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具有内含子的大鳞副泥鳅Sox8基因(英文)
引用本文:常重杰,杜启艳,周荣家,余其兴.具有内含子的大鳞副泥鳅Sox8基因(英文)[J].基因组蛋白质组与生物信息学报,2000(2).
作者姓名:常重杰  杜启艳  周荣家  余其兴
作者单位:河南师范大学生命科学学院!中国河南新乡453002(常重杰,杜启艳),武汉大学生命科学学院!中国湖北武汉430072(周荣家,余其兴)
基金项目:his project was supported by the National Doctorate Research Foundation of China,the National Natural Science Foundation of
摘    要:鱼类在脊椎动物系统进化过程中起着承先启后的作用,其性别决定具有原始性、多样性和可塑性。深入研究鱼类的性别决定和分化具有重大的理论意义。Sox基因家族是九十年代发现的一个新的基因家族,其中的许多成员都与性别决定和分化具有直接的关系。大鳞副泥鳅是一种常见的小型鱼类,属于鲤形目鳅科,是少数具有异形性染色体中的一种。本文根据已发表的Sox蛋白质的序列资料,选择在不同物种中保守程度最高的区段设计兼并引物。该组引物可以特异扩增 Sox基因的 HMG盒区。以大鳞副泥鳅基因组 DNA为模板,在扩增产物中有三条主带,其大小分别为220bp,550bp和1500bp,另有一条相当弱的带,大小为700bp(Fig.1)。雌雄个体中扩增结果一致。经克隆和DNA序列分析,从550bp扩增带中得到一新的基因片段,长500bp,编码53个氨基酸;其余部分长340bp,可能为一内含子,且符合“GT…AG”规律(Fig.2)。其可能编码的蛋白质氨基酸序列与小鼠的 Sox8, 9, 10,SRY基因的相似性分别为 96%, 94%, 90%和 47%;与人类 Sox 8, 9, 10, SRY基因的相似性分别为64%, 94%, 58%和40%(Fig.3)。


The Sox8 with Intron in Paramisgurnus dabryanus
CHANG Zhong-jie,DU Qi-yan,ZHOU Rong-jia and YU Qi-xing.The Sox8 with Intron in Paramisgurnus dabryanus[J].Genomics Proteomics & Bioinformatics,2000(2).
Authors:CHANG Zhong-jie  DU Qi-yan  ZHOU Rong-jia and YU Qi-xing
Abstract:The Sox genes of P. dabryanus were amplified by degenerate primers within HMG-box. From male and female individuals, three amplification bands with the lengths 220, 550 and 1500 hp were displayed, respectively. A fragment of potential novel gene was displayed in the band of 550 hp. It possibly coded 53 amino acid residues, whose amino acids had sequences in 96%, 94%, 90% and 47% similarities to those of the genes Sox 8, Sox 9, Sod o and SRY of mouse, and in 64%, 94%, 58% and 40% similarities to them of human, respectively. Accordingly, it was named PdSox 8. Northern blotting result indicated overexpression of it in adult liver and brain.
Keywords:Paramisgurnus dabryanus  PdSox 8
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