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甘蔗花叶病毒3’末端基因的克隆及外壳蛋白序列分析比较
引用本文:李利君,周仲驹,谢联辉,LI Li-jun,ZHOU Zhong-ju.甘蔗花叶病毒3’末端基因的克隆及外壳蛋白序列分析比较[J].中国病毒学,2001,16(1):45-50.
作者姓名:李利君  周仲驹  谢联辉  LI Li-jun  ZHOU Zhong-ju
作者单位:1. 福建农林大学植物病毒研究所,
2. Institute of Plant Virology of Fujian Agricultural and Fore stry University,
基金项目:福建省教委资助项目(K96022)
摘    要:选取我国SCMV优势株系A株系的分离物SCMV-CA为材料,经过病毒和病毒RNA的提纯,反转录获得病毒cDNA,并克隆到载体pUC19的SmaI位点上,筛选得到多个重组质粒。选取其中一个克隆SCMV-CA54进行测序,得到一个全长为1296 bp的核苷酸序列。这段序列由一个长为1044 bp的开放阅读框架(ORF)和一个长279 bp的3’末端非编码区序列(3'-UTR)及poly(A)尾巴组成。这个ORF包括病毒完整的外壳蛋白(CP)及部分核内含体蛋白b(NIb)基因序列。将所得序列同已知SCMV亚组中各株系分离物的核苷酸和氨基酸进行同源性比较,结果表明该序列与其它株系分离物CP核苷酸序列的同源性介于63.7%~77.6%之间,氨基酸的同源性介于64%~89%之间。根据马铃薯Y病毒属的序列同源性划分标准,SCMV-CA与其它株系或分离物的同源性关系均介于种与株系划分标准之间。这是我国首次报道SCMVCP基因序列。

关 键 词:甘蔗花叶病毒  3'端非编码区  外壳蛋白  序列分析
文章编号:1003-5125(2001)01-0045-06
修稿时间:1999年9月27日

Cloning of 3'-terminal Part of Sugarcane Mosaic Virus RNA and Sequence Comparison of CP Gene Between Chinese Isolate and Other Strains of SCMV
Abstract:
Keywords:
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