泡沫病毒的基因内部启动子

泡沫病毒的基因内部启动子刘佳建耿运琪（南开大学生命科学学院,天津３０００７１）关键词泡沫病毒内部启动子反式激活因子泡沫病毒在分类上属反转录病毒科（Ｒｅｔｒｏｖｉｒｉｄａｅ）的泡沫病毒属（Ｓｐｕｍａｖｉｒｕｓ）,因其感染细胞后可诱导产生类似泡沫的大量空...     

牛泡沫病毒（BSV）3026毒株的分离及分子生物学鉴定

从一头牛免疫缺陷病毒（ＢＩＶ）检测阳性３０２６号牛外周血中,分离到一株病毒,即３０２６病毒株。体外细胞增减和反转录分析证明,此病毒是一反转录病毒。可胎牛肺细胞中引起典型的泡沫样病变,形成合胞体,ＰＣＲ扩增和Ｓｏｕｔｈｅｍ杂交显示,此病毒的ＣＤＮＡ和ＰＣＲ产的均可与牛泡沫病毒（ＢＳＶ）阳性对照的ＨｉｒｔＤＮＡ杂交。３‘ＬＴＲ上游一段３３０ｂｐ的ＰＣＲ产物序理分析表明,３０２６毒株与ＢＳＶ阳性对照相比     

复制缺陷型人泡沫逆转录病毒载体构建和外源基因表达

在人泡沫逆转录病毒(human foamy virus,HFV)原病毒全长克隆pHRSV13的基础上,缺失病毒基因组的env基因和bel基因,构建了一个表达标记基因neo和报道基因gfp的重组人泡沫病毒载体质粒pGPSNI-GFP.在与辅助质粒p△GP共转染情况下,得到复制缺陷型的重组病毒颗粒GPSNI-GFP.该病毒颗粒可以感染多种宿主细胞,将携带的外源基因整合于细胞染色体DNA上并实现表达.     

复制缺陷型人泡沫逆转录病毒载体构建和外源基因表达

在人泡沫逆转录病毒 (humanfoamyvirus ,HFV)原病毒全长克隆pHRSV13的基础上 ,缺失病毒基因组的env基因和bel基因 ,构建了一个表达标记基因neo和报道基因 gfp的重组人泡沫病毒载体质粒pGPSNI GFP。在与辅助质粒 p△GP共转染情况下 ,得到复制缺陷型的重组病毒颗粒GPSNI GFP。该病毒颗粒可以感染多种宿主细胞 ,将携带的外源基因整合于细胞染色体DNA上并实现表达     

牛泡沫病毒中国株感染兔的研究

将牛泡沫病毒(BFV3026)感染的细胞经耳缘静脉注射兔子,并以正常细胞注射的兔为对照.1年后处死,病毒挽救实验及PCR检测显示兔经一次注射即可被BFV3026感染,病毒广泛分布于感染兔的多种脏器中,通过共培养可从感染兔血、肝、脾、肺、肾中拯救出相应感染性病毒颗粒,并在脑、骨髓、心、胰、肠系膜中检到高拷贝BFV原病毒DNA存在.同时,血清学检测表明感染兔在接受注射一个月后即产生高滴度抗病毒蛋白抗体,并维持该滴度水平直至实验终止,兔未表现任何可观病变.     

泡沫病毒基因组结构及其调节蛋白的功能

泡沫病毒（Ｓｐｕｍａｖｉｒｕｓｅｓ）传统上被分为反转录病毒科的泡沫病毒亚科,按１９９１年Ｃｕｌｅｎ的分类系统,泡沫病毒属复杂反转录病毒中的一个属。对泡沫病毒的研究远滞后于其它反转录病毒,这主要是由于至今未能确定其致病性。泡沫病毒可能与神经性病变相关的...     

牛泡沫病毒中国株感染兔的研究

将牛泡沫病毒(BFV3026)感染的细胞经耳缘静脉注射兔子,并以正常细胞注射的兔为对照。1年后处死,病毒挽救实验及PCR检测显示：兔经一次注射即可被BFV3026感染,病毒广泛分布于感染兔的多种脏器中,通过共培养可从感染兔血、肝、脾、肺、肾中拯救出相应感染性病毒颗粒,并在脑、骨髓、心、胰、肠系膜中检到高拷贝BFV原病毒DNA存在。同时,血清学检测表明：感染兔在接受注射一个月后即产生高滴度抗病毒蛋白抗体,并维持该滴度水平直至实验终止,兔未表现任何可观病变。     

泡沫病毒Gag蛋白的研究进展

Gag蛋白在逆转录病毒复制周期的许多阶段中发挥重要作用。泡沫病毒基因组结构与其它逆转录病毒类似,但它们的基因组成分和生活周期存在明显差异,这在一定程度上是由其Gag蛋白的结构和功能所决定的。本文对18种不同株型的泡沫病毒gag基因序列进行进化树分析,探究不同来源的泡沫病毒的亲缘关系;并以典型的原型泡沫病毒为代表,阐述泡沫病毒Gag蛋白的结构和功能以及对病毒复制不同阶段的影响。     

