele of tvb (J. Brojatsch, J. Naughton, M. M. Rolls, K. Zingler, and J. A. T. Young, Cell 87:845–855, 1996). We now report that in a backcross derived from an F₁ (Jungle Fowl × White Leghorn [WL]) male mated with inbred WL females, the cloned ALV receptor gene cosegregated with two markers linked to tvb. The two markers used were a tvb^s1-specific antigen recognized by the chicken R2 alloantiserum and restriction fragment length polymorphisms associated with the expressed sequence tag com152e. With all three markers, no crossovers were observed among 52 backcross progeny tested and LOD linkage scores of 15.7 were obtained. These data demonstrate that CAR1 is the subgroup B and D ALV susceptibility gene located at tvb^s3.     

SPF鸡胚中内源性白血病病毒全基因序列鉴定与分析

摘要:以国内某3家SPF鸡场的SPF鸡胚成纤维细胞提取的基因组DNA为模板,参照已发表的序列,设计合成了4对检测内源性白血病病毒引物,分别检测gag基因、pol基因、env基因和LTR片段,结果显示4者检出阳性率很高(gag,29/46;pol,27/46;env,24/46;LTR,31/46).设计合成了8对引物,选取4片段检测均为阳性的样品之一,经PCR成功扩增出了8段连续的、相互部分重叠的目的DNA片段,分别连接入T载体进行克隆测序.用DNAstar软件对测序结果进行拼接,从一个鸡胚得到了内源性白血病病毒前病毒全基因组序列.比较分析发现,该序列env基因与已知的E亚群内源性病毒代表株env基因的核苷酸序列同源性在98.5%以上,全基因组序列同源性在99.1%以上,而与其他亚群代表株同源性相对较低,env基因同源性仅为56.3%～91.5%.     

短小芽孢杆菌碱性蛋白酶基因启动子的克隆、鉴定及其应用

利用TAIL-PCR(Thermal asymmetric interlaced PCR)从短小芽孢杆菌基因组中扩增到碱性蛋白酶基因编码区上游的启动子片段。对该片段的序列测定和分析表明, 此片段长797 bp, 但与基因表达有关的序列长约390 bp。对启动子片段进行不同长度的缺失突变, 以获得最小的基因启动子片段, 结果表明, 该基因起始密码子上游约160 bp的DNA片段就可以启动基因的表达。将含有该片段的碱性蛋白酶基因WApQ3插入大肠杆菌-芽孢杆菌穿梭质粒载体pSUGV4中, 构建了碱性蛋白酶基因表达质粒pSUBpWApQ3。将该质粒分别转入枯草芽孢杆菌和短小芽孢杆菌中表达, 可在胞外检测到碱性蛋白酶活性, 最高酶活分别为466.5 U/mL和3060 U/mL。     

Secretion cloning vectors in Escherichia coli

The DNA fragment coding for the signal peptide of the OmpA protein, a major outer membrane protein of Escherichia coli, has been inserted into the high-level expression vectors, pIN-III. A foreign DNA fragment can be cloned in any one of the three reading frames at the unique EcoRI, HindIII or BamHI sites immediately after the ompA signal peptide coding sequence. The cloned foreign gene is under the control of both the lpp promoter and the lac promoter-operator. The expression of the gene is regulated by the lac repressor produced by the same vectors. Using the pIN-III-ompA vector, the DNA fragment coding for only the mature portion of beta-lactamase was inserted into the EcoRI site. Upon induction of gene expression, beta-lactamase was secreted into the periplasmic space. The ompA signal peptide was correctly removed resulting in the production of beta-lactamase with four extra amino acid residues (Gly-Ile-Pro-Gly) at its amino terminus due to the linker sequence in the vector. After a 3-h induction, beta-lactamase was accumulated to 20% of total cellular protein without any detectable accumulation of pro-beta-lactamase. Using oligonucleotide-directed site-specific mutagenesis, we have also removed the linker sequence and upon induction of gene expression, beta-lactamase with the authentic NH2-terminal sequence was produced, in even larger amounts than the beta-lactamase with the linker sequence.     

