广西植物标本馆标本数字化信息统计与分析

为更了解广西植物标本馆概况与各类标本构成情况,该文以标本馆信息数据库的标本信息为基础,分别从标本的种类、石山植物标本、采集地、采集年代及采集人等5个方面进行了统计与分析。结果显示,在统计的20万份维管植物标本中,共隶属314科2504属11452种;石山植物标本份数占45.35%,含205科1021属2700种;广西采集的标本份数最多,共100372份占总份数的50.19%;在50年代标本采集量最大,达87997份占总份数的44.00%。并提出了几点建议。     

植物模式标本数据整合新的机遇与挑战

命名模式是分类群名称永久依附的成分,在分类学研究中有不可替代的价值。中国复杂的植物采集历史以及对中国植物标本开展研究的单位各异,导致我国植物模式标本零散分布于全球各大标本馆,给分类工作的开展带来了极大的困难。标本数字化的开展为模式标本数据整合提供了新的机遇,同时也给我们带来了人名和地名标准化以及模式类型确认等方面的挑战。我国于2006年开始对模式标本数据进行收集和整理,迄今已完成国内外20余家标本馆9万余条标本数据的收集。模式考证和模式类型清理是我们下一步亟须开展的工作,同时我们应将地名变更资料、人名考证资料进行整合并建立相应的数据库以推动模式标本数据的标准化。这将在很大程度上有助于我们摸清中国模式标本的家底。     

紫堇属模式标本馆藏现状及分析

模式标本是发表新种的依据,对稳定物种学名至关重要。紫堇属(Corydalis DC.)隶属于罂粟科(Papaveraceae)荷包牡丹亚科(Fumarioideae)紫堇族(Corydaleae),是分类学研究的困难属之一。该研究首先基于《中国植物志》、Flora of China以及全球物种名录查询获得被认可的526个紫堇属物种,然后通过检索全球数字化植物标本数据库(JSTOR)、全球生物多样性信息网络数据库(GBIF)和中国数字植物标本馆(CVH)获得了其中395个物种1 894份模式标本,最后对获得的标本信息进行核实、整理和归纳,提取模式类型、馆藏地、采集人、模式产地和采集时间等关键信息进行统计分析。结果表明:紫堇属每个物种平均仅有约5份模式标本; 该属模式标本散落在全球80个标本馆中,其中超过85%为国外采集者采集。未来应当结合文献,加强对该属模式标本的信息考证和规范化整理。     

我国植物模式标本的馆藏量

植物标本是物种存在的永久凭证,模式标本在保障命名体系稳定中有不可替代的作用。标本馆藏量和模式标本数量反映一个国家或地区的历史积累。作者通过对比分析,发现我国的标本馆藏量远低于国际平均水平,模式标本馆藏量也相对较少,历史积累不足。在数字化本土馆藏模式标本基础上,标本数字化平台项目应将国外馆藏的中国植物种类的模式标本"引渡"回国。今后我国植物分类学研究者的重要工作之一是加强空白地区和国外标本采集,提高馆藏标本的代表性。     

秦仁昌与植物标本馆

经典植物分类学家与植物标本馆密不可分,标本馆所藏标本为其研究提供材料,而分类学家在野外标本采集则丰富标本馆馆藏。中国许多植物分类学家既做深入研究,又做艰辛之采集,秦仁昌便是其中一位,只是其蕨类植物研究名声过大,以致掩盖了他对标本馆的贡献。     

中国科学院华南植物园标本馆维管植物标本数据统计分析

为充分利用植物标本信息,从植物标本与物种信息系统数据库中对中国科学院华南植物园标本馆维管植物标本数据进行了统计和分析。结果表明,该馆馆藏标本统计时已录入696298号、716469份腊叶标本,分别隶属于354科5813属48707种(包含亚种、变种及变型),其中包括蕨类植物59科253属2105种(包含亚种、变种及变型)、裸子植物11科64属 557种(包含亚种、变种及变型)、被子植物284科5496属46045种(包含亚种、变种及变型)。标本分别采自中国33个省、自治区、直辖市、特别行政区以及其它107个国家或地区(98个国家,9个地区或岛屿);国内标本采自广东省的最多,国外标本采自美国的最多。其中模式标本6351号,隶属于194科938属4373种。还对标本馆今后的采集工作提出了建议。这些数据为科学研究提供了宝贵的数据资源。     