Nested-PCR检测恒河猴泡沫病毒

目的用nested-PCR检测恒河猴泡沫病毒SFV的前病毒形式。方法从SFV-1的pol区域选择两对引物分别对原代猴肾细胞（rhesus monkey kidney,RMK）及猴外周血淋巴细胞（peripheral blood lymphocytes,PBLs）进行体外扩增,扩增产物经1.0%的琼脂糖凝胶电泳,证实其特异性。阳性对照使用具有典型泡沫样病变的RMK377细胞株的前病毒DNA,阳性对照的PCR扩增产物经测序证实,阴性对照为恒河猴的SRV-1cDNA。结果nested-PCR能快速灵敏的直接从猴外周血淋巴细胞检出SFV的前病毒形式,与RMK细胞培养结果基本相一致。结论本实验所建立的检测SFV的nested-PCR法能快速准确的检测猴群中的SFV的带毒情况,对于提高实验猴的质量具有重要意义。     

牛泡沫病毒两类启动子活性的比较和机制探讨

牛泡沫病毒 (Ｂｏｖｉｎｅｆｏａｍｙｖｉｒｕｓ,ＢＦＶ)属反转录病毒科泡沫病毒属。其基因组两端为长末端重复序列 (Ｌｏｎｇｔｅｒｍｉｎａｌｒｅｐｅａｔ,ＬＴＲ) ,中间部分除ｇａｇ、ｐｏｌ、ｅｎｖ三个结构基因外 ,还有两个重叠的读码框ＯＲＦ 1、2 ,起始于ｅｎｖ基因 3′端 ,终止于 3′ＬＴＲ ,编码Ｂｏｒｆ 1、Ｂｏｒｆ 2等多种调节蛋白[1～ 3 ] 。其中Ｂｏｒｆ 1为ＢＦＶ的反式激活因子 ,可显著激活ＢＦＶＬＴＲ启动子起始的基因表达。近年来 ,在泡沫病毒家族成员人泡沫病毒 (Ｈｕｍａｎｆｏａｍｙｖｉｒｕｓ,ＨＦＶ)和猴泡沫病毒(…     

猴泡沫病毒间接免疫荧光检测方法的建立及初步应用

目的建立检测血清中猴泡沫病毒（SFV）抗体的间接免疫荧光方法,为检测实验用猴群中SFV的感染情况提供参考依据。方法用SFV-1病毒感染BHK-21细胞,待50%细胞出现病变时,用胰蛋白酶消化细胞后以2×107/mL浓度40μL的细胞滴到10孔镀膜的玻片上,丙酮固定。利用制备的抗原片通过间接免疫荧光法对34份猴血清标本进行检测。结果建立了检测SFV抗体的间接免疫荧光染色方法,SFV抗体阳性19例,15例血清检测为阴性。结论本方法具有良好的特异性,可作为SFV检测的可靠方法。     

RU5区对BFV3026基因表达的调控

以牛泡沫病毒(Bovine foamy virus, BFV)中国株BFV3026原病毒DNA为材料,构建R区系列缺失质粒, 通过对其转染细胞中RT水平及对缺失质粒与luc报告质粒共转染细胞中萤火虫荧光素酶活性的测定,确立U5区对于BFV3026两类启动子LTR和IP均具有负调控作用;同时将带有不同R区的BFV3026结构基因片段克隆于异源启动子CMV之下,通过对其转染细胞293T中RT酶活性的测定,确立R区对于病毒结构基因pol的表达具有一定的调节作用,并将其功能区域初步界定在R区5′端100bp内.     

牛泡沫病毒BFV3026细胞感染性的确立及包装细胞系的建立

分别将牛泡沫病毒BFV3026接种于胎牛肺细咆(FBL）、牛肺细咆系(BL12)、新生牛肾细胞(NBK)、兔肺细胞(RL)、人乳腺癌上皮细咆(MCF)、293T、HeLa、CV-1、CHO等9种细胞,通过对它们及其传代细胞的病变观察-RT—PCR检测,确立BFV3026对这9种细胞的感染。并以BFV3026原病毒DNA为模板,通过PCR构建以pcDNA3．1(-)为载体的gag—pol、env真核表达质粒共转染BL12细胞,经G418持续筛选,获得8个Neo^R细胞克隆RT—PCR及包装实验证实：其中7个细胞克隆能有效行使包装辅助功能。     

猴泡沫病毒SFV-1前病毒pol基因克隆及序列分析

采用nested-PCR从猕猴肾组织细胞中获得同源性较高、具有高度保守序列的、长度为465 bp 大小的猴泡沫病毒SFV-1的 pol 基因的cDNA,将其克隆到pMD18-T载体中,并对其进行序列分析,分析结果表明所克隆的基因片断为猴泡沫病毒SFV-1 pol 基因片段,与文献中已发表的来源于灵长类动物SFV-1、SFV-1A、SFV-1B、SFV-2、 SFVmac、SFVkm的 pol 基因核苷酸序列进行比对,显示SFVkm1与上述病毒 pol 基因核苷酸同源性分别为91.06%、90.59%、90.82%、90.21%、89.41%、91.53%.对 pol 基因克隆和序列分析是了解和掌握SFV病毒分子流行病学及其变异趋势的重要手段,7 种不同基因型的泡沫病毒的系统进化树分析显示了SFVkm1与它们之间的相互联系.     

