| 大鼠再生肝8种细胞的丝氨酸族氨基酸代谢相关基因的转录谱 |
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| 引用本文： | 常翠芳,王改平,朱秋实,王磊,张富春,马纪,徐存拴. 大鼠再生肝8种细胞的丝氨酸族氨基酸代谢相关基因的转录谱[J]. 遗传, 2010, 32(8): 829-838. DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00829 |
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| 作者姓名： | 常翠芳 王改平 朱秋实 王磊 张富春 马纪 徐存拴 |
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| 作者单位： | 1. 新疆大学生命科学与技术学院, 乌鲁木齐 830046; 2. 河南省-科技部共建细胞分化调控重点实验室, 新乡 453007; 3. 河南师范大学生命科学学院, 新乡 453007 |
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| 基金项目： | 国家973项目前期研究专项 |
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| 摘 要： | 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的丝氨酸族氨基酸代谢相关基因转录谱, 文章用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选分离大鼠的8种再生肝细胞, 用Rat Genome 230 2.0芯片等检测它们中丝氨酸族氨基酸代谢相关基因的表达变化, 用Cluster和Treeview等软件分析上述基因在肝再生中表达模式, 用生物信息学和系统生物学等方法分析上述细胞中丝氨酸族氨基酸代谢活动。结果表明, 在27个发生有意义表达变化的基因中, 肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、肝星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞的基因数分别为13、16、11、14、13、11、12、14, 相应细胞的上调、下调和上/下调的基因数分别为7、6和0, 2、10和4, 2、8和1, 8、3和3, 6、5和2, 4、6和1, 2、10和0, 6、6和2。总的来看, 肝再生中各细胞的表达下调基因占优势, 但在肝再生启动阶段, 肝星形细胞和窦内皮细胞的表达上调基因占优势。上述丝氨酸族氨基酸代谢相关基因转录谱预示丝氨酸族氨基酸的合成主要在肝再生启动阶段的肝细胞、肝星形细胞、窦内皮细胞和库普弗细胞中增强, 它们的降解主要在肝再生进展阶段的肝细胞、胆管上皮细胞、陷窝细胞和树突状细胞中进行。
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| 关 键 词： | 肝再生 Rat Genome 230 2.0芯片 甘氨酸 丝氨酸 半胱氨酸 |
| 收稿时间： | 2009-11-12 |
Transcriptome atlas of serine family amino acid metabolism-related genes in eight rat regenerating liver cell types |
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| CHANG Cui-Fang,WANG Gai-Ping,ZHU Qiu-Shi,WANG Lei,ZHANG Fu-Chun,MA Ji,XU Cun-Shuan. Transcriptome atlas of serine family amino acid metabolism-related genes in eight rat regenerating liver cell types[J]. Hereditas, 2010, 32(8): 829-838. DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00829 |
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| Authors: | CHANG Cui-Fang WANG Gai-Ping ZHU Qiu-Shi WANG Lei ZHANG Fu-Chun MA Ji XU Cun-Shuan |
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| Affiliation: | 1. College of Life Science and Technology, Xin Jiang University, Urumqi 830046, China; 2. Co-construction Key Laboratory for Cell Differentiation and Regulation, Xinxiang 453007, China; 3. College of Life Science, Henan Normal University, Xinxiang 453007, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rat liver regeneration Rat Genome 230 2.0 Array glycine serine cysteine |
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