使用Biotracks 采集植物标本

Biotracks 是一款自然观察类的公众科学应用,目前已经被各类科学调查和自然观察项目广泛使用。该文利用Biotracks 的标本采集项目将野外采集的数据与标本馆的数字馆藏系统连接起来,使用户在手机上记录的信息可以被应用到标本馆的标本数字化中。这种方式不仅提升了数字标本的转录效率,而且从根本上改变了整个标本收集流程中的数据整合方式,使得标本从采集到收藏的各个环节都能获得高质量的效率提升。同时,新的标本收集模式还能自然地将标本的野外照片与数字标本融为一体,从而使得传统标本原本很难呈现的颜色、行为、立体结构、环境等信息最终可以通过数字标本再次展现给研究者。这在信息维度上不仅拓展了传统标本的内涵,结合公众科学,未来还有望进一步延伸馆藏标本鉴定和讨论的时空范围。此外,公众科学在解决标本馆问题中所展现出来的潜质,为重新审视标本馆的领域价值提供了新的视角。     

中国科学院动物研究所兽类标本馆藏模式标本名录

中国科学院动物研究所兽类标本馆藏模式标本名录ＣＡＴＡＬＯＧＵＥＯＦＴＨＥＭＡＭＭＡＬＴＹＰＥＳＰＥＣＩＭＥＮＳＰＲＥＳＥＲＶＥＤＩＮＴＨＥＭＡＭＭＡＬＣＯＬＬＥＣＴＩＯＮＯＦＴＨＥＩＮＳＴＩＴＵＴＥＯＦＺＯＯＬＯＧＹ,ＣＨＩＮＥＳＥＡＣＡＤＥＭＹＯＦ...     

高校新型植物标本馆的建立与发展——以河南农业大学植物标本馆为例

高校标本馆作为重要的科普和教学实践基地,是连接大学与社会的桥梁,在提升高校社会影响力和加快高校发展中起着重要作用。目前,高校标本馆普遍存在经费少和缺乏管理等问题。如何立足高校现状,有效解决标本采集和标本数字化过程中耗时耗力的难题,建设具有地方特色的新型植物标本馆,是高校标本馆建设关注的焦点之一。该文以河南农业大学植物标本馆新馆建设为例,介绍了河南农业大学标本馆成立以来,充分发挥高校的人力资源优势,让学生通过实验课或野外实习积极参与新型植物标本馆的建设,基本实现了标本采集、制作、鉴定和数字化的同步进行。在这一过程中,既有效锻炼了学生能力,加深了学生对植物形态的认识,发挥了植物标本馆在教学、科学研究及科学普及中的积极作用,又极大地丰富了标本馆馆藏量,有效地促进了高校新型植物标本馆的发展。     

植物标本信息共享与整合——以广西植物标本馆为例

以植物标本资源整合共享为主线,寻求和探索信息孤岛现象的原因,进一步体现共享整合的价值。通过开展深入调研,找出存在的问题和原因,并采取灵活多样的整合方式和共享模式,来实现植物标本信息资源的高效利用。     

中国高等植物数字化标本分析

传统上馆藏标本,主要用于植物分类学、植物资源学的研究。数字标本的出现将标本的使用拓展到从研究生物多样性时间空间分布到生态学和进化学理论、生物多样性保护、农业和人类健康等广泛领域。截至目前,从互联网上获取的采自中国的植物标本数量已有1 200多万份。该文通过整理和分析这些数据以了解中国植物标本的数字化精度、采集时间和采集地区规律以及采集空缺等状况。结果表明:中国标本采集形成了4个高峰,即20世纪30年代、60年代、80年代和21世纪初,中国植物标本采集和研究工作主要在20世纪50年代后由中国学者完成。标本采集地区覆盖度在省级较好,县级标本采集则很不平衡; 标本采集类群在科属层面覆盖率高,但近五分之一的物种采集不足; 标本的采集量既与植物分布幅度相关,也与采集地区的知名度、所获科研项目及采集者偏好有关。未来中国植物标本数字化方向应该在继续挖掘馆藏标本的同时,一方面开展对现有数字化标本信息再审核及补充,并加强与欧美大馆的信息共享以获取早期历史标本信息; 另一方面应用数字化标本信息分析结果,指导境内标本的精准采集,包括采集薄弱/空白地区、采集薄弱/空白属种的采集,以进一步增强实体标本馆能力,提高数字化标本质量,为进一步完善植物标本数字化和精准化采集提供依据,更好地服务科学和社会的发展。     

Explaining invasiveness from the extent of native range: new insights from plant atlases and herbarium specimens

Aim

We tested the relationship between the extent of the native range and the success (number of occurrences) in the introduced range of European vascular plant species naturalized in the province of Québec (Canada). We hypothesized that the performance of models linking native range size and species invasiveness can be improved if residence time and climate tolerance are taken into account.

Methods

The extent of the native range (Europe, Asia) was estimated using plant atlases. The number of occurrences in the introduced range (Québec) was estimated using the number of herbarium specimens stored in herbaria. Herbarium specimens were also used to obtain residence time. Plant hardiness was used as an indicator of the suitability of a species to the climate of the introduced range. Multiple linear regression models, corrected to take into account phylogenetic biases, were used to calculate correlations between the extent of the native range and the number of occurrences in the introduced range.