禽白血病病毒J亚群env基因的克隆和序列分析

应用多聚酶链反应（PCR）的方法增出ADOL－4817毒株的囊膜蛋白env基因,并克隆进大肠杆菌。经核酸序列分析证明,env基因的大小为1746bp,其中gp85和gp37mh 1554bp组成,可翻译成517个氨基酸,分子量为57.7kD。根据糖基化位点N－X－S／T的特点,发现ADOL－4817的env蛋白有15个潜在的糖基化位点。同源性分析证明,ADOL－4817的env基因与其它ALV－J的env基因序列同源性为88.8％－92.4%,而与外源性ALVs的相应序列的同源性仅为40.5％－51.4％,然而,与内源性的EAV－HP毒株的类env基因的同源性高达91.2％;另外,ADOL－4817毒株的gp37d C末端多了13个氨基酸,这些结果提示,ALV－J的env基因存在广泛的变异性,env基因可能来源于内源性和外源性ALVs的重组。     

生物信息学辅助定位及延伸辐射诱导未知表达序列标签

研究辐射诱导的基因表达调控对于认识细胞对辐射损伤的应激反应有重要意义.在低剂量辐射诱导新基因RIG1表达序列标签(expression sequence tag,EST)片段的基础上,通过非克隆cDNA文库和RACE(rapid amplification of cDNA end)技术获得了其3′末端.依据实验得到的这两段EST序列所提供的信息,通过生物信息学分析将RIG1基因初步定位在20号染色体.对20号染色体RIG1区基因组序列进行外显子扫描,发现预测的外显子正好与实验得到的EST相吻合.利用预测的外显子设计特异引物,成功地克隆了RIG1基因全长序列.同时,对20号染色体RIG1区的生物信息学分析表明,在RIG1基因的上游存在启动子区,从而确定了RIG1基因的基因组序列.因此,通过生物信息学辅助设计实验,快捷地定位及延伸了未知EST片段RIG1,基本完成了RIG1的全基因、基因组序列及染色体定位研究.     

Structure and myofiber-specific expression of the rat muscle regulatory gene MRF4.

We have cloned an 11.3-kb rat genomic DNA fragment encompassing the muscle regulatory factor 4 (MRF4) protein-coding sequence, 8.5 kb of 5'-flanking sequence, and 1.0 kb of 3'-flanking sequence. In order to study MRF4 gene expression, the rat myogenic cell line, L6J1-C, which expresses the endogenous MRF4 gene only in differentiated myofibers, was transfected stably with the full-length genomic clone and various 5' deletions. RNase protection assays demonstrated that MRF4 genes containing as little as 430 bp of 5'-flanking sequence exhibited an increase in expression as the cells differentiated into myofibers, indicating that elements responsible for fiber-specific expression are contained within this cloned DNA fragment. Similar up-regulation was observed with genes containing 1.5 kb of 5'-flanking sequence. Interestingly, MRF4 genes containing 5.0 kb and 8.5 kb of 5'-flanking sequence were up-regulated to even higher levels, suggesting that additional myofiber-specific regulatory elements located between 1.5 and 5.0 kb upstream from the coding region play a role in regulating the expression of this muscle-specific gene.     

‘红巴梨’果皮UFGT基因的克隆及表达分析

以‘巴梨’红色芽变品种‘红巴梨’果皮为材料,采用同源克隆技术和RACE结合的方法,克隆了UFGT(UDP-葡萄糖:类黄酮3-O-葡萄糖基转移酶)蛋白的部分cDNA,命名为Pc UFGT。结果表明:该cDNA片段长为1 089 bp,与苹果UFGT基因序列一致性达89%,氨基酸序列同源性为85%,含有糖基转移酶的UDPGT、COG1819和MGT等保守域。荧光实时定量PCR分析表明,该基因在‘红巴梨’幼果期表达强度约为‘巴梨’的2倍,而果实成熟期表达强度略低于‘巴梨’;该基因在‘红巴梨’果肉中不表达。