GE 医疗集团携手华大基因共同开展干细胞研究项目

GE医疗集团6月12日宣布与基因组学研究机构华大基因（BGI）在干细胞学研究建立长期的战略合作关系。此次合作旨在更好地了解及发现不同种族的人类干细胞系的基本遗传变异,进一步推进干细胞检测方法在药物发现和毒性测试中的应用。GE医疗生命科学部细胞技术总经理AmrAbid博士、华大基因副院长方林、华大基因助理院长尹烨、华大基因助理院长杜玉涛等出席了此次签约仪式,并宣布双方正式展开合作。     

急人民之所急——勇担社会责任的华大

在科研和产业发展的同时,华大基因坚持利用自身技术优势,勇担社会责任,为社会公益健康事业贡献自己的力量。2003年5月,华大基因用十几个小时就测出了SARS病毒序列,96个小时就做出了SARS检测试剂酶联免疫试剂盒,并向全国防治非典型肺炎指挥部捐赠     

酚氧化酶参与德国小蠊对大肠杆菌的免疫应答

【目的】探讨酚氧化酶(phenoloxidase, PO)在德国小蠊Blattella germanica对大肠杆菌Escherichia coli的免疫响应中的作用。【方法】利用同源克隆和RACE方法获得德国小蠊酚氧化酶基因（BgPO）的全长cDNA序列,用MEGA5.1软件构建BgPO与其他昆虫PO的系统进化树,用RT-PCR方法检测BgPO的组织表达模式及大肠杆菌诱导后不同时间的表达量变化,用Hultmark 方法测定抑菌活力,用邻苯二酚法测定酚氧化酶活性。【结果】获得的德国小蠊BgPO基因（GenBank登录号：KJ789157）cDNA全长为2 252 bp,其中开放阅读框大小为2 085 bp,编码695个氨基酸,预测的分子量和等电点分别为79.7 kDa和6.19。Blast分析结果表明德国小蠊BgPO与其他昆虫PO有较高的同源性,其中与白蚁Coptotermes formosanus PO的氨基酸序列一致性高达80%;系统进化树分析显示其与C. formosanus PO的亲缘关系最近。基因表达检测结果表明BgPO主要在血淋巴细胞和表皮中表达。大肠杆菌诱导德国小蠊后,发现BgPO的表达量在诱导24 h后升高,在诱导后36 h达到峰值;其血淋巴的抑菌活力及酚氧化酶的活性在诱导后6-36 h内均随着诱导时间的增加而增加,且菌诱导组与PBS诱导组之间存在显著差异(P<0.05)。【结论】本研究获得的德国小蠊酚氧化酶基因BgPO主要在血淋巴和表皮中表达,并参与了大肠杆菌诱导的免疫应答反应。研究结果为进一步探索酚氧化酶在德国小蠊对病原菌的免疫响应机制奠定基础。     

德国复兴生物技术产业

生物技术的经济重要性在德国日益增长。长期以来德国以严格的法律条例和夸大其危险性的争论严重地阻碍了生物技术产业的发展。现在,德国开始利用生物技术所提供的机遇,试图通过政治家们、科学家们和企业界赶上其它国家,生命科学成为国家一个主要经济因素。据Ｅｒｎｓｔ＆Ｙｏｕｎｇ公司调查,１９９７年德国生物技术产品和工艺过程的总销售额为４４亿马克。全国约有４６０多家公司,生物技术已成为一个重要企业。大多数公司从事制药、农作物保护和诊断的研究与开发。有２３家大型跨国企业总部设在德国。近几年来,德国科学家已创办了１７…     

我国在世界上首次获得成活iPS克隆猪

中科院广州生物医药与健康研究院、浙江大学、华大基因研究所等机构的科研人员,在世界上第1次获得成活的iPS克隆猪,从而标志着我国在大动物iPS研究方面取得了标志性进展。相关成果发表在《细胞研究》杂志上。     

详解罪魁祸首O104:H4

大肠杆菌学名大肠埃希氏菌(Escherichia coli或E.coli),在生物界的分类为细菌界变形菌门γ-变形菌纲肠杆菌目肠杆菌科埃希氏菌属大肠杆菌种。大肠杆菌潜伏在人体内已有数百万年的历史,甚至在人类远祖还不能称作人类的时候就已经开始了。直到1885年一名叫埃舍利希的德国小儿科医生,在健康婴儿的尿     

