| 鲢EST-SSR标记的开发及其与生长性状关联性分析 |
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| 引用本文： | 王丹,邹桂伟,罗相忠. 鲢EST-SSR标记的开发及其与生长性状关联性分析[J]. 水生生物学报, 2020, 44(3): 494-500. DOI: 10.7541/2020.060 |
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| 作者姓名： | 王丹 邹桂伟 罗相忠 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院长江水产研究所 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-46-01);中国水产科学研究院基本科研业务费(2017JBF0201)资助。 |
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| 摘 要： | 研究采用Illumina高通量测序技术对鲢(Hypophthalmichthys molitrix)卵组织进行转录组测序分析,筛选多态EST-SSR标记并与生长性状进行关联性分析。研究结果显示:(1)测序组装总Unigene 77129个, SSR共24458个,占所测EST数据的31.7%。鲢包含SSR的EST序列主要有二碱基、三碱基、四碱基和五碱基组成。二碱基中, AC含量最丰富;(2)随机挑选175条EST序列设计SSR引物,筛选出多态EST-SSR标记36个, Blast结果显示有10条已知基因功能;(3)全同胞家系检测结果显示有两个标记与鲢的生长性状相关。SCE26与体长和体重显著相关(P<0.05), SCE65与肥满度显著相关(P<0.05)。研究结果将为鲢的分子标记辅助育种的应用提供基础理论指导。
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| 关 键 词： | 鲢 EST-SSR 分子标记 家系 生长性状 |
| 收稿时间： | 2019-02-01 |
DEVELOPMENT OF EST-SSR MARKERS AND ANALYSIS OF GROWTH TRAIT IN SILVER CARP |
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| WANG Dan,ZOU Gui-Wei,LUO Xiang-Zhong. DEVELOPMENT OF EST-SSR MARKERS AND ANALYSIS OF GROWTH TRAIT IN SILVER CARP[J]. Acta Hydrobiologica Sinica, 2020, 44(3): 494-500. DOI: 10.7541/2020.060 |
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| Authors: | WANG Dan ZOU Gui-Wei LUO Xiang-Zhong |
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| Affiliation: | (Yangtze River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Wuhan 430223,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hypophthalmichthys molitrix EST-SSR Molecular marker Family Growth traits |
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