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系统发生分析发现牛病毒性腹泻病病毒新基因亚型
引用本文:徐兴然,肖昌,梁龙,余兴龙,张青婵,涂长春.系统发生分析发现牛病毒性腹泻病病毒新基因亚型[J].中国病毒学,2005,20(6):626-631.
作者姓名:徐兴然  肖昌  梁龙  余兴龙  张青婵  涂长春
作者单位:1. 解放军军事医学科学院军事兽医研究所,长春,130062;西南农业大学,重庆,北碚,400716
2. 解放军军事医学科学院生物工程研究所,北京,100071
3. 解放军军事医学科学院军事兽医研究所,长春,130062
基金项目:国家"973"计划资助课题(No.G1999011905).
摘    要:本研究对我国首次分离获得的牛源牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株Changchun 184(CC-184)和猪源牛病毒性腹泻病毒ZM-95进行了遗传衍化关系研究.选择主要抗原E2基因为研究对象,首先应用RT-PCR及套式PCR克隆得到CC-184和ZM-95的E2片段,通过序列测定发现CC-184和ZM-95 E2基因长度分别为1,122bp和1,125bp,各自编码374和375个氨基酸残基.核酸序列同源性比较和系统发生分析表明2株病毒均属于BVDV-1,CC-184与Osloss亲缘关系最近,都属于已有的b基因亚型,其E2基因同源性达91.8%.而ZM-95的E2基因有一个特征性的变异区,包含一个密码子序列插入,这一变异区编码了一段有别于其他瘟病毒的五肽氨基酸序列HYKKK.结果还表明ZM-95与BVDV-1现有的5个基因亚型的亲缘关系均较远,E2基因同源性最高(与Oregonc24v)只有72.4%.而BVDV 1亚型内毒株间的同源性大于85%,亚型间的同源性在69%~75%之间,充分说明ZM-95是BVDV-1中一个新发现的基因亚型.通常认为猪源BVDV来源于牛,应该与牛源BVDV有十分近的遗传关系,但是本研究发现ZM-95与其他已知牛源BVDV较低的基因同源性说明猪源BVDV还具有独立的遗传衍化与传播来源的可能性.

关 键 词:猪源  BVDV  E2  基因  系统发生  新基因亚型
文章编号:1003-5125(2005)06-0626-06
修稿时间:2005年5月26日

A New Gene Subtype of BVDV-1 from ZM-95,a Pig-isdated train
XU Xing-ran,XIAO Chang,LIANG Long,YU Xing-long,ZHANG Qing-chan,TU Chang-chun.A New Gene Subtype of BVDV-1 from ZM-95,a Pig-isdated train[J].Virologica Sinica,2005,20(6):626-631.
Authors:XU Xing-ran  XIAO Chang  LIANG Long  YU Xing-long  ZHANG Qing-chan  TU Chang-chun
Abstract:
Keywords:
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