培养基因组学人才的摇篮

由于基因组科学的大科学、综合交叉与前沿性等特点,现有的教育模式已难以满足它的发展需求。为充分发挥华大基因和国内高校双方现有的人才和技术优势,推进创新型人才培养战略,深圳华大基因研究院提出在高校现有教育体系框架下,探索符合     

禽致病性大肠杆菌IMT5155 疑似毒力基因在人源及动物源大肠杆菌中的分布

[目的]检测禽致病性大肠杆菌IMT5155自分泌黏附素基因等具有代表性的疑似毒力基因在不同来源大肠杆菌中的分布,为进一步研究其致病机理提供依据.[方法]采用PCR和Dot blot,检测疑似毒力基因在不同地区(101株大肠杆菌中国分离株和121株大肠杆菌德国分离株)、不同来源(人源、禽源及猪源)大肠杆菌中的分布,并分析其和大肠杆菌系统进化分群的关系.[结果]自分泌黏附素基因B11等11个疑似毒力基因在禽致病性大肠杆菌中分布率较高,阳性率分别为:A1 36.4%(32/88)、A8 53.4%(47/88)、A1063.6%(56/88)、B1137.5%(33/88)、F3 59.1%(52/88)等,且疑似毒力基因主要存在于大肠杆菌B2进化群中.值得注意的是,D1、E9和F11基因片段在新生儿脑膜炎大肠杆菌中有较高的分布率,分别为60%(6/10)、80%(8/10)和90%(9/10),而在新生儿脑膜炎大肠杆菌中未检测到B11基因.[结论]自分泌黏附素B11等疑似毒力基因与禽致病性大肠杆菌关系密切,但疑似毒力基因D1、E9和F11与新生儿脑膜炎大肠杆菌密切相关,提示禽致病性大肠杆菌可能是新生儿脑膜炎大肠杆菌的毒力基因储库.     

昆虫神经毒素BjαIT的表达及杀虫活性

根据毕赤酵母Pichia pastoris密码子偏爱性,不改变毒素蛋白质一级结构,设计合成了昆虫神经毒素BjαIT基因,并分别克隆至大肠杆菌Escherichia coli融合表达载体pPET30-a(+)和毕赤酵母分泌表达载体pPIC9K。在IPTG的诱导下,神经毒素在大肠杆菌中融合表达,表达产物利用镍亲和层析柱纯化,纯化产物用于制备抗血清和活性测试。采用斑点杂交,筛选得到了较高水平分泌表达重组BjαIT的酵母转化子,摇瓶条件下,毒素表达量最大可达约20 mg/L。大肠杆菌BjαIT表达产物对东亚飞蝗Locusta migratoria manilensis和德国小蠊Blattela germanica没有活性,但酵母表达产物经注射东亚飞蝗和德国小蠊表现出杀虫活性。     

中国最大的基因公司——华大基因

1999年9月9日,随着"国际人类基因组计划1%项目"的正式启动,北京华大基因研究中心在北京正式成立。2007年,华大基因抓住新技术突破的机遇,主力南下深圳,成立了致力于公益性研究的事业单位——深圳华大基因研究院;在各级政府部门支持和关怀下,依靠基因组平台和科技服务,以商养研,     

加压CO2对大肠杆菌细胞膜的损伤作用

[目的]细菌细胞膜的损伤可以表现在细菌细胞内物质泄漏和细菌细胞吸收染料.与巴氏杀菌(63℃C、30 min)比较,研究加压CO2对大肠杆菌细胞膜的损伤作用,目的是分析出大肠杆菌死亡与细胞膜损伤的关系.[方法]检测大肠杆菌细胞膜通透性的改变情况,大肠杆菌内蛋白质和核酸的泄漏程度,并通过透射电镜观察大肠杆菌形态的改变情况.[结果]在研究范围内,加压CO2处理使大肠杆菌细胞膜通透性发生改变;加压CO2处理时虽然发生了胞内蛋白质泄漏,但发生泄漏的时间明显滞后于99％以上菌体死亡时间,因此并不是大肠杆菌死亡的原因,只是大肠杆菌死亡后的继发现象;大肠杆菌死亡与加压CO2处理导致的胞内核酸泄漏有关;大肠杆菌死亡与加压CO2处理导致的菌体形态改变有关.[结论]加压CO2对大肠杆菌细胞膜的损伤作用与菌体死亡有直接关系.     