牛泡沫病毒内部启动子的克隆及功能分析

以该实验室分离并鉴定的牛泡沫病毒（ＢＦＶ３０２６）为材料,用ＰＣＲ方法首次克隆了位于ｅｎｖ基因３’端的内部启动了,经序列分析后,引入ｌｕｃ基因作瞬时分析。结果表明,该内部启动子不但基础活性高于ＬＴＲ,而且转录活怀在Ｔａｓ参与下被大大激活,其激活活性也远远高于ＬＴＲ。同源分析表明,非灵长类泡沫病毒内部启动子之间的同源性高于其与灵长类泡沫病毒内部妄动子之间的同源性。     

RU5区对BFV3026基因表达的调控

以牛泡沫病毒(Bovine foamy virus,BFV)中国株BFV3026原病毒DNA为材料,构建R区系列缺失质粒,通过对其转染细胞中RT水平及对缺失质粒与luc报告质粒共转染细胞中萤火虫荧光素酶活性的测定,确立U5区对于BFV3026两类启动子LTR和IP均具有负调控作用;同时将带有不同R区的BFV3026结构基因片段克隆于异源启动子CMV之下,通过对其转染细胞293T中RT酶活性的测定,确立R区对于病毒结构基因pol的表达具有一定的调节作用,并将其功能区域初步界定在R区5′端100bp内。     

牛泡沫病毒长末端重复序列在大肠杆菌中的启动子功能

泡沫病毒具有复杂的基因组结构,包含典型反转录病毒共有的长末端重复序列(long terminal repeat,LTR)启动子,负责起始结构基因gag、pol、env的表达,并在env基因内部存在独有的内部启动子(internal promoter,IP)[13],用以起始下游反式作用因子Tas(在BFV中称Borf-1)的表达.有报道劳斯肉瘤病毒(rous sarcoma virus,RSV)和人免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)LTR可在E.coli中起始基因表达[4,7].泡沫病毒至今未见报道.     

牛泡沫病毒两类启动子活性的比较和机制探讨

牛泡沫病毒(Bovine foamy virus, BFV)属反转录病毒科泡沫病毒属.其基因组两端为长末端重复序列(Long terminal repeat, LTR),中间部分除gag、pol、env三个结构基因外,还有两个重叠的读码框ORF-1、2,起始于env基因3′端,终止于3′LTR,编码Borf-1、Borf - 2等多种调节蛋白[1～3].     

慢病毒载体感染成年食蟹猴骨髓间充质干细胞

骨髓间充质干细胞(Mesenchymal stem cells,MSCs)具有增殖和多向分化潜能,临床应用广泛,近年来备受关注。另一方面,MSCs易于转导和表达外源基因,是理想的基因工程细胞。非人灵长类(NHPs)和人类具有非常相近的遗传背景,NHPs模型在评价药物疗效和移植治疗等方面具有不可替代的价值。本研究采用密度梯度离心法分离成年食蟹猴骨髓单核细胞(Marrow mononuclear cells,MNCs),贴壁培养MSCs。同时构建表达绿色荧光蛋白(Green fluorescent protein,GFP)的慢病毒载体,感染成年食蟹猴MSCs。结果显示,体外培养的成年食蟹猴MSCs均感染猴泡沫病毒(Simian foamy virus,SFV),体外培养成年食蟹猴MSCs必须添加抗病毒药物Tenofovir。但由于食蟹猴MSCs感染SFV,以及培养中添加了抗病毒药物Tenofovir,慢病毒载体的感染效率明显降低(10%)。本研究通过停用抗病毒药,在细胞复苏后6d转染慢病毒,可大幅提高慢病毒的感染效率(50%)。为成年食蟹猴MSCs作为基因工程细胞应用于实验和临床研究提供了技术保证。     

泡沫逆转录病毒Bet蛋白的研究进展

泡沫逆转录病毒能长期感染哺乳动物宿主而不引发疾病,这一特点引起研究者们极大兴趣。有研究发现,泡沫逆转录病毒的辅助蛋白Bet不仅能调控病毒的基因表达和感染周期,对病毒慢性感染的建立有重要作用;还能阻止宿主细胞防御因子APOBEC3对病毒复制产生干扰,与病毒持续性感染的维持有关。为了阐明Bet在病毒复制和感染时所发挥的作用,本文对近年来有关Bet蛋白功能的研究进行了分析和总结。