甘蔗花叶病毒3’末端基因的克隆及外壳蛋白序列分析比较 |
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引用本文: | 李利君,周仲驹,谢联辉,LI Li-jun,ZHOU Zhong-ju.甘蔗花叶病毒3’末端基因的克隆及外壳蛋白序列分析比较[J].中国病毒学,2001,16(1):45-50. |
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作者姓名: | 李利君 周仲驹 谢联辉 LI Li-jun ZHOU Zhong-ju |
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作者单位: | 1. 福建农林大学植物病毒研究所, 2. Institute of Plant Virology of Fujian Agricultural and Fore stry University, |
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基金项目: | 福建省教委资助项目(K96022) |
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摘 要: | 选取我国SCMV优势株系A株系的分离物SCMV-CA为材料,经过病毒和病毒RNA的提纯,反转录获得病毒cDNA,并克隆到载体pUC19的SmaI位点上,筛选得到多个重组质粒。选取其中一个克隆SCMV-CA54进行测序,得到一个全长为1296
bp的核苷酸序列。这段序列由一个长为1044 bp的开放阅读框架(ORF)和一个长279
bp的3’末端非编码区序列(3'-UTR)及poly(A)尾巴组成。这个ORF包括病毒完整的外壳蛋白(CP)及部分核内含体蛋白b(NIb)基因序列。将所得序列同已知SCMV亚组中各株系分离物的核苷酸和氨基酸进行同源性比较,结果表明该序列与其它株系分离物CP核苷酸序列的同源性介于63.7%~77.6%之间,氨基酸的同源性介于64%~89%之间。根据马铃薯Y病毒属的序列同源性划分标准,SCMV-CA与其它株系或分离物的同源性关系均介于种与株系划分标准之间。这是我国首次报道SCMVCP基因序列。
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关 键 词: | 甘蔗花叶病毒 3'端非编码区 外壳蛋白 序列分析 |
文章编号: | 1003-5125(2001)01-0045-06 |
修稿时间: | 1999年9月27日 |
Cloning of 3'-terminal
Part of Sugarcane Mosaic Virus RNA and Sequence Comparison of CP Gene Between Chinese
Isolate and Other Strains of SCMV |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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