《自然-遗传学》:中国汉族人群MHC遗传变异图谱完成

正由安徽医科大学、复旦大学与华大基因研究院共同开展的人类MHC(主要组织相容性复合体)区域全覆盖深度测序近日完成。该研究构建出迄今为止最完整的中国汉族人群MHC遗传变异数据库(Han-MHC),并阐述了其在复杂疾病研究中的重要价值。相关成果5月23日在线发表于《自然-遗传学》。MHC又被称作HLA(人类白细胞表面抗原),位于6号染色体上,包括一系列紧密连锁的基因座,与人类免疫系统功能密切相关,涉及几乎     

生物科学专业信息资源推介

数据库名称BGI家蚕基因组数据库BGI SilkwormDatabase数据库网址http://silkworm.genomics.org.cn/数据库简介家蚕基因组有28条染色体,约4.8亿碱基对,估计有基因4万个。2003年11月,中科院华大基因和西南农大等单位已率先完成家蚕基因组"框架图"绘制工作,在此基础上构架家蚕基因     

微量热法研究磁性生物材料与大肠杆菌的相互作用

目的:考察利用微量热法研究磁性生物材料与大肠杆菌相互作用的优势.方法:将大肠杆菌与磁性生物材料共同培养,利用微量热仪记录大肠杆菌的生长放热曲线,分析拟合获得大肠杆菌生长过程的热动力学参数.然后观察大肠杆菌的显微形态,并分析其形态变化.同时利用光电比浊法测定大肠杆菌的密度.结果:磁性生物材料导致大肠杆菌的生长速率常数降低,茵液最大放热功率下降,生长代谢受到抑制.而电镜观察发现,与磁性生物材料共同培养的大肠杆菌菌体萎缩变形,细胞壁出现褶皱和破损.与光电比浊法的研究结果相比,微量热法的研究结果能更符合电镜观察结果.结论:磁性生物材料破坏了大肠杆菌的细胞壁,导致大肠杆菌生长代谢受到抑制.此外,微量热法有助于研究磁性生物材料与细菌的相互作用.     

不同致泻性大肠杆菌感染调控细胞信号通路的研究进展

腹泻性大肠杆菌是在全世界引起人类和动物疾病的主要病原之一,也给社会经济带来巨大损失。根据致病机理的不同,可将腹泻性大肠杆菌分为6种:肠致病性大肠杆菌、肠出血性大肠杆菌、肠凝集性大肠杆菌、产肠毒素大肠杆菌、扩散黏附性大肠杆菌和肠侵袭性大肠杆菌。不同致病型大肠杆菌侵入宿主的方式及引起的炎症反应有所不同。文章综合分析了致病机制不同的大肠杆菌在调控宿主细胞信号通路方式上的不同,从炎症级联反应方面阐述了不同致病类型大肠杆菌的感染特征,并探讨了炎症信号通路与病原感染、预防和治疗的关系,以期为腹泻性大肠杆菌致病机制及治疗方案的研究提供帮助。     

大肠杆菌F18菌毛及其亚型的PCR鉴定

F18菌毛是产肠毒素大肠杆菌 (ETEC)与产vero细胞毒素大肠杆菌 (VTEC)的重要致病因子 ,可介导细菌对小肠细胞的黏附 ,并具有F18ab和F18ac 2个抗原亚型。根据已发表的F18ab菌毛A亚单位 (FedA ab)的基因 (fedA ab)设计 3条引物 ,建立了 2种聚合酶链式反应 (PCR)扩增方法。通过对F18ab 大肠杆菌、F18ac 大肠杆菌、K88 大肠杆菌、K99 大肠杆菌、987P 大肠杆菌、F4 1 大肠杆菌的试验 ,结果表明所建立的PCR方法可特异性鉴定F18 大肠杆菌并区别其亚型F18ab与F18ac     