Results

The larger the native distribution area in Eurasia, the greater the number of occurrences (herbarium specimens) in Québec. The shorter the residence time and the less hardy the plant, the fewer the number of occurrences. In all models tested, the phylogenetic structure explained a significant proportion of the variance, but its influence decreased as the number of species or area studied (Europe versus Eurasia) increased.

Main conclusions

The extent of the native range is a good explanatory variable for the invasion success of vascular plants, especially once other factors (residence time, climate tolerance, phylogeny) are taken into account. Thus, a model using these variables could be used by environmental managers to flag species warranting further investigation. With the emergence of online databases, gathering the required information is becoming easier and cheaper. As online databases continue to improve and new analytical tools are developed, this approach will become even more powerful.

     

以贵州梵净山国家级自然保护区为模式产地的维管植物物种模式标本研究

在对有关模式标本资料广泛查询的基础上,统计出以梵净山国家级自然保护区为模式产地的维管植物91种(含种下单位),隶属于47科73属。除1种无采集人信息外,其余90种由31人或团队采集,这些标本保存于国内外21个研究机构。以该地为模式产地的物种中,19种以梵净山命名。原学名中有17个被归并,其中12个学名在种级水平发生了变化,5个学名在种下水平发生了变化。以该地为模式产地的物种中受威胁的共15种,包括极危(CR) 1种,濒危(EN) 6种,易危(VU) 8种。     

Reconstructing the spread of invasive plants: taking into account biases associated with herbarium specimens

Aim To reconstruct the spread of invasive wetland species using herbarium specimens and to develop a method that accounts for the biases associated with this type of historical record. Location Southern Québec. Methods The temporal and spatial distribution of herbarium specimens of vascular plants was examined. Six invasive species that are mainly found in wetlands were compared with five native, non‐expanding hydrophytes. The cumulative number of locations was plotted against time to construct invasion curves. For native species, this ‘invasion curve’ indicates the spatiotemporal distribution of the sampling for herbarium specimens of wetland plants. It also represents the history of the state of knowledge of the distribution of native species. Deviation from the native species invasion curve can be used to describe the spread of invasive species. For every year on record, the cumulative number of locations of each exotic species was divided by the cumulative number of locations of all native species, and the proportions obtained were plotted against time. Periods of invasiveness were then delineated. Results During the twentieth century, two periods of intensive herbarium specimen collection in Québec can be clearly distinguished, i.e. from 1930 to 1940 and from 1950 to 1985. Several periods of invasiveness were delineated for Butomus umbellatus L. (1922–35), Hydrocharis morsus‐ranae L. (1957–96), Lycopus europaeus L. (1963–2000), Lythrum salicaria L. (1890–1905, 1923–46), Phragmites australis (Cav.) Trin. ex Steudel (1963–84) and Rorippa amphibia (L.) Bess. (1929–34, 1943–52, 1971–79). Main conclusions Accounting for sampling biases associated with herbarium specimens is important in order to objectively delineate periods of invasiveness for exotic species. The spread of wetland vascular plant species can be reconstructed using herbarium specimens, even when the phenomenon is rapid, but the reconstruction is certainly more accurate when the invasion occurred during an active sampling period. The highly variable sampling effort for herbarium specimens in Québec and in other regions strongly cautions against using herbarium data without correction procedures.     

中国植物采集先行者钟观光的采集考证

基于文献与标本的研究, 本文重新梳理和考证了中国植物采集先行者钟观光先生的采集历史。钟观光是我国第一个进行大规模植物标本采集的学者, 已知其最早的标本采自1912年(采集于北京), 最晚的是1933年(采集于浙江)。目前能够确定的钟观光采集的馆藏标本计10,228份, 其中大部分保存于北京大学生物系植物标本室(PEY, 4,584份)、中国科学院植物研究所植物标本馆(PE, 2,966份)和北京师范大学生命科学学院植物标本室(BNU, 2,032份), 共计9,582份, 约占钟观光馆藏标本总数的93.7%。英国皇家植物园邱园植物标本馆、爱丁堡植物园标本馆、美国哈佛大学植物标本馆等亦存有少量钟观光采集的标本(16份)。     

数字化长白山植物标本馆在植物学实践教学中的作用

植物标本是植物信息的主要保存者。植物标本馆承担着植物标本资源的收藏、植物学实践教学、科学研究和科普教育的责任,并且为标本馆数字化建设提供基础保障。对延边大学农学院长白山植物标本馆发展的历史以及数字化建设情况进行了介绍,探讨了数字化标本馆建设在植物学实践教学中的作用,提出了改革创新的方式,并对今后标本馆的数字化建设进行了展望。