| 鲤春血症病毒中国分离株糖蛋白基因和氨基酸序列的初步解析 |
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| 引用本文： | 刘荭,付峰,黄倢,何俊强,史秀杰,高隆英,杨锦舜,江育林.鲤春血症病毒中国分离株糖蛋白基因和氨基酸序列的初步解析[J].中国病毒学,2005,20(6):647-651. |
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| 作者姓名： | 刘荭 付峰 黄倢 何俊强 史秀杰 高隆英 杨锦舜 江育林 |
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| 作者单位： | 1. 深圳出入境检验检疫局动植食中心水生动物病重点实验室,广东,深圳,518001
2. 中国科学院黄海水产研究所水产病害控制研究室,山东,青岛,266071 |
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| 基金项目： | 该项目由农业部中国水产科学研究院内陆渔业生态环境和资源重点开放实验室资助. |
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| 摘 要： | 2002～2004年间从国内养殖鲤科鱼类和观赏鱼类中分离出8株鲤春血症病毒(SVCV).根据SVCV参考株全序列,设计引物,用逆转录聚合酶链式反应扩增出8株SVCV糖蛋白编码基因片段,并对扩增产物进行了克隆和序列测定.用生物信息学方法对测得的序列进行分析,结果8个国内分离株的糖蛋白基因序列与参考株的基因序列相似性均在92%以上,8个国内分离株之间基因序列相似性均在97.7%以上;8个国内分离株之间糖蛋白推导出的氨基酸序列相似性均在94.5%以上,与参考株氨基酸序列相似性在92.9%-94.9%之间.系统发育树分析结果表明,SVCV国内分离株与USA株、980451株、980528株和970469株的进化方向一致,与其它SVCV毒株在进化方向上不同.8个毒株有19个共同的酶切位点,推导出的氨基酸序列中有10个亲水区、10个可能的抗原位点和10个跨膜蛋白区域,其峰值基本一致.对SVCV国内分离株的糖蛋白6个功能位点(天冬酰胺糖基化位点、精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸序列、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪氨酸磷酸化位点和肉豆蔻酰基化位点)进行了初步分析.
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| 关 键 词： | 鲤春血症病毒 糖蛋白 序列 解析 |
| 文章编号： | 1003-5125(2005)06-0647-05 |
| 修稿时间： | 2005年4月21日 |
Amino Acid Sequence of a Chinese Isolate of Spring Viraemia Virus of Carp and Preliminary Analysis of the Glycoprotein Gene |
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| LIU Hong,FU Feng,HUANG Jie,HE Jun-qiang,SHI Xiu-jie,GAO Long-ying,YANG Jin-shun,JIANG Yu-lin.Amino Acid Sequence of a Chinese Isolate of Spring Viraemia Virus of Carp and Preliminary Analysis of the Glycoprotein Gene[J].Virologica Sinica,2005,20(6):647-651. |
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| Authors: | LIU Hong FU Feng HUANG Jie HE Jun-qiang SHI Xiu-jie GAO Long-ying YANG Jin-shun JIANG Yu-lin |
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