| 楸树CbuATX1，CbuATX1-like和CbuATX2基因克隆及生物信息学分析 |
| |
| 作者姓名： | 赵佳明 樊二勤 刘轶 王智 王军辉 曲冠证 |
| |
| 作者单位： | 1.东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,哈尔滨 1500402.中国林业科学研究院林业研究所,林木遗传育种国家重点实验室,国家林业和草原局林木培育重点实验室,楸树国家创新联盟,北京 1000913.中国检验检疫科学研究院,北京 100176 |
| |
| 基金项目： | 国家重点研发计划课题“楸树良种选育与高效培育技术研究”(2017YFD0600604)。 |
| |
| 摘 要： | 开花是高等植物内部遗传因素和外界环境因素共同调节完成的复杂生命过程,是植物进入生殖生长从而具备遗传能力和繁殖能力的象征。使用PCR技术,以楸树（Catalpa bungei）混合芽cDNA为模板分别克隆CbuATX1,CbuATX1-like和CbuATX2 3个基因,并利用相关生物信息学软件对这3个基因编码的蛋白质结构进行预测,同时对基因的启动子序列进行顺式作用元件分析,通过qRT-PCR技术检测3个基因在楸树混合芽不同发育时期的表达量。结果表明：CbuATX1的CDS全长为726 bp,编码241个氨基酸,存在跨膜运输结构,属于HMA蛋白家族,与芝麻（Sesamum indicum）、甜菜（Beta vulgaris）亲缘关系较近。CbuATX1-like的CDS全长为801 bp,编码266个氨基酸,存在跨膜运输结构,属于HMA蛋白家族,与胡萝卜（Daucus carota）、欧洲橄榄（Olea europaea）亲缘关系较近。CbuATX2的CDS全长为1 554 bp,编码517个氨基酸,不存在跨膜运输结构,属于PWWP蛋白家族,与马尾草（Erythranthe guttatus）亲缘关系较近。这3个基因启动子均含有多个真核生物启动子的基本元件,如CAAT-box和TATA-box等,此外,还含有光响应、低温响应、生长素响应,以及与干旱诱导相关的MYB结合位点等3个基因与光响应密切相关,还可能参与外界环境胁迫响应等过程。qRT-PCR结果显示,上述3个基因在1年生普通楸树无性系9-1和突变株系-百日花楸树不同发育时期的表达量呈现显著差异。通过以上研究以期能够进一步阐述百日花楸树开花的性状,为楸树开花机制的研究和楸树的定向遗传改良提供理论支持。
|
| 关 键 词： | 楸树 CbuATX 克隆 开花 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2021-03-11 |
| 本文献已被 维普 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《植物研究》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《植物研究》下载全文 |
|
