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| 基于全基因组的龟鳖目Hox基因序列特征及进化分析 | |
| 作者姓名： | 黄保友 楼灵媛 樊嘉伟 孙伟 钱国英 葛楚天 王宗吉 |
| 作者单位： | 1. 上海海洋大学水产与生命学院;2. 浙江万里学院动物性别与发育重点研究所;3. 浙江万里学院生物与环境学院 |
| 基金项目： | 国家重点研发计划(2018YFD0900203);;国家自然科学基金(32102772); |
| 摘 要： | 为对Hox基因在龟鳖目物种中进行系统地序列比较分析和进化研究,文章对目前具有染色体水平的龟鳖目基因组进行了Hox基因的鉴定,序列特征、进化和转录组分析。研究结果表明龟鳖物种的Hox基因簇是高度保守的。非重复序列的缺失导致鳖科HoxB9—HoxB13基因间区相对龟科短了10 kb。大量Hox基因编码区发生了鳖科或龟科特异的序列替换、插入和缺失。胸部骨骼发育相关的Hox基因在鳖科祖先发生了快速进化和受到正选择。Hox基因的表达具有组织、时期特异性,主要在胚胎时期的顶端外胚层嵴、背甲嵴和性腺表达。研究为龟鳖目Hox基因不同胚胎时期的多组学及表达调控分析提供了靶标,也为进一步厘清龟鳖物种演化创新提供了参考。 |
| 关 键 词： | Hox基因 龟鳖目 演化 鳖 |