基因组学与动物克隆

“人类基因组计划”和动物克隆是生命科学史上两个重要的里程碑。 “人类基因组计划”所催生的基因组学的灵魂是生命的“序列化”和“数字化”。基于这一理念,华大基因一直致力于搭建测序和生物信息分析平台,其目标是通过广泛的国际合作,分析“所有人类个体和所有地球生命”的基因组。     

《基因组生物学》:科学家破译芝麻抗衰老功能密码

发表在国际专业刊物《基因组生物学》的文章称,中国农业科学院油料作物研究所与深圳华大基因联合开展的芝麻基因组破译工作近日顺利完成。这项研究分析了芝麻高含油量和特有抗氧化、抗衰老功能性成分芝麻素的形成机制。据项目主持人张秀荣介绍,芝麻油保存期明显长于其他食用油,原因在于芝麻中含有特殊物质芝麻素。芝麻素具有很强的抗氧化性,能够增加油质的稳定性,临床已证实芝麻素具有治疗癌症及心血管疾病等功效。科研团队通过比较基因组研究发现,芝麻素合成关键基因仅存在芝麻     

粪便样品中大肠杆菌多态性分子研究

以粪便样品中分离到的大肠杆菌为研究对象,比较了3种不同方法在分离鉴定大肠杆菌过程中的应用。首先,通过传统方法从粪便样品中分离,筛选和确定了一批大肠杆菌疑似菌株,再用现代分子生物学方法对待鉴定的大肠杆菌疑似菌株,已知大肠杆菌MG1655以及几种其它细菌进行ARDRA(AmplifiedRibosomalDNARestrictionAnalysis)分析,最后利用ERIC-PCR技术在个体水平上分析菌株的多样性。结果表明,所有由传统方法确定的大肠杆菌疑似菌株和MG1655都属于同一ARDRA型,并与其它细菌的ARDRA条码型不同。这说明ARDRA分析得到的结果与传统分析方法的结果吻合,利用ARDRA分析可以区分大肠杆菌和其它肠道细菌。但是在本实验中ARDRA分析不能反映大肠杆菌中不同菌株之间的多样性,ERIC-PCR则可以区分它们。     

ERIC-PCR对鸡舍大肠杆菌气溶胶向舍外环境传播的鉴定

为了研究鸡舍环境中大肠杆菌气溶胶向舍外环境的传播,本实验采用Andersen-6级空气微生物样品收集器和RCS（reuter centrifugal sampler）-离心式采样器分别在5个鸡场舍内空气、合外上风向10,50m和下风向10,50,100,200,400m不同距离收集气载大肠杆菌,计算每一个采样点的大肠杆菌的浓度（CFU·m^-3空气）;并采集鸡的粪便,分离大肠杆菌．利用肠杆菌基因间重复一致序列的聚合酶链式反应（enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction．ERIC-PCR）鉴定技术,扩增不同测量点收集的大肠杆菌的DNA条带,形成聚类图谱．通过每一个采样点分离的大肠杆菌遗传相似性分析以及大肠杆菌浓度变化,确认动物舍微生物气溶胶向舍外环境的传播模式．结果显示,5个鸡场舍内空气中大肠杆菌的浓度（中间值）为9-63 CFU·m^-3,远远高于舍外上风和舍外下风处的大肠杆菌浓度（P〈0．05）,但是舍外下风不同距离间的大肠杆菌浓度差异并不显著（P〉0．05）．ERIC-PCR结果表明,从鸡的粪便中分离到的大肠杆菌与从舍内空气中分离到的部分大肠杆菌（34．1％）相似性可达100％,从鸡场舍外下风方向（10,50,100,200m）分离到的多数大肠杆菌（54．5％）与舍内空气或粪便中分离的大肠杆菌相似性可达100％．而从鸡舍上风分离到的大肠杆菌与舍内空气或粪便中分离的大肠杆菌相似性仅在73％～92％之间．结果表明：从上风分离到的多数大肠杆菌并非来源于鸡的粪便或者舍内空气,而很多从舍内空气和舍外下风方向分离到的大肠杆菌来源于鸡的粪便,说明源于鸡舍的微生物气溶胶能够通过舍内外气体交换传播到舍外,依气象条件传播到舍外不同的距离,造成周边环境的生物污染以及病原微生物的扩散．对动物舍环境微生物气溶胶的发生与传播规律的研究,具